ACIDES AMINÉS

Question 1

Quelles sont les quatre classes de biomolécules?

Answer 1

• Protéines
• Lipides
• Sucres
• Acides nucléiques

Question 2

De quoi dépend la fonction d’une protéine?

Answer 2

La fonction d’une protéine dépend de sa structure. Comprendre la structure permet de développer des stratégies thérapeutiques.

Question 3

Qu’ont en commun la plupart des maladies génétiques?

Answer 3

La plupart sont liées à un fonctionnement anormal d’une protéine.

Question 4

D’où provient la caractère pathogène de nombreux agents infectieux?

Answer 4

De l’action d’une protéine.

Question 5

Définir le génome.

Answer 5

Ensemble de l’ADN.

Question 6

Définir le transcriptome.

Answer 6

Ensemble des ARN.

Question 7

Quel est l’autre nom de l’hormone de croissance?

Answer 7

Somatotrophine

Question 8

Quels sont les 7 types de fonction des protéines? Donner des exemples pour chaque.

Answer 8

1. Support mécanique (prot du cytoquelette, des tissus de soutien (collagène, kératine, …))
2. Transformation - Enzymes
3. Hormones (insuline, vasopressine, glucagon, …)
4. Signalisation (interrupteurs moléculaires, récepteur/ligand)
5. Transporteurs (transferrine, hémoglobine, transporteurs transmembranaires)
6. Stockage de matériels (ferritine, myoglobine pour l’oxygène)
7. Reconnaissance et défense (anticorps = immunoglobulines)

Question 9

Quelles enzymes ne sont pas des protéines?

Answer 9

Les ribosomes (ARN)

Question 10

Qu’est-ce qu’une liaison covalente?

Answer 10

Une liaison forte qui correspond à la mise en commun d’au moins une paire d’électrons entre deux atomes adjacents

Question 11

Quelle est le rôle d’une liaison covalente?

Answer 11

Le maintien de l’intégrité des biomolécules

Question 12

Quel est l’ordre d’énergie d’une liaison covalente?

Answer 12

Quelques centaines de kJ/mole

Question 13

Citer les 4 types de liaisons faibles, ie interactions non covalentes réversibles. Par quoi diffèrent-elles?

Answer 13

• ioniques
• hydrogènes
• Van der Waals
• hydrophobes
  Diffèrent par leur géométrie, leur longueur et leur spécificité. Elles sont affectées de façon différente par la présence de l’eau dans les milieux biologiques.

Question 14

Quelles sont les deux rôles des liaisons faibles?

Answer 14

• reploiement des protéines : relation structure/fonction
• interactions : enzyme/substrat ou récepteur/ligand

Question 15

Par rapport aux liaisons covalentes, de quel ordre est l’énergie des liaisons faibles?

Answer 15

20 fois moindre

Question 16

Quels sont les trois synonymes de liaisons ioniques?

Answer 16

• liaisons salines
• ponts salins
• forces électrostatiques

Question 17

Quels sont les deux rôles des liaisons ioniques?

Answer 17

• interaction molécule-molécule
• modification conformationnelle

Question 18

Energie d’une liaison ionique en milieu aqueux? Qu’est ce qui peut rompre une liaison ionique?

Answer 18

10kJ/mole. Un pH trop extrême ou bien une concentration ionique trop élevée.

Question 19

Qu’est-ce qu’une liaison hydrogène?

Answer 19

Une liaison entre deux molécules polaires qui résulte de l’attraction électronique due à la répartition inégale des électrons dans une liaison covalente.

Question 20

Quel est l’effet de l’eau sur les liaisons hydrogène?

Answer 20

L’eau affaiblit les liaisons hydrogène entre molécules polaires. C’est un excellent solvant des molécules polaires car les molécules polaires peuvent former des liaisons hydrogène avec les molécules d’eau.

Question 21

Quel est l’ordre d’énergie des liaisons de Van der Waals?

Answer 21

2 à 4 kJ/mole

Question 22

Qu’est-ce qu’une liaison hydrophobe?

Answer 22

Une liaison entre deux molécules hydrophobes, ie apolaires.

Question 23

Qu’est-ce qu’un acide aminé? Quels en sont les 5 éléments constitutifs?

Answer 23

Un AA comporte un carbone alpha lié à :
- une fonction carbonyle a-COOH
- un groupement amine a-NH2
- une chaîne latéral R spécifique de chaque AA
- un hydrogène H

Question 24

Les AA sont-ils solubles dans l’eau?

Answer 24

Plutôt oui

Question 25

Quel est l’autre nom des AA standards? Combien y en a-t-il?

Answer 25

Les AA protéinogènes. 20 à 22.

Question 26

Quels sont les rôles des AA standards?

Answer 26

• rôle métabolique
• rôle de médiateur chimique ou précurseur

Question 27

Quel est l’AA qui n’a pas de carbone asymétrique? Quelles sont les deux formes de tous les autres AA?

Answer 27

La glycine. Tous les autres AA ont un carbone asymétrique, il existe ainsi pour chacun deux énantiomères stéréoisomères L et D qui ont souvent des propriétés biologiques différentes.

Question 28

Dans le règne animal, quelle série d’AA est constitutive des protéines?

Answer 28

La série L, pour lévogyre, ce qui signifie que la molécule dévie la lumière vers la gauche. Pour noter une molécule L, le groupe amine est à gauche ( COOH au-dessus et R en bas)

Question 29

Quelle est l’orientation des chaînes latérales des protéines avec des AA apolaires?

Answer 29

Souvent vers l’intérieur, due à une aversion pour l’eau.

Question 30

Qu’est-ce que le pI? Comment le calculer?

Answer 30

Le point isoélectrique, qui correspond à la demi-somme des deux pK qui entourent la forme zwitterion (=electriquement neutre) de l’AA.