Acides aminés, protéines et enzymologie

Question 1

Décrit la structure des acides aminés (4)

Answer 1

• Groupement amine primaire (NH2)
• Groupement carboxyle (COOH)
• Un atome d’hydrogène
• Une chaîne latérale

Question 2

Les acides aminés sont des molécules __________. À un pH physiologique, leur groupement COOH et NH3 sont __________.

Answer 2

• Amphotères

- Ionisés

Question 3

Qu’est-ce qu’une peptide et qu’est-ce qu’une protéine ?

Answer 3

• Peptide : chaîne d’acides aminés (normalement courte chaîne de 15 à 20 AA)
• Protéine : Composée d’une ou plusieurs chaines peptidiques (polypeptide)

Question 4

Le carbone _____ de chaque AA est impliqué dans la lisaison peptidique.

Answer 4

Alpha

Question 5

Qu’est-ce que le lien peptidique ?

Answer 5

• Liason entre 2 acides aminés (CO-NH)
• Polmérisation d’AA
• Déshydratation (sortie d’H2O)

Question 6

La réaction de 2 groupements thiol permet la formation d’un pont ________ (déshydratation, liaison covalente). Ces ponts jouent un rôle important dans la _____________.

Answer 6

• Disulfure

- Stabilisation de ;a structure des protéines

Question 7

Qu’est-ce qui caractérise la stéréochimie des AA (3) ?

Answer 7

• Arrangement spatial (3D) des atomes
• Les AA ont tous une activité optique à l’exception de la glycine (dérivent la lumière vers la gauche ou vers la droite)
• Image miroir non superposable (chiral)

Question 8

Qu’est-ce qui caractérise la projection de Fisher (3) ?

Answer 8

• Projection à plat
• Identifie toutes les molécules comme étant de forme L- ou D-
• Tous les acides aminés dévrivés de protéines possèdent une configuraiton L-AA

Question 9

Qu’est-ce qu’un mélange racémique ?

Answer 9

Mélange avec des quantités égales des 2 isomères

Question 10

Qu’est-ce que l’énantiomérie ?

Answer 10

C’est une propriété de certaines molécules stéréoisomères, dont deux des isomères sont l’image l’un de l’autre dans un miroir plan, mais ne sont pas superposables.

Question 11

Nomme les différents rôles que les protéines de fontion peuvent jouer (4)

Answer 11

• Catalyse
• Transport
• Régulation de l’expression génique
• Protection
• …

Question 12

Quel type de structure aide les tissus et les cellules à garder leur intégrité ?

Answer 12

Protéine de structure (actine, collagène, kératine)

Question 13

La structure d’une protéine établie sa _______.

Answer 13

Fonction

Question 14

Qu’est-ce qui caractérise la structure primaire ?

Answer 14

C’est la séquence (plan rigide) d’acides aminés d’une protéine reliés par des liens peptidiques.

Question 15

La majorité des liens peptidiques ont une conformation _____. Les ________ sont de part et d’autre de la liaison peptidique.

Answer 15

• Trans

- Carbone alpha

Question 16

Que comporte la chaîne principale d’une protéine ?

Answer 16

Les atomes participant aux liens peptidiques

Question 17

Dans la structure secondaire, les angles de torsion sont limités par ________. Les forces de torsion influencent la _________.

Answer 17

• L’emcombrement stérique

- Structure tridimensionnelle de la protéine (prend la structure la plus stable énergiquement)

Question 18

Qu’est-ce qui caractérise la structure secondaire hélice alpha (3) ?

Answer 18

• Arrangement de la chaîne peptidique
• Structure en forme de spirale
• Stabilisée par des ponts hydrogène

Question 19

Comment est stabilisée la structure secondaire en feuillet B ? Quelles sont les 2 configurations possibles ?

Answer 19

• Stabilisée par des liaisons hydrogènes entre de AA distants (comme dans les hélices, mais plutôt linéaire)
• Parallèle (extrémités pas du même côté) et antiparallèle (extrémités du même côté)

Question 20

Qu’est-ce que la structure tertiaire ? Qu’est-ce qui la stabilise (4) ?

Answer 20

• L’arrangement tridimensionnel de tous les acides aminés
• Stabilisée par :
  Liaisons hydrophobes
  Forces électrostatiques
  Ponts disulfures
  Liasons peptidiques

Question 21

Les protéines de plus de _____ AA forment des structure appelées ________. Elles exercent des fonctions indépendantes telle que l’activité enzymatique, pore membranaire et interaction moléculaire.

Answer 21

• 200

- Domaines

Question 22

Vrai ou Faux :

Les structures quaternaires sont stabilisées par des liens peptidiques.

Answer 22

Faux : par des liens hydrogène