Análisis genómicos y proteomicos Flashcards
(28 cards)
Proyecto encargado de descubrir los elementos funcionales de la secuencia
ENCODE
El análisis bidimensional (SDS-PAGE) se analiza mediante:
- Punto isoeléctrico
- Masa molecular
El análisis monodimensional (SDS-PAGE) se analiza mediante:
Solo masa (tamaño)
Proceso que permite que 22,000 genes podrían originar en una sola célula 500,000 proteínas diferentes
Splicing alternativo
El principal objetivo de la proteómica es…
Entender:
* Expresión
* Función
* Regulación
Del conjunto completo de proteínas codificadas por un organismo
Las modificaciones post-traduccionales sirven para…
Regular:
* Actividad
* Estabilidad
* Localización subcelular
De una proteína, así como sus interacciones con otras proteínas
Las proteínas son efectoras del…
Trabajo celular
Técnicas para realizar estudios de las proteínas
- Electroforesis mono y bidimensional
- Espectrometria de masas (secuenciar protes)
- Tecnicas in silico (análisis de bases de datos)
Fun fact
La proteína de estudio se aísla por la afinidad que tiene con un anticuerpo y las proteínas que están pegadas a ellas se analizan por espectrometría de masas.
Las interacciones proteína-proteína se analizan mediante la purificación por…
Afinidad-MS
・
¿Qué buscan las estrategias de separacion de proteinas?
Reducir complejidad y tiempo de analisis
La purificación se monitoriza mediante
SDS-PAGE (gel bidimensional)
El proceso de purificación de una proteína supone una secuencia de etapas en las que las proteínas contaminantes se eliminan a partir de…
Diferencias de tamaño, carga e hidrofobicidad.
Proceso de espectrometría de masas
- Extracción
- Tripsina
- Espectrometría
- In silico
- Identificación
Una vez que la proteína llega a su carga neutra se realiza una separación mediante…
Iones
Espectrometría de masa
¿Qué peptidasa se utiliza?
Tripsina → a.a (específicos)
Espectrometría de masa
¿Qué se utiliza para determinar c/u de las masas de los a.a?
Espectofotrómetro
Espectrometría de masa
¿Qué hace?
Usa la relación masa/carga para calcular componentes de una proteína
Ensayo in silico → identificar prote
¿Qué es la huella peptídica?
- Capacidad de identificar una proteina
- Usa espectometria de masas (MS)
¿Qué es un MALDI-TOF?
Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight
Desorción/ionización laser asistido por matriz a tiempo de vuelo
Está acoplado a la espectrometría de masas
PASO 1
MALDI-TOF (La matriz se ⎽⎽⎽⎽)
Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight
Co-cristaliza
PASO 2
MALDI-TOF (Características del láser)
Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight
Láser de 337nm → analito se vuelve en forma gaseosa
PASO 3
MALDI-TOF ¿Qué se transfieren las moléculas de la matriz?
Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight
Protones ionizando la muestra
PASO 4
MALDI-TOF ¿Qué pasa con los residuos de la matriz?
Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight
Se eliminan (desolvatación)
