ARN non-codants

Question 1

C quoi un ARN non codant

Answer 1

Molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine
ncRNA

Question 2

Quels sont les types de ncRNA et RNA interference

Answer 2

miRNA, siRNA, lncRNA régulent l’expréssion des gènes
miRNA et siRNA

Question 3

Quelles sont les classifications de ncRNA

Answer 3

lncRNAs (+ de 200 nucléotides) et sncRNAs (- de 200 nucléotides)

Question 4

Que font les miRNA, siRNA et lncRNA

Answer 4

Régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et épissage du pré-ARNm
Également participent à la formation d’hétérochromatine, la modification d’histones, ciblage de la méthylation et silençage des gènes
Sont impliqués dans diverses pathologies comme le cancer
Impliqués dans l’épigénétique, qui a un rôle important dans l’établissement et le maintien des types celluaires
Donc restent pour la plupart inexplorés à l’heure actuelle

Question 5

Que font les RNA interférence (iRNA) et comment

Answer 5

Rôle important dans la défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites=virus et transposons
Processus biologique dans lequel des molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

Question 6

Quelle est l’utilité des iRNA

Answer 6

Applications en recherche et dans des approches thérapeutiques
siRNA synthétiques inroduits dans les cellules peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêt spécifiques

Question 7

Qu’est-ce qu’un microRNA

Answer 7

Petite molécule de ncRNA d’environ 22 nucléotides
Plantes, animaux et certains virus ont
Fonctionne dans la régulation post-transcriptionnelle de l’expression génique
Abondants dans de nombreux types de cellules demammifères
Ciblent environ 60% des gènes humains

Question 8

Les miRNA sont-ils conservés

Answer 8

Oui, la plupart sont conservés entre les espèces et ont des fonctions importantes
On peut donc les étudier chez la souris pour comprendre leurs fonctions chez l’humain

Question 9

Que font les miRNA

Answer 9

Inhibent l’expression génique en ciblant des ARNm
FOnctionnent via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNm cibles

Question 10

Quels sont les processus que les miRNA utilisent pour silencier des ARNm cibles

Answer 10

Clivage du brin d’ARNm en 2 morceaux
Déstabilisation de l’ARNm par clivage de la queue poly-A
Réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en protéines

Question 11

Qu’est-ce qui polymérise les miRNA

Answer 11

ARN pol II

Question 12

Décrit le processus de fabrication des miRNA

Answer 12

Le transcrit par ARN pol II est coiffé, polyadénylé et épissé
Les miRNa font partis d’un transcrit précurseur contenant un ou plusieurs miRNA appelé pri-miRNA
Un pri-miRNA oeut contenir 1-6 précurseurs de miRNA nommés pré-miRNA
Chaque pré-miRNA a une structure en tige-boucle (épingle à cheveux) composées d’environ 70-80 nucléotides
Chaque sturcutre double-brin (dsRNA) des épingles à cheveu dans un pri-miRNA est reconnue par une protéine nucléaire appelée DGCR8 chez les vertébrés ou Pasha chez les invertébrés. Celle-ci et l’enzyme Drosha (endonucléase) forment le complexe microprocesseur
L’activié enzymatique de Drosha décou e les pré-miRNA à partir du pri-miRNA à la base en épingle à cheveux (CROPPING)
Le pré-miRNA a 2 nucléotides non-appariés à son bout 3’
Export par Exportin-5, qui reconnait les 2 nucléotides laissés au bout 3’ par Drosha. Ce transport est dépendant de l’énergie, le GTP lié à Ran
Dicing: Dans le cyto, l’épingle à cheveux pré-miRNA est processée par Dicer, une endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miARN-miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides de long
miRNA est nommé le brin guide
miRNA* est nommé le brin passager
Argonaute (Argo) choisi le brin guide
Ce brin, avec Argo et d’autres protéines formant RISC (RNA-induced Silencing Complex) dans lequel miRNA et sa cible ARNm interagissent

Question 13

Que se passe-t-il quand il y a appariement étendu (parfait) des miRNA

Answer 13

Splicing: le mRNA cible est clivé puis dégradé
Certains argonautes, comme Ago2, clivent directement l’ARNm cible

Question 14

Que se passe-t-il en cas d’appariement pas extensif (partiel ou imparfait)

Answer 14

Argonaute ne slice pas, la traduction est inhibée, mRNA déstabilisé
Les mRNA sont séquestrés dans des structures cytosoliques dites P-bodies ou a lieu la dégradation des mRNA

Question 15

Que sont les P-bodies

Answer 15

Structures dynamiques contenant l’enzyme Dcp1 (decaping enzyme) ainsi que des enzymes de dégradation des mRNA

Question 16

Coment agissent les miRNA partiellement complémentaires

Answer 16

Inhibent l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début de l’ARNm
Peuvent aussi accéléer la déadénylation entrainant la dégradation précoce des ARNm
miRNA provoquent aussi parfois des modifs d’histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs, ce qui affecte l’expression des gènes

Question 17

Interaction de miRNA avec la p53 dans le cancer du sein

Answer 17

Certains régulent p53, d’autres sont régulés par p53 (suppresseur de tumeurs)

Question 18

Ou sont les miRNA

Answer 18

Majorité=intracellulaires
Certains, généralement appelés miRNA circulants ou extracellulaires, ont également été découverts dans un environnement extracellulaire, notamment divers fluides biologiques et milieux de culture cellulaire

Question 19

Que sont les lncRNA

Answer 19

Transcrits de plus de 200 nucléotides qui ne codent pas pour des protéines
Définition arbitraire, elle permet de distinguer les lncRNA des petits ARN régulateurs comme les miRNA et autres
Exprimés plus faiblements que les gènes codants pour des protéines
Expression remarquablement spécifique dans certains tissus
Généralement plus enrichis dans le noyau

Question 20

Conservation de séquence des lncRNA

Answer 20

Faible, bien que certains sont fortement conservés

Question 21

lncRNA intergéniques et antisens

Answer 21

Intergéniques: dans une région entre gènes
Antisens: transcrits dans la direction opposée d’un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé

Question 22

lncRNA introniques et divergents

Answer 22

Introniques: contenus dans un intron d’un gène codant
Divergents: transcrit de façon divergente au promoteur d’un gène codant

Question 23

Comment les lncRNA controlent l’expression des gènes

Answer 23

1) voisins (en cis, action locale)
2) indépendamment de la localisation de leurs gènes cibles (en trans, action distale)
Ce contrôle peut avoir un impact positif ou négatif sur l’expression des gènes cibles

Question 24

Mécanismes d’action des lncRNA

Answer 24

Dirigent des modificateurs de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques
Déplacent des régulateurs de l’expression (activateurs ou répresseurs) des séquences régulatrices de l’expression
Entrent en compétition avec des miRNA et protègent des ARNm de la dégradation par ces miRNA (fonction éponge)
Modulent des évènements d’épissageet interfèrent avec la traduction
Promeuvent l’association des facteurs à des séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription