ARNsb+ Flashcards
(33 cards)
Nommer les hôtes des Coronaviridae
Oiseaux
Mammifères
Nommer les hôtes des Retroviridae
Infectent tous les vertébrés
Nommer les hôtes des Picornaviridae
Pathogène important pour les humains et les animaux
Décrire la structure des Coronaviridae
Capside hélicoidale d’une seule protéine enveloppée par une membrane sphérique recouverte de spicule
118 à 136 nm
Décrire la structure des Retroviridae
Virion sphérique de 100 nm de diamètre
Enveloppé
Décrire la structure des Picornaviridae
Pico pour petit
Non enveloppé (donc résistant au faible pH)
Capside qui fait des canyons à cause des tétramères de VP1, VP2, VP3 VP4.
Quelles sont les protéines principales retrouvée dans Coronaviridae ? (Et nommer ou elles sont)
1A et 1B (Polymérase)
HE, S, M et E (Surface)
N (Nucléocapside)
Quelles sont les protéines principales retrouvées dans les Rétroviridae ? (Et nommer ou elles sont)
NC (Ribonucléocapside)
CA et MA (Capside)
TM (lie la capside à l’enveloppe)
SU (Surface)
PR, IN et RT (Protéase, intégrase et rétrotranscriptase)
Quelles sont les protéines principales retrouvées dans les Picornaviridae ? (Et nommer ou elles sont)
VP1, VP2, VP3 et VP4 (Capside)
VPg lié de façon covalente en 5’ du génome
3C et 3D (polymérase)
2C et 3AB (Vésicules de réplication)
L (Protéase)
Nommer la structure du génome des coronaviridae
ARNsb+
Coiffe 5’ et une queue poly-A en 3’
Plus grand génome de tous les virus à ARN
Nommer la structure du génome des Rétroviridae
ARNsb+ mais PRÉSENT EN DEUX COPIES dans le virus
Génome est apparié à deux ARNt volés à l’ancienne cellule hôte (servent d’amorces)
Il est considéré comme pseudo-diploide car le génome est présent en deux copies identiques. Recombinaison très importante.
Dans les Rétroviridae, à quoi sert les séquences non codantes en 5’ et 3’ ?
5’ : Intégration du génome
3’ : Régulation
Décrire la structure du génome des Picornaviridae
ARNsb+
7 à 8.8 kb avec un seul ORF pour tous le génome.
Région 3’ : régulation de la réplication du génome.
Région 5’ non codante : Contient bcp de structures secondaires conservées (IRES) et beaucoup de réplication
Comment se fait l’attachement des coronaviridae à la cellule hôte ?
Se lie par un récepteur de surface avec ses protéines S
Comment se fait l’attachement des rétroviridae à la cellule hôte?
Liaison des protéines SU au récepteur cellulaire.
Comment se fait l’attachement des picornaviridae à la cellule hôte?
Motif de surface de la capside lie le récepteur cellulaire, qui est souvent des immunoglobulines (CD155 pour le Poliovirus)
Comment se fait l’entrée du corona dans l’hôte?
Fusion de l’enveloppe et de la membrane de l’endosome grâce au pH faible de l’endosome.
La nucléocapside est libérée dans le cytoplasme.
Comment se fait l’entrée du Rétroviridae dans l’hôte ?
Pénétration du virus par endocytose.
Clivage de la couche externe par les protéases de l’endosome grâce au core d’entrer dans le cytoplasme.
Comment se fait l’entrée des picorna dans l’hôte ?
Virus entre par endocytose et le faible pH avec l’attachement du virus (changement de conformation) libère le génome dans le cytoplasme.
Décrire la réplication, en bref, des corona.
Traduction directe du génome pour produire les polyprotéines 1A et 1B (mécanique de ribosomal frameshifting sur le pseudonoeud pour changer de ORF)
Les polyprotéines sont clivées pour produire la polymérase ARN (capable de relecture) et créer les vésicules pour répliquer le génome.
La synthèse d’ARNv produit des ARNsg qui contiennent tous une séquence leader et un gène en moins que le précédent.
Décrire la réplication en bref des Rétroviridae.
Rétrotranscription du génome d’ARNv (besoin de deux copies). La RT utilise ARNt comme amorce pour débuter le processus.
1. Synthèse d’ADN strong-stop négatif qi prolonge l’ARNt pour effectuer le premier échange de gabarit.
2. Synthèse complète du brin - puis synthèse de l’ADN strong-stop au niveau du site PBS ou se trouve l’ARNt.
3. Deuxième échange de gabarit pour synthétiser complètement le brin + en suivant le brin - comme gabarit. La molécule d’ADN db est intégrée au génome.
Décrire, en bref, la réplication des picorna
VPg sert d’amorce pour débuter la réplication du génome. La polymérase va répliquer le génome dans les vésicules doubles construites à partir du RE et du Golgi par les protéines 2C et 3AB.
Le brin - est d’abord produit pour servir de gabarit.
Le brin + est finalement produit en très grande qté (50000 + par brin-).
Polymérase clive les protéines qui stimulent la traduction pour s’assurer que la réplication et la traduction n’aient pas lieu en même temps.
Comment se fait la traduction/production des protéines chez les coronaviridae?
Les ARNsg servent à produire les protéines.
Les ARNm codant pour des protéines de surface sont traduits dans le RE pour être exprimées dans la membrane.
Comment se fait la traduction/production des protéines chez les Rétroviridae?
Le génome intégré est transcrit par l’ARNpol de la cellule hôte.
Une partie des transcrits servent de copie du génome et l’autre sert d’ARNm.
Les protéines d’enveloppe sont traduites dans le RE et les autres (Comme RT ou PR) dans le cytoplasme.
