BİYOLOJİ 1 Flashcards
(203 cards)
1
Q
Bazlar …. içeren halkasal moleküllerdir.
A
Nitrojen
2
Q
Bazlar birbirleri arasında hangi bağı yapar?
A
Hidrojen
3
Q
Bazların geçirdiği kimyasal reaksiyonlar neler?
A
Deaminasyon, Depürinasyon, Metilasyon
4
Q
Deaminasyona uğrayabile bazlar hangileridir?
A
Adenin Guanin ve citozin
5
Q
Deaminasyona uğramış sitozin molekülüne ne ad verilir ?
A
Urasil
6
Q
Timin neden deaminasyona uğramaz ?
A
Amino grubu içermediği için.
7
Q
Bazlarda en sık rastlanan reaksiyonlar nelerdir?
A
Deaminasyon ve depürinasyon
8
Q
Deaminasyon ve depürinasyon neye neden olur?
A
Ciddi DNA Hasarı
9
Q
Gen ekspresyon kontrolünde metilasyon geçiren baz hangisidir?
A
Sitozin %3 kadarı
10
Q
5 metil sitozin deamine olursa neye dönüşür?
A
Timin
11
Q
Baz+şeker yapısına ne ad verilir?
A
Nükleozid
12
Q
Baz+şeker+fosfat yapısına ne ad verilir?
A
Nükleotid
13
Q
N Glikozidik bağ nasıl kurulur?
A
Pirimidin 1 nolu N ,pürin ise 9 nolu N den şekerin 1 C atomuna bağlanır.
14
Q
Fosfat grubu şeker kaçıncı karbondan bağlanır?
A
- C daki OH grubuna bağlanır. Nükleotidi negatif hale getirir.
15
Q
DNA nın monomer yapısını ne oluşturur?
A
Deoksi Ribo Nükleotidler
16
Q
Nükleotidler birbirine hangi bağ ile bağlanır aynı zincir üzerinde?
A
Fosfodiester bağı
17
Q
Fosfodiester bağının kurulması için gereken enerji nereden elde edilir?
A
Fosfat gruplarının bağlanma öncesi kopmasından.
3 fosfattan 2 sinin ayrılmasıyla 3.7 kj enerji çıkar.
18
Q
DNA zincirinin 5 ucunda ve 3 ucunda sırasıyla hangi yapılar vardır?
A
5 ucunda fosfat
3 ucunda oh grubu
19
Q
Fosfodiester bağı hangi yapılar arası kurulur?
A
3 oh ve 5p arasında kurulur
20
Q
Baz DNA’ya hangi ucundan bağlanır ?
A
3’
21
Q
DNA …. yapıdadır. …. polaritede yerleşmiş iki komplementer iplikten oluşmuştur.
A
Antiparalel , ters
22
Q
Çift sarmal modelini kim tanımladı?
A
Watson ve crick
23
Q
İki DNA ipliği arası uzaklık ne kadardır?
A
20A
24
Q
Adeninin timine oranının veya guaninin sitozine oranının her zaman 1 e eşit olmasına hangi ad verilir?
A
Chargaff kuralı
25
B-DNA özellikleri nelerdir?
Sağa dönümlü
Çap 19A
Her dönüm 10 baz çifti
Büyük ve küçük oluklar var
26
Canlılarda en baskın olan DNA formu nedir?
B-DNA
27
A-DNA özellikleri nelerdir?
Sağa dönüm
Komşu bazlar arası 2.7A
Çap 23A
RNA’nın çift iplikli kısmı ve DNA-RNA Çift sarmalları biçimde
B’ya göre daha kısa ancak daha geniş çaplı
Her dönüm 11 baz çifti
28
RNA Çift sarmalı ve DNA-RNA sarmalında bulunan DNA tipi hangisidir?
A-RNA
29
C-DNA nedir?
Sağa dönümlü
9.33 baz çifti her dönümde
Çapı 19A
Hakkında henüz kanıt yok
30
Z-DNA özellikleri nedir?
Sola dönümlü
Dönüm boyu 45.6A
Her dönüm 12 baz çifti
En dar çaplı olan 18A
Tek çeşit oluklu
Şeker fosfat omurgası zikzak şeklinde
Pürin ve pirimidinlerin birbirini izlediği in vitro ortamlarda gözleniyor.
31
Nükleotidleri fosfoanhidrid bağı taşıması neye neden olur?
ATP ve GTP gibi enerji kaynağı olarak kullanılmasına
32
nükleotidler koenzim yapısına katılırmı?
Evet
33
Hücre içi sinyal iletiminde rol oynayan nükleotid hangisidir?
cAMP
34
DNA molekülü hangi aşamada kromozom görüntüsü alır?
Metafaz
35
DNA bilgisinin ikiye katlanmasına ne ad verilir?
DNA Replikasyonu
36
Ökaryotik hücrelerde DNA Replikasyonu hücre döngüsünün hangi fazına gerçekleşir?
S
37
Konservatif eşlenme modeli nedir?
Bir atasal iplikten yeni dna sentezlenir atasal dna tamamen korunur.
38
Yarı konservatif (maselson stahlo modeli nedir)?
Yeni sarmal 1 atasal 1 yeni iplikten oluşur
39
Dispersiv model nedir?
Atasal iplik yeni sentezlenen molekül içinde dağılmış halde bulunur.
40
Günümüzde kabul edilen DNA replikasyonu modeli hangisidir?
Yarı korunumlu model yani atasal DNA’nın ve yeni sentezlenen DNA’nın bir arada bulunduğu sistem.
41
Replikasyon nerede ve nasıl gerçekleşir?
Replikasyon çatalında iki iplikte de aynı anda gerçekleşir.
42
Replikasyon süreci tüm canlılarda nasıldır?
1 Başlangıç noktasının tespiti
2 DNA’nın bu noktadan açılması
3 Replikasyon çatalının oluşması ve replikasyon
43
Replikasyonun gerçekleştiği genom birimine ne ad verilir?
Replikon, her zaman başlangıç ve bitiş noktası vardır.
44
Replikasyon başlangıç noktasına ne ad verilir?
Replikasyon orjini.
45
Replikasyon orjininde hangi bazlar yoğun görülür?
AT ce zengin çünkü çift bağ daha zayıf.
prokaryotlarda tek bir orjin
ökaryotlarda birden fazla orjin
46
İnsan ve e coli replikasyonu tek orjinden başlasaydı ne kadar sürerdi?
insan 4-5 hafta
e coli 40 dakika
bu nedenle insanda yaklaşık 30.000 replikasyon orjini vardır.
47
Replikasyon ….. orjinde her iki çatal yönünde …. primerler kullanılarak yürütülebilir.
tek , farklı
48
Orjin tanıma kompleksinin kısaltması nedir ve hangi evrede görev alır?
ORC, G1
ORC Cdc6 ve Cdt1’ den oluşur
49
DNA hangi zinciri kalıp olarak kullanır ve işleme hangi yönlü olur?
3’ 5’ ipliği kalıp olur 5’ 3’ yönünde sentez gerçekleşir.
50
Replikasyon çatalnın açılma yönünde ilerleyen ipliğe …….. zıttı yönde ilerleyene …… denir.
leading(kesintisiz), lagging(kesintili)
51
Okazaki fragmentleri neye verilen addır?
Lagging strend parçalarına verilen addır.
52
Replikasyonda görevli proteinlerden DNA polimeraz prokaryot ve ökaryotlarda nasıl isimlendirilir?
prokaryot. 1 2 3 4 5
ökaryot alpha beta gama delta epsilon
53
gama DNA polimeraz(y) nerede bulunur?
Mitokondri içerisinde bulunu
54
alpha delta ve epsilon ve gama DNA polimeraz hangi görevi yapar
sentezden sorumludur bölünen hücrelerden elde edildi.
55
B DNA polimerazın görevi nedir ?
Onarımdan sorumludur. Hem bölünen hem bölünmeyen hücrelerden izole edilmiştir
56
Prokaryotlarda 1 2 3 4 5 DNA polimeraz görevleri nedir
1245 tamir
3 replkasyon
1 ekzonukleas aktivitesi 5’ 3’ sentez 3’ 5’ ekzonukleaz
57
Uzayan zincirin 3’ yani OH ucuna dNTP ekleyen ezim hangisidir?
DNA polimeraz. 5’ , 3’ yönünde sentezi sağlar.
58
DNA polimerazın sentez yönünün zıt yönde aktivitesine ne ad verilir?
Ekzonükleaz aktivitesi
59
Ekzonükleaz aktivitesi nedir?
DNA polimerazın hatalı bazı çıkarıp düzeltemesi aktivitesidir.
60
Ekzonükleaz aktivitesinin yaptığı işlemin adı nedir?
Ekzonükleotik proofreading
61
DNA polimerazın parçalarına ne ad verilir?
P ve E polimeryzing ve editing
62
Hem kesintili hem kesintisiz ipliği, DNA polimeraz aynı anda sentezleyebilir mi ?
Evet. Kesintili iplik loop yapısı oluşturarak bu olayın oluşmasını sağlar.
63
DNA polimerazın çalışması için RNA öncülü hangi enzim sentezler ?
Primaz
64
Primaz enziminin yapısı nasıldır?
Başka proteinlerin de bulunduğu kompleks bir yapıdır. Buna primazom kompleksi adı verilir.
65
Yalnızca DNA polimerazın varlığında çalışan enzim hangisidir?
Primaz DNA polimeraza 3 oh ucu sağlar ilk iki ribonükleotidin bağlanmasıyla birlikte
66
Ökaryotlarda primaz aktivitesi nasıldır hangi DNA polimeraz ile birlikte çalışır?
DNA pol. a ile birlikte çalışır. ilk 10 nükleotidi sentezler sonra pol a 20 30 tane daha sentezler. Primer oluşur. Ve DNA pol delta ve epsilon senteze devam eder.
67
Lagging strand’te RNA primer sentezi ne zaman gerçekleşir ve uzunluğu ne kadardır?
200 nükleotidde 1 sentez gerçekleşir. Uzunluğu 10 nükleotid kadardır.
68
Lagging strandte yer alan RNA öncülleri hangi enzim yardımıyla kesilir?
RNaz H uzaklaştırmadan sorumludur.
69
Sliding clamp ve clamp loader ne işe yarar ?
DNA’ ya bağlı ATPaz aktivitesi ile sentez sırasında polimerazın zincir üzerinde ilerlemisini sağlar .
70
Tek iplikli dna ‘ ya bağlanıp sentez sırasında kalıp ipliğin yapısını koruyan ve yapıyı almasını sağlayan protein nedir?
SSBP (Single strand binding protein)
71
Replikasyon için hazır halde bulunan DNA kısımlarına ne ad verilir?
Hair pin katlanmaları
72
Helikazın görevi nedir?
Helikaz DNA ipliğini sentez yönünde açan enzimdir.
Hekzamerik ring yapısındadır.
73
Hekzamerik ring yapısında olan enzim hangisidir?
DNA helikaz.
74
Helikaz aktivitesi sırasında ATP kullanılır mı ?
Evet
75
DNA Topoizomerazın görevi nedir?
DNA sarmalarındaki dönme kısımlarını coilleri açar. Dönüşsel zorlanma da denilir.
76
E. Coli’ de dna topoizomerazın adı nedir?
DNA gyraz
77
DNA topoizomeraz ve helikaz işlemleri sırasında ATP kullanır mı ?
Evet
78
Katlanmış DNA bölgelerini reversible olarak kesen ve fosfodiester bağlarını ortadan kaldıran yapı hangisidir?
DNA topoizomeraz
79
DNA topoizomerazın alt birimleri nasıl adlandırılır?
1 ve 2 olarak adlandırılır
80
Aktif bölgesinde tirozin bulunduran topoizomeraz hangisidir?
1
81
Tip 1…….. dna zincirindeki bazın fosfatına ……… bağlanır böylece ……… bağı ortadan kalkar. Kırılma sonucu DNA dönerek açılır.
Kopma sonucunda ortaya çıkan bağ enerjisi …….. residüsünde saklanır. Bu enerji fosfodiester bağının tekrar kurulmasında kullanılır.
Topoizomeraz, kovalent, fosfodiester , fosfotirozin
82
Duble heliks yapısında görev alan topoizomeraz hangisidir?
Tip 2
83
Tip 2 topoizomeraz ……………..’yı açar ve birinin diğeri içerisinden geçmesini sağlar.
DNA duble heliks
84
DNA polimerazın sentez sırasında bıraktığı boşlukları hangi enzim doldurur ?
DNA Ligaz, kesikli zincirin tamamlanmasını sağlar.
85
Histonlar hangi fazda üretilir ?
S fazında üretilir
86
DNA’yı kromatin haline getiren protein hanigisdir?
Histon
87
S fazında aynı kromozomun farklı bölgeleri …. zamanlarda replike olur
farklı
88
heterokramin … s fazında ökramatin ise …. s fazında replike olur
geç , erken
89
H ve L olarak iki farklı boz kompozisyonuna sahip olan DNA kime aittir ?
Mitokondri
90
Mitokondri DNA’sı …… yapıdadır
Çembersel
91
H yapısında …… L yapısında ……. fazladır.
guanin, sitozin
92
H ipliğinin L’yi kalıp olarak kullanarak sentezlediği DNA’nın adı nedir? Ve boyutu nedir?
7S’lik dnadır. CR/D Loop olarak adlandırılır. L’nin yerini h Alır ve sentez bitirilri.
93
Mitokondriyal DNA’nın uzunluğu ne kadardır?
16.6 KB
94
Transkripsiyonda ilk adım nedir?
Primer RNA transkriptinin sentezi.
95
Transkripsiyonda uçlara ne eklenir ?
5’ ucuna cap 3’ ucuna ise ployadenin
96
5’ ucuna cap 3’ ucuna polyadenin eklenen yapının sonraki adımda yaşayacağı işlem nedir?
Splicing sonucu mrna oluşumu. Ve stoplazmaya geçiş.
97
98
Ribonükleotidlerin fosfodiester bağları ile bir araya geldiğiyapıya ne ad verilir?
Ribonükleik asit RNA
99
RNA ‘ da timin yerine bulunan bazın adı nedir?
Urasil
100
Ökaryotik ve prokaryotik Rna sentezi hangi enzim aracılığı ile sağlanır?
Rna polimeraz tarafından sağlanır. DNA’ yı kalıp olarak kullanır.
101
Prokaryotik RNA Polimeraz alt birimlerinin adı nedir?
a2 B’ B o w
102
Delta diğer alt birimlere …… şekilde bağlıdır ?
gevşek bağlıdır. Sentez başladıktan sonra yapıdan ayırılır.
103
Prokaryotik RNA polimerazın katalitik core kısmını hangileri oluşturur?
a2 B’ B w
104
Prokaryotik RNA polimerazın delta alt birimi nasıl hareket eder ?
Zincir üzerinde kayarak hareket eder .
Başlama noktasını bulur (Promatör bölge)
105
RNA pol
106
Prokaryotik RNA polimeraz hangi yönde görev yapar?
İstisnai durumlar hariç 5’ 3’ yönünde sentez yapar.
107
RNA polimeraz hangi yapıya sentez için ihtiyaç duymaz ?
Primer yani öncül moleküle
108
Prokaryotik RNA polimerazın bölümleri nelerdir?
a başlama
b başlama ve uzama
b’ bağlanma dnaya
o sigma promotor bölge tanıma
w bilinmiyor
109
Ökaryotik RNA polimeraz kaç çeşittir ve özellikleri nelerdir?
RNA pol 1 5.8 18 28 s sentezi
pol2 protein kodlayan gen transkripsiyonu 12 alt birim
pol3 trna snrna rrna 5s sentezi
110
Mitokondri ve kloroplastın rna polimerazları ….. lara benzer kendilerine aittir.
prokaryotlara
111
………… RNA polimeraz iki dna zincirini de kalıp olarak kullanabilir?
Ökaryot
112
E Coli kromozumunda birden fazla gen aynı anda RNA sentezina kalıp olabilir mi?
Evet
113
RNA polimeraz DNA polimeraza göre daha ……’dır
Yavaş. Ancak sayıca daha fazladır.
114
RNA polimerazın hata oranı DNA polimeraza göre daha …….’ dır. Bunun nedeni ………. dır
Yüksektir. 3’ 5’ yönünde ekzonükleotik proofreading olmamasıdır.
115
Türler arasında sekans homolojisi gösteren yapı hangisidir?
Promotor diziler.
Ökaryotlar -25’ te tata denilen benzer dizi mevcuttur. Ayrıca enhancer denilen diziler de yer alır.
116
Promotor grup mutasyona uğrarsa transkripsiyon ……..
Gerçekleşmez.
117
Rna polimeraz nereye yerleşir dna üzerinde?
-40 ile +20 arasında 60 bp lik alana.
118
RNA’ yı dna üzerine bağlşayan eve afiniteyi arttıran alt birim hangisidir?
Sigma alt birimi olmadan düşük afinitede bağlanır.
119
Transkripsiyon kontrolü için ana basamak hangisidir?
Başlangıç
farklı sigmalar farklı alt birimleri tanıyarak başlatır.
120
RNA sentezi genellikle hangi bazlarla başlar ?
Pürinler
121
Prokaryotik transkripsiyonda sigma alt birim nereye bağlanır?
-35 -10 bölgelerine bağlanır.
122
prokaryotik rna sentezinde Sigma alt birimi ayrıldıktan sonra uzama devam eder mi?
Evet
123
ökaryotlarda yer alan pol2 kendiliğinden rna sentezi başlatabilir mi?
Hayır, başka proteinlere ihtiyaç duyar.
124
Pol2’ nin gereksinim duyduğu proteinlere transkripsiyon faktörleri denir ve 2 gruba ayrılır bunlar ?
A genel transkripsiyon faktörleri : transkripsiyonun başlması ve sürmesini sağlar
B spesifik transkripsiyon faktörleri: Gen ekspresyonunu düzenler.
125
A genel transkripsiyon faktörleri : transkripsiyonun başlması ve sürmesini sağlar
126
İnsan genomunun ….. lık kısmı transkripsiyon faktörlerini kodlar .
%10
127
Ökaryotik rna pol2 ‘ nin görevine yardımcı olan genel transkripsiyon faktörlerine ne ad verilir?
TF2a b c diye devam ediyor RNa sentezinin başlamasını sağlar.
128
Prokaryotlardaki sigma alt biriminin görevini ökaryotlarda pol2 için hangi proteinler yapar ?
TF2
129
ökaryotik rna pol2 ‘nin tanıdığı ortak diziler hangileri
BRE(-35) TATA(-30) INR(Başlangıç) DPE(+30)
130
131
wow
132
TBP kimin alt birimidr ve ilk adımı oluşturarak tata kompleksine bağlanır?
TF2D. Birleşme ile promotor kompleks oluşur.
133
TBP ye 2. aşamada hangi tf bağlanır?
TF2B.
134
3. RNA polimeraz hangi tf ile birlikte promotora bağlanır ?
TF2F
135
RNA polimerazın TF2F ile dna ya bağlanmasının ardından bağlanan tfler hangileridir?
TF2E ve TF2H
136
Fosforillenerek rna polimerazın yapısını değiştiren faktör hangisidir?
TF2H. Ardından diğer faktörler yapıdan ayrılır rna uzaması devam eder.
137
Ökaryotik transkripsiyon hangi yollar ile sonlanır?
RHo bağımlı sonlandırma RNA ya bağlanır ve helikaz gibi DNA ve RNA’yı ayırır Buna faktöre bağımlı sonlandırma denir.
Sentezlenen Rnanın uç bölümlerinde tekrar dizileri kendi arasında eşlenerek hair pin yapısını oluştur Bu bölgede işlev durur.
Buna faktör bağımsız sonlanma denir.
138
Transkripsiyon sırasında 5 ucuna cap 3 ucuna polyadenin bağlanması hangi sınıfa ait özelliklerdendir?
Ökaryotik rna sentezi
139
CTD carboksi terminal domain hangi yapıda bulunur?
Rna pol 2
140
Ökaryotik rna sentezinde 5 ucuna cap ‘i hangi yapı takar?
CTD
141
5’ ucuna cap kuyruğu takan CTD Rna ‘ ya nasıl bir fayda sağlamış olur?
RNA stabilizasyonu sağlar
142
CTD’ nin rna nın 5 ucuna eklediği cap yapısında hangi molekül yer alır?
7 metil guanozin
143
CTD sentez sonlanınca hangi molekülü zincirin sonuna yerleştirir?
Polia 200 nükleotitten oluşan adenin grunu
144
Pre m rna splicingde intron ….. 5 ucundaki fosfat bağlarını kırar. Ardından …… kovalent bağlanarak loop oluşturur. Oluşan bu yapı, 3’ ucunda …… ile sonlanır
A, intron a, oh
145
Alternatif splicing nedir?
Aynı genden farklı proteinler sentezlenmesini sağlayan mekanizmaya verilen addır.
146
Aynı genden farklı mRNA sentezlenebilmesine olanak sağlayan mekanizmaya ne ad verilir?
Alternative splicing
147
Splicing sırasında oluşan hatalar A ……….. ve B ………. olarak ikiye ayrılır. Hatalı oluşan mrna’ lar ……. içerisinde degrade edilir.
Exon atlanması ve cripting splicing sinyal seçilimi. Exozom
148
Sentezlenen mRNA çekirdekten nasıl çıkar ?
Nükleer porlardan aktif taşıma aracılığı ile çıkar.
149
Nükleer eksport reseptörü zarı tanır cbc ( cap binding protein) dışarı doğru mrnayı taşır dışarıda cbc ayrılır.
Hücre zarından dışarı taşınma.
150
Gen kontrol proteinleri (enhancer ) bağlandığında ne olur?
Regulator sekanslara bağlanırlar, transkripsiyon başlama hızını etkilerler, ileri yöndek intronlarda veya promotora komşu bölgelerde bulunabilirler. Bunun sayesinde uzak bölgelerdeki gen ekspresyonu kontrol edilir. Ayrıca bu yapı gen ekspresyonunu arttırıcı niteliktedir.
151
Transkripsiyon faktörlerine koakvitatör ve korepressörün görevi nedir?
koaktivatör transkripsyonu başlatırken, korepressör bağlanması durdurur.
Farklı koaktivatörler aynı genin transkripsyonunda görev alabilir.
152
Kodon nedir?
mRNA üzerinde bir aa kodlamak için üç nükleottidden oluşan birim.
153
İnsan genomu kaç kodon içerir?
toplam 64 kodon 20 aminot asit kodlar 3 tanesi stop kodondur
154
Stop kodonları hangileridir?
UAA, UGA , UAG
155
Kodonların okunup proteinlere dönüşümünü sağlayan yapı nedir?
tRNA ‘ daki antikodon yapısıdır.
156
Bir m rnanın okunmasına göre ….. farklı aa sentezlenebilir. Her bir okuma şekline ….. ……. ddenir. Gerçekte yalnızca …. adet vardır
3, frame shif, 1
157
5 ucunda g 3 ucunda cca bulunan 73-93 nükleotitten oluşan yapıya ne ad verilir ?
tRNA
158
tRNA’ nın hangi ucuna aa bağlanır?
3
159
tRNA2 Nın halkasal yapısının sebebi nedir?
Yapısındaki bazlar.
160
İnsanlarda kaç gen tRNA kodlar ?
500
161
tRNA’ lar nerede kovalent modifikasyonlara uğrarlar ?
Nükleustan çıkmadan önce
162
tRNA hangi rna pol tarafından sentezlenir?
RNA pol 3
163
tRNA sentezinde önce …… trna sentezlenir daha sonra …. trna ya dönüşür. ……. reaksiyonları mrnalar dan farklı olup proteinler tarafından katalizlenen ….. …….. mekanizması kullanılır.
Prekürsör, matür, splicing , kes yapıştır
164
tRNA sentezinde görev alan kes yapıştır mekanizması hangi şartta çalışır?
Prekürsor trnanın doğru sentezlenip yonca formunu aldığı durumda .
165
tRNA ‘ yı intronik bölgesen kesen enzim ……….. dır . Açık iki tRNa ucunu birleştiren enzim ise ………. dır.
tRNA splicing endonükleaz ( 4 alt birim), multifonksiyonel tRNA ligaz
166
AA. lerin tRNA ‘ yı tanıması ve ona bağlanması hangi enzim tarafından gerçekleşir?
aminoaçil tRNA sentetaz enzimi
167
aminoaçil t rna sentetaz enzimi nasıl aa. t rna ‘ ya bağlar
1. basamakta atp ile aa yı bağlar doğrudan aa.’din karboksil ucuna (adenylated aa.)
2. basamak tRNA’ nın 3’ ucuna ekleme yapar
3. basamak aminoaçilin karboksil ucu, tRNA’ nın 3’ oh ucundaki riboza fosfodiester ile bağlanır.
168
tRNA’ ile aa. birleşirken tRNA’ nın 3’ oh ucundaki …… ile aa.’ in …….. ucu arasında …… bağı kurulur.
Riboz(oh) ile karboksil , fosfodiester
169
tRNA sentetazın temel görevleri nelerdir?
Doğru aa seçmesi ve aa ile amp arasında kovalent bağ kurması
Bu yapıyı trnaya transfer etmesi
170
tRNA Sentetazın doğru aa’ i doğru tRna ‘ ya taşıması dna polimerazın ….. özelliğine benzer.
Editing
171
tRNA sentetaz enzimi kaç kısımdan oluşur ve bunlar nelerdir?
2 kısımdan oluşur. Sentez ve editing bölgeleridir.
172
Aa. tRNA sentetazın sentez bölgesine …… afinite ile bağlanır. hatalı ise editing kısmına yönlendirili ve burada amp ya da trna’dan ayrılması ……… enzimler aracılığı ile sağlanır.
Yüksek, hidrolitik
173
tRNA tarafından taşınan aa lar sentezlenen proteinin hangi ucuna bağlanır?
Karboksil
174
Ribozom üzerinde kaç adet bağlanma bölgesi vardır ve görevleri nelerdir?
Mrna bağlanan bölge
a tRNA aa. in geldiği yer
p zincirin peptit bağlarının kurulduğu yer
e tRNa çıkış bölgesi
175
Ribozom mRNA’ yı hangi bölgeden bağlar?
Başlangıç kodonu
176
mRNA hangi doğrulta okunur?_
5’ - 3’. Ribozom mrna üzerinde 5’ 3’ yönünde hareket eder.
177
Ribozom proteini hani taraftan sentezlemeye başlar?
N ucundan C ucunda doğru
178
Translasyonun başlaması için gerekli faktörler nasıl çalışır?
mRNA’ daki başlatıcı aug’ u tanıyacak olan met-tRNAi küçük ribozomal alt birime eIF2 aracılığı ile bağlanır.
eIF4E ve eIF4G küçük ribozomal alt birimi mRNA’ ya bağlar.
179
eIF4E ve eIF4G ‘ nin görevi nedir?
Küçük ribozamal alt birimi mRNA’ ya bağlamak
180
Küçük alt birim mRNA’ ya bağlandıktan sonra. ne olur ?
eIF2 gibi başlatıcı faktörler yapıdan ayrılır metiyoninli t rna p bölgesine geçer ve ardından yapıya büyük subunit bağlanır.
181
Başlatıcı tRNA p bölgesinde bekledikten sonra ne olur?
aminoaçil trna a bölgesine gelir . Yeni gelen ile metiyonin arasında peptidiltransferaz aracılığı ile peptit bağı kurulur.
182
Translasyon süreci nasıl olur anlatınız
metiyonin içeren aktive tRNAi mRNA’ nın başlangıç kodonunu tanımak için tutunur. eIF2 aracılığı ile.
Daha sonra küçük ribozomal subuniti, mrna ya bağlamak için eIF4E ve eIF4G görev alır.
Büyük alt birimin bağlanması için eIF2 gibi faktörler ayrılır metiyonin p bölgesinde kalır.
aminoaçil tRNA A bölgesine gelir ve yeni aa ile metiyonun arasında peptidil transferaz ile peptit bağı kurulur.
A bölgesinde oluşan yeni yapı p ye kayar ve m rna ‘ da bir kodon kayar.
Daha sonra yeni aa. gelir ve yine aynı süreç devam eder
183
Peptit bağı hangi 2 yapı arasında kurulur?
1. aa. c grubu ile yeni gelen aa. in n grubu arasında
184
Peptit bağı kurulumunda görev alan enzim hangisidir?
Peptidil transferaz
185
mRNA üzerindeki stop kodonları nelerdir?
UAA UGA UAG,
186
UAA UGA UAG hangi faktör tarafından tanınır?
Releasing factor
187
RF’ nin görevi nedir? Yapısı nasıldır?
Polipeptiti son tRNA’ dan ayrılma reaksiyonunu katalizler
3D şekli nedeniyle tRNA’ taklit eder
188
Translasyonun doğruluğu ve uzaması, bakteride eftu ve ef g ile sağlanırken ökaryotta eEF1 ve eEF2 ile sağlanır bu yapılar doğru sentez için hangi moleküle ihtiyaç duyarlar ?
GTP hidrolizi olmadan yavaş ve yanlış sentez oluyor.
189
Prokaryottaki EFTU ‘ nun ökaryottaki karşlılığıının adı nedir ve görevi nedir?
eEF1
aaçil tranın ribozoma gelişi ve aa trna doğruluğunu kontrol eder
Kodon antikodon doğru eşlendiyse hemen GTP hidrolizi gerçekleşri
190
Ökaryotik mRNA’ lardan protein sentezi tek bir …….. üzerinden yürür . Birden çok ribozomun bağlanması ile oluşan yapıya ……. adı verilir.
Frame shift , polizom
191
Proteinlerin işlevsel hale geldiği katlanmalar ne zaman başlar ?
Ribozomda sentez devam ederken başlar, ayrıldıktan sonra tamamlanır.
192
Fonksiyonel bir protein oluşurken nasıl başlar*.
Şaperon bağlanır polipeptide
kovalent modifikasyonlar glikozillenme, fosforilenme gibi
alt üniteleri bağlanması ve kesilmeler.
193
194
Şaperonların protein katlanmasındaki görevi nedir? Oluşan yeni proteinin parçası haline gelirler mi ?
Proteinin parçası haline gelmezler, sadece katlanmayı kolaylaştırarak kataliz ederler.
Şaperon yokluğunda tamamen hatalı veya kısmen hatalı katklanmalar yaşanır. Proteinler kararsız hale gelir.
195
Şaperonlar protein yeni sentezlenen proteine …. ucundan bağlanır. ilk önce ………….. daha sonra katlanmayı kataliz eder.
Yapıyı stabilize eder
196
Proteinlerin stoplazmada gidecekleri organele güvenli yolculuğunu sağlayan ve stabilitesini sağlayan yapıya ne ad verilir?
Şaperon
197
Proteinlerin yüksek sıcaklıkta denatüre olması hangi yapı tarafından önlenir bu yapının özel bir adı var mıdırı?
Şaperonlar tarafından önlenir. Bu görevi yapan şaperonlara HSP (Heat shock protein) adı verilir. Hem korumayı, sıcaktan etkiklendiyse de düzeltilmesini sağlar. HSP 60 ve 70 iyi tanımlanmış şaperonlardır. ÖKARYOT VE PROKARYOTLARDA ORTAK
198
Sentezlenen proteinin hücre içi iletimini sinyal dizileri sağlar bunlar …….. da sentez devam ederken eklenir ………. enizimi tarafından işi bitince proteinden ayrılır
ribozomda, sinyal peptidaz
199
Proteine belirli yapıların katılmasıyla modifikasyonlar yaşanır bunlar nelerdir_?
Glikozillenme
Lipid eklenmesi (palmitiol, prenil, meristil?
Fosforillenme(serin tirozin veya treonin grubuna atp den p takılmasıdır, protein kinazlar tarafından yapılır p ayırılırken protein fosfatazlar görev alır.)
200
Hatalı proteinler hangi yolak ile ortadan kaldırılır ?
Proteaz yolağı
201
Protein kinaz ve protein fosfataz farkına değininiz?
Protein kinaz serin tirozin veya treonin aa. içeren gruba p eklerken protein fosfataz bu eklenen p ‘yi gruptan ayırır.
202
Translasyon kontrolü ferritin mekanizması nasıl çalışır?
Ferritin demir bağlayan bir proteindir . Ortamda demir varsa gen eksprese olur yoksa olmaz
203
Ferritin repressör mekanizması nasıl çalışır?
Ferritin kodlayan mRNA’nın ucunda IRE dizisi bulunur. Ortamda demir varsa IRE ucu açıktır ve sentez devam eder ancak ortamda demirin az olması durumunda IRE- BP salgılanır ve bu ucu kapatarak ferritin gen ekspresyonunu durdurur.
