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Biologie moléculaire > BM7 > Flashcards

BM7 Flashcards

1
Q

Quels sont les deux principales sources d’erreurs lors de la réplication?

A

1- Le manque de fidelité lors de la réplication

2-Lésions de la double hélice

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Q

Quels sont les conséquences des erreurs et des lésions?

A

1-Les séquences d’ADN sont en évolution permanente

2-Modification de l’ADN (inhibition des machinerie de transcription et de réplication)

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Q

Qu’est-ce qui arrive si la machinerie de transcription est altérée?

A

Incidence immédiate sur la cellule

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4
Q

Qu’est-ce qui arrive si la machinerie de RÉPLICATION est altérée?

A

Incidence sur les cellules filles

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5
Q

Afin d’éviter les conséquences négatives des mutation, que dois faire la cellule?

A

1-Examiner le génome

2-Restaurer la molécule originale avec fidélité

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6
Q

Nommer les erreurs de réplication:

A

1-Substitution

2-Insertion/délétion

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7
Q

Nommer les processus d’altération de l’ADN

A

1-hydrolyse
2-Alkylation, oxydation, radiation
3-Molécule analogue
4-Agent intercallant

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8
Q

Qu’est-ce que la substitution?

A

Changement d’une base pour une autre.

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9
Q

Quel est l’erreur de réplication la plus commune?

A

La substitution

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10
Q

Qu’est-ce que la transition?

A

substituer A pour T ou C pour G (vice-versa)

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11
Q

Qu’est ce que la transversion?

A

Substituer purine pour purimidine ou vice versa

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12
Q

Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle?

A

Mutation d’un seul nucléotide.

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13
Q

Qu’entraîne une délétion?

A

Décalage du cadre de lecture des codon. Cela aura une incidence sur la protéine finale.

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14
Q

Qu’entraine l’insertion?

A

La même chose que la délétion

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15
Q

Quels gène évoluent le plus vite? (microsatellite ou séquences codante)

A

Les microsatellites (10^-5 vs 10^-8)

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16
Q

Quel facteur influence la taux de mutation?

A

1-Les contrainte sélective des gènes

2-Leur facilité à être répliqué fidèlement

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17
Q

Qu’arrive-t-il si une erreur n’est pas réparer avec le prochain cycle de réplication?

A

Elle devient permanente

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18
Q

Que comprend le système de réparation MutS?

A

1 Dimère qui reconnais les distorsion dans l’ADN.

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19
Q

Comment MutS répare l’ADN?

A

1- MutS s’installe sur l’ADN distordue
2- Charge 2ATP = change de conformation (change aussi la conformation de la double hélice)
3- Hydrolyse un ATP pour recruter MutL
3-MutL active MutH
4-MutH fait une césure (insise le brin avec le méchant nucléotide)
5-Une hélicase (UvrD) sépare les deux brin de l’insision a MutS
6-Une exonucléase 5’-3’ digère
7-L’hydrolyse du 2ieme ATP permet probablement a MutS de se décrocher
8-ADN pol III synthetise le brin et ligase attache le 3’

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20
Q

Pourquoi MutS est-il capable de courber l’ADN ?

A

Car le mésapariment rend l’ADN plus flexible

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21
Q

Ou MutH effectue t-elle la césure?

A

à partir des séquences GATC non-méthylés

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22
Q

GATC revient tous les x paire de base

A

x=256

23
Q

Qu’est-ce qui méthyle les adénine?

A

Les méthylase DAM

24
Q

Vrai ou faux. La MutH fait seulement des incision en amont de MutS.

A

Faux.

25
Q

Quels les deux endonucléase qui digère l’ADN incisé dépendamment de l’orientation de la césure?

A

Exonuclase VII si 5-3

Exonucléase I si 3-5

26
Q

Qu’est-ce qui sert à marquer le brin néoformé sur l’ADN eucaryote?

A

Les pont phosphodiester manquant entre chaque fragment d’Okazaki

27
Q

Qu’est-ce que l’hydrolyse ?

A

Dégradation spontanée de l’ADN par hydrolyse

28
Q

Donner un exemple d’hydrolyse?

A

La désamination: C -> U, A-> hypoxantine(s’apparie avec C), G -> Xantine (s’apparie avec C mais avec 2 liaison W-C)
Dépurination

29
Q

POurquoi l’ADN n’a pas d’uracile?

A

Parce qu’un U provenant de la désamination d’un C serait difficile a détecter.

30
Q

Qu’est ce que la dépurination?

A

Hydrolyse de la liaison glycosidique= ntp sans base ( plus rare). Cela donne des base artificielle

31
Q

Quelle est la seule dépurination qui résulte en une base naturelle?

A

La désamination du 5-méthyl-cytosine = tyrosine

32
Q

Qu’est-ce que l’alkylation?

A

Des groupement éthyl ou méthyl sont transféré au site réactif des bases. G s’apparie avec T

33
Q

Qu’est-ce que l’oxydation?

A

Les radiation ionisante et des agents chimiques favorise l’attaque par des radicaux libres qu’elles génères. G peut s’apparier aussi bien avec C qu’avec A

34
Q

Qu’est-ce la radiation?

A

Rayon UV absorbé par les bases, = dimère de thymine qui empêche les liaisons W-C.

35
Q

Nommer deux technique utiliser en chimiothérapie et en radiothérapie?

A

Radiation ionisante , bléomycine

36
Q

Qu’entraîne les rayons X et les rayons gamma?

A

Des cassures double brin

37
Q

Que se passe-t-il lorsqu’on rencontre une molécule analogue aux bases?

A

Ils sont incorporé lors de la réplication mais s’apparient mal

38
Q

Qu’est-ce qu’un agent intercallant?

A

Une molécule plane qui s’Insère dans l’ADN. Elle peut causer une insertion si la polymérase y apparie un nucléotide ou une délétion si la polymérase glisse dessus

39
Q

Les dégradation de l’ADN peuvent être classé en deux type. Nommez les.

A

1- obstacle à la réplication (ex. dimère de T ou cassure double brin)
2-Altération de la séquence d’ADN (tout ce qui change bases)

40
Q

Quels sont les 4 type de réparation de l’ADN?

A

1-Enzyme inversant le processus
2-réparation par excision
3- réparation par recombinaison
4-polymérase trans-lésion

41
Q

Pourquoi les mécanisme de réparation doivent-il opéré avant la réplication?

A

Car apres la réplication, on perd l’erreur.

42
Q

Comment briser un dimère de T?

A

Avec la photolyase, elle utilise l’energie lumineuse pour briser le l’anneaux cyclobutane

43
Q

Comment peut-on enlever un méthyle de G?

A

La méthyltransférase le met sur son résidu cystéine (elle devient inutilisable = très couteux pour la c)

44
Q

Comment se fait l’excision des bases?

A

1-La glycosylase longe le sillon mineur a la recherche d’une distorsion dans la double hélice
2-la basse fautive est appé par la glycosylase
3- le lien glycosidique est est hydrolysé
4-le sucre sans base est retiré par une rx endonucléotique.

45
Q

Comment peut-on réparer l’ADN même après la réplication?

A

La glycosylase de sécurité retire le A apparié à l’oxoG et le remplace par C

46
Q

Comment se fait l’excision des nucléotides?

A

1) UvrA-UvrB BALAIE L’ADN
POUR IDENTIFIER UNE
UNE DÉFORMATION

 2) UvrA QUITTE LE COMPLEXE
 UvrA-UvrB ET UvrB OUVRE
 LOCALEMENT LA DOUBLE
 HÉLICE AUTOUR DE LA
 DÉFORMATION.

3) UvrB RECRUTE 2X UvrC
POUR FORMER UN COMPLEXE
UvrC-UvrB-UvrC

4) LES 2 UvrC EXCISENT UN
12-13 MÈRE COMPRENANT
LE NUCLÉOTIDE CAUSANT
LE MÉSAPARIEMENT

5) L’HÉLICASE UvrD EST ALORS
RECRUTÉE POUR RETIRER
LES 2 UvrC,

6) L’ADN POL I REMPLACE LE BRIN
 EXCISÉ ET LA LIGASE SYNTHÉTISE
 LE DERNIER PONT PHOSPHODIESTER
 APRÈS LE DERNIER NUCLÉOTIDE AJOUTÉ
 PAR L’ADN POL I .
47
Q

Chez l’humain, quel système est analogue à Uvr?

A

XPC-XPA-XPD

48
Q

Qu’a de particulier la réparation chez l,humain?

A

La réparation est couplé à la transcription

49
Q

Qu’est-ce que la synthèse de translésion?

A

ADN pol (UmuC et UmuD) qui polymérise l’ajout de nucléotide en face du site endommagé sans se soucier de l’ordre

50
Q

Qu’est-ce qu’un polymérase Y spécifique?

A

Un polymérase qui ajoute deux A lorsqu’elle rencontre un dimère de thymine.

51
Q

Qu’entraîne une cassure double brin pour la cellule?

A

Elle empeche la réplication et entraine la mort de la cellule

52
Q

Comment peut-on réparer un ADN cassé avant la réplication

A

Avec le système JENH

53
Q

Comment fonctionne JENH?

A

1-Ku70/80 stabilise les extrémité de l’ADN
2-Ku70/80 recrute AND-PK qui recrute artémis
3-Le complexe apparie les nucleotides simple brin et enleve les orphelins

Biologie moléculaire (8 decks)

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