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Biologie moléculaire > BM7 > Flashcards

BM7 Flashcards

(53 cards)

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1
Q

Quels sont les deux principales sources d’erreurs lors de la réplication?

A

1- Le manque de fidelité lors de la réplication

2-Lésions de la double hélice

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Q

Quels sont les conséquences des erreurs et des lésions?

A

1-Les séquences d’ADN sont en évolution permanente

2-Modification de l’ADN (inhibition des machinerie de transcription et de réplication)

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Q

Qu’est-ce qui arrive si la machinerie de transcription est altérée?

A

Incidence immédiate sur la cellule

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4
Q

Qu’est-ce qui arrive si la machinerie de RÉPLICATION est altérée?

A

Incidence sur les cellules filles

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5
Q

Afin d’éviter les conséquences négatives des mutation, que dois faire la cellule?

A

1-Examiner le génome

2-Restaurer la molécule originale avec fidélité

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6
Q

Nommer les erreurs de réplication:

A

1-Substitution

2-Insertion/délétion

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7
Q

Nommer les processus d’altération de l’ADN

A

1-hydrolyse
2-Alkylation, oxydation, radiation
3-Molécule analogue
4-Agent intercallant

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8
Q

Qu’est-ce que la substitution?

A

Changement d’une base pour une autre.

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9
Q

Quel est l’erreur de réplication la plus commune?

A

La substitution

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10
Q

Qu’est-ce que la transition?

A

substituer A pour T ou C pour G (vice-versa)

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11
Q

Qu’est ce que la transversion?

A

Substituer purine pour purimidine ou vice versa

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12
Q

Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle?

A

Mutation d’un seul nucléotide.

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13
Q

Qu’entraîne une délétion?

A

Décalage du cadre de lecture des codon. Cela aura une incidence sur la protéine finale.

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14
Q

Qu’entraine l’insertion?

A

La même chose que la délétion

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15
Q

Quels gène évoluent le plus vite? (microsatellite ou séquences codante)

A

Les microsatellites (10^-5 vs 10^-8)

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16
Q

Quel facteur influence la taux de mutation?

A

1-Les contrainte sélective des gènes

2-Leur facilité à être répliqué fidèlement

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17
Q

Qu’arrive-t-il si une erreur n’est pas réparer avec le prochain cycle de réplication?

A

Elle devient permanente

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18
Q

Que comprend le système de réparation MutS?

A

1 Dimère qui reconnais les distorsion dans l’ADN.

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19
Q

Comment MutS répare l’ADN?

A

1- MutS s’installe sur l’ADN distordue
2- Charge 2ATP = change de conformation (change aussi la conformation de la double hélice)
3- Hydrolyse un ATP pour recruter MutL
3-MutL active MutH
4-MutH fait une césure (insise le brin avec le méchant nucléotide)
5-Une hélicase (UvrD) sépare les deux brin de l’insision a MutS
6-Une exonucléase 5’-3’ digère
7-L’hydrolyse du 2ieme ATP permet probablement a MutS de se décrocher
8-ADN pol III synthetise le brin et ligase attache le 3’

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20
Q

Pourquoi MutS est-il capable de courber l’ADN ?

A

Car le mésapariment rend l’ADN plus flexible

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21
Q

Ou MutH effectue t-elle la césure?

A

à partir des séquences GATC non-méthylés

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22
Q

GATC revient tous les x paire de base

23
Q

Qu’est-ce qui méthyle les adénine?

Study These Flashcards
A

Les méthylase DAM

24
Q

Vrai ou faux. La MutH fait seulement des incision en amont de MutS.

25
Quels les deux endonucléase qui digère l'ADN incisé dépendamment de l'orientation de la césure?
Exonuclase VII si 5-3 | Exonucléase I si 3-5
26
Qu'est-ce qui sert à marquer le brin néoformé sur l'ADN eucaryote?
Les pont phosphodiester manquant entre chaque fragment d'Okazaki
27
Qu'est-ce que l'hydrolyse ?
Dégradation spontanée de l'ADN par hydrolyse
28
Donner un exemple d'hydrolyse?
La désamination: C -> U, A-> hypoxantine(s'apparie avec C), G -> Xantine (s'apparie avec C mais avec 2 liaison W-C) Dépurination
29
POurquoi l'ADN n'a pas d'uracile?
Parce qu'un U provenant de la désamination d'un C serait difficile a détecter.
30
Qu'est ce que la dépurination?
Hydrolyse de la liaison glycosidique= ntp sans base ( plus rare). Cela donne des base artificielle
31
Quelle est la seule dépurination qui résulte en une base naturelle?
La désamination du 5-méthyl-cytosine = tyrosine
32
Qu'est-ce que l'alkylation?
Des groupement éthyl ou méthyl sont transféré au site réactif des bases. G s'apparie avec T
33
Qu'est-ce que l'oxydation?
Les radiation ionisante et des agents chimiques favorise l'attaque par des radicaux libres qu'elles génères. G peut s'apparier aussi bien avec C qu'avec A
34
Qu'est-ce la radiation?
Rayon UV absorbé par les bases, = dimère de thymine qui empêche les liaisons W-C.
35
Nommer deux technique utiliser en chimiothérapie et en radiothérapie?
Radiation ionisante , bléomycine
36
Qu'entraîne les rayons X et les rayons gamma?
Des cassures double brin
37
Que se passe-t-il lorsqu'on rencontre une molécule analogue aux bases?
Ils sont incorporé lors de la réplication mais s'apparient mal
38
Qu'est-ce qu'un agent intercallant?
Une molécule plane qui s'Insère dans l'ADN. Elle peut causer une insertion si la polymérase y apparie un nucléotide ou une délétion si la polymérase glisse dessus
39
Les dégradation de l'ADN peuvent être classé en deux type. Nommez les.
1- obstacle à la réplication (ex. dimère de T ou cassure double brin) 2-Altération de la séquence d'ADN (tout ce qui change bases)
40
Quels sont les 4 type de réparation de l'ADN?
1-Enzyme inversant le processus 2-réparation par excision 3- réparation par recombinaison 4-polymérase trans-lésion
41
Pourquoi les mécanisme de réparation doivent-il opéré avant la réplication?
Car apres la réplication, on perd l'erreur.
42
Comment briser un dimère de T?
Avec la photolyase, elle utilise l'energie lumineuse pour briser le l'anneaux cyclobutane
43
Comment peut-on enlever un méthyle de G?
La méthyltransférase le met sur son résidu cystéine (elle devient inutilisable = très couteux pour la c)
44
Comment se fait l'excision des bases?
1-La glycosylase longe le sillon mineur a la recherche d'une distorsion dans la double hélice 2-la basse fautive est appé par la glycosylase 3- le lien glycosidique est est hydrolysé 4-le sucre sans base est retiré par une rx endonucléotique.
45
Comment peut-on réparer l'ADN même après la réplication?
La glycosylase de sécurité retire le A apparié à l'oxoG et le remplace par C
46
Comment se fait l'excision des nucléotides?
1) UvrA-UvrB BALAIE L’ADN POUR IDENTIFIER UNE UNE DÉFORMATION ``` 2) UvrA QUITTE LE COMPLEXE UvrA-UvrB ET UvrB OUVRE LOCALEMENT LA DOUBLE HÉLICE AUTOUR DE LA DÉFORMATION. ``` 3) UvrB RECRUTE 2X UvrC POUR FORMER UN COMPLEXE UvrC-UvrB-UvrC 4) LES 2 UvrC EXCISENT UN 12-13 MÈRE COMPRENANT LE NUCLÉOTIDE CAUSANT LE MÉSAPARIEMENT 5) L’HÉLICASE UvrD EST ALORS RECRUTÉE POUR RETIRER LES 2 UvrC, ``` 6) L’ADN POL I REMPLACE LE BRIN EXCISÉ ET LA LIGASE SYNTHÉTISE LE DERNIER PONT PHOSPHODIESTER APRÈS LE DERNIER NUCLÉOTIDE AJOUTÉ PAR L’ADN POL I . ```
47
Chez l'humain, quel système est analogue à Uvr?
XPC-XPA-XPD
48
Qu'a de particulier la réparation chez l,humain?
La réparation est couplé à la transcription
49
Qu'est-ce que la synthèse de translésion?
ADN pol (UmuC et UmuD) qui polymérise l'ajout de nucléotide en face du site endommagé sans se soucier de l'ordre
50
Qu'est-ce qu'un polymérase Y spécifique?
Un polymérase qui ajoute deux A lorsqu'elle rencontre un dimère de thymine.
51
Qu'entraîne une cassure double brin pour la cellule?
Elle empeche la réplication et entraine la mort de la cellule
52
Comment peut-on réparer un ADN cassé avant la réplication
Avec le système JENH
53
Comment fonctionne JENH?
1-Ku70/80 stabilise les extrémité de l'ADN 2-Ku70/80 recrute AND-PK qui recrute artémis 3-Le complexe apparie les nucleotides simple brin et enleve les orphelins

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