case spørgsmål Flashcards
(35 cards)
1
Q
- Vi har anvendt BLAST i undervisningen. Hvad er det?
A
- BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) er et program til at finde regioner af lokal lighed mellem sekvenser af nukleotider eller aminosyrer.
2
Q
- Hvad er forskellen på BLASTN og BLASTP?
A
- BLASTN sammenligner nukleotidsekvenser, mens BLASTP sammenligner proteinsekvenser.
3
Q
- Hvad er homologe proteiner?
A
- Homologe proteiner er proteiner, der deler en fælles evolutionær oprindelse, ofte identificeret ved sekvenslighed.
4
Q
- Hvad er konservativ og non-konservativ substituering i proteiner?
A
- Konservativ substituering indebærer ændringer, der bevarer den biokemiske funktion, mens non-konservativ substituering kan ændre proteinets funktion.
5
Q
- Hvad er divergent og convergent evolution?
A
- Divergent evolution er, når arter udvikler sig fra en fælles forfader og bliver mere forskellige, mens convergent evolution er, når ikke-relaterede arter udvikler lignende egenskaber.
6
Q
- Hvordan vurderes oftest, om proteiner er i familie med hinanden?
A
- Ofte vurderes homologe proteiner ved hjælp af sekvenslignende analyser og proteindomænsamling.
7
Q
- Hvad betyder insertions og deletions for evolutionen?
A
- Insertions og deletions kan føre til ændringer i proteinstruktur og funktion, hvilket kan påvirke evolutionære resultater.
8
Q
- Hvorfor er posttranslationelle modifikationer vigtige + giv et eksempel på en posttranslationel modifikation?
A
- Posttranslationelle modifikationer er vigtige, fordi de påvirker proteiners funktion; et eksempel er glykosylering.
9
Q
- Hvordan vil du få fat i en primær celle?
A
- En primær celle kan fås ved isolering af celler fra væv gennem enzymatisk nedbrydning eller mekanisk nedbrydning.
10
Q
- Hvad er en transformeret celle + giv et eksempel.
A
- En transformeret celle er en celle, der har gennemgået ændringer, der gør den kræftagtig; et eksempel er HeLa-celler.
11
Q
- Hvad er serum, og hvorfor bruges det til at dyrke celler?
A
- Serum indeholder næringsstoffer og vækstfaktorer, der er nødvendige for cellevækst.
12
Q
- Hvornår bruger man typisk planteceller?
A
- Planteceller anvendes typisk i bioteknologisk forskning og produktion af sekundære metabolitter.
13
Q
- Hvilken funktion har en elicitor?
A
- En elicitor er et signalmolekyle, der inducerer en immunrespons i planter.
14
Q
- Hvorfor kan det være specielt udfordrende at dyrke planteceller?
A
- Det kan være udfordrende at dyrke planteceller, fordi de ofte kræver specifikke vækstbetingelser og signaler.
15
Q
- Kan man hurtigst sekventere et genom vha. Sanger sekventering eller NGS?
A
- NGS (Next-Generation Sequencing) sekventerer et genom hurtigere end Sanger sekventering.
16
Q
- Får man mest data ved Sanger sekventering eller NGS?
A
- NGS giver generelt meget mere data end Sanger sekventering.
17
Q
- Hvad er epigenomisk sekventering?
A
- Epigenomisk sekventering kortlægger og analyserer de kemiske ændringer på DNA og histoner, der påvirker genaktivitet.
18
Q
- Hvad er exome sekventering?
A
- Exome sekventering fokuserer på at sekventere kun de kodende regioner af genomet.
19
Q
- Hvad er metagenomisk sekventering?
A
- Metagenomisk sekventering involverer gen-sekventering af DNA fra komplekse mikrobiologiske miljøer.
20
Q
- Hvad er TaqMan prober?
A
- TaqMan prober er specifikke oligonukleotider, der bruges til kvantitativ PCR til at detektere specifikke DNA-sekvenser.
21
Q
- Er der fordele og ulemper ved brug af interkalerende prober, fx baseret på SYBR Green?
A
- Interkalerende prober som SYBR Green kan være mindre specifikke, hvilket kan føre til falske positive; fordelene inkluderer lavere omkostninger og nemmere brug.
22
Q
- Sommetider hævdes LNA prober at være de bedste – hvorfor?
A
- LNA-prober (Locked Nucleic Acid) har højere stabilitet og bindingsspecificitet, hvilket gør dem effektive til analyse.
23
Q
- Nævn en fordel / ulempe ved at anvende E. coli som værtscelle.
A
- Fordel: Hurtig vækst; Ulempe: Manglende evne til at udføre posttranslational modifikationer.
24
Q
- Nævn en fordel / ulempe ved at anvende insektceller og baculovirus.
A
- Fordel: Er i stand til at udføre posttranslational modifikationer; Ulempe: Mere komplekst at dyrke og håndtere.
25
25. Giv eksempler på risikogrupper, når man arbejder med mikroorganismer i lab.
25. Risikogrupper omfatter patogene bakterier, virus, og svampe, klassificeret efter deres evne til at forårsage sygdom.
26
26. Hvad er l-repressorens rolle i l-phagen?
26. λ-repressor binder til operatoren i λ-phagen for at forhindre transkription af virulensgener i lysogen tilstand.
27
27. Hvad er quorum sensing?
27. Quorum sensing er en regulatorisk proces, hvor bakterier kommunikerer og koordinerer adfærd baseret på cellerne i nærheden.
28
28. Hvordan kan en attenuator regulere mængden af aminosyrer i en prokariot?
28. En attenuator kan regulere transkription ved at skabe en strukturel konformation, der stopper RNA-syntesen under bestemte forhold.
29
29. Hvordan kan kromatinstrukturen påvirke genregulering?
29. Kromatinstrukturen påvirker genregulering ved at styre tilgængeligheden af DNA for transskriptionsfaktorer.
30
30. Hvad er epigenetik?
30. Epigenetik studerer heritable ændringer i genaktivitet, der ikke involverer ændringer i DNA-sekvensen.
31
31. Hvordan reguleres niveauet af jern i cellerne – brug ferritin eller transferrin receptoren som eksempel.
31. Jernniveauet reguleres af ferritin og transferrin-recept
32
32. Hvordan fører mikroRNA til genregulering?
32. MikroRNA fører til genregulering ved at binde til komplementære sekvenser på mRNA, hvilket normalt resulterer i mRNA-nedbrydning eller hæmmet translation. Dette reducerer, hvor mange proteiner der dannes ud fra mRNA’et.
33
34
35
