Chapitre 5: Enzymes Flashcards
(27 cards)
Que sont les enzymes
Ce sont des biocatalyseurs
Qu’est-ce qu’une réaction exothermique
- Réaction qui libère de l’énergie (de la chaleur)
- possède un H négatif
Qu’est-ce qu’une réaction endothermique
- Une réaction qui absorbe de l’énergie (de la chaleur)
- Possède un H positif
Qu’est-ce qu’une réaction exergonique
- Quand le (triangle)G est inférieur à zéro
- La réaction de fera spontanément
Qu’est-ce qu’une réaction endergonique
- Une réaction ou le changement d’énergie libre est supérieur à zéro
- (triangle) G est positif
- La réaction ne se fera pas spontanément
Qu’est-ce que le couplage énergétique
- C’est une façon pour la cellule d’effectuer des réactions non spontanées en utilisant l’énergie supplémentaire dégagée par d’autres réactions spontanées
- Les cellules couplent des processus métaboliques défavorables à d’autres qui sont favorables de sorte que la variation nette d’énergie libre soit négative (exergonique)
EX: un processus exergonique peut être couplé avec un processus endergonique pour faire en sorte que la somme des 2 processus soit exergonique et spontanée
Qu’est-ce qu’un site actif
- Lieu où la liaison du substrat avec l’enzyme se fait
- Sont presque toujours localisée dans des cavités (poches, crevasses) à la surface des enzymes
- Formé de quelques acides aminés formant une sorte de poche dans laquelle le substrat peut se glisser
- Les a.a sont généralement non polaires pour interdire l’eau de rentrer dans le site actif
Pourquoi est il important que l’eau n’entre pas dans le site actif
- Parce que si des molécules d’eau pouvaient entrer dans le site actif, il faudrait qu’elles en ressortent pour laisser place au substrat et cet échange eau-substrat ralentirait beaucoup le processus
- L’absence d’eau dans le site actif fait en sorte que les interactions ioniques sont beaucoup plus fortes que si de l’eau était présente
Quels sont les caractéristiques du site actif
- Cavité tridimensionnelle
- Cavité relativement petite comparé à l’enzyme
- Cavité hydrophobe
- Les a.a formant le site actif sont éloignés dans la structure primaire
- Le substrat est lié à l’enzyme par des attractions faibles et temporaires
- Liaison du substrat se fait de façon complémentaire
Qu’est-ce qu’un site allostérique
- Ce sont des sites supplémentaires dans lesquels d’autres molécules, différente du substrat peuvent se lier
- Cesr dans ces sites que des molécules régulatrices viendront se lier pour activer ou inhiber l’enzyme
Qu’est-ce que le modèle de michaelis-merden
- Cest un modèle qui décrit les variations de la vitesse initiale des réactions enzymatiques en fonction de la concentration en substrat
- Dans ce modèle, on considère que la qté d’enzymes est tjrs fixe, donc que la vitesse de la réaction ne peut être influencée par une qté différente d’enzymes
Qu’est-ce que la représentation Lineweaver-Burk
- C’est une méthode dans lequel on transforme la courbe en une droite en mettant sur graphique les valeurs de 1/V en fonction de 1/[S]
- Le point d’intersection avec l’axe des x (ou 1/[S]) correspond à -1/Km et l’intersection avec l’axe des y (ou 1/V) correspond à 1/Vmax
Qu’est-ce qu’un inhibition compétitive
- Lorsqu’une substance se fixe de façon réversible (pas de liaison covalente) à une enzyme et que cela empêche l’enzyme de faire son travail
- Dans l’inhibition compétitive, l’inhibiteur a une structure qui ressemble au substrat, donc il y aura compétition entre l’inhibiteur et le substrat pour le site actif de l’enzyme
Qu’est-ce qu’une inhibition non compétitive
- Quand l’inhibiteur se lie sur un autre site que le site actif
- Donc, présente d’un inhibiteur allostérique qui se lie sur un site allostérique
Qu’est-ce qu’un cofacteur
- C’est un ion métallique nécessaire à l’activité d’une enzyme
- Ressemble à une coenzyme mais sous la forme d’ion métallique
Qu’est-ce qu’un coenzyme
- C’est une molécule organique, non protéique, essentielle au bon fonctionnement de certaines enzymes
- Plusieurs sont dérivées des vitamines et non liés en permanence à l’enzyme
Quel est un groupement prosthétique
- C’est si un coenzyme est fortement lié à l’enzyme et reste toujours à l’intérieur du site actif
- Elles sont liées en permanence par des liaisons covalentes à la protéine d’enzyme
Qu’est-ce qu’un cosubstrat
Ce sont certains cofacteurs qui ne s’associent à l’enzyme que pendant la réaction et peuvent entrer et sortir du site actif comme le font les substrats
Quels sont le nom des vitamines hydrosolubles
- Thismine
- Riboflavine
- Nicotinate
- Pantothénate
- Pyridoxine
- Acide folique
- Acide ascorbique
Quel est le rôle de la Thiamine
Transfert des groupements aldéhydes activés
Quel est le rôle de la Riboflavine
FAD et FMN
Quel est le rôle de la Nicotinate
NAD+/NADP+
Coenzymes des réactions d’oxydoréduction
Quel est le rôle de la Pantothénate
Coenzyme A
- Activation des acides gras
- Transfert de groupement acyle
Quel est le rôle de la Pyridoxine
Phosphate de pyridoxal
Activation des a.a
