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Génétique moléculaire > Chapitre 6 > Flashcards

Chapitre 6 Flashcards

(79 cards)

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1
Q

Transcription chez eucaryotes
Actions activateurs et répresseurs est complexifiées par 2 caractéristiques additionnelles
Nommer les

A
  1. Nucléosomes et leurs modifications

2. + régulateurs et + grandes séquences régulatrices

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Q

Définir enhancers

A

Plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité

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3
Q

Problème de l’activation à distance

A

Activateur lié à enhancer peut contrôler plusieurs gènes à sa portée plutôt qu’un seul

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4
Q

Solution du problème de l’activation à distance

A

Séquences régulatrices -> isolateurs

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5
Q

Entre quoi et quoi sont situés les isolateurs

A

Entre enhancers et promoteurs

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6
Q

Rôle isolateurs

A

Bloquent activation du promoteur induite par activateurs liés à enhancer -> garantissent que activateurs fonctionnement uniquement sur gènes que enhancer doivent régulés

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7
Q

Définir domaine de liaison à l’ADN (DLA)

A

Partie de protéine (activateur) qui sert uniquement à reconnaitre ADN et s’y accrocher

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8
Q

Gal4 se lie sous forme

a) monomère
b) dimère
c) tétramère

A

b) dimère

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9
Q

Nommer l’activateur eucaryote le + étudié

A

Gal4

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10
Q

Gal4 (activateur) active la transcription de quel gène

A

S.cerevisiae

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11
Q

Nommer le site initiation de transcription du gène GAL4

A

GAL1

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12
Q

Que se passe t’il avec Gal4 en présence de galactose

A

Gal4 se lie à SAAg et active transcription GAL1

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13
Q

Définir homéodomaine

A

Classe de DLA de type hélice-coude-hélice

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14
Q

Nommer les 4 DLA

A

Homéodomaine
Domaine en doigt de zinc
Fermeture à glissière de leucines lie l’ADN
Motif hélice-boucle-hélice

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15
Q

Nommer le plus commun des DLA

A

Domaine en doigt de zinc

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16
Q

Où le domaine en doigt de zinc a été initialement identifié

A

TFIIA

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17
Q

Domaine en doigts à zinc sont constitué d’environ 30 a.a parmi lesquels se retrouvent 2 résidus de … et 2 résidus de …

A

Cystéine

Histidine

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18
Q

Que se passe t’il s’il n’y a pas de zinc dans le domaine en doigt à zinc

A

Pas bonne structure pour s’insérer dans ADN

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19
Q

Présence de résidus acides/basiques et résidus hydrophiles/hydrophobes dans domaine en doigt à zinc

A

Basiques

Hydrophobes

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20
Q

Structure de 30 a.a du domaine en doigt à zinc se replie pour former quoi

A

2 barreaux B antiparallèle suivis d’une hélice alpha

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21
Q

Activateur Sp1 est quoi

domaine de liaison en doigt à zinc

A

3 structures en doigts de Zn consécutives

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22
Q

Rôle activateur Sp1

A

Permet reconnaitre 9 nucléotides (très GC riche)

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23
Q

1 chaine doigt permet de reconnaitre combien de nucléotides (domaine liaison doigt zinc)

A

3 nucléotides

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24
Q

Rôle activateur

A

Stimule transcription en liant ADN par une surface (DLA) et interagit avec ARN pol par une autre face

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25
Activateur recrute ARN pol a) directement b) indirectement À l'aide de qui?
b) indirectement | Grâce protéines régulatrices (médiateur avec composants (TFIID))
26
Les activateurs recrutent qui
- Modificateurs du nucléosome (aident à initiation) | - Facteurs nécessaires à initiation ou élongation par polymérase
27
Vrai ou faux | Plupart des caractéristiques régulation génique sont mêmes chez tous eucaryotes
Vrai
28
Plupart régulateurs bactériens lient ADN sous forme a) monomère b) dimère c) tétramère
b) dimère
29
Quel motif a été le premier DLA a être caractérisé
HCH hélice coude hélice
30
Plusieurs régulateurs eucaryotes (ceux forme HCH) lient sous forme a) monomère b) dimère c) hétérodimère
a) monomère | c) hétérodimère
31
DLA fermeture à glissière de leucines forment a) homodimère b) hétérodimère
a) homodimère | b) hétérodimère
32
Définir domaine d'activation
Recruteur de protéine (comme aimant) les amène près complexe initiation transcription
33
Qui a une structure définie entre DLA et régions activatrices (domaine activation)
DLA
34
Nommer structure que les régions activatrices (domaine activation) forment à l'occasion
Structures en hélice probablement induites par liaison ADN
35
Avantage du fait que les domaines d'activation n'ont pas de structure définie
Surfaces adhérentes -> capable d'interagir avec plusieurs surfaces protéiques
36
Comment appelle t'on région activatrice Gal4 et particularité (fortes)
Région activatrice acide en raison prépondance aa acides
37
Nommer activateur de la région activatrice riche en glutamine (faible)
Sp1
38
Nommer activateur de la région activatrice riche en proline (faible)
CTF1
39
Un des composants de TFII... contient bromodomaines
TFIID (TAF1/TAF250)
40
Nommer les 3 composants avec qui Gal4 interagit
Médiateur SAGA TFIID
41
Rôle SAGA
Activité acétylation et capable interagir machinerie transcriptionnelle
42
Comme TFIID, SAGA contient ... qui sont nécessaire pour certains promoteurs en remplacement de TFIID -> permet SAGA de s'accrocher à ...
TAFs | TATA
43
Par quoi est activé le gène HSP70 de drosophile
Choc thermique
44
Par quoi est contrôlé le gène HSP70 de drosophile (nom de 2 activateurs)
GAF-1 | HSF
45
Est-ce qu'un isolateur agit comme un répresseur
Non, car pas recruteur de protéine
46
Enhancer agit a) amont b) aval
a) amont | b) aval
47
Nommer le mécanisme (chez bactéries) qui aide communication entre protéines liées à distance des promoteurs (les rapprochent)
Protéine architecturale IHF
48
Rôle IHF
Lie sites ADN en courbant l'ADN | Aide activateur lié à ADN à atteindre (rapproche) ARN pol sur promoteur
49
Nommer la protéine chez drosophiles qui aide la communication entre enhancer et gène (forme miniboucles pour rapprocher enhancer et promoteur)
Chip/Ldb1
50
Qui contrôlent les actions des activateurs
Isolateurs
51
Rôle isolateur
Inhibe activation du gène induite par activation, mais inhibe pas activation gène régulé par autre enhancer placé en aval ou amont du promoteur
52
Vrai ou faux | Les isolateurs répriment les promoteurs et les activateurs
Faux | Bloquent la communication
53
Où sont exprimés les gènes Apo
Foie et intestin
54
À quoi servent gènes Apo
Essentiels métabolisme + redistribution lipoprotéines et lipides
55
APOA1, APOA4 et APOA5 sont des constituants prédominants de...
HDL (high density lipoproteins)
56
Comment isolateur affecte seulement gènes précis et pas d'autres gènes collés
Protéine CTCF
57
Mode action protéine CTCF
CTCF + cohésine (Rad21/Scc1) se lie isolateurs AC2 et AC3 Forme boucles qui rapproche enhancer des promoteurs Bloque fonction enhancer Peut réprimer transcription
58
Définir loci LCR
Long segment ADN avec bcp site liaison | Région contrôle locus
59
Définir intégration du signal
Nombreux signaux nécessaires à expression gène | Signal transmis au gène par régulateur distinct (activateur/répresseur)
60
Effet de 2 activateurs agissant ensemble (synergie) est... que somme de chacun agissant seul a) égale b) plus grand c) plus petit
b) plus grand
61
Synergie peut résulter de... (3)
1. Multiples activateurs recrutant 1 composant machinerie transcriptionnelle 2. Multiples activateurs recrutant chacun un composant différent 3. Multiples activateurs s'entraidant pour lier sites à proximité du gène qu'ils contrôlent
62
Donner exemple de multiples activateurs recrutant 1 composant machinerie transcriptionnelle
Médiateur recruté par plusieurs activateurs différents en touchant différentes parties
63
Donner exemple multiples activateurs recrutant chacun un composant différent
1 activateur recrute FTIID et un autre recrute médiateur
64
Multiples activateurs s'entraidant pour lier sites à proximité du gène qu'ils contrôlent La liaison de l'un dépend de la liaison de l'autre On appelle cela un phénomène de...
Coopérativité
65
Donner un exemple de coopérativité (Multiples activateurs s'entraidant pour lier sites à proximité du gène qu'ils contrôlent)
Répresseur lambda
66
Liaison d'une protéine à son site ADN peut faciliter la liaison d'une autre protéine à proximité de 4 façons directes ou indirectes -> coopérative Nommer les
Directe 1. Interaction directe entre 2 protéines (individuellement pas reconnu) 2. 2 protéines peuvent en recruter une 3e Indirecte: liaison A aide B à se lier 3. Modificateur recruté par A rend accessible B 4. Liaison A permet décompaction pour donner accès à B
67
Gène HO (levure) est exprimé a) cellules mères b) cellules pères c) les deux cellules c) à tout moment b) certains moments
a) cellules mères | b) certains moments
68
Les deux conditions de l'exprimation du gène HO (levure) sont communiqués par qui (Nom des 2 activateurs)
Swi5 et SBF
69
Mode d'action de la transcription gène HO (levure) Exemple de coopérativité Parler de SBF et Swi5
SBF (activateur) peut pas lier ses sites (compacté dans chromatine) Swi5 peut se lier sans aide, mais trop éloigné pour activer HO -> va recruter modificateurs de nucléosomes -> dépacte chromatine localement Permet SBF de se lier et activer transcription en recrutant médiateur
70
Définir contrôle combinatoire
Action de plusieurs régulateurs transcriptionnels (activateurs ou répresseurs) qui sont requis pour transcrire gène en particulier (signal commun entre 2 gènes)
71
Nommer 4 modes d'action des répresseurs eucaryotes
- Chevauchement site liaison - Action directe répressive sur composantes transcription (médiateur, FTG) - Liaison répresseur bloque domaine d'activation via domaine répression - Recrute enzyme qui enlève acétyle des queues histones = recompaction chromatine
72
Comment réprime t'on gène levure GAL1 | GAL1 contient site auquel s'accroche la protéine... qui réprime transcription GAL1 en recrutant la protéine ...
Mig1 | Tup1
73
Nommer les 2 modèles répression par Tup1
- Recrute histone désacétylase qui désacétylent à proximité des nucléosomes = compaction - Interagit directement avec machinerie transcriptionne: inhibe initiation
74
Expression d'un gène dépend de signaux environnementaux communiqués sous différentes formes Chez bactéries: Chez eucaryotes:
Petites molécules relarguées par une cellule et reçues par une autre Plusieurs signaux communiqués via voies de transduction du signal
75
Signaux contrôlent activités des régulateurs transcriptionnels de diverse façon Chez bactéries: Chez eucaryotes:
Changements allostériques qui contrôlent régulateurs transcriptionnels: affectent leur capacité à lier ADN Régulateurs transcriptionnels en général pas contrôlés au niveau liaison ADN
76
Comment les régulateurs transcriptionnels sont contrôlés (eucaryotes)
- Région activatrice démasquée | - Transport dans noyau
77
Comment la région activatrice masquée est-elle révèlée
Changement conformationnel de l'activateur lié à ADN | Relargage protéine liant et masquant région activatrice (ce qui révèle domaine liaison)
78
Rôle ligand de signalisation
Induit migration dans noyau
79
Nommer les différents (2) scénarios du transport dans le noyau
Régulateur maintenu dans cytoplasme par protéine inhibitrice ou membrane cellulaire Régulateur dans conformation où signal nécessaire à son import nucléaire dissimulé

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