Chapitre 6 - ADN

Question 1

Chromatine

Answer 1

2e niveau de condensation
Stabilisé par H1
4x

Question 2

Nucléosome

Answer 2

1er niveau d’enroulement
Histone : 5 protéines (H1, 2A, 2B, 3, 4) basiques octamériques (riche en lys er arg)
Condensation 10x

Question 3

Synthèse ADN

Answer 3

Catalysée par des ADN polymérases
Requiert des désoxynucleosides 5’ - triphosphate
Amorce
5’ -> 3’

Question 4

Comment se nomme la machinerie protéique capable de procéder aux réactions de polymérisation ?

Answer 4

Réplicateur ou réplisome

Chacune des deux fourches ont une réplicateur

Question 5

Qu’est-ce qu’une amorce ?

Answer 5

Amorce d’ARN (primase) est requise pour la synthèse du brin avancé et elle est synthétisée à l’origine de réplication
Ajouté sans contrôle qualité
ARN peut être facilement reconnu comme “non ADN” et dégradé

Question 6

Que fais l’ADN polymérase ?

Answer 6

Elle catalyse la réaction de polymérisation complémentaire au brin-matrice à partir de l’amorce.
Remplacée par ADN pol s
ADN pol I : répare ADN + synthèse de l’un des brins -> réplication
ADN pol II : réparation
ADN III : enzyme de réplication principale, élongation de la chaine au cours de la réplication

Question 7

Fragments Okazaki

Answer 7

Démarrage de la synthèse des fragment d’oka = présence d’amorces d’ARN
Catalysé par une enzyme primase
Prolongé à partir de l’extrémité 3’ par ADN pol III
Amorce ARN est digéré par une RNase H, remplacé par de l’ADN et reliés par une ligase
RNase hydrolyse le brin d’ARN dans un double brin hybride
Libères les extrémités
Possède un domaine HBD et un domaine catalytique (H)

Question 8

Terminaison de réplication chez E.coli

Answer 8

Se termine au site de terminaison sur le chromosome en cercle. Cette zone d’ADN porte des séquences servant de liaison pour une protéine dite de fixation au terminateur (tus).
En inhibant l’activité hélicase du réplicateur, tus empêche la fourche de dépasser cette région

Question 9

Réparation ADN

Answer 9

BER : excision de base, corrige les lésions les plus fréquentes (enzyme glycosylases catalysent l’élimination des bases altérées par hydrolyse de la liaison N-glycosidique, la désamination hydrolytique de la cytosine forme l’uracile)
NER : excision de nucléotide corrige la 2e forme la plus fréquente (dommages causés par lumière UV et radicaux libres. Un segment avec le nucléotide + 30 voisins sont enlevés et comblé par ADN pol)
NHEJ : cassure double brin sont réparées par jonctions des extrémités (radiations et radicaux libres, Ku recrute des exonucléases et polymérases qui rogne et allonge les brins. L’ADN ligase finit et c’est propice aux erreurs)
HR : molécule ADN cassés -> recombinaison homologue (une autre molécule double brin homologue, protéines recombinantes liant l’ADN simple brin sont nécessaires

Question 10

ARN polymérase

Answer 10

3’OH attaque le Palpha d’un NTP
Formation de liaison phosphodiester
Libération de pyrophosphate

Question 11

Les modifications des histones détermine quoi ?

Answer 11

La conformation ouverte ou fermées de la chromatine

Question 12

Les histones acétyltransférases (HAT) aident à faire quoi ?

Answer 12

Décondenser la chromatine en ajoutant des groupements acétyl sur la chaine des lys

Question 13

Structure de TBP lié à l’ADN

Answer 13

Insertion des résidus Phe et TBP courbe l’ADN à deux endroits

Question 14

TFIID et TAF1

Answer 14

Bromodomaine : lie les histones acétylés
Activité HAT sur H2
Boucle de régulation positive pour promouvoir la transcription
Activité ubiquitine ligase sur H1

Question 15

TFIIH

Answer 15

Activité hélicase

Question 16

Le domaine C-terminal non phosphorylé de l’ARN pol sert à quoi ?

Answer 16

Site de fixation pour un complexe médiateur (recrute pol II)

Phosphorylation du C-terminal change la polymérase vers un mode d’élongation

Question 17

Lactose

Answer 17

Source d’énergie à l’aide de la B-galactosidase (converti le lactose en glucose et galactose).
B-galac = enzyme inductible.
Opéron lactose : se fixe sur deux sites voisins du promoteur de l’opéron lac, induisant une boucle dans l’ADN = empêche l’ADN pol de démarrer la transcription
Expression dépend du gène lacI est ajusté par l’allolactose (isomère du lactose)
Quand lac = source C, ce lactose se transforme en allolac et la fixation au lacI induit une transformation qui entraine la dissociation du répresseur de son site de liaison sur l’opérateur.
Inactivation répresseur permet à l’ARN pol de commencer à transcrire l’opéron et induire l’expression des gènes