Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

chemisty > chemistry > Flashcards

chemistry Flashcards

test (100 cards)

Start Studying
1
Q

prva oksidativna dekaborksilacija

A

Prvu oksidativnu dekaborksilaciju predstavlja izocitrat koji se oksidira i dekarboksilira u a-ketoglutarat, a drugu nastajanje sukcinil CoA putem oksidativne dekarboksilacije a-ketoglutarata.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

po čemu se sukcinat dehidrogeneza razlikuje od ostalih enzima

A

Sukcinat dehidrogenaza razlikuje se od ostalih enzima u ciklusu jer se nalazi u sklopu unutarnje membrane mitohondrija, direktno povezan sa lancem za prijenos elektrona te predstavljva vezu između ciklusa limunske kiseline i sinteze ATP-a.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

2 mehanizma kontrole ulaska u ciklus i metaboliziranja

A

2 mehanizma kontrole ulaska u ciklus i metaboliziranja su kontrola kompleksa piruvat dehidrogenaze (alosterički i putem reverzibilne fosforilacije) i kontrola unutar ciklusa limunske kiseline (primarno putem koncentracije ATP-a i NADH)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Oksidativna dekarboksilacija

A

Oksidativna dekarboksilacija je reakcija pri kojoj se piruvat pretvara u acetil CoA, ključna reakcija koja povezuje metabolički put glikolize sa ciklusom limunske kiseline. U eukariota ova se reakcija odvija u matrixu mitohondrija dok se u prokariota odvija u citoplazmi i staničnoj membrani. Katalizira je enzimski sustav piruvat dehidrogenaze.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Oksidativna fosforilacija

A

Oksidativna fosforilacija je proces stvaranja ATP-a kao rezultat prijenosa elektrona s NADH ili FADH2 na O2 putem niza prijenonika elektrona.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Protonske pumpe koje su uključene u proces of

A

Protonske pumpe koje su uključene u proces su NADH-Q oksidoreduktaza (oksido-reduskcijski centar je FMN I Fe-S), Q-citokrom c oksidoreduktaza (centar je 3 hema i 2Fe-2S nakupine) i citokrom c oksidaza (centar je hem a3 i CuB).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Posljednja faza oksidacijske fosforilacije

A

Posljednja faza oksidacijske fosforilacije je sinteza ATP-a pomoću ATP sintaze.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

građa mitohondrija

A

Mitohondrij ima 2 membrane, vanjsku koja je vrlo porozna radi velikog broja porina i unutranju membranu koja je naborana i obavija matrix te sadrži enzim ATP sintetazu.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

dva odjeljka mitohondrija

A

. Dva odjeljka mitohondrija su matrix koji sadrži enzime za oksidaciju piruvata i masnih kiselina te enzime ciklusa limunske kiseline i međumembranski prostor koji sadrži nekoliko enzima koji koriste ATP za fosforilaciju drugih nukleotida.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Oksidativna fosforilacija ovisi o

A

Oksidativna fosforilacija ovisi o potencijalu prijenosa elektrona (elektroni visoke energije i redoks potencijal).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Redoks potencijal je?

A

Redoks potencijal je sposobnost supstrata da prima elektrone (redukcija) ili otpušta elektrone (oksidacija). U procesu oksidacijske fosforilacije energija oslobođena redukcijom svakog prenositelja elektrona koristi se za stvaranje gradijenta protona koji se potom koristi za sintezu ATP-a i transport metabolita kroz unutarnju membranu mitohondrija.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Gradijent protona služi za

A

Gradijent protona služi za transport metabolita kroz unutarnju membranu i za sintezu ATP-a.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

. Promjene redoks potencijala u respiracijskom lancu su

A

Promjene redoks potencijala u respiracijskom lancu su prijenos elektrona sa NADH na kompleks I te na kompleks III i zatim na kompleks IV, elektroni sa FADH2 prenose se sa kompleksa II na kompleks III, a zatim na kompleks IV. Elektroni s FADH2 ulaze u lanac nizvodno od elektrona koje prenosi NADH budući da elektroni FADH2 imaju manju redoks potencijal nego elektroni s NADH te zbog toga oksidacijom FADH2 nastaje manje molekula ATP.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

4 kompleksa uključena u respiratorni lanac su

A

4 kompleksa uključena u respiratorni lanac su 3 protonske pumpe (NADH-Q oksidoreduktaza, Q-citokrom c oksidoreduktaza i c citokrom oksidaza) i sukcinat Q-reduktaza (spona s ciklusom limunkse kiseline)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Koenzim Q ili ubikinon je

A

Koenzim Q ili ubikinon je hidrofobni kinon koji brzo difundira u unutarnju membranu mitohondrija , vrši transport između većih elektronskih prenositelja unutar membrane.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

. Lanac prijenosa elektrona

A

Elektroni s NADH prenose se na FMN prostetsku skupinu NADH-Q oksidoreduktaze, te dalje preko Fe-S proteina na Q, pri čemu nastaje QH2 , reducirani oblik ubikinona. Enzim citratnog ciklusa, sukcinat dehidrogenaza, sastavni je dio kompleksa sukcinat-Q reduktaze, također donira elektrone s FADH2 na Q kako bi nastao QH2 . QH2 su vrlo mobilni membranski prenositelji elektrona i oni prenose elektrone na Q-citokrom c oksidoreduktazu. Q-citokrom c oksidoreduktaza sadržava citokrome b i c1 kao i Fe-S centar. Ovaj kompleks reducira citokrom c, periferni membranski protein topljiv u vodi. Citokrom c, slično kao i Q je mobilni prenositelj elektrona koji prenosi elektrone s citokroma c na citokrom c oksidazu. Kompleks citokrom c oksidaze sadržava citokrome a i a3 i ione bakra. Željezo u hemu i bakarni ioni ove oksidaze prenose elektrone na O2 , zadnji akceptor elektrona, te nastaje voda.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Q ciklus

A

Q ciklus je mehanizam koji povezuje prijenos elektrona sa Q na Cyt c i transmembranski transport protona. Ciklus također pomaže prijelaz elektrona prenositelja koji prenosi 2 elektrona (QH2) na prenositelja koji prenosi jedan elektron (Cyt c).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Jednosmjerna protonska pumpa j

A

Jednosmjerna protonska pumpa je ATP sintaza (kompleks V).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

ATP sintaza se sastoji od

A

ATP sintaza se sastoji od F0 i F1 podjedinica. F0 (štap) hidrofoban,uronjen u unutarnju mitohondrijsku membranu, izgrađuje kanal za protone. F1 (lopta) sačinjena od 5 vrsta polipeptida, nalazi se u matrixu mitohondrija, odgovorna za katalitičku aktivnost sintaze.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

ATP sintaza katalizira sintezu

A

ATP sintaza katalizira sintezu ATP iz ADP i ortofosfata (ADP3- + HPO4 + H+  ATP 4- +H2O)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

3 B podjedinice su

A

3 B podjedinice su L (opuštena) konformacija - vezivanje ADP-a i Pi, T (napeta) konformacija- čvrsto vezivanje ADP-a i Pi pri čemu dolazi do sinteze ATP-a i O (otvorena) konformacija - otpuštanje sintetiziranog ATP-a.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

U rotacijskoj katalizi y podjedinica

A

U rotacijskoj katalizi y podjedinica rotira u suprotnim smjerovima ovisno o tome dali se ATP sintetitira ili hidrolizira, svaka rotacija u smjeru kazaljke na satu za 360 dovodi do sinteze i otpuštanja 3 molekule ATP.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Uloga bioloških membrana

A

Uloga bioloških membrana je definiranje stanične dimenzije, podijela stanica u odjeljke , omogućavanje provedbe kompleksnih reakcijskih putova i sudjelovanje u primanju signala i pretvorbi energije.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Osnovna gradvina jedinica stanične membrane

A

Osnovna gradvina jedinica stanične membrane je lipidni dvosloj (fosfo i glikolipidi)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Karakteristike svih bioloških membrana su
membrane su tanke strukture koje grade zatvorene odjeljke, sačinjavaju ih uglavnom lipidi i proteini u omjeru 1:4-4:1, membranski lipidi su amfipatske molekule, specifični enzimi služe kao medijatori razlićitih funkcija membrana,membrane su asimetrične, nekovalentne, fluidne strukture, većina membrana je poralizirana (unutrašnjost neg. -60mv).
26
Lipidni dvosloj je obično se sastoji od
Lipidni dvosloj je obično se sastoji od fosfolipida koji imaju hidrofilnu glavu i dva hidrofobna repa, izrazito je nepropusan za ione i većinu polarnih molekula. Mala molekula može proći kroz dvosloj na način da odbaci za sebe vezanu vodu, otapanjem u ugljikovodičnom sloju membrane, difundiranjem kroz membranu na drugu stranu i otapanjem u vodi.
27
Membranski proteini mogu biti
Membranski proteini mogu biti periferni (labavo povezani putem ionskih i vodikovih veza i lipidnim sidrima), integralni (čvrsto povezani hidrofobnim vezama između lipidnog dvosloja i nepolarnih aminokiselinskih ostataka) i amfitropni (reverzibilno vezani za membranu ovisno o vrsti regulatornog procesa).
28
Karakteristike građe membranskih proteina su
Karakteristike građe membranskih proteina su: dijelovi proteina koji stupaju u interakciju sa hidrofobnim dijelovima membrane obloženi su s pokrajnim lancima građenim od nepolarnih AK dok su dijelovi koji su u interakciji s vodenim okolišem puno hidrofilniji, proteinske strukture koje se nalaze u membranama su rasprostranjene te AK u polipeptidnim lancima rado stvaraju vodikove veze, pucanje vodikove veze unutar membrane je energ. nepovoljno budući da u hidrofobnom okruženju nema baš vode koja bi stupila u kompeticiju za polarne skupine AK.
29
Membranska sidra su
. Membranska sidra su hidrofobne skupine koje su kovalentno vezane za proteine i vezuju ih za membrane.
30
Lateralna difuzija ili prijelaz | Flip flop difuzija ili prijelaz s jedne strane membrane na drugu
Lateralna difuzija ili prijelaz je vrlo brz proces za lipide koji se odvija u ravnini membrane, proteini variraju u brzini, neki su mobilni poput lipida dok su drugi praktično nepokretni. Flip flop difuzija ili prijelaz s jedne strane membrane na drugu je vrlo spor proces, posebice za proteine radi polarnih regija u njihovoj strukturi.
31
. FRAP (Flourescence recovery after photobleaching) omogućuje
. FRAP (Flourescence recovery after photobleaching) omogućuje
32
Fluidnost membrana ovisi
Fluidnost membrana ovisi o kolesterolu (remeti interakcije između lanaca masnih kiselina i stvara specif. komplekse s nekim fosfolipidima).
33
Biološke membrane su
asimetrične
34
Fosfogliceridi sintetiziraju se na
Fosfogliceridi sintetiziraju se na citoplazmatskoj strani ER koja je topološki identična citoplazmatskoj strani plazmatske membrane.
35
Proteini se razvrstavaju u stanici u
. Proteini se razvrstavaju u stanici u pojedine stanične odjeljke uz pomoć signalnih sekvenci.
36
Membrane primaju molekule putem
Membrane primaju molekule putem endocitoze posredovane receptorom ; obrnuti proces je fuzija vezikule s membranom.
37
Prolaz molekule kroz membranu ovisi o
Prolaz molekule kroz membranu ovisi o propusnosti lipidnog dvosloja za molekulu i izvoru energije. Prolaz može biti aktivan ili pasivan.
38
. Prolaz kroz membranu omogućen je pomoću
Prolaz kroz membranu omogućen je pomoću 3 vrste membranskih proteina- pumpa, kanala i transportera.
39
Pumpe koriste izvore
Pumpe koriste izvore slobodne energije poput ATP-a ili svjetla kako bi omogućile transport supstrata suprotno njegovom konc.gradijentu (aktivni transport)
40
Kanali i transporteti omogućavaju
. Kanali i transporteti omogućavaju prolaz supstranata niz njegov konc.gradijent - pasivni transport ili olakšana difzija.
41
. Jednostavna difuzija
Jednostavna difuzija je prolaz lipofilnih molekula kroz membranu niz njihov koncentracijski gradnijent (2.zakon termodinamike) ,a olakšana difuzija je prolaz supstrata (polaran) kroz membranu niz konc.gradijent olakšan kanalom.
42
Energija potrebna za transport iona ovisi o
Energija potrebna za transport iona ovisi o membranskom potencijalu odnosno o sumi slobodnih energija koncentracijskog i električnog gradijenta.
43
Membranske pumpe su
Membranske pumpe su P,V i F pumpe te ABC transporteri, pokreće ih hidroliza ATP i unutarstanična konc. iona. P pumpe su izgrađene od dvije katalitiče alfa podjedinice koje se fosforiliraju tijekom transporta iona. V i F pumpe ne fosforiliraju se tijekom transporta ,transportiraju samo protone. ABC transporteri sadrže dvije transmembranske domene i dvije citoplazmatske koje povezuju domenu za hidrolizu sa domenama za prijenos tvari.
44
Na- K pumpa
Na- K pumpa - održavanje Na-K gradijenta od velikog je fiziološkog značaja jer se tim putem provodi kontrola volumena stanice, održavanje podražljivosti živčanih i mišićnih stanica, pokretanje aktivnog transporta šećera i AK. Pumpa hidrolizira ATP samo kada su Na i K vezani za pumpu.
45
Ca2 ATPaza čini
Ca2 ATPaza čini 80% proteina koji grade sarkoplazmatski retikulum mišićnih stanica, djelovanjem ove pumpe održava se stalna koncentracija Ca. Citoplazmatski dio enzima sastoji se od 3 različite domene- N (veže ATP nukleotid), P (veže fosforil skupinu na aspartatski ostatak pumpe) i domena A (uloga pokretača za N domenu).
46
Učinak P pumpi na staničnom nivou
Učinak P pumpi na staničnom nivou - zajedničkim radom Na-K ATPaza u plazmatskoj membrani i Ca2ATPaza u membrani sarkop.retikuluma stvara se uobičajena koncentracija iona u živ.stanici.
47
Flipaze su
Flipaze su P pumpe koje transportiraju fosfolipide i održavaju asimetriju staničnih membrana okretanjem fosfolipida iz vanjskog u unutarnji sloj membrane.
48
Uniporteri su
Uniporteri su transporteri u olakšanoj difuziji koja se razlikuje od jednostavne difuzije zbog toga što je brzina prijenosa tvari uniporterima daleko brža , transportirana molekula nikada ne ulazi u hidrofobni dvosloj pa koeficijent particije nije bitan, transport se odvija pomoću ograničenog broja molekula uniportera, postoji maksimalna brznia transportera vmax ( kad je gradijent konc. vrlo velik), transport je specifičan (transporter prenosi jednu vrstu molekula).
49
Uniportni prijenos glukoze odvija se putem
Uniportni prijenos glukoze odvija se putem GLUT (transportera glukoze) . Postoje dvije različite konformacije, u jednoj u kojoj su mjesta vezna supstrata okrenuta na egzoplazmatsku stranu i jednu u kojoj su okrenuta na citosolnu. Koristi se gradijent koncentracije za ulaz glukoze u stanicu.
50
Mehanizam vezanja glukoze
Mehanizam vezanja glukoze- vezanjem glukoze na GLUT u prvom konformacijskom stanju dolazi do promjene GLUT u drugo konf.stanje te posljedičnog otpuštanja glukoze. Nakon otpuštanja glukoze GLUT ponovo podliježe konformacijskoj promjeni kojom se vraća u prvobitno stanje i spreman je za novi ciklus prijenosa
51
Sekundarni transporteri ili kotransporteri
. Sekundarni transporteri ili kotransporteri koriste jedan koncentracijski gradijent kako bi stvarili drugi (nisu direktno povezani s hidrolizom ATP-a) ,dijele se na antiportere i simportere.
52
Ionski kanali su
Ionski kanali su vrlo brzi sustavi pasivnog prijenosa , visokosofisticirane membranske strukture koje odgovaraju na okolinske uvjete konformacijskim promjenama. Karakteristike - ionski kanali mogu biti vrlo selektivni za supstrate (ione), mogu biti u otvorenom ili zatvorenom stanju,a prijelazi između ta dva stanja su regulirani, u otvorenom stanju često spontano pređu u inaktivno stanje.
53
Acetilkolinski receptorski kanal je
Acetilkolinski receptorski kanal je ionski kanal reguliran ligandom (acetilkolinom-neurotansmiter koji prenosi živ.impulse među sinapsama).
54
K kanal je
K kanal je ionski kanal reguliran naponom. Specifičnost kanala- K ioni selektivo reagiraju s karbonilnim kisikovim ionima specifičnih aminokiselina koje se nalaze u pori i time se smanjuje energije aktivacije koja je potrebna za prolaz K iona u odnosu na druge. (K kanali 100x više permeabilni za K u usporedbi s Na)
55
Inaktivacija ionskog/ K kanala nastaje zbog
Inaktivacija ionskog/ K kanala nastaje zbog skraćivanja lanca (polipeptida) budući da lopta (citoplazmatska struktura od ostataka) brže nalazi komplementarno mjesto, depolarizacija otvara kanal i stvara negativno nabijeno mjesto za pozitivno nabijenu loptu).
56
. Tijesni spojevi su
Tijesni spojevi su kompleksi proteina koji povezuju citoplazmu dvaju susjednih stanica, omogućuju brzu izmjenu malih spojeva u slojevima stanica i organima. Građeni od 12 molekula koneksina. Nastaju kad su stanice blizu jedna druge, zatvaraju ih visoke konc. Ca i nizak Ph.
57
DNA I RNA
. DNA I RNA su nukleinske kiseline, makromolekule koje se sastoje od niza vezanih nukleotida (baza (purin ili pirimidin) + šećer + fosfat)
58
Genska informacija nalazi se u
Genska informacija nalazi se u slijedu baza duž lanca nukleinske kiseline.
59
uloga baza
Baze, osim što prenose gensku informaciju imaju važnu ulogu u stvaranju dvostruke uzvojnice DNA, parovi baza ( stabilizirani vodikovim vezama) predstavljaju mehanizam za kopiranje genetske informacije sa postojećeg lanca na nukleinske kiseline za novonastali lanac.
60
DNA se replicira pomoću
. DNA se replicira pomoću enzima DNA polimeraze koji kopira slijed s predloška nukleinske kiseline s velikom preciznošću.
61
Primarna klinička primjena CK (kreatin kinaza)
Primarna klinička primjena CK (kreatin kinaza) je dijagnoza infarkta miokarda (povišenje MB varijante u serumu) , ali i za dijagnostiku drugih raznih stanja ( mišićne bolesti i tramue- povišen MM i MB, traume mozga- povišen BB).
62
. Uglijkohidrati su
Uglijkohidrati su biomolekule, aldehidi ili ketoni sa višestrukim hidroksilnim skupinama, čine većinu organiskih tvari na zemlji, a u organizmu imaju bitnu ulogu u pohrani energije, čine strukuturu RNA,DNA, strukturni su elementi staničnog zida bakterija i biljaka, važni u metabolizmu proteina i lipida.
63
Monosaharidi su najjednostavniji ugljikohidrati
Monosaharidi su najjednostavniji ugljikohidrati, strukturne su jedinice nukleinskih kiselina te važna skladišta energije, aldehidi ili ketoni koji imaju dvije ili više hidroksilnih skupina. Razvrstavaju se na temelju broja ugljikovih atoma te kao aldoze (aldehidna skupina) i ketoze (ketonska).
64
3 oblika glukoze
3 oblika glukoze su glukoza u obliku polimera glikogena (u životinjama) i škorba (u biljkama)-rezervna energija organizma te celuloza-osnovni gradivni element stanične stijenke biljaka.
65
Struktrura glukoze može se prikazati na
. Struktrura glukoze može se prikazati na 3 načina- lančasti oblik, ciklični (Haworthova projekcja) ili oblik stolice.
66
Glukoza ima
Glukoza ima 4 asimetrična C atoma i 16 izomera, najvažniji su L i D izomer (većina monosaharida u sisavaca su D šećeri). Smjer zakretanja polariziranog svjetla neovisan je o stereokemiji ugljikohidrata.
67
Ciklizacija glukoze
. Ciklizacija glukoze odvija se reakcijom aldehida s alkoholom pri čemu nastaje hemiacetal.
68
Disaharidi su
Disaharidi su kondenzacijski produkti dviju jedinica monosaharida povezanig O glikozidnom vezom. 3 najznačajnija su saharoza (obični šećer, glukoza+fruktoza,enzim saharaza) , laktoza (mliječni šećer, glukoza+galaktoza, enzim laktaza, betagalaktozidaza) i maltoza (nastaje hidrolizom škorba, glukoza+glukoza, enzim maltaza).
69
Enzimi saharaza, laktaza i maltaza locirani su
. Enzimi saharaza, laktaza i maltaza locirani su na vanjskoj površini epitelnih stanica tankog crijeva (mikrovili,mikroresice).
70
. Oligosaharidi su
Oligosaharidi su kondenzacijski produkti 3-10 monosaharida povezanih alfa ili beta glikozidnim vezama, formiraju lance i razgranate lance. Većinom se ne razgrađuju humanim enzimima.
71
. Polisaharidi su
Polisaharidi su kondenzacijski produkti više od 10 monosaharida, dijele se na pentozane ili heksozane. Imaju ključnu ulogu u pohrani energije. Najćešći homopolimer je glikogen.
72
Stereokemija
Stereokemija je grana kemije koja istražuje trodimenzionalnu strukturu molekula.
73
Izomeri
Izomeri su spojevi identične molekulske formule koji se razlikuju po vrsti ili redosljedu veza među atomima (konstitucijski) ili rasporedom atoma u prostoru (stereoizomeri).
74
Podvrste stereoizomera su
Podvrste stereoizomera su konformacijski (međusobno se razlikuju po rasporedu atoma ili skupina u prostoru, a mogu se prevesti jedan u drugi rotacijom oko jednostrukih veza) i konfiguracijski izomeri ( razlikuju se po konfig. ne uzimajući u obzir rasporede koji se razlikuju radi rotacije oko jednostrukih veza).
75
Kiralne molekule su
Kiralne molekule su one čija se slika ne može preklopiti sa vlastitom zrcalnom slikom, poput dlanova ruke, a akiralne su one koje se mogu preklopiti. Kiralne imaju asimetrično središte (AK su kiralne,osim glicina).
76
Ovisno o R skupini aminokiseline se dijele na
Ovisno o R skupini aminokiseline se dijele na AK a alifatskim bočim ogrankom, AK s bočnim ogrankom koje sadržavaju hidroksilnu OH skupinu, AK s boč.ogr. koje sadržavaju atom sumpora, AK s boč.ogr. koje sadržavaju kiselinske skupine ili njihove amide, bazične skupine, AK s aromatskim prstenom i imonokiselina (Pro).
77
Nomenklatura kiralnih spojeva
Nomenklatura kiralnih spojeva- dva sustava nomenklature- d (desnozakrećući) i l (lijevozakrećući) s obzirom na stranu zakretanja ravnine polariziranog svjetla kad prolazi kroz otopinu enantiomerno čistog spoja i sustav nomenklature Cahn- Ingold Prelog (CIP) -označava apsolutne struktrure kiralnog centra oznakama konfiguracije R (desno) ili S (lijevo) s obzirom na raspored prioritetnih skupina oko kiralnog asimetričnog središta.
78
Aminokiseline se u otopinama neutralnog pH javljaju u
Aminokiseline se u otopinama neutralnog pH javljaju u obliku dipolarih iona (zwitter iona), amino skupina u dipolarnom obliku je protonirana, karboksilna deprotonirana.
79
Jakost slabih kiselina označava se kao
Jakost slabih kiselina označava se kao njihov pK.
80
Esencijalne aminokiseline su
Esencijalne aminokiseline su one koje životinja ili čovjek moraju uzimati u hrani budući ih ne mogu sami sintetizirati, neesnecijalne su one koje tijelo samo sintetizira, a uvjetno esencijalnima smatraju se one koje se dobivaju složenijim biokemijskim procesima nego što je sama transaminacija.
81
Proteini se sastoje od
Proteini se sastoje od 20 a-L aminokiselina
82
Primarna struktura proteina se sastoji od
Primarna struktura proteina se sastoji od AK povezanih peptidnim vezama koje tvore polipeptidne lance, svaka AK unutar polipeptida se naziva aminokiselinski ostatak.
83
Peptidna veza nastaje
Peptidna veza nastaje spajanjem karboksilne skupine jedna AK s amino skupinom druge AK. Formaciju dipeptida od dvije AK prati gubitak molekule vode te je stoga reakcija bliža hidrolizi nego sintezi , te zahtjeva unos energije.
84
Disulfidne veze nastaju
Disulfidne veze nastaju oksidacijom para cisteinskih ostataka .
85
Slijed aminokiselina unutar proteina je
Slijed aminokiselina unutar proteina je jedninstvena i genetski predodređena primarna struktura, poznavanje slijeda je osnova za razumijevanje njegovog mehanizma djelovanja, AK slijed određuje 3D strukturu proteina.
86
Sekundarna struktura opisuje
Sekundarna struktura opisuje prostorni raspored dijela proteina odnosno prostorni raspored glavnih atoma okosnice tog dijela polipeptidnog lanca da se pri tome ne uzima u obzir konformacija bočnih ogranaka aminokiselina.
87
2 glavna oblika sekundarne strukture su
2 glavna oblika sekundarne strukture su alfa uzvojnica i beta lanci koji se povezuju u beta nabranu ploču. U sekundarnu struktruru ubrajaju se još i petlje te oštri (beta) zavoji.
88
Alfa uzvojnica je
Alfa uzvojnica je nabrana struktura koju stabiliziraju vodikove veze unutar polipeptidnog lanca.
89
Smjer uzvojnice može biti
Smjer uzvojnice može biti desni (u smjeru kazaljke na satu) i lijevi (suptotno).
90
Stabilnost alfa uzvojnice ovisi o
Stabilnost alfa uzvojnice ovisi o intrinzičnom svojstvu bočnog ogranka AK , interakciji između R skupina koje su udaljene za 3,4 aminokis. ostatka, voluminoznosti susjednih R skupina, pojavi glicinskih ili prolinskih ostataka, interakciji između aminkis. ostataka na krajevima uzvojnice i elekt. dipolu alfa uzvojnice. Stabiliziraju je i vodikove veze.
91
. Beta nabranu ploču čine
. Beta nabranu ploču čine dva ili više beta lanaca koji su međusobno povezani vodikovim vezama. Ovisno o smjeru beta lanaca beta ploče mogu biti antiparalelne, paralelne i mješane.
92
Tercijarna struktura je
Tercijarna struktura je trodimenzionalni raspored (konformacija) svih atoma jednog polipeptidnog lanca. Konfiguracija - geometrijski odnos između pojedinih skupina atoma, prijelaz iz jedne konfiguracije u drugu zahtjeva kidanje kovalentnih veza. Konformacija- prostorni raspored svih atoma u molekuli (rotacija skupina oko jednostrukih veza, kovalentne veze se zadržavaju).
93
Proteini topivi u vodi smataju se u
Proteini topivi u vodi smataju se u kompkaktne strukture s nepolarnom jezgrom (npr. Mioglobin).
94
Kapacitet mioglobina da veže kisik ovisi o
Kapacitet mioglobina da veže kisik ovisi o prisutstvu hema, nepeptidne skupine koja se sastoji od protoporfirina IX i središnjeg atoma željeza.
95
Hem je
Hem je nepeptidna skupina sačinjena od protoporfirina IX i središnjeg atoma željeza.
96
Unutrašnjost hemoglobina čine
Unutrašnjost hemoglobina čine gotovo u potpunosti nepolarni ostatci, jedini polarni su dva His ostatka ( kritična uloga u vezanju željeza i kisika) ,a površina mioglobina sadrži polarne i nepolarne ostatke.
97
Proteini koji grade biološke membrane smataju se
Proteini koji grade biološke membrane smataju se na način da na površini ostaju hidrofobni ostatci koji stupaju u interakciju sa susjednim alkilnim lancima, dok središte sadrži velik broj nabijenih i polarnih AK koje okružuju kanal napunjen vodom koji se nalazi u središtu?
98
Domene su
Domene su kompaktne glubularne jednice hrađene od 30- 400 AK ostataka , međusobno povezane fleksibilnim dijelom polipepidnog lanca
99
Oligomerni proteini su.
Oligomerni proteini su oni koji imaju više domena (vežu po nekoliko supstrata), mogu se međusobno udruživati te mogu nastati funkcionalni proteini koji su izgrađeni od nekoliko polipeptidnih lanaca.
100
Homomeri sadrže a heteromeri
Homomeri sadrže istovjetne polipeptidne lance, a heteromeri različite lance (podjedinice).

chemisty (2 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions