Clase 2 Flashcards
¿Cuáles son los criterios que una partícula debe cumplir para ser considerada viva? (Son 7)
- Metabolismo propio → toma compuestos del ambiente para transformarlos dentro de la célula y después liberar los desechos.
- Reproducción (crecimiento) → químicos del ambiente se transforman en nuevas células bajo la dirección de células preexistentes
- Diferenciación → forma una nueva estructura celular
- Comunicación → interacción de células, a través de compuestos que se liberan o capturan principalmente
- Movimiento → al menos en una parte de su ciclo de vida
- Evolución
- Barrera que diferencia del ambiente
¿Qué compone la mayoría de lo que está vivo?
Bacterias, y luego arqueas.
¿Qué significa COFGE?
Clase Orden Familia Género Especie
¿Qué implican los nuevos descubrimientos para la microbiología?
El microscopio de van Leeuwenhoek o los descubrimientos de Pasteur permiten darse cuenta de que las muertes estaban asociadas a las enfermedades causadas por los microorganismos. Conocerlos nos permitió enfrentarlos de mejor manera
¿Es fácil cultivar microorganismos? ¿Hay grupos que no hayan sido cultivados aún?
No es fácil debido a que tienen muchos requerimientos energéticos y de nutrientes que podemos no llegar a conocer, lo que nos lleva a no darles suficientes nutrientes o muchos, y se saturan. Sí hay grupos que no han sido cultivados, y es por esto mismo. También es importante considerar que los organismos que se intentan cultivar, se hacen por sí solos, cuando podrían estar siendo simbiontes de otros, que no lo estaríamos cultivando.
¿Con qué filogenia nos quedamos hoy en día? ¿A qué grupo perteneceríamos?
A los eucariontes se les separa en estos supergrupos, desaparecen un poco los reinos y estaríamos en Opisthokonta, dentro de los metazoos. Los hongos no serían un reino, sino que parientes de nosotros. (Imagen en el doc)
¿De qué trata la gran anomalía del conteo de placas?
Trata de que unos científicos al estar cultivando y luego observando microorganismos a través de microscopía, tenían ciertas colonias que daba un cierto número de células, que luego no calzaban con los que se estimaban a partir de su cultivo en medios de crecimiento en el laboratorio. Eso es porque de todos los microorganismos hemos logrado cultivar muy pocos, no teniendo aún las técnicas necesarias para hacerlo, por lo que en medios de cultivos no vamos a poder tener todos los microorganismos que se puedan encontrar en una muestra de agua por ejemplo.
Diga 3 características de un Microscopio óptico
Utiliza luz o fotones, aumento de hasta 1000 veces, su profundidad de campo es muy limitada, depende de la luz que atraviesa la muestra y usualmente son necesarias técnicas especiales para aumentar el contraste de la imagen
Diga 3 características de SEM (Microscopio electrónico de barrido)
Utiliza un haz de electrones en lugar de un haz de luz para formar una imagen. Las muestras se hacen conductoras metalizando su superficie. Gran profundidad de campo, permite enfoque a la vez de una gran parte de la muestra. Produce imágenes tridimensionales de alta resolución.
Diga 3 características de TEM (microscopio electrónico de transmisión)
Se juntan distintas tinciones. Utiliza iluminación puntual (sólo la luz que está dentro de este plano puede ser detectada), para reconstruir imágenes bi o tridimensionales. Entrega morfología y estructura de una comunidad.
Diga 3 características de la Citometría de Flujo
La muestra, ingresa a este sistema asociado a un fluido, que es lo que va a mover la muestra y hacerla pasar por un orificio por el que sólo pasan gotitas, que en cada una de ellas va 1 partícula
Esta partícula pasa a través de ≠s láseres y esa es la parte óptica
Cuando a la gota le impacta el láser, la partícula puede generar muchas cosas como desviar la luz, que va a ser detectado por los detectores de luz.
También se puede estimular a una cierta longitud de onda y luego es detectado y se junta información sobre las características ópticas de una partícula
Después de que la muestra pasa, se pueden seguir haciendo muchas cosas
Todo lo que ve en el detector por ej se puede mandar a un tubo y separar las células en función de sus características ópticas en ≠s tubos
MIENTRAS MÁS GRANDE MÁS VA A DISPERSAR LA LUZ
¿Qué es lo primero que hay que hacer en una extracción de ácidos nucléicos? ¿Cuál es el objetivo de esto?
Lisis celular
Mecánica: con algún agente mecánico como “beads “acoplado a agitación a alta velocidad
Química: basado en el uso de Lisozima y detergentes
Temperatura: basado en congelamiento/descongelamiento rápido de la muestra
Objetivo: identificar, mediante análisis de secuencias, los microorganismos presentes en el ambiente de estudio, su abundancia, y sus funciones
¿Qué es una sonda?
Una sonda es un pequeño fragmento de DNA o RNA complementario, en secuencia de bases, a la parte de un gen con el cual puede hibridarse
Describa la secuenciación automática de Sanger
Usa dideoxinucleótidos (ddNTPs) como terminadores de la cadena de DNA, marcados con radioactividad o con fluorescencia para su detección automática en secuenciadores
Como ninguna de las lecturas puede cubrir toda la longitud de la secuencia original, las lecturas pueden ser alineadas usando la superposición de sus extremos
Diseñó esta metodología de secuenciación que está basada en:
En la reacción se agregan ddNTPs, en vez de desoxinucleótidos que es lo que normalmente se incorpora
Marcados con reactividad o con fluorescencia para su detección automática en secuenciadores
¿Por qué se usa el gen 16S?
Porque es una molécula compartida en todos los organismos ribosomales (no virus), es abundante en la célula, muy conservado por lo que se puede saber bien su historia evolutiva, regiones variables y conservadas (se pueden hacer comparaciones en las que sí varían)
Limitación: se necesita una base de datos con la cual comparar
