CM1 et CM2 - Introduction et microbiologie Flashcards
(85 cards)
1
Q
Quelles sont les 4 grandes classes traditionnelles de micro-organismes
A
Les bactéries
Les virus
Les mycoses (champignons)
Les parasites
2
Q
Quelle est la structure d’une bactérie?
A
la paroi cellulaire est plus en externe que la membrane cellulaire
3
Q
Qu’est-ce que le plasmide?
A
Matériel ‘ADN/ARN extra-chromosomal, pas essentiel à la survie de la bactérie
4
Q
Différence entre les pili et les fimbrae?
A
Les deux sont des structures qui aident à l’adhérence et à la motilité
Les pili sont longs et les fimbrae sont courts
5
Q
Laquelle a la couche la + épaisse de peptidoglycans et lipopolysaccharrides: gram - ou +?
A
peptidoglycans: +
polysaccharrides: -
6
Q
Quelle est la nomenclature des micro-organismes?
A
- Genre (commence par une majuscule)
- Espèce (commence par une minuscule)
- Italique ou souligné dans les textes
7
Q
Sur quoi est basé le sérotype?
A
Basé sur types d’antigènes somatiques et flagellaires à la surface du micro-organisme
8
Q
Comment sont classées les bactéries
A
- Propriétés tincturales - Coloration de Gram; Gram +, Gram –
- Morphologie microscopique - Forme, arrangement et capacité à former des spores
- Exigence environnementale - Aérobie vs anaérobie
9
Q
Qu’est-ce que la nomenclature du groupe lancefield?
A
Nomenclature des bactéries selon les antigènes de leur enveloppe bactérienne: détermine si elles font partie du groupe A, B, C, etc. selon les antigènes de surface
10
Q
Couleur Gram + et Gram -
A
+: Purple for positive
-: rouge
11
Q
Dans la coloration de Gram, pourquoi est-ce que le violet de cristal reste accroché à la paroi bactérienne des bactéries Gram positif?
A
Couche plus épaisse de peptidoglycane qui retient le colorant violet.
De plus, les bactéries Gram négatif possèdent une membrane externe qui les empêche de fixer le violet de cristal.
12
Q
Formes de bactéries (4)
A
Cocci
Bâtonnet (ou Bacille)
Coccobacille
Spiralée
13
Q
Quelles sont les limites de la coloration Gram?
A
Faible quantité de bactéries sur l’échantillon clinique
* Absence de bactéries vues à l’examen microscopique
* Culture bactérienne positive
14
Q
Quelles sont les bactéries non visibles à la coloration Gram et pk?
A
Mycobactéries (tuberculosis): Elles possèdent une paroi riche en acide mycolique qui interfère avec la coloration de Gram.
Mycoplasma: une absence de peptidoglycane dans la paroi cellulaire
Chlamydia: rop petites, qui sont non cultivables en gélose et qui se reproduisent uniquement dans des cellules grâce à des structures appelées “corps élémentaire” et “corps réticulé”.
15
Q
Quelles sont les cocci gram +?
A
Staphylococcus
Streptococcus
Enterococcus
16
Q
Quel est le staphylocoque coagulase positive?
A
Staph. aureus
17
Q
Quelles sont les cocci gram -?
A
Neisseria
Moraxella
NB: Il existe plusieurs espèces de Neisseria non pathogènes. On les retrouve le plus souvent sur les muqueuses.
18
Q
Nomme des Bâtonnets Gram positif SPORULÉS et des maladies associées
A
Clostridium spp.
Bacillus spp.
19
Q
La spore permet une survie prolongée dans l’environnement. Les spores sont détruites par … 3
A
la stérilisation,
l’eau de javel et le peroxyde d’hydrogène.
20
Q
Nomme des batonnets gram -
A
21
Q
Nomme une bactérie batonnet gram - anaérobie stricte
A
Bacteroides fragilis est une bactérie anaérobie stricte
22
Q
- Les bactéries anaérobies … sont tuées par l’oxygène. Il faut les mettre dans un lieu où l’on aura remplacé l’oxygène par de l’azote pour leur croissance.
- Les bactéries anaérobies … peuvent croître en présence ou en l’absence d’oxygène.
+Exemples
A
- Les bactéries anaérobies strictes sont tuées par l’oxygène. Il faut les mettre dans un lieu où l’on aura remplacé l’oxygène par de l’azote pour leur croissance.
- Les bactéries anaérobies facultatives peuvent croître en présence ou en l’absence d’oxygène.
23
Q
Quelles sont les 3 étapes dans le traitement d’échantillons médicaux ainsi que leur description?
A
Pré-analytique
* Test demandé par le professionnel de la santé.
* Identification des specimens
* Échantillon prélevé et acheminé au laboratoire.
* Réception de l’échantillon au laboratoire de microbiologie.
Analytique
* Étalement de l’échantillon sur une lame microscopique : coloration de Gram
* Étalement de l’échantillon sur des «géloses»
* Géloses sont mises dans des incubateurs à 37°C
* Hémolyse, Coagulase, Catalase
Post-analytique
* Rapporter les résultats
* Transmettre les résultats
* Interpréter les résultats
24
Q
Nomme 3 atmosphères d’incubation
A
- Dans une étuve à l’air ambiant (21% d’O2)
- Dans une étuve à CO2
- Dans une tente anaérobie
Pour satisfaire les bactéries, certaines géloses sont incubées
25
Quand le médecin doit-il prescrire des hémocultures?
**Patient qui présente de la fièvre avec signes d’atteinte systémique sévères**: Atteinte de l’état général, Frissons solennels, Tension artérielle basse
**Lorsque certains diagnostics graves sont évoqués**: Méningite, Endocardite
26
Combien d'hémocultures sont prescrites ( =cmb de bouteilles)?
En général :
* le médecin **prescrit 2 hémocultures**
* L’infirmière **prélève 4 bouteilles**
27
Pourquoi une bouteille **aérobie et une anaérobie** dans les hémocultures?
La littérature montre que 10 mL (aé) + 10 mL (ana) = meilleur recouvrement de bactéries
* À cause des anaérobies (augmentation légère)
* Meilleure croissance de certaines bactéries aérobies dans les bouteilles anaérobies
28
Pourquoi prélever 2 hémocultures (40 ml de sang)?
**La probabilité de trouver la bactérie dans le sang dépend du volume de sang cultivé.**
* Plus le volume est grand, plus la probabilité est haute.
* Risque « coût-bénéfice » devient moins intéressant après 40 mL.
* Facteur le plus important pour trouver des bactéries dans le sang si elles sont présentes.
29
Quand prescrire plus que 2 hémocultures? 2
**Endocardite aiguë :**
* Obtenir 3 hémocultures < 2h, avant de débuter le traitement.
**Endocardite subaiguë** (germe en général peu virulent, patient non instable):
* Obtenir 3 hémocultures < 24h, avant de débuter le traitement.
* Prélever 2 autres hémocultures si la première série est négative après 24 heures.
30
Pourquoi prélever en « 2 temps » lors d'endocardites?
* Évaluer la contamination cutanée
* Évaluer le caractère continu de la bactériémie
31
Est-ce important de savoir quelle(s) bouteille(s) est (sont) +?
**Pas vraiment**
* Un S. epidermidis dans les 2 bouteilles d’une hémoculture n’est pas plus significatif que s’il était retrouvé dans une seule bouteille (contaminant probable).
* Même si on trouve un BGN seulement dans la bouteille anaérobie, probabilité demeure élevée que ça sera une bactérie aérobie.
32
Nomme des questions que le médecin doit se poser pour interpréter les résultats d'hémoculture.
* La bactérie rapportée est-elle reconnue comme un **pathogène ou un colonisant de la peau**?
* **Nombre d’hémoculture positive (pas le nombre de bouteilles)**? 1/2 vs 2/2
* Après combien d’**heures d’incubation**, l’appareil a-t-il détecté la croissance bactérienne?
* Le **lien** entre le site de l’infection et le germe identifié est-il **plausible**?
33
Contaminants: lesquels le sont jamais? 6
S.aureus
S.pneumoniae
Streptococcus pyogenes (Gr. A)
Listeria monocytogenes
E.coli
Candida albicans
34
Contaminant: lesquels en sont parfois/peut-être?
Staphylocoque à coagulase négative
Streptocoque du groupe viridans
35
Contaminant: lequel en est probablement un?
Bacillus spp.
36
Après combien d’heures d’incubation, l’appareil a-t-il détecté la croissance bactérienne?
* En présence d’une bactériémie, la majorité des hémocultures seront positives en moins de 24 heures (ex. levures, HACEK, etc).
* Les bouteilles d’hémoculture sont incubées un maximum de 5 jours avant de conclure qu’elles sont négatives.
37
Comment savoir si le lien entre le site de l’infection et le germe identifié est plausible? Expliquez avec des exemples
* Exemple de lien **plausible** : présence de Neisseria meningitidis dans l’hémoculture d’un patient hospitalisé pour une méningite.
* Exemple de lien **peu plausible** : présence de Streptococcus viridans dans l’hémoculture d’un enfant hospitalisé pour une méningite. Les Streptococcus viridans ne cause pas de méningite.
38
Les infections de cathéter (veineux ou artériel) peuvent être attribuables à des bactéries de la flore normale de la peau. La présence de ..cmb.. hémocultures positives à un germe de la flore normale de la peau devrait évoquer une infection de cathéter vasculaire.
2/2
39
Différenciez infection communautaire et nocosomiale
Une bactériémie **communautaire** est attribuable à une infection acquise dans la communauté si:
* Elle survient **< 48 heures après l’arrivée à l’hôpital**
Une bactériémie est qualifiée de **nosocomiale** si:
* Elle survient **> 48 heures après l’arrivée à l’hôpital**
ET
* Elle est attribuable à une condition infectieuse qui n’était **pas présente à l’arrivée à l’hôpital.**
40
2 types d'échantillons urinaires
* Analyse d’urine (laboratoire de biochimie)
* Culture d’urine (laboratoire de microbiologie)
41
L’urètre distale est ...
L’urine est ...
| stérile ou pas
L’**urètre distale** n’est **pas stérile**
L**’urine** est normalement **stérile**
42
Comment faire la différence entre la croissance de bactéries qui proviennent de l’urètre et celles qui proviennent de la vessie?
* Technique de prélèvement par mi-jet. = urine
* Culture quantitative de bactéries (>10^8 UFC/L).
43
v ou f
La présence de bactérie dans les urines sans symptômes associés nécessite toujours un traitement.
FAUX
La présence de bactérie dans les urines sans symptômes associés nécessite **très rarement** un traitement. (danger si enceinte)
44
Lisez les recommandations de prélèvement d'urine par mi-jet (Homme et Femme)
**Femme**
* Écarter le plus possible les genoux, lorsqu’assis sur la toilette.
* Avec les mains préalablement nettoyées, dégager le méat urinaire.
* Nettoyer la région vulvaire en commençant au-dessus du méat urinaire.
* Débuter la miction dans la toilette.
* Par la suite, transférer le pot stérile sous le jet urinaire.
* Terminer la miction dans la toilette.
**Homme**
* Rétracter le prépuce (si non circoncis).
* Avec les mains préalablement nettoyer, nettoyer la région du méat urinaire.
* Débuter la miction dans la toilette.
* Par la suite, transférer le pot stérile sous le jet urinaire.
* Terminer la miction dans la toilette.
45
Si on recherche **la gonorrhée ou la chlamydia**, quelle doit-être la technique de prélèvement utilisée (début ou mi-jet)?
Début de jet (urètre)
46
Quelle quantité de bactériurie est significative?
| NB: pas coulé dans le béton
* Un décompte bactérien de > 108 UFC/L (> 105 UFC/mL ) est traditionnellement jugé significatif.
* Des infections des voies urinaires sont parfois associées à un décompte plus faible (jusqu'à 105 UFC/L)
* La culture mi-jet est rapportée comme une "absence de croissance significative" s'il y a un faible décompte urinaire.
47
V ou F
Une culture d’urine positive = automatiquement un épisode d’infection urinaire.
Faux
Une culture d’urine positive **≠** automatiquement un épisode d’infection urinaire.
48
V ou F
Pour une culture urinaire, l'antibiogramme est disponible en moins d'1 heure
FAUX: IL Y A UN DÉLAI de 2-3 jrs avant de recevoir antibiogramme, MAIS le clinicien commence souvent à traiter avant
49
Comment expliquer l’inflammation avec culture d’urine négative? 3
* Culture faite après le début des antibiotiques
* L’inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre?, la prostate?)
* L’inflammation est causée par un microorganisme non cultivable.
50
Quels sont les principaux agents d'infection urinaire? 5 + le plus famous
*** E. coli**
* Proteus mirabilis
* Klebsiella pneumoniae
* Enterocococcus spp.
* Staphylococcus saprophyticus
51
Différenciez une infection urinaire haute/basse
**Symptômes d’infection urinaire basse**
* Brûlements mictionnels
* Hématurie macroscopique
* Urgence mictionnelle
**Symptômes d’infection urinaire haute**
* Idem à 1) +
* Douleur loge lombaire (punch rénal +)
* Fièvre
* Leucocytose
52
Quelles sont les méthodes de prélèvement pour un strept pyogenes
Culture de gorge
Dépistage de SGA par test rapide
Test Amplification des Acides Nucléiques (TAAN)
Sérologie - ASO
53
Culture de gorge: quels sont les rôles du MD?
Examiner la gorge (rechercher une inflammation des amygdales, rechercher des pétéchies, rechercher des sécrétions purulentes)
Abaisser la langue et frotter les amygdales avec une culturette Identifier l’échantillon
Compléter la requête de laboratoire
54
Que recherche la technicienne sur la gélose lors d'une culture de gorge pour un strept pyogenes
La technicienne recherche la présence de colonies β hémolytiques (= positif)
55
Lorsqu’un médecin prescrit une culture de gorge sans autre précision, les agents infectieux recherchés sont :
* Streptococcus β hémolytique du groupe A
* Streptococcus β hémolytique du groupe C
* Streptococcus β hémolytique du groupe G
56
Pourquoi indiquer si le patient est allergique à la pénicilline sur la requête? (culture de gorge)
* Pas de résistance à cet antibiotique = pas d’antibiogramme d’emblée
* Possibilité de cephalexine/cefadroxil si allergie non sévère
* Besoin d’un antibiogramme pour l’azithromycine/clindamycine: Sera fait seulement s’il est indiqué que le patient est allergique à la pénicilline
57
Comparer Culture de gorge vs test rapide vs TAAN (sensibilité, détection, délai, antibiogramme, coût)
58
Expliquer sérologie ASO – anticorps antistreptolysine
* Suite à une infection pharyngée par le SGA, il y aura production d’anticorps (Ac).
* Les Ac sont détectables 7-14 après le début des symptômes.
* Ne pas faire si suspicion d’infection aigüe à Streptococcus pyogenes.
59
La sérologie ASO est utile pour supporter un diagnostic de ...
La sérologie ASO est utile pour supporter **un diagnostic de rhumatisme articulaire aigu (RAA)**, une complication immunologique de la pharyngite à Streptococcus pyogenes.
60
Culture de plaie de surface: comment récolter le spécimen? 3
1) Nettoyer la plaie
2) Peser sur les tissus au pourtour
3) Prélever des sécrétions purulentes
61
Culture de plaie de surface: méthodes d'analyse
* Coloration de Gram
* Culture aérobie seulement
NB: Souvent contaminée par les bactéries de la flore normale cutanée = Choix « éditorial » des laboratoires sur ce qui est rapporté ou non rapporté
62
Culture de plaie de surface: quelles cellules devraient-on trouver ou non sur un prélèvement de QUALITÉ?
La qualité d’une prélèvement de plaie se mesure par :
*** La présence de polynucléaires
* L’absence de cellules squameuses**
Aussi dans le PP: absence de polynucléaires...
63
nomme des exemples de culture de pus profond
* Prélèvement fait en salle d’opération ou par un chirurgien.
* Prélèvement fait en radiologie d’intervention.
Idéalement, une seringue contenant du pus ou un morceau de tissue prélevé en profondeur.
64
Culture de pus profond: méthodes d'analyse
* Coloration de Gram
* Culture aérobie **et** anaérobie
| Risque de contamination théoriquement moindre que plaie superficielle.
65
Vrai ou Faux -Culture de pus profond
On y retrouve des polynucléaires et des bactéries
Vrai
66
Quels sont les principaux liquides biologiques normalement stériles? 5
* Liquide articulaire
* Liquide péricardique
* Liquipe péritonéal
* Liquide pleural
* Liquide céphalo-rachidien
67
Liquides biologiques normalement stériles : Que retouve-t-on à la coloration de gram et dans les cultures utilisées?
**Gram**
* Présence de neutrophiles
* Quantité abondante de bactéries (réponse rapide)
* Sensibilité faible à modérée
**Culture**
* Aérobie eet Anaérobie
* Même dans des bouteilles d’hémocultures
* **On « rapporte tout »** et le MD décide
68
Comment se fait le diagnostic de diarrhée à
Clostridioides difficile
**Selles non formées**
**Basée sur la recherche de toxines**
* Test rapide EIA
* Recherche du gène de la toxine par TAAN
69
Décris la technique EIA (GDH + toxine)
GDH: Antigène présent sur c. difficile, mais aussi sur d'autres clostridoides donc peu spécifique
Toxine: Recherche toxine libre
70
Explique le TAAN pour la C. difficile?
* TAAN plus sensible que les tests rapides EIA.
* Ce test **détecte le gène de la toxine et non la toxine libre.**
* Trop sensible?
* Risque de traiter des porteurs sains de souches toxinogènes.
* De plus en plus de laboratoires utilisent cette méthode.
* Algorithme diagnostique souvent nécessaire.
71
Comparer GDH vs EIA vs TAAN
(sensibilité, détection, spécificité)
voir tableau
72
Avantages et inconvénients de la recherche de pseudomembranes
**Examen assez rapide**
* Le gastro-entérologue va voir avec un colonoscope.
**Examen très spécifique**
* Le diagnostic différentiel est très limité.
**Examen peu sensible**
* La plupart des patients n’auront PAS de pseudomembranes.
* Associé à formes plus sévères.
73
Nomme des agents patho autres que c. diff qui peuvent causer. la diarrhée
**Bactéries entéropathogènes**
* Salmonella spp.
* Shigella spp.
* Yersinia enterocolitica
* E. coli
* Campylobacter spp.
**Virus**
* Norovirus (diarrhée épidémique)
* Rotavirus (enfants surtout)
**Parasites**
* Au Québec, giardiase surtout
74
Prévention des infections – Nomme les pratiques de base
Hygiène des mains
Hygiène respiratoire
* Tousser dans son coude
* Porter un masque si Sx respiratoires
Équipement de protection individuel (EPI) lors de situations particulières
* Gants/blouses/protection du visage
Utilisation et disposition adéquate des objets tranchants
75
Nomme des pathogènes se transmettant par voie aérienne. 4 (donc masque)
Rougeole
COVID-19
Tuberculose
Virus varicelle-zona
76
Nomme une maladie pour laquelle une chambre à pression négative est recommandée
Rougeole
L'air est tiré dans la pièce et avant qu'il ressorte il est filtré
77
Quel est le mécanisme d'action des Bêta-Lactamines
| Revoir
78
Péniciline: classe et voies d'administration
Classe : β-lactamines
Voies d’administration :
* Orale (V)
* Intraveineuse (G)
* Intramusculaire (benzathine)
79
ß-lactamines – quels sont les principaux effets secondaires? 4
* Allergie (fièvre et/ou éruption)
* Néphrite interstitielle
* Gastro-intestinal (diarrhée, nausée, colite à C.diff)
* Surinfection à Candida spp.
80
Quel est le spectre (général) de la péniciline ?
Streptocoques, Treponema pallidum, Bactéries anaérobies de la flore ORL
81
Ampiciline????
82
Quelles sont les bactéries productrices de ß-lactamases?
* **Staphylococcus aureus (non SARM)**
* Environ 35% des **Haemophilus influenzae**
* La plupart des **Moraxella catarrhalis**
* Tous les **Klebsiella pneumoniae**
* Environ 30% des **E. coli**
83
Quelles sont les 2 solutions pour inhiber les ß-lactamases
**Des antibiotiques qui résistent aux ß-lactamases**
* Cloxacil**line**/oxacil**line**/méthicil**line**
* Céfazo**line**
**Les inhibiteurs de ß-lactamases**
* Acide clavulanique
* Tazobactam
84
Pipéracilline/tazobactam ???
85
Nomme un bâtonnet gram + aérobie
Bacillus anthracis
-agent de l'anthrax
