Compléments du cours 10 Flashcards

(36 cards)

1
Q

Dit le nom complet de l’ADN et l’ARN

A

ADN:
acide désoxyribonucléique
ArN :
acide ribonucléique

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Q

De quoi son formés les nucléotides?

A

PO4(2-) et de nucléoside (constitués d’une base azoté et de pentose)

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3
Q

Explique les liaisons entre les molécules formant un nucléotide

A

Pentose - liaison phosphoester - phosphate (sucre à 5 c)
Pentose - liaison glycosidique -base azotée (formé d’azote et de carbone)

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4
Q

Quelles bases azotés sont:

a) des purines
b) des pyrimidines
c) font la liaison glycosidique à l’aide de l’azote (N) en position 9
d) font la liaison glycosidique à l’aide du N en position 1
e) ont deux cycle carboné
f) ont 1 cycle carboné

A

a) adénine et guanine
b) cytosine, thymine, uracile
c) les purines
d) les pyrimidines
e) purines
f) pyrimidines

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5
Q

Comment on distingue un brin d’ADN d’un brin d’ARN

A

Deux différnces
1)
ADN : on retrouve de la thymine
ARN : on retrouve de l’uracile a la place de la thymine
2)
ADN: 2-deoxy-beta-D-ribofuranose (c’est le pentose)
ARN: beta-D-ribofuranose
*la différence est qu’en position 2, ADN le pentose a un H et ARN il a un OH

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6
Q

Au ph de la cellule, le phosphate des nucléotide est chargé comment

A

possède deux charges négatives

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7
Q

Explique la structure d’un nucléoside

A

Formé d’une base azotée liée à un pentose

Liaison covalente N-glycosidique entre le C-1’ du sucre et N-1 des pyrimidines ou N-9 des purines

groupement OH

Chez les ribonucléosides: en 2’, 3’ et 5’

Chez les désoxyribonucléosides : en 3’ et 5’

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8
Q

Comment se forme les liaisons phosphoester entre le sucre et le phosphate?

A

OH du sucre est estérifiable par le PO4 (2-)

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9
Q

Nomme les nucléosides et explique la logique de la nomenclature

A

nomenclature : purine=osine, pyrimidine=idine

Adénosine, guanosine, cytidine, uridine

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10
Q
A
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11
Q

À quoi ressemble la structure de la majorité des nucléotides

A

ribonucléotides phosphorylés en 5’

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12
Q

Quelle est la liaison qui lie les 2ieme et 3 ieme phosphate accroché au pentose?

A

liaison phosphoanhydre

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13
Q

Quelle est la principale fonction des nucléotides?

A

transfert des groupements phosphates au substrat (énergise les substrats)

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14
Q

Nomme une autre fonction des nucléotides

A

transfert d’un groupe adénilyl, guanidilyl, cytidilyl,uridilyl ou thmidilyl

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15
Q

Différence entre un nucléoside et nucléotide

A

Nucléoside n’a pas de groupement phosphate

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16
Q

Donne l’abréviation pour l’adénosine 5’-monophosphate, la molécule de sucre qui le compose et si on le retrouve dans l’ADN ou l’ArN

A

AMP, ribose, ARN

17
Q

Quelle liaison relie les nucléotides entre eux

A

liaison phosphodiester 3’-5’

18
Q

dans quel sens se synthétise l’adn et l’ArN et dans quel sens on note les nucléotide

19
Q

Explique la règle de chargaff

A
  1. Ratio Pu/Py =1
  2. A=T et G=C

donc A+G = C+T mais A+T/G+C varie

20
Q

Lors du pairage de l’Adénine avec la tyrosine, comment a lieu la liaison

A

charge delta+ sur NH2 en pos 6 de l’Adénine rencontre charge delta -de O en pos 4 de la tyrosine

Charge delta - sur N en position 1 de l’adénine rencontre charge delta + de NH en position 3 de la tyrosine

2 liaisons

21
Q

Qu’est ce qui pourrait faire croire que les paires de base n’ont pas le meme diametre?

A

Parcequ’il y a trois liaisons entre G et C et seulement deux entre A-T et A-U

22
Q

Qui a decouvert l’adN

A

Watson et crick

23
Q

Explique les différences entre AdN B, A et Z

A

ADN B

hélice droite, favorisée en milieu aqueux, 10-10,5 base/tour, 0,34nm entre les pb

ADN A

hélice droite, 11 bases/tour, - espace entre les pb, + compacte, sillon égaux (pas de majeur et mineur)

ADN-Z

structure riche en G-C, hélice gauche, pas de sillon

24
Q

Quelles forces stabilisent l’ADN B

A

Effet hydrophobe (entre les paires de base)

Force de Van der Waals (empilement des bases)

Ponts H (AT et GC on se rappelle que GC plus fort que AT parceque 3 liaisons au lieu de 2)

Ponts salins (groupe phosphodiester neg et cation mg++)

25
Explique les conditions qui font varier la température de fusion TM avec le graphique de l'absorbance
lorsque l'absorbance augmente, on a plus d'ADN simple brin Lorsque l'absorbance diminue, on a plus d'ADN double brin Si on a plus de A-T, la température de fusion sera plus faible parce que lien moins fort qu'avec G-C donc plus facile à briser et donc absorbance augmente plus rapidement Si on a plus de G-C température de fusion plus grande parce que besoin de plus d'énergie pour briser 3 liaison absorbance augmente plus tard
26
Explique la notion de température de fucsion TM
Température a laquelle 50% de l'ADN est simple brin et l'autre 50% est double brin
27
Quelle est la structure quaternaire de l,ADN
la chromatine
28
Qu'est ce que le nucléosome
octamère d'histone autour duquel l'ADN s'enroule Cela constitue le premier niveau d'enroulement
29
De quelles prot est composé l'histone
H1, H2A, H2B, H3, H4 protéines basiques richez en lysine et arginine
30
Facteur de condensation du premier niveau d'enroulement
10X
31
Quelle structure on peut observer quand on met la chromatine en milieu de faible force ionique
il y a décondensation de la chromatine et on peut voir le collier de perle (ADN double brin qui lie les histones)
32
Combien de pb d'une perle à l'autre dans la structure en collier de perle
200pb
33
Explique le deuxieme niveau de condensation de l'AdN
forme solénoide 6 nucléosomes par tour (1200pb/ tour) Stabilisation par l'histone H1 facteur de condensation 4X (40X au total avec le premier niveau)
34
Explique le troisième facteur de condensation
Boucles et mini bandes 60 000 à 150 000 pb ancrées à une charpente de protéine NON-HISTONE enroulement des boucles en minibandes de 18 loupes facteur d'enroulement 200x en tout 10X+4X+200X (8000)
35
Explique la structure du chromosome
Empilement de minibandes stabilisé par des complexes de prot et d'ARN 2,4x10\*8 pb longueur 10 um 23 paires de chromo = 46 molécules d'ADN db
36