Cours 1

Question 1

4 méthodes phénotypiques?

Answer 1

Antibiogramme (difficile de distinguer les souches de la même espèce)
Biotypage (galerie API)

Sérotypage
Typage de phage (Méthodes peu discriminantes)

Question 2

MLVA? VNTR?

Answer 2

Multi Locus VNTR Analysis (Amplification régions head to tail)

Variable Number Tandem Repeats

Étudie le nombre et la longueur des séquences répétées

Question 3

Pulsovar?

Answer 3

Gel d’EGCP qui a été digitalisé

Question 4

Critères de Tenover?

Answer 4

Permet d’analyser les EGCP selon le nombre de bandes qui se ressemble. Donne une réponse sur le lien épidémiologique

Question 5

MLST?

Answer 5

Multi Locus Sequence Typing

Pour étudier les populations ET le long terme (seul campylobacter)

Environ 7 gènes (house keeping genes)

Question 6

WgMLST?

Answer 6

MLST avancé = comparaison avec arbres phylogénétiques gène par gène digitalement

Question 7

SNVphyl?

Answer 7

Single Nucleotide Variant

Détecte les variations de 1 nucléotide (sequencage d’adn)