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Biochimie 2 > Cours 1 > Flashcards

Cours 1 Flashcards

(93 cards)

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1
Q

Quels sont les éléments qui constituent jusqu’à plus de 95% de la masse corporelle des mammifères

A

C, O, H et N

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Q

Carbone représente combien pour-cent matière sèche des substances organiques

A

50%

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3
Q

Quels sont les éléments qui constituent environ 3 % de la masse corporelle

A

Na, K, Mg, Ca, Cl, S et P

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4
Q

Les oligo éléments représentent combien de pourcentage de la biomasse indispensable aux organismes

A

<0,01%

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5
Q

Carences en fer entraîne quoi

A

Anémie

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6
Q

Carence en iode entraîne quoi

A

Perturbation du développement

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7
Q

Constitution fer

A

4 chaînes polypeptidiques qui possède chacune un heme associé à un ion Fe2+

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8
Q

Chaque heme peut fixer quoi

A

1 molécule d’O2

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9
Q

Chaque partie protéique peut s’associer à quoi

A

Au CO2

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10
Q

Symptômes anémie

A

Pâleur muqueuse
État fatigué
Baisse appétit
Détérioration qualité vie

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11
Q

Carence en iode effets :

A

Production hormones T3 et T4 par la thyroïde repose sur utilisation iode > carence iode entraîne désordres hormonaux

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12
Q

Carence en iode plus grande cause évitable de quoi

A

Retard mental

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13
Q

Qu’est ce qui a favorisé le dev cérébral humain

A

Conso aliments iodés (produits mer)

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14
Q

Carbone de Valence : caractéristiques

A

La Valence d’un élément chimique est le nombre maximal de laissions qu’il peut former avec d’autres éléments

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15
Q

Atome C tetravalent

A

Peut établir au max 4 liaisons avec d’autres atomes

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16
Q

Liaison simple du carbone

A

Lié à 4 autres atomes
- 4 liaisons vers les 4 sommets d’un tétraèdre régulier
- libre rotation des groupes d’atomes reliés aux 2 carbones
- représentation de cram

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17
Q

Représentation de cram

A

Liaisons des atomes situés dans le plan de la feuille sont indiqués par un trait fin
Liaisons des atomes qui sont au dessus du plan sont représentés par un trait épais
Liaisons au dessous du plan sont représentés par un trait hachuré

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18
Q

Carbone double liaison

A

Atome carbone lié à 3 autres atomes
- structure plane : tous les atomes de la molécule sont dans le même plan
- Angle entre les liaisons est le même pour toutes les liaisons : 120°C
- liaison double peut pas tourner librement (ça empêche rotation des groupes d’atomes reliés aux 2 carbones)

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19
Q

LIASION triple du carbone

A

Atome C lié à 2 autres atomes
- structure plane contenant les 3 atomes
- les 3 atomes sont alignés (angle de 180°)

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20
Q

Exemple de composé carbone

A

Hydrocarbure

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21
Q

Hydrocarbures

A

Molécules uniquement formés de H et de C
Peuvent être linéaires, ramifiés ou cycliques

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22
Q

Hydrocarbures ont ils un intérêt pour la biochimie ?

A

Non car participent pas volontiers à de nombreuses réactions chimiques
C’est quand d’autres atomes remplacent les H > des molécules plus réactives apparaissent = substituants

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23
Q

Les substituants les plus courants dans les cellules

A

Oxygène
Azote

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24
Q

Substituants plus rare dans les cellules

A

Souffre
Phosphore

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25
Groupe fonctionnel confère quoi à une molécule
Propriétés et des réactivités particulières
26
Plupart molécules possèdent plusieurs groupes fonctionnels : nom ?
Molécule multi-fonctionnelle
27
Versatilité du carbone
Combinatoire chimique très riche Permet au C d’occuper une place très importantes dans substances organiques Permet construction molécules aux géométries diff
28
Propriétés molécule déterminées par
Nb et nature atomes qui les constituent Arrangement atomes en groupes fonctionnels Géométrie des liaisons Géométrie 3D des molécules
29
Importance géométrie moléculaire pour les prot
Permet interaction avec leur ligand Modèle clé serrure : structure tridimensionnelle enzyme permet formation surface complémentaire avec substrat
30
Isomère
Molécule avec même formule brute mais structure diff
31
Isomères de constitutions
Se distinguent par leur connectivité (succession atomes et liaisons) (Même formule brute mais demi dev diff)
32
Stereoisomeres
Même connectivité mais organisation spatiale diff
33
Isomère de configuration (classe de stereoisomere)
Organisation 3D diff (non réversible)
34
Isomère de confirmation (classe de stereoisomere)
Organisation 3D diff (réversible)
35
Stereoisomere de conformation
Même formule brute et demi dev Même connectivité Mais pas même organisation 3 D (réversible) = confomeres Rotation autour liaison simples possible Atomes peuvent pivoter les uns par rapport aux autres et adopter conformations diff Lors changement conformation : pas de rupture de liaison Fonction prot peut être modif par changement conformation
36
Stereoisomere de configuration : configuration Cis-Trans
Même formule brute et demi dev et connectivité Mais organisation spatiale diff (non réversibles) Pas de rotation autour double liaisons donc pas passage config à l’autre sans rupture liaison
37
Exemples de cis transomeres
Configuration Cis : substituants des atomes voisins de C se trouvent du même côté de la double liaison Configuration Trans : substituant des atomes voisins de C se trouvent de part et d’autre de la double liaison
38
Les réactions chimiques dans la cellule
Oxydo réduction Formation et rupture de liaisons Transfert de groupes
39
Réaction d’oxydo réduction permet quoi
Synthèse atp
40
C’est quoi réaction oxydo réduction
Réaction chimique au cours de laquelle il se produit un échange d’électrons entre 2 molécules
41
Oxydation c’est quoi
Libération électrons (libération énergie)
42
Réduction c’est quoi
Consommation électron
43
Électrons peuvent se balader dans le milieu ?
Non Oxydation s’accompagne tjs réduction : électrons peuvent pas circuler seuls et transfères molécule à autre
44
Forme réduite ou oxydée ? NAD+
Oxydée
45
Forme réduite ou oxydée ? NADH
Réduite
46
Réaction oxydo réduction entraîne passage de ions quoi ?vers quoi ? Entraîne quoi ?
Ions H+ contre leur gradient Retour ions H+ dans matrice mitochondrie est couplée avec synthèse atp
47
Simple liaison convalente correspond à quoi
Mise en commun de 2 électrons entre ces 2 atomes
48
Façons rompre liaison convalente
- homolyse - hétérolyse
49
Homolyse
Rupture liaison convalente chaque atome retient l’un des deux électrons du doublet d’électrons liants
50
Heterolyse
Rupture liaison convalente générant un anion et un cation. Les 2 électrons qui formait la liaison sont réassignés à un seul atome
51
Nucleophile
Aime les charges positives
52
Condensation
À l’origine de la formation de macromolécules
53
Hydrolyse
À l’origine de la dégradation des macromolécules
54
Phosphorylation
Transfert de groupes entre molécules distinctes
55
Réarrangement : transfert d’un groupe au sein d’une molécule
Déplacement d’un substituant
56
Enzymes
Catalysent réactions cellulaires
57
Liaisons faibles
Forces électrostatiques généralement de faible force
58
Liaison convalente facile à rompre ?
Non difficile
59
Liaisons convalente permettent quoi
Association atomes et dc formation bio molécule
60
Comment mesurer force d’une liaison convalente
Énergie qu’il faut apporter pour la rompre Dépend : - electronegativite Distance electrons nucléons Charge nucléaire Numéro électrons impliqués
61
Liaisons faibles font quoi
Stabilisent structure macromolécule et complexes Permettent asso prot et ligand Peuvent s’établir spontanément Conduisent pas liaison durable sauf si nombreuses Facilement t rompues
62
H2O polaire ou apolaire
Polaire
63
Ponts salins
Liaison faible qui se forme entre 2 ions chargés de manière opposée
64
Molécules d’eau interagissent entre elles par quoi
Liaison hydrogène
65
Liaison hydrogène se forme entre ?
- un H lié à un atome électronégatif (donneur H) - un atome accepteur d’H ayant au moins une paire d’électrons non engagés dans une liaison convalente
66
Molecules apolaires hydrophobes ?
Oui
67
Quelle situation stable est spontanément adoptée
Celle où le plus de liaison faibles sont établies ou préservées
68
Molécule polaires comportement avec eau
Liaisons h avec eau + solubles dans eau
69
Molécules apolaires comportement avec eau
Insolubles dans eau + regroupement par effet hydrophobe
70
Molécules amphipatiques comportement avec eau
Région hydrophile et région hydrophobe Peuvent établir liaisons avec eau + interagir avec molécules hydrophobes
71
Petites molécules chargées sont polaires ou apolaires
Polaires
72
Force de van der waals
Entre 2 atomes lorsque ils sont à faible distance Énergie très faible et diminue quand atomes s’éloignent Quand très nombreuses Qd atomes trop proche : répulsion Qd attraction = répulsion : contact de van der Waals
73
Rayon de van der waals
Distance à laquelle 2 atomes sont en contact de van der waals
74
Liaisons faibles importance
Structure des grandes molécules (stabilité) Stabilisé interactions prot avec ligand
75
Structure proteine déterminée par
Établissement liaisons faibles entre ses composants Interactions entre ses composants et le milieu environnant
76
Liaisons convalente peuvent stabiliser structure 3D ?
Oui Ex : pont disulfure
77
Pepsine
Enzyme digestive liberee dans estomac Digéré prot dans intestin grêle
78
Trypsine
Enzyme digestive du suc pancréatique Digére prot dans intestin grêle
79
Phosphatases alcalines
Enzymes catalysent dephosphorilisation Dans tous tissus organismes Particulier concentrée dans conduits biliaires
80
Estomac pH
<2
81
Intestin grêle pH
Neutre
82
Conduits biliaires pH
Entre 7,6 et 8,6
83
Activité enzymatique dépend pH ?
Oui Permet confiner activité enzymatique dans certaines régions organisme
84
Acides forts
Réagissent totalement avec eau
85
Acides faibles
En équilibre avec son conjuguée
86
Plus le pka d’un acide est élevée plus l’acide est
Faible
87
Formule pka
-log ka
88
Quand pH < pka-1 quelle forme majoritaire
Acide
89
Qd pH > pka+1 quelle forme majoritaire
Base conjuguée
90
Qd pka-1 < pH < pka+1 quelle forme majoritaire
Acide et base conjuguée coexistent
91
Calpha asymétrique ?
Oui car asso a 4 constituants diff
92
Glycine asymétrique
Non
93
Système tampons
Acide faible et sa base conjuguée Provoque changement de ph à l’ajout d’une petite quantité d’acide ou de base

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