Cours 1 Flashcards
(162 cards)
1
Q
Avant 1945, que pouvions-nous observer au photonique?
A
- noyau
- mito
- cyto (hyaloplasme)
- plastes
- vacuole
- cristaux
2
Q
Qu’est-ce que l’hyaloplasme?
A
solution colloïdale de prots et d’ions
3
Q
Centrifugation différentielle permettait d’avoir quoi?
A
culots de:
- noyaux
- mito
- Hyaloplasme (fraction soluble)
4
Q
En 1945, qui observe la c au MET?
A
Keith Porter
5
Q
Keith Porter observe quoi? Et avec quoi?
A
- Réseaux de membranes délimitant des cavités et portant ou non des particules sur la face cytosolique
- MET
6
Q
Keith Porter remarque quoi au MET?
A
- Espace entre les organelles est peuplé de sacs membranaires
- réseau de membranes = RE et ne s’étend jamais dans l’ectoplasme périphérique
7
Q
Ultracentrifugation permet d’obtenir quoi?
A
Nouveau culot: microsomes
8
Q
Qu’est-ce que des microsomes?
A
Artefact (membrane de RE): petite vésicule avec bcp d’ARN
9
Q
En 1956, qui montre la relation entre les microsomes et le RE?
A
Palade et Siekevitz
10
Q
Qui montre que microsomes sont des artefacts?
A
Palade et Siekevitz
11
Q
Donne la définition du RE
A
Réseau de saccules et de tubules qui portent ou non des ribosomes sur la face cytosolique
12
Q
V du RE =
A
10% celui de la c
13
Q
Surface du RE =
A
50% de la surface membranaire cellulaire
14
Q
Quelles sont les 4 formes du RE avec leurs caractéristiques
A
- Tubules: petits tubes
- Saccules: sacs aplatis
- Citernes: sacs gorgés
- Vésicules: petites sphères
15
Q
Comment le contenu d’un saccule est transféré au prochain saccule?
A
Fusion des membranes
16
Q
Lumière du RE est en continuité avec…
A
- Lumière du golgi
- Lumière des vésicules
- Milieu extérieur
17
Q
V ou F: la composition de la membrane du feuillet cytosolique du RE a la même composition que le milieu extérieur
A
F: Feuillet qui fait face à la lumière du RE
18
Q
Quelles sont les caractéristiques du REG?
A
- Ribosomes sur le feuillet cytosolique
- sacc ou citernes formés de feuillets membranaires aplatis qui favorisent l’adhésion des ribosomes
- Abondant dans les c qui font les prots
19
Q
Quelles sont les caractéristiques du REL?
A
- Pas de ribosomes
- Forme tubulaire –> augmente le rapport surface/volume –> favorise les interactions avec les prots du cytosol
- synthèse des lipides
20
Q
Quelles sont les caractéristiques du RE de transition?
A
- Endroit où se forment les vésicules de transition
- Ribos sur le feuillet proche du noyaux
- Pas de ribos sur feuillet proche du golgi
21
Q
Est-ce que le fait que l’intérieur du noyau (nucléoplasme) soit topologiquement en continuité avec le cytosol c’est surprenant?
A
Non, car ADN des c pro baignent dans le cytosol
22
Q
Pourquoi le plasmocyte a des REG développé?
A
Car il fait les Ac qui sont des prots
23
Q
Ensemble, comment sont les REL et RER?
A
En continuité
24
Q
V ou F: seulement 20 protéines diffusent entre le REL et RER
A
Faux, la majorité des subs diffusent entre les 2
25
Quelle est la différence de la composition membranaire entre le REL et RER?
20 prots qu'on retrouve chez le RER, mais pas REL
26
Donne 2 exemple de prots qu'on retrouve chez le RER, mais pas REL
1. Prots pour attacher les ribosomes au REG
| 2. Prots pour donner la forme aplatie aux saccules du REG
27
Quel est le mécanisme de ségrégation des prots entre le REL et RER?
Pas connu, mais on ne pense pas que ça soit dû au fait que le REL soit fait de tubule
28
Comment varie l'abondance du RER et REL dans une c?
Selon ses besoins
29
Que contiennent les c spécialisées dans le métabolisme des lipides?
Bcp de REL
30
Donne un exemple de c qui a bcp de REL
Hormones stéoridiennes des glandes sexuelles
31
Que contiennent les c qui font les prots, enzymes et hormones peptidiques?
Bcp de RER
32
Donne un exemple de c qui a bcp de RER
c d'un acinus du pancréas
33
De quelle forme sont les ribosomes?
Sphérique
34
Quel est le diamètre des ribosomes?
20-30 nm
35
De quoi est constitué les ribosomes (composition)?
ARN et prots
36
Où se font les ribosomes?
Nucléole
37
Comment est le coefficient de sédimentation des ribosomes? Pourquoi?
1. Petit
| 2. Dense et petit
38
Est-ce que les 2 sous-unités des ribosomes doivent être liés?
Oui
39
Décris la grosse unité des ribosomes
1. 60S
2. liée à la chaine peptidique et catalyse la formation de liens peptidiques et permet de s'attacher au REG
3. 49 prots
4. 3 ARNr: 5S, 5,8S, 28S
40
Décris la grosse unité des ribosomes
1. 40S
2. liée à ARNm
3. 33 prots
4. 1 ARNr: 18S
41
Qu'est-ce qu'un polysome?
Ensemble des ribosomes qui travaillent sur le même ARNm
42
Les polysomes sont-ils toujours libres?
Non, peuvent être au REG aussi
43
Quel est l'enjeu du REG?
Faire sous-etiquettage des prots
44
V ou F: il y a 2 types de ribosomes, soient les ribosomes libres et ceux sur le REG
Faux, ce sont les meme ribos
45
Quel genre de ribosome fait les prots cytosoliques?
Polysome LIBRE dans le cytosol
46
Quel genre de ribosome fait les prots de sécrétion?
Polysome FIXE au REG
47
Qu'est-ce qui va faire en sorte que la traduction va se terminer ou non dans le cytosol?
Type de prots
48
PSIT permet quoi?
À la séquence d'aa de se fixer au REG
49
V ou F: avec le PSIT, une séquence en U émerge de la petite sous-unité
Faux: c'est la grosse
50
Qd le PSIT intervient, quelle sont les 2 possibilités pour les prots (genre où elles vont)?
1. Reste dans le cytosol
| 2. Enchassées dans la membrane avec 1 ou plusieurs hélices-a
51
Qd PSIT est là, on fait...
Cotraduction
52
Souvent PSIT est où dans la prots?
Extrémité
53
On dit que la cotradiction de base est qd...
La prots reste dans la lumière de RE
54
Quel est l'acteur qui permet au PSIT de se lier?
PRS
55
Comment fait pour amener prot au REG?
Encadre PSIT
56
Lorsque le PRS encadre le PSIT, quelle est la conséquence?
Arrête la traduction
57
Quelles sont les dimensions du PRS?
24nm (long) x 6nm (largeur)
58
Quelle est la constitution du PRS?
6 prots + ARN PRS ---> forte teneur en métionine
59
PRS a comme 2 parties et chaque partie se lie à quelque chose de diff...
Une se lie au PSIT et l'autre au ribosome
60
Quel est le but du PRS?
Faire passer aa dans la lumière du RE, alors besoin d'une ouverture et c'est le récepteur qui va permettre cette ouverture
61
Quelle est la famille d'une des prots de PRS et quel est son rôle?
1. Famille des prots G
| 2. Hydrolyse le GTP
62
Où est le récepteur de PRS?
Enchâssé dans la membrane
63
Prots du PRS sont de quelle famille?
G
64
Se lie ____ pour aller vers ___
1. Au duo PRS, ribo
| 2. Complexe de translocation
65
Donne les étapes de l'intervention du récepteur de PRS
1. Hydrolyse GTP lié au PRS
2. libération du PSIT
3. Fixation au complexe de translocation
4. ouverture du pore du complexe de trans
5. PRS et sont récepteur ne sont plus liés au ribo
6. Reprise de la synthèse vers la lumière
66
Donne les étapes de l'intervention du PRS
1. Liaison au PSIT
2. Arrêt de la traduction
3. PRS se lie à son récepteur
4. Rapprochement vers complexe de trans
5. PRS se détache
6. Reprise de la synthèse vers la lumière
67
Pourquoi nécessaire de bloquer la synthèse de l'ARNm par PRS?
Car sinon on va avoir une prot dans le cytosol
68
Que fait la peptidase du signal?
Coupe PSIT, mais PSIT demeure attaché pour garder le pore ouvert et permettre l'entrée de la prot dans la lumière
69
Lors de la cotradiction, qu'arrive-t-il lorsque l'extrémité COOH pénètre dans la lumière?
Complexe de translocation s'ouvre latéralement pour libérer prot dans lumière
70
Dans la cotradiction, qui dégrade la prot en aa une fois qu'elle est dans la lumière?
Peptidases
71
Est-ce que c'est la peptitase signal qui dégrade la prot en aa une fois qu'elle est dans la lumière?
Non, d'autres Peptidases
72
Quels sont les 5 types de prots que peuvent faire RE?
1. Prots dans la lumière
2. Prots enchâssées par SAT
3. Prots enchâssées par PSIT interne
3. Prots enchâssées 2+hélice-a
4. Prots ancrées via phospholipides
73
Que fait SAT et que permet-il?
1. Arrêt de la séquence
| 2. Varier les prots
74
SAT est hydrophobe ou hydrophile?
hydrophobe
75
Prots enchâssées par SAT fonctionne comme Prots dans la lumière, sauf...
SAT qui va se fixer au complexe de translocation et va se fixer dans la membrane (vu qu'il est hydrophobe), alors cotraduction arrête
76
Est-ce que quand il y a 1 SAT, PSIT est excisé?
Oui
77
Qd on a 1 SAT, dis où sont les diff parties de la prot
1. NH2 dans lumière
2. Partie hydrophobe dans lumière
3. SAT enchâssé
4. COOH dans cytosol
78
Donne les étapes lorsque SAT intervient (Prots enchâssées par SAT)
1. PSIT commence cotradiction: NH2 dans lumière
2. SAT arrive
3. SAT reste enchâssé dans la membrane
4. Traduction de la partie qui est dans le cytosol
79
Où est le PSIT dans Prots enchâssées 1 hélice-a?
Extrémité NH2
80
Où est le PSIT dans Prots enchâssées par PSIT interne?
Intérieur de la séquence
81
Dans une Prots enchâssées par PSIT interne, est-ce que le PSIT peut être excisé? Pourquoi?
1. Non
| 2. Fait partie de la prots
82
Dans les Prots enchâssées par PSIT interne, quelle va être la diff entre les parties qui sont dans le cytosol et celles qui sont dans la lumière?
Cytosol va faire la traduction et lumière: cotradiction
83
C'est dans quelle circonstance que NH2 est dans lumière?
Qd il y a plus d'aa positif entre PSIT et COOH
84
C'est dans quelle circonstance que COOH est dans lumière?
Qd il y a plus d'aa positif entre PSIT et NH2
85
De quoi est constitué une prots enchâssée 2+ hélice-a dans membrane?
Alternance de PSIT et SAT
86
Prots ancrée dans membrane du RE via phospholipides peuvent être ancrées où?
Feuillet luminal ou cytosolique
87
Quelle est la diff entre prots ancrées du Feuillet luminal et cytosolique?
Cytosolique de transite pas vers le REG
88
Comment une prots peut devenir ancrée au feuillet luminal?
1. Au début c'est semblable au PSIT pour extrémité NH2
2. COOH reste ancrée dans la membrane
3. Enzyme coupe proche de COOH et l'attache à GPI
4. Prots a donc une partie extracaire
89
Comment une prots peut devenir ancrée au feuillet cytologique?
1. prots synthétisée dans cytosol
| 2. Attache à un ag
90
Est-ce que peptidase signal agit sur tous les PSIT?
Non: juste ceux à l'extrémité
91
Prots enchâssées dans membrane du RE peuvent se retrouver:
1. Membrane du golgi
2. Membrane d'u réseau endosomes-lysosomes
3. Membrane plasmique
92
Donne des exemples d'incorporation cotraductionnelle
pas mal tout ce qu'on voit, car prot transférée dans lumière pendant cotraduction de ARNm
93
Donne des exemples d'incorporation posttraductionnelle
Ce qui se passe chez bcp d'organelles: peroxysome, noyau, mito, chloro, etc
94
Qu'est-ce que la glycosylation?
Ajouter un oligosacc à prots, lipides ou polysoc
95
Dans la glycosylation, nommes les 2 liaisons possibles:
o-glycosidique et n-glycosidique
96
Donne un exemple de liaison o-glycosidique
liaison de n-acétylgalactosamine au OH de thréonine ou sérine
97
Donne un exemple de liaison n-glycosidique
liaison de n-acétylglucosamine au NH2 de l'asparagine
98
Parmi les 2 types de liaisons dans la glycosylation, laquelle est plus rare:
o-glycosidique
99
Parmi les 2 types de liaisons dans la glycosylation, laquelle se passe dans le golgi:
o-glycosidique
100
Parmi les 2 types de liaisons dans la glycosylation, laquelle commence dans le RE et finit dans le golgi
n-glycosidique
101
Qu'est-ce qu'une liaison o-glycosidique?
sucre attaché à aa via OH
102
Qu'est-ce qu'une liaison n-glycosidique?
sucre attaché à aa via NH2
103
Quelle est la constitution d'un oligosacc de base?
9 mannoses + 3 glucoses + 2 n-acétylglucosamines
104
Pourquoi c'est important de glycosyler?
Pour donner une sous-étiquette dans le RE et étiquette dans le golgi
105
Quelles sont les étapes de la glycosylation de l'asparagine?
1. Construction de l'oligosacc
2. Transfert de l'oligosacc
3. Modification de l'oligosacc
106
Que se passe-t-il lors de la construction de l'oligosacc (glycosylation)?
Chaque monosacc est ajouté avec une enzyme spécifique et ce passe sur le dolichol qui est déjà phosphorylé, alors pas besoin d'E
107
Que se passe-t-il lors du transfert de l'oligosacc (glycosylation)?
1. Transfert grâce à oligosaccharyl transferase
2. Transfert se fait en bloc
3. 1 oligosacc transferase/complexe de translocation
108
Que se passe-t-il lors de la modification de l'oligosacc (glycosylation)?
Glucosidase 1 coupe 2 des 3 glucoses et 1 mannoses
109
Qu'est-ce que le dolichol?
lipide phosphorylé (alors activé) qui a des longues chaines hydrophobes qui traversent les 2 feuillets de la membrane du RE
110
De quel côté est le site actif de l'oligosaccharyl transferase?
luminal
111
La modification de l'oligosacc permet quoi?
De transférer le tout au golgi
112
Est-ce que toutes les asparagines vont être glycosylées?
Non, car dépend de la séquence d'aa qu'on a
113
Quel est le rôle du RE dans la détoxication?
va transformer les drogues hydrophobes en molécules hydrophiles pour qu'elles se solubilisent dans l'eau et soient excrétées
114
Juste avant d'être excrétées, les drogues maintenant rendues hydrophiles vont où? Pourquoi?
1. Dans la lumière
| 2. Car c'est le milieu ext
115
Dans les c ____, on retrouve bcp de RE pour la détoxification
hépatiques
116
La synthèse du cholestérol et phospholipides commence où?
cytosol
117
Lorsque la solubilité dans l'eau du cholestérol et phospho devient trop faible, va où?
Feuillet cytologique de la membrane du RE
118
Comment les phospho d'incorporent dans la membrane? C'est quoi la conséquence?
1. Via le feuillet cytosolique
| 2. Asymétrie
119
Quels sont les 2 enzymes qui jouent un rôle dans le déplacement des phospho dans la membrane du RE?
Scramblases et translocases
120
Que font les scramblases?
Prenne n'importe quel phospho et le mette vers le feuillet luminal, car la qu'il en a le moins, alors genre de diffusion simple
121
Que font les translocases?
Prenne des phospho particuliers et vont contre le gradient, alors genre de transport actif, car nécessite de l'ATP
122
Lors de la synthèse des lipides, pourquoi on finit dans la membrane?
Car ils sont rendus hydrophobes
123
Pourquoi le glycocalyx est toujours dans le milieu extérieur?
car glycosylation a lieu dans la lumière du RE = milieu extra caire
124
Comment RE fait les membranes?
Bourgeonnement de la membrane du RE--> vésicule --> golgi --> membrane plasmique
125
De quelle manière les prots arrivent dans la membrane?
de manière vectorielle
126
De quel côté se fait la glycosylation?
lumière du RE = milieu extérieur
127
Transferase font basculer phospho ___
Spécifiques
128
Donne un exemple de transferase
Phosphatidylcholine
129
V ou F: durant le bourgeonnement, les feuillets de la membrane des vésicules changent selon leur destination
F: ils gardent leur identité
130
Quel rôle joué le RE au niveau des cavités?
ségrégation
131
Lors de la ségrégation dans les cavités, RE agit sur...
Les prots d'exportation et les ions Ca2+
132
Lors de la ségrégation dans les cavités, quel rôle joue le RE dans les prots d'exportation? Donne un exemple
1. Une fois dans les cavités du RE, les prots ne peuvent revenir vers le cytosol, alors vont subir des modification 2. comme la glycosylation
133
Lors de la ségrégation dans les cavités, quel rôle joue le RE dans les ions Ca2+?
ions Ca2+ rentre dans RE grâce à Ca2+ATPase + prots du RE aide à mtnir en place les ions Ca2+
134
Quel est le nom de la prot du RE qui aide à mtnir les ions Ca2+ dans le RE?
Calsequestrine
135
Chez quel c le rôle du RE au niveau des ions Ca2+ est important?
c des muscles
136
Le passage des ions Ca2+ dans RE implique...
E, car va contre le gradient (sinon [] seraient les memes des 2 bords)
137
Dans le transport vésiculaire, qu'arrive-t-il si la prot n'a pas la bonne conformation? (juste dire 1re étape)
1. calnexine va se fixer au dernier glucose pour la forcer à rester dans le RE et lui donner le temps d'avoir la bonne conformation
2. Après, glucosidase 2 enlève le dernier glucose et libère la prots de la calnexine pour qu'elle parte
3. Glycosyltransferase vérifie si la conformation est ok
138
Dans le transport vésiculaire, qu'arrive-t-il si la prot n'a pas la bonne conformation? (et que calnexine marche pas)
1. On va mettre des chaperone
2. Chaperone dirige la prot vers un complexe de translocation
3. Prot va dans cytosol (rétrotranslocation)
4. Destruction de la prot
139
Dans le transport vésiculaire, qu'arrive-t-il si la prot a la bonne conformation?
Peut partir!!!
140
Lorsque Glycosyltransferase vérifie si la conformation est ok, qu'arrive-t-il si la prot est mal repliée?
Glycosyltransferase rajoute 1 glucose et on recommence le cycle avec la calnexine
141
Lorsque Glycosyltransferase vérifie si la conformation est ok, qu'arrive-t-il si la prot est bien repliée?
Peut partir!!!
142
Qu'est-ce que la rétrotranslocation?
Qd on met prot (ou quelque chose d'autre) de la lumière au cytosol
143
Donne les étapes de la destruction de la prot quand calnexine et chaperone ne fonctionnent pas
1. N-glycanase coupe oligosacc
2. Queue avec bcp d'ubiquitines ajoutée à la prot
3. ubiquitines font puissant signal de dégradation
5. Prot est conduite dans les protéasomes pour qu'elle soit hachée en aa
144
Calnexine est un ___ qui nécessite ___ pour fonctionner
1. Chaperone
| 2. Ca2+
145
Calnexine est quel type de prot?
Lectine
146
Qui libère Calnexine de la prot?
Glucosidase 2
147
Quels sont les 2 types de chaperones?
Hsp 60 et Hsp 70
148
Quand Calnexine ne fonctionne pas, quel est le rôle des Chaperons Hsp 70?
Chaperons Hsp 70 se lient sur les plaques hydrophobes des prots mal repliées pour les aider à prendre structure tout en évitant leur agglutination
149
Quand Calnexine ne fonctionne pas, quel est le rôle des Chaperons Hsp 60?
tonneaux protéiques qui recoivent les prots après leur synthèse
150
Où retrouve-t-on les Chaperons Hsp 60?
Cyto, mito, RE, chloro
151
Où retrouve-t-on les Chaperons Hsp 70?
Cyto, mito, RE, chloro
152
Que font les protéasomes lorsque la calnexine ne fonctionne pas?
Tonneaux protéiques qui dégradent les prots en aa
153
Lorsque la calnexine ne fonctionne pas, quels sont les 3 acteurs qui peuvent agir?
1. Chaperon Hsp 70
2. Chaperon Hsp 60
3. protéasomes
154
Quel acteur joué rôle important dans la formation de vésicule de sécrétion dans le RE?
COP II
155
Quel acteur joué rôle important dans la formation de vésicule de sécrétion dans le golgi?
COP I
156
Comment se forme une vésicule de transition dans le RE?
1. Plusieurs SAR-I s'encrent dans la membrane du RE par les chaines d'ag
2. Formation de pivots sur lesquels se fixent COP II
3. formation d'une structure géométrique dans laquelle une partie de la membrane s'invagine
4. Vésicule de transition bourgeonne sur membrane du RE
157
Comment on fait pour savoir qu'une prot réside dans le RE? et où exactement dans le RE?
1. KKXX: dans la membrane du RE
| 2. KDEL: dans la lumière du RE
158
KDEL est formé de quoi? Et se retrouve où dans la prot?
1. 4 aa: Lys-Asp-Glu-Leu
| 2. extrémité COOH
159
SAR-I fait partie de quel type de prot?
G
160
Qu'arrive-t-il quand SAR-I es lié à GTP?
expose la chaine d'ag
161
Qu'arrive-t-il quand SAR-I es lié à GDP?
camoufle la chaine d'ag
162
Une prot libre dans le RE sera-t-elle nécessairement excrétée vers milieu extra caire?
Non, car peut être mal repliée, peut avoir KDEL, peut aller dans les lysosomes
