Cours 1 : Épidémiologie moléculaire Flashcards
(50 cards)
La source d’une toxi-infection alimentaire provient souvent d’une _____
Zoonose
Que veut dire EGCP
Électrophorèse en gel sur champ pulsé
Quelle est la question de base de l’épidémiologie moléculaire?
Suite à l’utilisation d’une technique moléculaire, les génotypes des isolats A et B sont-t-ils suffisamment similaires pour conclure qu’ils représentent la même souche ou l’inverse?
Qu’est-ce que des isolats reliés épidémiologiquement?
Des isolats cultivés dans le cadre d’une investigation épidémiologique qui suggère que les isolats pourraient provenir d’une souche commune
Est-ce que les isolats reliés épidémiologiquement ont le temps d’évoluer?
Non, car l’incident est arrivé récemment
Qu’est-ce qu’un isolat?
Une culture pure d’une bactérie provenant d’une colonie isolée sur une gélose primaire
Qu’est-ce qu’une souche?
Isolat ou groupe d’isolat différenciable d’autres isolats du même genre
De quoi une souche, qui est une subdivision descriptive d’une espèce, est dépendante?
De la méthode de typage moléculaire utilisée
Est-il possible que le même groupe d’isolats puisse être classé en des souches différentes par différents systèmes?
Oui
Qu’est-ce que des isolats reliés génétiquement?
Isolats non distinguables par des tests génétiques, qu’on présume qu’ils proviennent d’un précurseur commun
Quelle est la première chose à faire pour déterminer si un lien est relié épidémiologiquement?
Vérifier le lien génétique
Quels sont les 3 termes définissant les résultats de typage?
- Non différenciables
- Différents
- Similaires
Quel terme définissant les résultats de typage est la zone grise?
Similaires
Qu’est-ce qui augmente et devient supérieur au niveau de base et fait en sorte qu’on peut parler d’éclosion ou d’épidémie?
L’incidence d’une maladie infectieuse dans un endroit spécifique à un moment donné
Vrai ou faux : une éclosion implique que le groupe d’isolat provient de précurseurs différents
Faux, c’est d’un précurseur commun
De quoi s’agit-il ? :
Isolat reliés génétiquement et épidémiologiquement où le temps, l’endroit et la provenance sont une souche commune
Souches épidémiologiques
Qu’est-ce que le typage moléculaire démontre en laboratoire?
Que des isolats reliés épidémiologiquement sont aussi reliés génétiquement et proviennent donc de la même souche
Vrai ou faux : Le typage moléculaire remplace l’investigation épidémiologiquement et clinique de base
Faux, il le complète
Quels sont les 3 applications du typage moléculaire en épidémiologie?
- Épisodes d’infections chez un patient individuel
- Éclosions ou épidémies
Surveillance épidémiologique
Quel est l’application du typage moléculaire en génétique bactérienne?
Évolution et structure des populations
Qu’est-ce qui est souvent utile pour identifier et classer les espèces bactériennes et qui varie excessivement lentement?
Les séquences ribosomales (ex : le gène 16S pour la bactérie)
Est-ce que le typage moléculaire nécessite une échelle de temps lente ou courte au niveau des variations?
Courte pour identifier si deux souches sont génétiquement reliées ou non
Quels sont les 7 critères d’évaluation des méthodes de typage moléculaire?
- Résultat non ambigu pour chaque isolat
- Reproductivité
- Pouvoir de discrimination
- Facilité d’interprétation
- Facilité de la technique
- Étendue de l’utilisation
- Coûts
Que détectent les méthodes phénotypiques?
Les caractéristiques exprimées par les microorganismes en réponse à un substrat
