cours 11 Flashcards

(50 cards)

1
Q

Quels sont les 12 précurseurs essentiels?

A
  • Glucose 6-P
  • Fructose 6-P
  • Ribose 5-P
  • Erythrose 4-P
  • Triose phosphate (glycéraldéhyde-3P)
  • 3-phosphoglycérate
  • Phosphoenolpyruvate (PEP)
  • Pyruvate
  • Acetyl-CoA
  • alpha- Ketaglutarate
  • Succinyl CoA
  • Oxaloacetate
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Q

Quels sont les 6 précurseurs qui viennent de la glycolyse?

A
  • Glucose 6-P
  • Fructose 6-P
  • Triose phosphate (glycéraldéhyde-3P)
  • 3-phosphoglycérate
  • Phosphoenolpyruvate (PEP)
  • Pyruvate
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3
Q

Quel est le seul précurseur qui vient du cycle des pentoses phosphates?

A
  • ribose-5P
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4
Q

Quels sont les 4 précurseurs qui viennent du cycle de Krebs?

A
  • Acetyl-CoA
  • alpha- Ketaglutarate
  • Succinyl CoA
  • Oxaloacetate
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Q

Quel est le seul précurseur qui vient du ribose-5P

A
  • Erythrose 4-P
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6
Q

Qu’est-ce qu’une rx anapleurotiques? Qu’est-ce qu’elles produisent?

A
  • rx biochimiques dans des conditions autres que le catabolisme en présence de glucose et d’O2.
  • produisent les métabolites requis pour l’anabolisme dans le cas où ils ne sont pas générés par le catabolisme
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7
Q

Dans quelles conditions se produisent les rx anapleurotiques?

A
  • ana
  • source alternative de C
  • source alternative d’énergie (phosynthèse)

source de glucose: non, sauf si aussi en ana

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8
Q

Dans les rx anapleurotiques, il est possibles d’avoir croissance avec des sources alternatives de C et d’énergie. Donner un exemple.

A
  • le fructose
  • il va être importé et converti en fructose-1,6-biP
  • une fois sous cette forme, peut intégrer la glycolyse
  • il se retrouve aussi dans la voie des pentose phosphate
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9
Q

Quelles sont les 3 rx non réversible de la glycolyse?

A
  • glucose 6-P
  • fructose1,6-biP
  • pyruvate
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10
Q

Comment faire pour transformer le glucose-6-P à partir du fructose-1,6-biP?

A
  • fructose-6-P –(phosphofructokinase, glycolyse)–> Fructose-1,6-biP
  • fructose-6-P <–(fructose-1,6-diphosphatase, néoglucogénèse)– Fructose-1,6-biP
  • Glucose-6-P –>(glycolyse) ou <– (néoglucogénèse) Fructose-6-P
    l’enzyme utilisée pour la rx dans les deux sens est la phosphohexoisomérase
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11
Q

Qu’est-ce que la néoglucogénèse?

A

voie métabolique pour la synthèse de glucose
- l’inverse des voies de catabolisme pour la dégradation des sucres

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12
Q

Nommer un autre type de croissance en rx anapleurotique. Et quels sont ses précurseurs essentiels générés directement?

A
  • croissance sur triglycérides
  • acétyl-CoA (dans bêta-oxy)(après va Krebs) et glycéraldéhyde 3P (après va glycolyse)
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13
Q

Nommer un autre type de croissance en rx anapleurotique. Et qu’est-ce qui peut être produit pour se rendre à la glycolyse?

A

Croissance sur pentose, capable d’aller dans la voie des pentoses phosphates, donc de produire du fructose-6-P et qui peut aller dans glycolyse après

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14
Q

Qu’arrive-t-il en condition ana?

A

la voie entre pyruvate et acétyl-CoA est bloquée donc impossible de produire les 4 précurseurs qui sont normalement produit dans le cycle de Krebs

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15
Q

Pourquoi le pyruvate a besoin d’oxygène pour effectué sa transformation en acétyl-CoA à l’aide de la pyruvate deshydrogénase?

A

Parce que si on n’a pas d’O2, on n’a pas de chaine de transport des électrons et si on a pas cette chaine, on ne peut pas recycler notre NAD+

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16
Q

En ana, quelles sont les deux options pour les bactéries qui utilisent généralement la chaine de transport des électrons aé?

A
  • respiration ana (où autres accepteur terminaux d’électrons utilisés pour la chaine)
  • fermentation (où les e- entreprosés dans les coenzymes d’oxydoréduc pendant le cata sont transférés à un accepteur d’e- sans l’utilisation de la chaine)
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17
Q

Est-ce que le NADH peut être recyclé d’une autre façon?

A
  • oui mais pas efficace
  • Dans les 2 cas (respi ana et fermentation), les coenzymes d,oxydorédec réduits par le cata (NADH et FADH2) ne sont pas aussi efficacement recyclés en leurs formes oxydées (NAD+ et FAD) qu’en aé.
  • ils ne peuvent donc pas assurer pleinement leur rôle oxydant dans les rx cata
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18
Q

Pourquoi la rx de la pyruvate déhydrogénase requiert des conditions aé?

A

en absence d’O2, la [] en NAD+ est trop faible pour assurer la synthèse efficace d’acétyl-CoA par la pyruvate déshydrogénase

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19
Q

Pourquoi triose-P-déshydrogénase fonctionne en ana, mais pas pyruvate déshydrogénase? (indice, affinité)

A
  • triose-P-déshydrogénase a une forte affinité pour le NAD+ et donc une faible [] en NAD+ est suffisante pour cette rx. le recyclage est donc suffisant
  • pyruvate déshydrogénase a une faible affinité pour le NAD+, une [] faible de NAD+ ne suffit pas pour cette rx
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20
Q

Vrai ou faux. Le cycle de Krebs peut bien fonctionner malgré la faible [] en NAD+ disponible.

A

Faux. Krebs ne fonctionne pas bien lorsque pas bcp de NAD+

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21
Q

Comment arrivons-nous à l’oxaloacétate avec les rx anapleurotiques?

A
  • rx de contournement
  • on utilise la PEP carboxylase pour passer du PEP (phosphoenolpyruvate) à l’oxaloacétate.
  • il y a formation d’ATP et de NADPH
22
Q

Quelles enzymes sont nécessaire pour la formation des précurseurs manquants et le recyclage du NADH en NAD+ dans le cycle de Krebs bifurqué?

A
  • oxaloacétate réductase
  • aspartate transaminase
  • fumarate réductase
  • dans ce cycle modifié, on utilise le NADHpour produire du NAD+ (inverse de d’hab)
23
Q

Comment est possible la formation d’acétyl-CoA en ana?

A
  • par l’e* pyruvate formate lyase qui ne requiert pas de NAD+ et qui produit du formate et l’acétyl-CoA
24
Q

Quelles sont les 3 types de rx anapleurotiques et donner un exemple pour chacune?

A
  • rx biochimique inverse (ex.: phosphohexoisomérase)
  • utilisation d’une nouvelle e* pour effectuer une rx biochimique inverse (ex.: fructose-1,6-biP)
  • utilisation d’une nouvelle e* pour effectuer une nouvelle rx biochimique (ex.: PEP carboxylase)
25
Pourquoi les sources d'azotes sont essentieles?
pour l'anabolisme
26
Sous quelle forme l'azote est-elle assimilée?
sous forme d'ammonium(NH4+)
27
D'où peuvent provenir les source d'ammonium?
- Composés organiques (AA, nucléotides) - NO3- - N2 (azote gazeux) - NH4+ (ammonium dans environnement)
28
Comment sont utilisés les AA comme source d'ammonium? (3 rx)
- AA --> NH4+ + cétoacide (AA sans NH4+) Rappel - rx désamination oxydative: alanine + NAD+ --> pyruvate + NADH + NH4+ (ammonium libre) - rx déshydratation: aspartate --> fumarate + NH4+ (ammonium libre) - rx aminotransférase: glutamate + oxaloacétate --> aspartate + 2-cétoglutarate (ammonium lié)
29
Comment sont utilisés les acides nucléiques comme source d'ammonium?
il y a libération d'un ammonium libre dans la cata des acides nucléiques (NH3 est libéré)
30
Comment sont utilisés l'urée comme source d'ammonium?
il y a libération de deux NH4+
31
À quoi servent les nitrate et nitrite réductase?
- nitrate réductase: réduire le nitrate en nitrite (NO3- --> NO2-) - nitrite réductase: réduire le nitrite en ammonium (NO2- --> NH4+)
32
Qu'est-ce que représente le retrait d'atome d'O d'une molécule?
une réduction
33
Comment est la demande énergétique de la fixation de l'azote? Donner un exemple.
- demande bcp d'énergie: 2 ATP par e- transférés - fixation d'une molécule de N2: N2 --> 2 NH3 (on passe d'une triple lien à un lien simple) - on a 6 électrons à transférer donc 12 ATP investi, mais il y a une perte dans la rx - Donc: N2 + 8 e- + 8 H+ + 16 ATP --> 2 NH3 + H2 + 16ADP + 16 Pi
34
Est-ce que les cofacteurs de la nitrogénase fonctionnent en aé?
Non. L'oxygène oxyde les cofacteurs de la nitrogénase donc elle fonctionne normalement seulement en absence d'O2
35
Quels sont les deux solutions pour que la nitrogénase fonctionne même en présence d'O2?
- la nitrogénase est protégée par un haut taux de respiration (on utilise ++ l'O2 comme accepteur final d'e- donc il y a très peu d'O2 libre pour oxyder la nitrogénase - la nitrogénase est protégée par les cellules hétérocystes, dédiées à la fixation d'azote. La séparation physique de la prod d'O2 et la fixation de N se fait dans des compartiment distincts de la cellule. Donc la fixation de N se fait en ana
36
Quelles sont les deux voies de l'assimilation de l'azote? Expliquer.
Voie de la glutamine synthétase/glutamatesyntase (GS/GOGAT) - utilise système glutamate/glutamine pour l'assimilation de l'azote - utilisée en faible [ ] d'ammonium - glutamine synthétase à haute affinité pour ammonium - besoin d'ATP Voie de la glutamate déshydrogénase (GDH) - utilise l'alpha-cétoglutarate/glutamate pour l'assimilation de l'azote - utilisée en forte [ ] d'ammonium - e* à faible affinité pour ammonium - aucun besoin d'ATP
37
Comment se fait l'assimilation et l'utilisation pour la voie GS/GOGAT?
- assimilation: 1. glutamine synthétase (attachement de l'ammonium à la molécule organique - utilisation: 2. glutamate synthase, 3. aminotransférase
38
Comment se fait l'assimilation et l'utilisation pour la voie GDH?
- assimilation: 1. glutamate déshydrogénase - utilisation: 2. aminotransférase on ne passe pas par glutamine contrairement a GOGAT
39
Quelles sont les sources de prédilection pour le soufre?
le sulfate et le thiosulfate
40
Comment se fait l'assimilation du soufre?
sous la forme de sulfure qui est ajouté à la sérine pour la biosynthèse de la cystéine.
41
Quelle est la différence entre le sérine et la cystéine?
la cystéine a un soufre et pas la sérine
42
Est-ce que les bactéries peuvent utiliser directement la cystéine comme source de soufre?
Oui
43
Qui s'occupe de l'entrée du thiosulfate dans le cytoplasme? Quel type de transport?
Les Cys (P,U,A) type ABC donc ATP dépendant
44
Comment se fait l'assimilation du sulfate en sulfure pour son utilisation métabolique?
1. 1e phase d'activation des sulfates par CysD, formation de APS, demande un ATP 2. 2e phase d'activation pas CysC, conversion de APs en PAPS, demande un ATP 3. réduction de PAPS en sulfite (SO32- par CysH, sources d'e-: thiorédoxine réduite 4. réduction de sulfite en sulfure (S2-) par CysG-I-J
45
Quel est le rôle du soufre dans l'anabolisme?
Tout ce qui nécessite du soufre passe pas cystéine
46
En cas de carence de soufre, il y a production de 3 types de protéines, lesquelles?
1. e* et système de transport impliqués dans l'utilisation des sources de soufre 2. copies alternatives de protéines cellulaires importantes avec des AA de remplacement au lieu de la cystéine et méthionone 3. prot pour la mobilisation des composés intracellulaire de stockage de soufre (utilisation des réserves de soufre)
47
Quelles sont les principales sources de phosphore?
- phosphates inorganique (Pi) (++ souvent) - organophosphates
48
Comment se fait l'assimilation du phosphore?
sous la forme de phosphate inorganique, les organophosphate doivent être transformés
49
Comment se fait l'import et l'assimilation des phosphates inorganiques et otganophosphates?
- ils entrent par le périplasme par la porine PhoE - des phosphatases périplasmiques libèrent les groupements Pi des composés - la protéine de liaison périplasmique PstS transporte les Pi au travers du périplasme - les Pi sont importés dans le cytoplasme par le système ABC PstA-C - Le Pi entre directement dans le métabolisme central sans dépense énergétique
50
Par quoi (voie) le Pi est ajouté à l'ADP pour la formation d'ATP ?
- par catabolisme: glycolyse, voie ED, Krebs - la phosphorylation oxydative: repiration, phosotsynthèse, chiomiolithotrophie - fermentation