cours 2 mcb2992 Flashcards
quels sont les éléments du gène qui permettent expression génique
- promoteur: interagit avec ARN pol
- site initiation transcription
- RBS/SD: site attachement ribosome
- codon initiateur
- codon arrêt
- site terminaison transcription
différence entre thymine et uracil
thymine c’est uracil avec méthyl en position 5
quelles sont les structures secondaire de ARN
- épingle à cheveux
- pseudo noeud
G-U accepté, mais pas appariement
différence entre ARN pol coeur vs holoenzyme
ARN pol coeur: toutes sous-unités alpha, beta, omega
holoenzyme: ARN pol coeur avec facteurs sigma
dans quel sens se fait la transcription et sur quel brin d’ADN
sur brin matrice
synthèse 5’->3’
par quel nucléotide la transcription débute la plupart du temps
purine
étapes de transcription
- formation holoenzyme
- lien ARNpol promoteur: complexe fermé
- isomérisation: complexe ouvert
- initiation et cycle transcription abortive
- évasion ARN pol
- relâchement facteur sigma: élongation
- terminaison
avec quoi les différents facteurs sigma interagissent
4: -35
2: -10
3: proche beta
2: interagit beta’
quelle sont les variations possibles dans la structure des promoteurs et comment facteur sigma s’adapte
pas de région -35 mais région -10 étendue: sigma3 interagit avec étendue
ajout élément UP: interagit avec sous-unité alpha de ARN pol
en quoi consiste l’étape d’isomérisation dans la transcription
sigma2 sépare brins ADN à -10 et interagit avec brin codant
formation complexe ouvert
à quoi sert la rifampicine dans la transcription
après ajout de 2-3 nt: rifampicine interagit avec beta et bloque synthèse
qu’est-ce que la transcription abortive
ARN atteint 10 nt: canal de sortie est bloqué par sigma 3.2: fait arrêter synthèse
relâchement des nt et recommence jusqu’à pousser s3.2
que fait un bon promoteur
forte interaction avec ARNpol et séparation rapide ADN et transition rapide à phase élongation
qu’est-ce que ça veut dire la transcription est processive obligatoire
réaction doit avoir lieu du début à la fin: peut s’arrêter, mais pas quitter et continuer
sinon doit recommencer
quand ecq la ARNpol prend un pause pendant élongation
suite de U dans ARN forme épingle à cheveux
pcq A/U moins stable que A/T
à quoi servent les pauses pendant élongation
bien timer transcription et traduction pour ne pas avoir transcription prématurée
2 types de terminaison
indépendante ou rho-dépendante
en quoi consiste la terminaison indépendante
suite de U dans ARN juste à côté de ARNpol -> formation épingle à cheveux
rend instable ARNpol et relâchement ARNpol
en quoi consiste la terminaison rho-dépendante
protéine rho se lie quand avec séquence riche en C
activité hélicase ADN/ARN: brise hybride: relâchement ARNpol
comment est fait un ARNt
5 régions:
- boucle D, boucle pseudo-U: assure compatibilité a.a. et nucléotide
- anticodon
- bras accepteur: termine par CCA pour lier a.a.
quelles sont les étapes de l’initiation de traduction
- s-u 16S du ribosome reconnait site RBS
- début à AUG
- IF1/2/3 aide à former complexe initiateur
- ajout s-u 50S
comment se fait la terminaison de la traduction
- codon stop
- pas ajout ARNt mais déplacement au site P par RF1/2
- RFE relâche ARNm et ribosome
à quoi sert ARNtm
hybride entre ARN transfert et messager
quand ARNm dégradé: ARNtm ajoute alanine puis 10 a.a. avant d’arrêter
queue ajoutée: site de reconaissance pour protéase pour dégrader protéine
qu’est-ce que le phénomène de polarité
traduction se fini prématurément ce qui fait finir la transcription prématurément
site rut (pour protéine rho) est cachée par ribosome pendant transcription/traduction
mutation non-sens: codon stop fait arrêter la traduction
site rut plus caché fait terminer transcription
