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Génétique > Cours 3 - Réplication de l'ADN > Flashcards

Cours 3 - Réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

V/f: Notre ADN est identique d’une cellule à une autre parce qu’à la base l’ADN provient d’une seule et unique cellule

A

Vrai

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2
Q

C’est quoi le but de crée des millions de cellule par jours ?

A

Croissance
Remplacement

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3
Q

Vrai ou faux: Les cellules ont un code génétique différent selon leur fonction.

A

Faux.
Toutes ces cellules ont exactement le même code génétique (et même séquence)

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4
Q

La division cellulaire prend 16h, répliquer l’ADN prend combien de temps ?

A

10h

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5
Q

Pourquoi dit-on que la réplication de l’ADN est efficace et fidèle ?

A

Parce qu’elle peut faire 80 000 pb / sec sans erreur

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6
Q

Pourquoi dit-on que l’ADN est un moule ?

A

parce que chaque brin d’ADN mère sert de moule pour le brin fille complémentaire. (séquence inverse; brin complémentaire)

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7
Q

Qu’elles sont les 4 caractéristiques de la réplication de l’ADN ?

A
  • Complexe (plusieurs prot. impliqué)
    – Hautement spécialisée
    – Vitesse impressionnante
    – Fidélité quasi parfaite
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8
Q

Qu’elle sont les deux qualités de la réplication de l’ADN qui est le plus important pour éviter des erreurs (qui peuvent s’avérer grave)?

A

Fidele et efficace

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9
Q

La réplication de l’ADN nécessite 2 choses, lesquelles ?

A
  1. dNTP (desoxyribonucléotides triphosphates)
  2. Jonction amorce:matrice
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10
Q

c’est quoi une jonction amorce:matrice ?

A

brin mère à recopier
+
mini portion brin à synthétiser avec un 3’ OH très important
=
jonction amorce matrice

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11
Q

C’est quoi un dNTP

A

un substrat contenant 3 phosphate, un sucre et une base (A,C,T ou G)

-> nucléotide kinda

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12
Q

Simplement et biochimiquement, comment se passe la réplication de l’ADN?

A
  1. Appariement des bases avec dNTP
  2. attaque nucléophile du 3’OH du brin à synthétiser (pas le brin mère) qui va liberer les 2 phosphates sur 3
  3. phosphate qui reste va se lier et devient le nouveau 3’OH
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13
Q

Vrai ou faux: L’ADN polymérase est plus spécifique aux base G et C parce qu’ils ont 3 lien H et donc, sont plus efficace

A

Faux.
L’ADN polymérase ne discrimine pas

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14
Q

Lorsque 3’OH va pour se lier au phosphate de dNTP, quelle phosphate elle se lie?

A

alpha
(

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15
Q

Lorsque 3’OH va pour se lier au phosphate de dNTP, quelle phosphate elle se lie?

A

alpha

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16
Q

Que ce passe-t-il s’il n’y a pas d’appariement des bases ?

A

la liaison 3’OH - phosphate ne pourra pas se faire.
ANDpol est plus efficace lorsqu’apparié

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17
Q

Dans l’ADN polymérase, qu’elle partie de la main est la région catalytique ?

A

La paume

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18
Q

Que fait la paume de la main dans l’ADN pol ?

A
  1. aide efficacité (attaque nucléophile) avec les ions métalliques
  2. diminue les erreurs avec l’exonucléases
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19
Q

à quoi servent les 2 ions métalliques dans la paume de la main ?

A

modifient l’environnement chimique du 3’OH et dNTP
1er ion réduit 3’OH en 3’O-
2iem ion stabilise les phosphates beta et gama

= 3’O- devient hyper réactif et attaque le phosphate

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20
Q

À quoi sert l’exonucléases ?

A

Améliore efficacité en diminuant les erreurs.

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21
Q

Le mésappariement a deux effets sur ADN pol, lesquels?

A
  1. ralentit la catalyse
  2. Diminue l’affinité de l’ADN pol pour la jonction amorce:matrice
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22
Q

C’est quoi le processus lorsqu’il y a un mesappariement dans l’ADN pol?

A
  1. l’amorce sort du site actif de l’ADN pol
  2. se lie à l’exonucléase
  3. l’ADN mésapparié est retiré
  4. Retourne au site actif
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23
Q

À quoi servent les doigts dans l’ADN pol ?

A
  1. Si appariement ok, se referme sur dNTP et rapproche les nucléotides entrant du 3’OH (et des ions) = accélère catalyse
  2. induit une rotation 90 degrés (courbure) entre la 1er et 2iem base pour éviter que les bases dNTP se lie ailleurs.
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24
Q

À quoi sert le pouce dans l’ADN pol?

A

Stabilisateur
maintient l’amorce et le site actif à une position parfaite + maintient association forte entre ADN pol et son substrat

N’AIDE PAS A LA CATALYSE

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25
Q

Entre le pouce, les doigts et la paume, lequel est le seul pas catalytique ?

A

Pouce.

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26
Q

C’est quoi les 4 éléments pour répliquer l’ADN?

A
  • Polymérase,
  • ion métallique (Magnésium)
  • jonction amorce/matrice,
  • nucléotides
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27
Q

En résumé, comment l’ADN est répliqué ?

A
  1. dNTP s’apparie à une base si bien fait
  2. provoque fermeture doigts autour dNTP apparié
  3. place ions métallique pour catalyser formation lien phosphodiester
  4. attache du nucléotide à l’amorce
  5. provoque ouverture des doigts et permet à la jonction amorce:matrice d’avancer d’une base
  6. ADN pol prête new cycle
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28
Q

Pourquoi dit-on que l’ADN polymérase est processive ?

A

À chaque liaison, elle peut ajouter jusqu’à 50 000 nucléotides avant de se détacher et non 1 à la fois
= plus efficace

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29
Q

c’est quoi la particularité de l’ADN polymérase en comparaison avec les autre enzyme ?

A

Elle est processive
d’hab, enzyme s’attache, catalyse et part.
Elle, elle peut en faire plusieurs

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30
Q

Toute les enzymes, ions et caractéristique de l’ADN polymérase servent à …?

A

Augmenter l’Efficacité

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31
Q

c’est quoi une fourche de réplication ?

A

endroit ou l’ADN passe de 1 ADN double brin à 2 ADN simple brin

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32
Q

Dans une cellule, les brins d’un ADN sont répliqué en même temps ou un à la fois ?

A

en même temps

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33
Q

Pourquoi les brins ADN doivent être répliqué en même temps?

A

Sinon le 2iem brin va se faire dégrader

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34
Q

La réplication va dans quel sens ?
5’-> 3’ ou
3’->5’

A

5’->3’

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35
Q

c’est quoi la différence entre un brin continue et un brin discontinu ?

A

Brin continue, l’ADN pol fait une réplication continue
Brin discontinue = ADN pol fait des fragment d’Okazaki

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36
Q

Dans le brin discontinue, la réplication va de 3’->5’

A

FAUX.
5’->3’ mais par petit fragment.

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37
Q

Le sens de la réplication dans les brin continu et discontinu est la même

A

Non. Sens n’est pas le même mais les deux vont de 5’->3’

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38
Q

c’est quoi une primase

A

Une ARN polymérase

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39
Q

À quoi sert la primase

A

consacré à faire des amorce courte d’ARN comme site d’attache pour l’ADN polymérase

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40
Q

Que fait la RNase H ?

A

dégrade les bout d’amorce d’ARN apparié à l’ADN (sauf le dernier nucléotide)

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41
Q

Qui enleve le dernier nucléotide de l’amorce ARN?

A

Exonucléase 5’

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42
Q

c’est quoi la différence entre l’exonucléase et l’exonucléase 5’?

A

Exonucléase: retire mauvais appariement lors réplication
Exonucléase 5´: retire dernier ARN amorce

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43
Q

Que fait l’ADN polymérase dans l’élimination des amorces ARN ?

A

remplit la breche créée (le trou du RNase H et l’exonucléase 5’), mais laisse une césure.

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44
Q

Qui répare la césure de l’ADN créé par l’ADN polymérase lors de l’élimination des amorces ARN ?

A

Ligase.

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45
Q

Qui lie chaque fragment d’Okazaki?

A

Ligase.

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46
Q

Que font les Hélicases ?

A

catalyse l’ouverture de l’ADN double brin

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47
Q

Que sont les caractéristiques de l’hélicase ?

A
  1. TRÈS processive
  2. peut aller 5’->3’ ou 3’->5’ selon besoin
  3. Besoin ATP
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48
Q

Que font les SSB?

A

Se lie au ADN simple brin pour stabiliser et empêcher la dégradation (simple brin= très instable)
- empeche appariement
- empeche degradation
- empeche formation de boucle

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49
Q

Pourquoi dit on que SSB est coopérative ?

A

La liaison d’une seule SSB facilite la liaison d’une autre

50
Q

L’hélicase (séparation ADN 2 brin) change le surrenroulement pour du positif ou du negatif ?

A

surrenroulement positif

51
Q

Quelle enzymes régle le problème du surrenroulement positif ?

A

Topoisomérase

52
Q

Que fait la Topoisomérase

A

coupe ADN et fait passe un brin dans la coupure (= surrenroulement négatif = va se défaire à fur et à mesure qu’on avance)

53
Q

V/f: Seule les eucaryotes ont les primases, hélicase, SSB et topoisomérase

A

Faux. Bactérie et levure aussi

54
Q

Que fait la primase

A

initie synthese sur nimporte quel segment ADN simple brin

55
Q

Quelle ADN pol est la plus importante chez les bactéries ?

A

ADN POL III

56
Q

Les ADN pol avec des chiffres sont ceux des eucaryotes

A

Faux, bactérie.

57
Q

Quelles sont les 3 ADN pol les plus importante chez les eucaryotes ?

A
  1. ADN pol alpha
  2. ADN pol delta
  3. ADN pol epsilon
58
Q

Que fait ADN pol epsilon?

A

synthèse brin continu ADN

59
Q

Que fait ADN pol delta ?

A

synthèse brin discontinu ADN + réparation

60
Q

Que fait ADN pol alpha ?

A

Synthese amorce ADN
Elle est couplé à une primase.

61
Q

Les ADN pol peuvent avoir comme fonction la réparation

A

Vrai

62
Q

la processivité de l’ADN pol alpha est faible

A

Vrai

63
Q

V/f: ADN pol delta et epsilon fonctionne bien même si ARN

A

Faux

64
Q

V/f: ADN pol delta et epsilon prennent le relais de pol alpha

A

Vrai

65
Q

V/f: ADN pol delta et epsilon ont une processivité élevé

A

Vrai (surtout epsilon)

66
Q

entre ADN pol delta et epsilon, qui a la plus grande processivité

A

epsilon (brin continu)

67
Q

À quoi sert l’anneau coulissant ?

A
  1. (role principal) augmente processivité
  2. encercle la double hélice (ADN mère et fille) et force ADN pol de continuer

'’glisse’’ sur l’ADN

68
Q

L’anneau coulissant est fortement lié l’ADN pol seulement si…
et que se passe-t-il si pu lié?

A

ADN pol est relié à la jonction amorce:matrice
- ADN pol s’en va

69
Q

V/f: La structure de l’anneau coulissant est très conservé

A

Vrai
avec les années et entre espèce (virus, procaryote, eucaryoe)

70
Q

Quand l’ADN pol se détache, l’anneau coulissant fait quoi?

A

Il reste pour recruter des protéines(ex. ligase)

71
Q

Quelle protéine pose les anneaux coulissants? et ou est-ce qu’il les pose ?

A

Les poseurs d’anneaux coulissants
sur chaque jonction amorce:matrice

72
Q

V/f: Les anneaux coulissant peuvent servir dans la réparation

A

Vrai

73
Q

c’est quoi une holoenzyme

A

Complexe reliant les enzymes pour synchroniser les étapes.

74
Q

Dans l’holoenzyme, il y a combien de ADN pol?

A

2 (2x pol III chez bactéries, 1 epsilon et 1 delta chez eucaryote)

75
Q

L’holoenzyme ralentit quoi? et pourquoi?

A

Hélicase
car sinon elle irais trop rapidement pour le complexe

76
Q

Qu’est-ce qui déloge les SSB sur l’ADN simple brin?

A

ADN pol lorsqu’elle passe

77
Q

La primase a une capacité de liaison sporadique. Pourquoi?

A

Quand se lie à l’hélicase, s’en va et revient se lier à chaque seconde.

78
Q

c’est quoi un réplisome ?

A

Complexe :
- Holoenzyme ADN pol
- helicase (se lie sous-unité tau)
- primase (se lie faiblement helicase)

C’est tout ce qu’il faut pour faire la réplication

79
Q

La formation initiale d’une fourche de réplication nécessite quoi?

A

L’ouverture de la double hélice pour fixer l’hélicase.

80
Q

Comment se nomment les sites spécifiques ou débute la réplication

A

origine de réplication

81
Q

V/f: Le nombre d’origine de réplication varie selon les espèces ?

A

Vrai

82
Q

Chez les eucaryotes, il a 1 origine de réplication par combien de kpb ?
Seront-il tous débuter ?

A

30 or /kbp
Non

83
Q

Quel sont les composants de l’initiation?

A
  • Le réplicateur
  • L’initiateur
84
Q

Entre le réplicateur et l’initiateur, lequel est la séquence d’ADN et lequel est la protéine ?

IMPORTANT À LEXAMEN

A

Région ADN - réplicateur
protéine - initiateur

85
Q

Que faut-il pour que la région de l’ADN soit considérée comme réplicateur ?

A
  1. Beaucoup de A-T
  2. séquence fixatrice de l’initiateur
86
Q

Pourquoi le réplicateur doit avoir beaucoup de A-T?

A

Car c’est facilement dénaturable = facile à ouvrir

87
Q

l’initiateur fait quoi?

A
  1. reconnait les séquences réplicateurs et lie l’ADN à ses sites
  2. Active l’initation de la réplication (aide ouvrir l’hélice)
    - en recrutant des protéines
    - déforme et dénature
88
Q

Est-ce que la réplication se fait aux extrémité ou à l’intérieur des chromosomes ?

A

intérieur

89
Q

Dans quelle ordre les composantes de l’initiation de la réplication d’ADN se passent chez les PROCARYOTE?

A
  1. initiateur s’installe sur le réplicateur
  2. dénaturation se produit
  3. Le poseur d’hélicase pose l’hélicase
  4. primase s’associe
  5. ADN pol holoenzyme s’ajoute
  6. polymérisation chaque coté
  7. anneau coulissant
90
Q

Est-ce que l’initiation est la même chez les procaryotes et eucaryotes

A

Non.

91
Q

L’initiation de la réplication se passe en 2 étapes. lesquels ?

A
  1. sélection des réplicateurs
  2. Activation des origines de réplication
92
Q

Que se passes-t-il à l’activation des origines de réplication

A

Sépare des brins aux réplicateurs et recrute les ADN pol

93
Q

Quand se passes-t-il l’activation des origines de réplication (dans quelle phase)?

A

à la phase S

94
Q

Que se passe-t-il à La sélection des réplicateurs

A

Identifie les séquences qui dirigent l’initiation et assemble un complexe de protéines sur chaque réplicateur (NE DÉNATURE PAS )

95
Q

Quand se passes-t-il LA Sélection des réplicateurs (quelle phase)?

A

En phase G1 (avant synthese)

96
Q

Est-il possible de changer d’idée et sélectionner d’autre Ori lors de l’‘activation des origines de réplication

A

Non

97
Q

Comment est formé le préréplicatif (pre-RC)

A

Reconnaissence du réplicateur par l’initiateur (ORC)
-> ORC recrute 2 poseurs d’hélicases (Cdc6 et Cdt1)
-> Ce complexe recrute l’ADN hélicase

98
Q

Dequoi le complexe préréplicatif ?

A

hélicase + Cdc6 + Cdt1 + ORC

99
Q

Comment se nomme les poseur d’hélicase et que ce passe-t-il s’il ne quitte pas l’hélicase ?

A

Cdc6 et Cdt1
Rien ne va bouger. on doit s’en débarasser pour activer.

100
Q

V/f: Cdc6 est libéré et non dégradé

A

Faux.
Il est dégradé.

101
Q

V/f: Cdt1 est dégradé

A

faux.

Il est juste détaché

102
Q

C’est à partir de quelle moment que Cdt1 et Cdc6 quitte le complexe ?

A

Lorsqu’ils sont phosphorylé (par Cdk et Ddk)

103
Q

La Phosphorylation (activation) des preRC est fait par qui?

A

Cdk et Ddk (enlèvent les poseurs d’hélicase (Cdt6 et Cdt1) en les phosphorylant)

104
Q

Que se passe-t-il après La Phosphorylation (activation) des preRC

A

recrutement des ADN pol

105
Q

Pourquoi important de réguler les fourches ?

A

Les gènes sont tellement long qu’on ne veut pas que d’autre ori se forment.

106
Q

Que se passe-t-il si l’activité de Cdk est basse
à quelle phase cela arrive ?

A
  1. Formation PreRC
  2. PAS D’ACTIVATION pre-RC
    G1
107
Q

Que se passe-t-il si l’activité des Cdk est élevée
à quelle phase cela arrive ?

A
  1. PAS formation de nouveaux pré-RC
  2. activation ceux deja formé.
    S
108
Q

Les Chromosomes circulaires terminent leurs réplication comment ?

A

Termine sur eux même: topoisomérases II libere les deux anneaux et se séparent

109
Q

Pour terminer la réplication sur les brin discontinu, il faut faire quoi?

A

enlever amorce ARN

110
Q

Quelle est le problème dans la terminaison de la réplication chez les eucaryotes

A

Pu de jonction matrice: amorce = trou

111
Q

c’est quoi des télomères ?

A

extrémité des chromosomes (5’TTAGGG)
Répétitions bicaténaires possédant une extrémité 3’ monocaténaire

112
Q

Télomère recrute quelle enzyme

A

Télomérase (polymérase unique)

113
Q

Pourquoi la télomérase est unique ?

A
  1. pas besoin de matrice exogène **IMPORTANT CAR LA SEULE, A SA PROPRE MATRICE **(contient prot+ARN et l’ARN agis comme matrice et ADN comme amorce)
  2. allonge extrémité 3’
114
Q

La télomérase forme une jonction amorce:matrice pour quoi?

A

TERT

115
Q

c’est quoi TERT et il fait quoi

A

Sous-unité catalytique
* Réverse transcriptase
* Rétro-transcrit l’ARN en ADN

116
Q

La télomérase rallonge en 3’, mais qu’est-ce qui se passe après ?

A

Synthèse en 5’ assurée par la machinerie du brin discontinu (fragment d’Okazaki)

117
Q

À la fin de la télomérase, il reste quand même une extrémité 3’ monocaténaire. Alors pourquoi faire ça ?

A

Sert à protéger l’ADN en allongeant.

118
Q

V/f: Long télomère = info sur la longétivité de la vie d’une espèce ?

A

Faux.
Mais la longétivité des cellules oui.

119
Q

Protéines liant l’ADNdb télomérique font quoi?

A

Inhibe la télomérase faiblement

120
Q

Comment la télomérase peut être inhiber fortement ?

A

Plus qu’elle avance, plus il y a de protéines liant l’ADNbd télomérique, plus la télomérase est inhibée.

121
Q

La télomérase sans inhibition pourrait continuer vraiment longtemps

A

Vrai

122
Q

C’est quoi la boucle T

A

Vu que extrémité du telomere reste simple bin, veut le proteger pour pas inhiber = va avoir un repliement = séquence triple.

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