cours 4 Flashcards

(52 cards)

1
Q

Classification des microorganismes selon leurs besoins nutritifs

A

Source de carbone
Source d’énergie
Source d’électrons

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Q

Hétérotrophes

A

Molécules organiques préformées (Ex. glucide, lipide …)

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Q

Autotrophes

A

CO2 seul ou principale source

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3
Q

Chimiotrophes

A

Oxydation des composés organiques (Ex. glucose)
et inorganiques (Ex. H2S, NH4+, Fe2+,…)

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4
Q

Lithotrophes

A

Molécules inorganiques réduites (H2S, NH4+, Fe2+,…)

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5
Q

Organotrophes

A

Molécules organiques réduites (Ex. glucose)

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6
Q

Source de carbone

A

Autotrophe
Hétérotrophe

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7
Q

Source d’énergie

A

Phototrophe
Chimiotrophe

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8
Q

Source d’électrons (H/e-)

A

Lithotrophes
Organotrophes

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9
Q

Minimale vs optimale vs maximal

A

Température minimale: Température la plus basse à laquelle un microorganisme peut croître
Température optimale: Température idéale permettant aux microorganismes un taux de croissance maximal
Température maximale: Température la plus élevée à laquelle un microorganisme peut croître

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10
Q

Nom des microorganismes selon T optimale

A
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11
Q

Noms microorganismes selon pH

A

1) Acidophiles : pH 0-5.5
2) Neutrophiles : pH 5.5-8.0
3) Alcalophiles : pH 8.5-11,5

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12
Q

Bactéries vs mycètes

A

ph back = 6-7
ph Myc = 5-6

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13
Q

hypotonique

A

l’eau entre dans la cellule mais la paroi oppose une certaine résistance mécanique à la pression osmotique

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14
Q

hypertonique

A

l’eau quitte la cellule au profit du milieu ambiant (déshydratation)
- Plasmolyse (la membrane se rétracte de la paroi) - Faible disponibilité en eau libre

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15
Q

Types de microorganismes pression osmotique

A

Osmotolérants = peut deal avec une pression osmotique élevé
Osmophiles = Veut une pression osmotique élevé pour croitre
Halophile = Nécessite NaCl au dessus de 0.2 M

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16
Q

Macroéléments role

A

éléments nécessaires en grandes quantité pour la synthèse de macromolécules (CHONPS) et Ca, Mg, K
Carbone, Hydrogène, Oxygène, Azote, Phosphore, Soufre Calcium, Magnésium, potassium
- C : Carbone: nécessité d’une source de carbone - H2O (eau): indispensable

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17
Q

Oligoéléments

A

besoin en petite quantité (trace): Fer, cuivre, molybdène, zinc …

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18
Q

Facteurs de croissance

A

facteurs organiques: vitamines, acides aminés, et bases azotés

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19
Q

Pas de chimiotrophe capable de dégrader la molécule = ?

A

non biodégradable

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20
Q

Azote = ?%

A

14% de la matière sèche,

21
Q

soufre et phosphore = ?%

22
Q

Source d’azote:

A
  • La majorité vont utiliser une forme organique ou d’ammonium (NH4+).
  • La fixation de l’azote : utilisation direct de l’azote atmosphérique (N2),
23
Q

Prototrophe

A

microorganisme de type sauvage du point de vue nutritionnel. Autonome, pouvant croître sur un milieu défini (synthétique)

24
Auxotrophe:
Perte de capacité à synthétiser certains métabolites essentiels (comparé au type sauvage) - Incapable de croître sur un milieu synthétique (il faut l’enrichir)
25
Eau liée
liée aux macromolécules, ions ou toute surface hydrophile
26
Eau libre
*Seule l’eau libre du milieu est disponible pour les microorganismes* -uffisamment éloignée d’une surface chargée et libre de ses mouvements, propriétés physico-chimiques normales
27
Activité de l’eau libre
indice de la disponibilité de l’eau pour les microorganismes
28
Aw (Activity water)
Pression partielle de vapeur d’eau d’une solution Pression partielle de vapeur de l’eau pure
29
Oxygène Eucaryote
Presque tjrs essentiel
30
Oxygène procaryotes
Essentiel, toléré ou toxique
31
Types de demande d'oxygène
Aérobie stricte Anaérobie facultative Anaérobie stricte Anaérobie aérotolérant Microaérophile
32
microaérophile
pression d'o2 faible (2-10%)
33
anaérobie aâérotolérant
oxygène les tue pas, mais se développe sans
34
SOD pour
Dismutation
35
Catalse fait quoi
transforme 2 peroxyde en 2 h2o + o2
36
Comment faire anaerobie
1) Bouillon au thioglycolate 2) Jarre anaérobie (Systèmes ‘GasPak’) 3) Chambre anaérobique
37
phases de croissance
Latence exponentielle stationnaire mortalité
38
Latence
Pas de division cellulaire Temps dépend de : -age bactérie + milieu
39
Exponentielle
-Logarithmique -Developpement vitesse max -Population uniforme -Court moment -+ de nutriments, mieux c'est
40
Stationnaire
causes : limitation de nutriments -conditions défavorables à la reproduction
41
Mortalité
Causes : Préparé par génétique dégâts irréparables formation de cellules viables non cultivables (VNC) (dormance)
42
La culture continue (ouvert)
* Apport de nutriments * Elimination des déchets * La phase de croissance exponentielle est maintenue sur une longue période * Concentration constante de la biomasse * Il y a 2 types: Chémostat et turbidostat – Chémostat : Apport constant de nutriments à la même vitesse que le milieu est éliminé – Turbidostat: vitesse de dilution déterminée par la densité
43
Mesure de la croissance des microorganismes
1) Méthodes directes: A) Décompte total des microorganismes B) Décompte des unités viables (UFC, filtre) 2) Méthodes indirectes: A) Mesure de l’activité B) Mesure de la masse cellulaire C) Turbidité
44
A) Décompte total des microorganismes
- Compteur Coulter et Cytomètre de flux (protistes, levures et cellules mammifères) - Chambre de comptage observée au microscope * Hémocytomètre: Les levures et cellules mammifères * Cellule de Petroff-Hausser: Les bactéries Avantages: - facile à utiliser, rapide et peu coûteux - informations sur la taille/morphologie des microorganismes Désavantages: - densité microbienne élevée (petit volume) - décompte des cellules mortes et vivantes
45
Hémocytomètre:
Dimensions: 0.1cm x 0.1cm x 0.01cm = 1/10000 cm3 Cellules/ml: 10000 x cellules comptées x facteur de dilution
46
Cellule de Petroff-Hausser:
Dimensions : 10 fois plus petit que l’hémocytomètre Cellules/ml: 100000 x cellules comptées x facteur de dilution
47
Décompte unité viable
Nombre de colonies * dilution = ufc
48
Méthode des filtres de cellulose
L’échantillon est passé sur un filtre de cellulose dont la porosité retient les microorganismes
49
Mesure de l’activité
- En mesurant la consommation de substrats (C, N2, O2 ou un facteur spécifique de croissance), la concentration des constituants cellulaires (ATP, FAD ou FMN, ADN, protéines) ou l'excrétion de certains produits (CO2 ou NH3), il est possible d'évaluer la concentration microbienne d'un échantillon
50
Mesure de la masse cellulaire
- Poids sec * Récolte des microorganismes (filtration sur membrane) * Lavage + dessiccation (100 à 110oC) * Pesée (toutes les bactéries, mortes ou vivantes sont pesées) * Valeurs exprimées en g/L - Turbidité par la densité optique (D.O.): Turbidimétrie
51
Turbidimétrie
Évaluation de la concentration cellulaire à l'aide de sa densité optique [D.O.] (absorption lumineuse) à une certaine longueur d'onde (Ex 600 nm) -Dans une certaine limite (106/ml < [ ] < 108/ml), la D.O. d'une suspension microbienne est directement proportionnelle à sa concentration cellulaire