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COURS 5 : MYCOLOGIE MÉDICALE 🧬 Flashcards

(91 cards)

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1
Q

pourquoi connait-t-on uniquement 150 000 espÚces de champignons alors que 2.4 millions estimées

A

manque d’intĂ©rĂȘt et on ne connait pas leur conditions de croissance

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2
Q

distinguer micromycĂštes et macromycĂštes

A

micromycĂštes: levures et moisissures
macromycùtes: champignons macroscopique, incluent ceux qu’on mange

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3
Q

caractéristiques des champignons, mycÚtes et fungi

A

eucaryotes
sans chlorophylle
porteur de spores
nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (hétérotrophes)
reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
paroi cellulaire chitine/glucanes
saprophytes pour la plupart

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4
Q

comment classe-t-on les champignons selon la morphologie (3)?

A

basée sur la forme de la croissance végétative, 3 types de morphologies

-levures (forme levuriforme)
-moisissures (champignons filamenteux)
-champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)

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5
Q

quelle est la forme la plus simple de champignon?

A

levures

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6
Q

mode de reproduction asexuée des levures

A

bourgeonnement (S. cerevisiae) et fission (Schizosaccharomyces pombe)

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7
Q

les levures pathogĂšnes de l’Homme sont dĂ©signĂ©es par 
 ?

A

Blastoconidies (C. albicans)

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8
Q

décrire les moisissures

mycélium = ?

A

cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes

mycĂ©lium =une masse d’hyphes

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9
Q

décrire les pseudohyphes

A

morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale

cellules levuriformes allongées et attachées

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10
Q

décrire les champignons dimorphiques
exemple de champignons, températures

A

dimorphisme = caractéristique de plusieurs champignons pathogÚnes endémiques comme Blsatomyces et Histoplasma

Filamenteux à 25 degrés
Levures à 37 degrés

Ce changement morphologique (morphogenĂšse) est une caractĂ©ristique d’identification de ces champignons au laboratoire

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11
Q

quel agent cause la blastomycose?

A

Blastomyces derematitidis

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12
Q

nommer 3 méthodes de reproduction fongique asexuée

A

1) production de spores: endospores, exospore, blastospores

2) fragmentation de mycĂ©lium: Spores formĂ©es Ă  la suite de fragmentation d’hyphes/filaments

3) production de stolons: propagation par extension des filaments

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13
Q

décrire la reproduction sexuée (gamÚtes/contenu cellulaire) pour donner lieu à un zygote (isogamie et cystogamie)

A

isogamie: fusion de deux gamĂštes
cystogamie: fusion du contenu cellulaire

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14
Q

nommer les structures spĂ©cialisĂ©es oĂč les spores se forment aprĂšs la mĂ©iose de la reproduction sexuĂ©e

A

asques qui contiennent ascospores

basides qui contiennent les basidiospores

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15
Q

quelles est la caractéristique des champignons parfaits vs imparfaits

A

parfaits: capables de fabriquer des spores (reproduction sexuée et asexuée) alors que

imparfaits: reproduction que par des spores asexuée

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16
Q

quels sont les trois caractĂ©ristiques qui permettent d’effectuer la classification taxinomique?

A

présence ou absence de reproduction sexuée

caractĂšres morphologiques

phylogénie moléculaire/génétique

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17
Q

quels sont les 5 groupes oĂč on retrouve la majoritĂ© des champignons pathogĂšnes?

A

ascomycĂštes
basidiomycĂštes
glomeromycĂštes
mucormycĂštes
mortierellomycota

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18
Q

concernant les ascomycĂštes
- %
- 2 formes retrouvées
- types de reproduction
- exemples

A
  • ReprĂ©sentent 75% des champignons connus
  • Levures ou filamenteux
  • Reproduction sexuĂ©e (ascospores) ou asexuĂ©e par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
  • Exemples : Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium, Alternaria, Blastomyces, Histoplasma, Aleuria, Neurospora, Thaxteriella
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19
Q

concernant les basidiomycĂštes
1- type de reproduction
2- apparences
3- exemples

A

1- reproduction sexuée par formation des basidiospores ou des conidies

2- Sporophore/carpophore, levures, filaments, capsules

3- Cryptococcus neoformans, Boletus, Agaricus, Russula

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20
Q

concernant cryptococcus, que cause-t-il? transmission?

A

méningite et via les pigeons

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21
Q

quels sont les trois groupes de champignons pathogĂšnes qui composent les ZygomycĂštes (ancien nom)?

A

GlomeromycĂštes, MucoromycĂštes et Mortierellomycota

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22
Q

décrire les groupes de champignons appartenant aux ZygomycÚtes
-forme primitive des

-notion de cellules coenocytiques
-reproduction
-mycorhize
-exemples

A
  • Forme primitive des champignons
  • Cellules coenocytiques (en majoritĂ©, mais exception existe)
  • Formation de zygospores (reproduction sexuĂ©e), sporocystes (reproduction asexuĂ©e)
  • Ectomycorhizes et endomycorhizes
  • Exemples : GlomeromycĂštes (Glomus, Gigaspora, Rhizophagus), MucoromycĂštes
    (Mucor, Phycomyces), Mortierellomycota (Mortierella, Diussophora)
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23
Q

nommer un groupe qui ne fait pas parti des 5 groupes oĂč on trouve des champignons pathogĂšnes

A

Microsporidies

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24
Q

décrire les microsporidies et donner des exemples de pathogÚnes

A

pathogĂšnes intracellulaires de plusieurs animaux

Agent de la pébrine (maladie du ver à soie), Nosema bombycis et de la Microsporidiose (Encephalitozoon)

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25
que contient la cellules fongique (7)?
- Noyau avec membrane nucléaire - Cytoplasme - Mitochondrie - Vacuole - Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi - Membrane plasmique - Paroi cellulaire
26
nombre de couches de la paroi?nommer les 3 composantes de la paroi
3 couches: Interne (chitine), intermédiaire (glucane) et externe (mannane)
27
décrire la membrane plasmique d'une cellule fongique
ergostérol (cholestérol fongique) absent chez les cellules animales (du coup on peut le cibler) permet de réguler fluidité de la membrane
28
nommer les 4 types de modes de vie/Ă©cologie des champignons
saprophytes: se nourrissent de la matiĂšre organique en dĂ©composition symbiotique: vivent en symbiose avec les racines de plantes (mycorhizes) ou algues (Lichens); ceci confĂšre un avantage nutritif aux deux partenaires pathogĂšnes/opportunistes: chez plantes sont nĂ©crotrophes ou biotrophes OU chez humain sont opportunistes ou pathogĂšnes stricts venant d l'enviro commensaux: champignons faisant partie de la flore des animaux, de l’Homme et des plantes. Profitent de l’hĂŽte sans causer de dommage. Ils peuvent ĂȘtre opportunistes dans certain contexte (Candida albicans )
29
définir une mycose
infections fongiques touchant les animaux incluant l’Homme peuvent ĂȘtre superficielles ou profondes et mĂȘme systĂ©mique
30
définir la mycologie médicale
distincte de la microbiologie mĂ©dicale consiste Ă  isoler et Ă  caractĂ©riser des champignons pathogĂšnes dans le but de caractĂ©riser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
31
Ă  l'Ă©poque du moyen Ăąge quel agent attaquait le cuir chevelu, la peau lisse et les ongles?
Trichophyton schoenleinii
32
quel agent cause le muguet?
C. albicans
33
quel agent a été associé à une éclosion d'infections sous cutanées chez des travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-44)? lors de la deuxiÚme guerre mondiale, il y a eu apparition de zones endémiques aux USA, quel agent et quelle maladie?
1-Sporothrix schenckii 2- Histoplasma capsulatum, agent de l’Histoplasmose
34
l'Úre de la suppression immunitaire (chimie, VIH/SIDA, maladies auto-immunes, etc) a favorisé l'apparition de quoi?
mycose opportunistes nosocomiales
35
quels sont les trois découvertes importantes qui ont été faites durant l'ùge d'or de la mycologie médicale?
1- dĂ©veloppement de tests diagnostics comme mise en culture spĂ©cifiques, tests de susceptibilitĂ© aux agents antimicrobiens, sĂ©quençage ADRr et ITS 2- DĂ©veloppement d’antifongiques: Azoles et Ă©chinocandines 3- AvancĂ©s dans la comprĂ©hension du pouvoir pathogĂšne fongique
36
Concernant les avancées dans la compréhension du pouvoir pathogÚne fongique, nommer deux initiatives qui ont été faites
1- Fungal Genome Initiative: sĂ©quençage de plusieurs gĂ©nomes de champignons pathogĂšnes de l’Homme 2- GĂ©nomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrĂ©tomes
37
concernant la classification des champignons selon la pathogénÚse, nommer les 5 sites d'infections primaires
mycoses superficielles, cutanées, opportunistes systémiques, sous-cutanées et endémiques
38
nommer deux agents associés à des mycoses superficielles,
Titea versicolor, infection de la couche supérieure morte kératinisée de l'épiderme infection cutanées par Malassezia ***souvent problÚmes cosmétiques
39
définir les mycoses cutanées et nommer un agent qui y est associé
dermatophytres, infections qui touchent la peau, les cheveux et les ongles agent: Trichophyton tonsurans et d'autres Trychophyton
40
nomme deux caractĂšres distinctifs d'une infection par Trychophyton
couche concentrique caractéristique ET infecte la couche VIVANTE de la peau, pas la morte comme dans mycoses superficielles
41
décrire les mycoses opportunistes systémiques et nommer des agents qui peuvent les causer
Infections de tous les organes par des champignons environnementaux Touchent surtout les SI des immunosupprimés AGENTS: Aspergillus fumigatus ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota comme Candida albicans
42
VRAI OU FAUX Les mycoses opportunistes systémiques peuvent survenir chez des personnes saines?
VRAI, dans le cas des champignons dimorphiques
43
décrire les mycoses sous-cutanées et quel agents y sont associés?
Mycoses d’implantations (suite Ă  des piqĂ»res ou des traumatismes transcutanĂ©s, IL FAUT DES LÉSIONS agents: champignons mĂ©canisĂ©s comme Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
44
VRAI OU FAUX dans le cas d'une infection par Sporothrix, la présence de noir correspond à de la nécrose?
FAUX, c'est las production de mélanine
45
décrire les mycoses endémiques, nommer quelques exemples de maladies/agents.
Champignons ayant une répartition géographique restreinte ET cause en majorité de l'infection pulmonaire qui peuvent évoluer en infections systémiques (exception Sporothrix par implantation) - Histoplasmose, Histoplasma capsultum, USA, River valleys - Blastomyces, B. dermatidis, comme en haut mais aussi CAN-QC - Penicilliose, P. marneffei, Asie sud-est -C. gatti, cÎte ouest USA et CAN etc
46
VRAI OU FAUX une majorité d'histoplasmose est retrouvé en Afrique de l'Ouest-Centrale-Sud?
VRAI
47
nommer des facteurs de risques qui prédisposent les patients à un taux de mortalité plus élevé aprÚs une mycose invasive
cancer, cancer du sang, transplantation de cellules hématopoïétiques ou moelle osseuse, transplantation d'organes, VIH, diabÚte
48
quel agent est responsable d'infections pulomonaire et cérébrales, d'otites, d'infections des ongles et d'allergies quelles personnes sont affectées?
Aspergillus sp A. fumigatus et aspergillose invasive immunocompromises
49
quel agent cause des lésions cérébrales et pulmonaires et des méningites? transporté par? quelles personnes sont affectées?
Cryptococcus gatti excréments de pigeons affecte les sujets sains et immunosupprimés?
50
quel agent (endémique au QC) cause des infection fatales et pulmonaires, des lésions dermiques et des ostéomyélites? à quel autre agent pathogÚne les lésions qu'il cause se ressemblent?
Blastomyces dermatitidis et au parasite Leishmania
51
quel pathogÚne a été associé à une éclosion dans la PremiÚre Nation de Constance Lake dans le Nord de l'Ontario?
B. dermatidis
52
quel agent pathogĂšne cause une enflure des ganglions qui peut ĂȘtre observĂ© Ă  la suite d'un voyage dans le Sud?
Paracoccidioides sp. Paracoccidioides brasiliensis, DIMORPHIQUE END.MIQUE
53
quel est l'espÚce de champignon est la plus prévalente (i guess dans le monde)?
Candida spp ET SURTOUT C. albicans
54
pourquoi il peut ĂȘtre difficile de diagnostiquer C. albicans?
diversité morphologique extraordinaire
55
nommer une ressemblance et une différence entre les Candida spp et S. cerveisiae
ont une morphologie similaire mais s.cervisiae est saprophyte alors que candida est pathogĂšne
56
quelle est la 4e maladie nosocmiale la plus connue? elle est transmise par qui? morbidité/mortalité?
candidose par C. albicans transmise par le personnel de soins cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosupprimés
57
pourquoi les hospitalisations associĂ©es Ă  des candidose peut ĂȘtre trĂšs couteuse (40 000$?
souvent les infections fongiques et les infections bactĂ©riennes sont confondues et donc longue durĂ©e Ă  l'hĂŽpital = coĂ»ts âŹ†ïž
58
quel caractéristiques confÚre une virulence à C. albicans?
son dimorphisme soit - forme de levure à 30 degrés (dissémination) - des hyphes à 37 degrés (invasion/colinsation organes)
59
VRAI OU FAUX C. albicans est un champignon dimorphisme?
FAUX il forme des filaments à 37 degrés alors que les champignons dimorphiques forment des levures à 37 degrés
60
VRAI OU FAUX C.albicans forme des biofilms?
VRAI, croissance multi-cellulaire, sessile (attachée) et résistante
61
à quel endroit du corps a été retrouvé la forme commensale de C. albicans?
intestin
62
VRAI OU FAUX C. albicans effectue de la reproduction sexuée, car son génome contient tout ce qu'il faut pour l'effectuer?
FAUX, oui il a tous les gÚnes mais C. albicans de peut pas l'effectuer quand on force en labo il a un mating genre une méiose et c'est terminé, bref pas efficace
63
VRAI OU FAUX 95% des infections à levures sont causées par C.albicans?
VRAI, le reste glabrata
64
quel type de mycose est fréquemment retrouvée au Canada?
vaginose Ă  Candida
65
au niveau du vagin, il est important de retrouver un Ă©quilibre entre quoi et quoi?
Lactobacilles et Candida
66
effet d'un traitement antibiotique sur une vaginose Ă  Candida
Lactobacilles baissent et Candida prend le dessus
67
pourquoi il est difficile d'éliminer les bactéries et les levures au niveau du vagin?
pH trĂšs acide, soit 3-4
68
quelles sont les 5 composantes du microbiote?
bacteriome, virome, mycobiome, parasites et archeome
69
nommer des types de mycobiomes humain
buccal, nasal, respiratoire, gastro-intestinal, vaginal, cutanée, oesophagien, dentaire
70
définir l'abondance relative lors de la mesure du mycobiome
distribution relative (en proportion de la population) des espĂšces dans le mycobiome
71
définir la richesse lors de la mesure du mycobiome
Nombre d’espĂšces trouvĂ©es dans un microbiome (richness)
72
définir l'équitablité lors de la mesure du mycobiome
rĂ©partition des individus dans le mycrobiome (evenness) L’équitabilitĂ© microbienne est Ă©levĂ©e lorsque les microbes cohabitent en propor6ons Ă©gales. Inversement, si un type de microbe domine tandis que les autres sont peu prĂ©sents, l’équitabilitĂ© sera faible
73
On mesure la diversitĂ© microbienne d’un mycobiome en combinant les notions ... et ...
d’équitabilitĂ© et de richesse
74
nommer trois outils de mesure du mycobiome
culture microbienne: étude un champignon à la fois, pas toujours représentatif car on ne connait pas conditions croissances de tous séquençage 18S et ITS métagénomique complÚte: déterminer fonctions
75
quel type d'amorce est utilisé pour identifier les espÚces par le séquençage de 18S et des ITS
amorces universelles dans régions bien conservées
76
VRAI OU FAUX le mycobiome reflÚte l'état de santé d'un individu?
VRAI, mais ne permet pas d'établir causalité
77
que peut-on supposer si Candida est retrouvée dans les poumons?
Fibrose kystique
78
dans les maladies inflammatoires intestinales comme la maladie de Crohn et la colite ulcĂ©reuse, l'inflammation pourrait ĂȘtre causĂ©e par quoi?
âŹ†ïž de Candida
79
nommer un problĂšme des kits d'extraction d'ADN des champignons
pas adapté à la paroi des champignons, on a besoin de plus de détergents
80
sachant que des agents comme Malassezia pourraient ĂȘtre associĂ©s au cancer, quel expĂ©riences ont Ă©tĂ© rĂ©alisĂ©es?
l'ablation du mycobiome, pourrait augmenter l'effet des chimiothérapies (par gemcitabine) (testé chez la souris)
81
à quel type de cancer est associée Candida?
gastro-intestinaux ADN de Candida enrichi dans les tumeurs prédit un mauvais pronostic
82
VRAI OU FAUX les champignons associés à 35 types de cancer sont intra-tumoraux?
VRAI et ils ont prĂ©dictifs de pronostic et de la rĂ©ponse Ă  l’immunothĂ©rapie
83
quel champignon pathogÚne est associé aux fourmis zombies?
Ophiocordyceps unilaterali
84
nommer une raison expliquant une possible fin du monde causée par les mycoses
les champignons sont les seules microbes connus qui ont causĂ© l'extinction d’une espĂšce ". A Casadevall
85
nommer une espÚce qui a été extincte par une mycose
amphibiens, chytridiomycose des amphibiens Ă  l’échelle mondiale Batrachochytrium dendrobatidis (Bd)
86
quel espĂšce risque de disparaĂźtre en raison de mycose
chauves-souris au nez blanc, CAN et USA Pseudogymnoascus destructans
87
CDC, center of disease control and prevention quel pathogÚne multi résistant est en émergence? problÚme?
Candida auris, premier cas de champignons transmissibles...😃 bah du coup on aura bientît aucun traitement contre C. auris
88
VRAI OU FAUX il y.a peu de cas de mycose en Afrique et Amérique du Sud?
FAUX, seulement qu'il n'y a pas vraiment d'études de prévalence sur ces continents
89
5 caractéristiques de C. auris
- resiste à 42 degrés - résiste à salinité (mer etc) - résiste à alcool 70% et autres alcool de soins intensifs - ADORE LE PLASTIQUE - TRANSMISSIBLE
90
d'oĂč providrait C. auris? distinction entre les souches enviro et cliniques
Inde, Bengale sur ßles paradisiaques, gens qui nagent et hop MAIS, souche environnementale ne semble pas tant pathogÚne alors que l'étude des souches cliniques révÚlent qu'elles le sont
91
dans la premiÚre liste d'agents pathogÚnes fongiques publiée par l'OMS, caractéristiques communes aux différents pathogÚnes = ?
Taux de mortalité et résistance trÚs élevés

LEVURESđŸ„đŸ»đŸ„– (6 decks)

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