Cours 7

Question 1

Définition de communauté

Answer 1

L’ensemble des micro-organismes qui habitent dans une niche écologique particulière

Question 2

Définition de population

Answer 2

Groupe d’individus de la même espèce défini dans le temps et dans l’espace

Question 3

Pourquoi n’importe qui peut interagir avec n’importe qui? Comment est ce possible?

Answer 3

Les acides aminés sont identiques
Les bases azotées sont identiques

Question 4

Nommez les 4 interactions conflictuelles

Answer 4

La compétition
L’amensalisme
La prédation
Le parasitisme

Question 5

La quelle des interactions conflictuelles est la plus répandue?

Answer 5

La compétition

Question 6

Expliquez la compétition

Answer 6

Interaction dans laquelle les partenaires utilisent la même ressource

Question 7

Expliquez en bref l’amensalisme

Answer 7

C’est une interaction de type négative-neutre ( 1 des 2 bactérie va être en compétition et l’autre va être neutre)

Question 8

Expliquez la prédation

Answer 8

Élimination instantanée d’un organisme par un autre (relation négative (proie) bénéfique (prédatrice))

Question 9

Expliquez le parasitisme

Answer 9

Interaction durable négative pour l’hôte parasité elle peut être définitive ou temporaire (cycle de reproduction)

Question 10

Nommez les 3 interactions bénéfiques

Answer 10

Le commensalisme
La pro-coopération
Le mutualisme

Question 11

Expliquez le commensalisme

Answer 11

C’est la seule interaction bénéfique pour laquelle les effets positifs ne s’exercent que sur l’un des 2 partenaires. Aucun effet négatif pour les 2 partenaires.

Question 12

Expliquez la pro-coopération

Answer 12

Relation facultative à bénéfice réciproque. Les 2 partenaires collaborent pour survivre dans certains milieux ou certaines conditions seulement.

Question 13

Quel autre nom peut on donner au mutualisme

Answer 13

La symbiose

Question 14

Expliquez le mutualisme

Answer 14

Relation obligatoire à bénéfice réciproque

Question 15

Définition de adaptation

Answer 15

Ensemble de caractéristiques morphologiques et physiologiques qui permet aux organismes de se multiplier dans un biotype donné

Question 16

Définition d’adaptabilités

Answer 16

Capacité à l’adaptation

Question 17

Définition de fitness

Answer 17

Capacité d’un organisme à se reproduire et à transmettre ses gènes

Question 18

Qu’est ce que le quorum sensing?

Answer 18

Un système de communication bactéries relié à la densité cellulaire

Question 19

Quelles sont les utilités du quorum sensing?

Answer 19

Important pour la virulence, colonisation de l’hôte,formation de biofilms,défense contre les concurrents et adaptation à des environnements changeants
Permet la communication intra-espèce et inter-espèce
Fait intervenir des molécules appelées «auto-inducteurs»

Question 20

Par quoi sont produit les AHL?

Answer 20

Par les lactones

Question 21

Nommez 3 familles d’AHL synthase

Answer 21

LuxI
LuxM
HdtS

Question 22

Les AHL sont elles spécifiques ou non-spécifique à une espèce bactérienne?

Answer 22

Non spécifique

Question 23

Dans quelles conditions on va avoir de l’interférence ou «quorum-quenching»?

Answer 23

Par pH basique et température élevée
Par dégradation enzymatique
Par production de composés mimant les AHL

Question 24

Nommez 3 caractéristiques important sur les PAI

Answer 24

Forte diversité structurelle
Les PAI sont très spécifiques et reconnu par 1 seul récepteur
Communication intra-espèces spécifique
(Les récepteurs peuvent être présent chez différentes espèces donc possibilité de communication inter-espèce )

Question 25

Quels sont les 2 stress pouvant influencer les communautés?

Answer 25

Le stres biotique Le stress abiotique

Question 26

Donnez des exemples de facteurs de stress abiotique

Answer 26

Environnementaux (pH, salinité, température, disponibilité des nutriments) Humains (pollution, exploitation,antibiothérapie)

Question 27

Donnez des exemples de facteurs de stress biotique

Answer 27

Animaux (disparition de l’espèce, labourage etc) Bactériens (transfert de gènes, mutation, nouvelle espèce etc)

Question 28

Quelles sont les protéines exprimées en cas de choc thermique?

Answer 28

Hsp classé selon leur masse moléculaire Hsp70 (DnaK) Hsp60 (GroEL) Hsp40 (DnaJ)

Question 29

Les Hsp sont sous la régulation de quoi?

Answer 29

Sigma32

Question 30

Les canaux ioniques bactériens ont une homologie avec quels canaux ioniques?

Answer 30

Les canaux ioniques des eukaryotes

Question 31

De quoi sont responsables les canaux ioniques bactériens?

Answer 31

De signaux électriques longues distances dans les biofilms bactériens

Question 32

Comment se propagent les signaux envoyés par les canaux ioniques?

Answer 32

Ils sont envoyés par des ondes qui se propagent du centre aux extrémités des biofilms

Question 33

À quoi est due la diversité existante de la population bactérienne?

Answer 33

À l’apparition de variants via un mécanisme appelé variation de phase ou conversion phénotypique

Question 34

Nommez les deux façons dont la variation de phase peut se faire

Answer 34

Par modification du génome Par régulation épigénétique

Question 35

Définir conversion génique

Answer 35

Événement de recombinaison entre une copie silencieuse et une copie exprimée d’un gène, conduisant à la formation d’un gène chimère

Question 36

Quels sont les 5 sous types de variation de phase par modification du génome?

Answer 36

Conversion génique Inversion site spécifique Insersion-excision Duplication Délétion

Question 37

Définir inversion site spécifique

Answer 37

Événement de recombinaison qui implique la présence de séquences répétées et d’une recombinase

Question 38

Définir Insersion-excision

Answer 38

Nécessite la présence d’un élément génétique mobile comme une séquence d’insertion conduisant à l’inactivation d’un gène

Question 39

Définir duplication (notion de variation de phase)

Answer 39

Implique la duplication d’une partie d’un gène entraînant la perte de la fonction du gène. Cette duplication est ensuite excisée de manière précise au moment de la réversion

Question 40

Définir délétion

Answer 40

Phénomène non réversible qui consiste en l’excision et la suppression d’un gène

Question 41

Quelle est la différence entre la variation par modification du génome et la variation par régulation épigénétique

Answer 41

La régulation épigénétique ne modifie pas la séquence génomique

Question 42

Expliquer le principe de la variation de phase par régulation épigénétique

Answer 42

Régulation par méthylation des séquences dans les zones régulatrices, ce qui affecte donc la fixation du facteur de transcription

Question 43

En quoi consiste les bactéries tricheuses?

Answer 43

Ce sont des bactéries qui utilisent les ressources produites par la population sans participer à sa production

Question 44

Qu’est ce qu’il va se passer lorsque les biofilms vont manquer de nutriments? (Notions canaux ioniques)

Answer 44

Ils vont envoyer une vague d’ions potassium, ce qui va dire aux cellules qui sont à l’extérieur (au niveau du contour du biofilm) que l’intérieur du biofilm manque de nutriments. Donc les bactéries autour vont arrêter de prendre les nutriments ce qui va permettre aux nutriments de diffuser vers l’intérieur

Question 45

Qu’est ce qu’une bactérie tricheuse?

Answer 45

Bactérie qui utilise les ressources produites par la population sans participer à sa production

Question 46

Les bactéries tricheuses sont favorisés en présence d’antibiotiques, expliquez ce qui ce passe

Answer 46

1- leur proportion augmente 2- les coopérateurs sont plus sensibles aux antibiotiques à cause du coût énergétique de la coopération 3-les tricheuses ne participant pas à la coopération ont plus d’énergie disponible pour leur croissance