Cours 7 - Introduction à la génétique des maladies complexes Flashcards

(50 cards)

1
Q

Qu’est-ce que le modèle infinitésimal de Fisher permet d’expliquer ?

A

Il explique comment plusieurs gènes ayant chacun un effet minime peuvent générer une variation phénotypique continue, en accord avec les lois de Mendel.

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2
Q

Pourquoi les traits comme la taille ou la pression artérielle sont-ils dits « quantitatifs et continus » ?

A

Parce qu’ils varient de façon continue dans la population et sont influencés par plusieurs gènes et l’environnement.

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3
Q

Comment Galton a-t-il contribué à la compréhension de l’hérédité ?

A

Il a introduit la notion de régression vers la moyenne et a posé les bases de l’approche biométrique de l’hérédité.

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4
Q

Qu’est-ce que la biométrie en génétique ?

A

C’est l’étude statistique de la variation des traits, assumant qu’ils suivent une distribution continue normale avec des cas extrêmes (sans mutation).

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4
Q

Comment Fisher a-t-il réconcilié les idées des Mendéliens et des Biométriciens ?

A

En montrant qu’un grand nombre de loci à petits effets, soumis aux lois de Mendel, peut engendrer des phénotypes continus.

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5
Q

Qu’est-ce que la variance phénotypique ?

A

C’est la mesure de la variation d’un trait dans une population, attribuable aux composantes génétiques et environnementales.

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6
Q

Quelle est la différence entre l’effet additif et l’effet de dominance d’un allèle ?

A

L’effet additif correspond à l’effet moyen de l’allèle, alors que l’effet de dominance reflète l’interaction entre les allèles.

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6
Q

Pourquoi la modélisation de l’hérédité est-elle utile pour comprendre les maladies complexes ?

A

Parce qu’elle permet de quantifier la contribution des gènes à des traits influencés par plusieurs facteurs.

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6
Q

Quels sont les objectifs de la génétique quantitative en biologie humaine ?

A

Expliquer la ressemblance entre individus apparentés pour des traits à variation continue.

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7
Q

Quel est le but de normaliser les données phénotypiques ?

A

Transformer les valeurs pour qu’elles aient une moyenne de 0 et un écart-type de 1, facilitant la comparaison entre individus.

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7
Q

Qu’est-ce que l’effet génétique additif α ?

A

C’est l’effet moyen d’un allèle sur le phénotype, calculé à partir de la régression du phénotype sur le nombre d’allèles.

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8
Q

Comment la dominance influence-t-elle la variance génétique ?

A

Elle introduit une composante non-additive à la variance génétique, liée aux interactions entre allèles.

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8
Q

Quelle information donne la covariance entre génotype et phénotype ?

A

Elle mesure à quel point le génotype est corrélé avec la variation du phénotype.

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9
Q

Pourquoi l’héritabilité est-elle une mesure populationnelle ?

A

Parce qu’elle dépend du contexte environnemental et génétique d’une population donnée à un moment précis.

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9
Q

Qu’est-ce que l’héritabilité au sens strict (h²) ?

A

La proportion de la variance phénotypique due uniquement à la variance génétique additive.

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10
Q

Qu’est-ce que l’héritabilité au sens large (H²) ?

A

La proportion de la variance phénotypique totale qui est expliquée par l’ensemble des effets génétiques (additifs, dominance, interactions).

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11
Q

Quelles relations peuvent faire fluctuer l’estimé de l’héritabilité.

A

Comme l’héritabilité est un ratio de variances, une variation dans ces variances (ex. changement dans la fréquence allélique dû à la sélection ou la dérive, changement d’environnement) peut faire fluctuer l’estimé de l’héritabilité.

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12
Q

Pourquoi une forte héritabilité n’implique-t-elle pas une prédiction parfaite du phénotype ?

A

Car l’environnement peut toujours influencer l’expression du trait, malgré une forte composante génétique.

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13
Q

Comment peut-on estimer l’héritabilité ?

A

En évaluant la ressemblance phénotypique entre individus apparentés.

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13
Q

Pourquoi les études d’héritabilité utilisent-elles parfois des individus élevés dans des environnements différents ?

A

Pour réduire la covariance environnementale et isoler l’effet génétique.

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14
Q

Qu’est-ce que l’identité par descendance (IBD) ?

A

Deux allèles sont IBD s’ils sont identiques et hérités d’un ancêtre commun.

14
Q

Quelle est la différence entre IBS et IBD ?

A

IBS signifie que les allèles ont la même séquence ; IBD implique en plus une origine commune.

15
Q

Quelle proportion du génome est IBD entre jumeaux monozygotes ?

A

100 % (IBD2 = 1).

16
Q

Quelles sont les valeurs typiques de partage IBD entre pleins-frères ?

A

25 % IBD0, 50 % IBD1, 25 % IBD2.

17
Quelle est la variance génétique attendue pour des parents-enfants ?
½ de la variance génétique additive, aucune de dominance.
18
Qu’est-ce que le coefficient de régression entre phénotypes apparentés représente ?
Il correspond à la proportion de variance génétique partagée.
18
Comment calcule-t-on h² à partir de la régression parent-enfant ?
h² = 2 × coefficient de régression parent-enfant.
18
Pourquoi les estimés d’héritabilité sont-ils parfois exagérés ?
Parce qu’ils ne tiennent pas toujours compte de la covariance environnementale.
19
Quel est l’effet de la sélection environnementale sur l’héritabilité ?
Elle peut modifier la variance phénotypique, influençant ainsi l’estimation de l’héritabilité.
19
Quelle est la relation entre la variance additive et la prédiction phénotypique ?
Plus la variance additive est grande, plus il est possible de prédire le phénotype à partir du génotype.
20
Pourquoi les parents ne transmettent-ils pas toute leur valeur génétique aux enfants ?
À cause de la recombinaison génétique, seuls les allèles sont transmis, pas les interactions entre eux.
20
Quelle est l'utilité des modèles polygéniques en génétique humaine ?
Ils permettent d’expliquer des maladies complexes influencées par plusieurs gènes.
21
Qu’est-ce qu’un SNP et quel rôle joue-t-il dans la génétique quantitative ?
Un SNP est une variation d’un seul nucléotide, souvent utilisé pour estimer l’effet d’un locus sur un trait.
22
Pourquoi le modèle de Fisher est-il fondamental ?
Il montre que les lois de Mendel peuvent générer une distribution normale des traits.
22
Quel est l’impact de la fréquence allélique sur la contribution d’un allèle à la variance ?
Les allèles à fréquence intermédiaire contribuent généralement davantage à la variance que les allèles rares.
23
Pourquoi les traits polygéniques sont-ils souvent difficiles à prédire individuellement ?
À cause de l’effet cumulé de nombreux gènes à faible impact et des facteurs environnementaux.
24
Comment la normalisation des phénotypes aide-t-elle à l’analyse statistique ?
Elle permet de comparer différents individus sur une même échelle standardisée.
25
Pourquoi les maladies mendéliennes ne nécessitent-elles pas de modélisation polygénique ?
Car elles sont causées par un ou quelques gènes à effet majeur, contrairement aux maladies complexes.
26
Comment interpréter une pente de régression dans un modèle génétique ?
Elle représente le changement moyen du phénotype pour chaque allèle additionnel.
27
Pourquoi les estimés de h² peuvent-ils varier entre populations ?
En raison de différences dans l’environnement, la structure génétique et les fréquences alléliques.
28
Quel est le rôle des tests entre apparentés dans l’estimation de l’héritabilité ?
Ils permettent de corréler le degré de parenté génétique à la similarité phénotypique.
29
Quelles sont les limites des études d’héritabilité ?
Elles peuvent surestimer les effets génétiques si les effets environnementaux partagés ne sont pas contrôlés.
29
Quelle est la différence entre variation phénotypique et variation génétique ?
La variation phénotypique inclut la variation génétique et environnementale ; la variation génétique est la portion héritée.
30
Pourquoi les coefficients de corrélation sont-ils importants en génétique quantitative ?
Ils mesurent la force et la direction de la relation entre deux variables, par exemple entre génotype et phénotype.
30
Que reflète la covariance entre génotypes apparentés et phénotypes ?
L’influence héréditaire sur les traits partagés.
30
Comment la dérive génétique peut-elle influencer l’héritabilité ?
En modifiant la fréquence des allèles, elle peut faire fluctuer la variance génétique dans la population.
31
Pourquoi les modèles à un locus sont-ils simplificateurs ?
Parce qu’ils ignorent l’effet combiné de plusieurs loci et des interactions génétiques.
31
Quels types d’étude sont utilisés pour calculer l’héritabilité chez l’humain ?
Études de jumeaux, d’adoption, ou de parenté généalogique.
32
Comment un changement d’environnement peut-il affecter l’héritabilité estimée ?
En augmentant ou réduisant la variance environnementale, ce qui modifie le rapport entre variances.
33
Pourquoi la génétique quantitative est-elle essentielle dans le contexte des maladies complexes ?
Parce qu’elle permet de modéliser la contribution cumulative de nombreux gènes à un risque de maladie.