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cours 8 - liaisons spécifiques Flashcards

(72 cards)

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1
Q

quelles sont les 4 critères qui définissent une liaisons spécifique?

A
  1. saturabilité
  2. réversibilité
  3. stéréospécificité
  4. affinité
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Q

qu’est ce qui définit l’affinité d’un ligand pour son récepteur?

A

plus un ligand à une forte affinité pour son récepteurs, plus il devra être en faible concentration pour déplacer un autre ligand en compétition.

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3
Q

Kd

A

constante d’affinité: concentration du ligand lorsque 50% des récepteurs sont liés.

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4
Q

saturabilité

A

lorsqu’il y a un nombre fini de liaison spécifique; la liaison atteint un plateau car tous les sites de liaisons spécifiques sont occupés.

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5
Q

6 types de ligands

A
  1. agoniste
  2. agoniste inverse
  3. antagoniste
  4. agoniste protéan
  5. agoniste biaisé
  6. agoniste partielle
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6
Q

agoniste protean

A

peut agir comme un agoniste ou peut agir comme un agoniste inverse.

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7
Q

agoniste biaisé

A

active une partie des voies de signilisation

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8
Q

récepteurs de réserve

A

portion des récepteurs qui ne sont pas liés à un ligand lorsque l’effet maximal est atteint. Ces récepteurs permettent de garder une réponse maximal même si le nombre de récepteurs est réduit ou ils se désensibilisent.

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9
Q

3 types de récepteurs

A
  1. récepteurs à 7 domaines transmembranaires liés aux protéines G
  2. récepteurs à canaux
  3. récepteurs à activité enzymatique
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10
Q

quels sont les 5 généralités des RCPG?

A
  1. les hormones ou les agents de stimulations sont présent en très faible concentration (grande affinité pour le récepteurs)
  2. les NT sont présent en plus grande quantité
  3. chaque cellule possède plusieurs types de récepteurs pour le même messager
  4. différents récepteurs, activés par différents ligands, peuvent induire la même réponse biologique.
  5. chaque récepteurs a une spécificité de liaison + spécificité de réponse biologique
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11
Q

quel extrémité du RCPG est extracellulaire et lequel est intracellulaire?

A

L’extrémité NH2 est extracellulaire et l’extrémité COOH est intracellulaire.

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12
Q

quelles sont les 4 familles de RCPG

A
  1. famille A - Rhondopsine-like
  2. famille B - secretine-like et adhesion
  3. Famille C
  4. Famille F
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13
Q

combien de récepteurs et combien de medicaments pour les RCPG de la famille A

A

715 récepteurs et plus de 500 médicaments

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14
Q

quelles sont les 5 caractéristiques des RCPG de la famille A?

A
  1. activation commune des RCPG de classe A
  2. changements conformationnels clés
  3. implication du motif NPxxY
  4. rôle du motif DRY
  5. variabilité de la structure
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15
Q

explication activation commune des RCPG de la famille A?

A

implique des micro-interrupteurs conservés liant le site de liaison du ligands à la région de couplage au protéines G.

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16
Q

quelle est le changement de conformation clé de la famille A ?

A

la liaison d’un agoniste déclenche des réarrangements structuraux, notamment le déplacement vers l’extérieur de TM6, signature de l’activation.

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17
Q

implication du motif NPxxY de la famille A

A

change de conformation pour intéragir avec TM3, renforçant l’empactage entre TM3 et TM7.
Permet la stabilisation de la nouvelle conformation active du récepteur.

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18
Q

rôle du motif DRY de la famille A

A

forme un verrou entre TM3 et TM6 dans l’état inactif; ce verrou est levé après la liaison de l’agoniste, facilitant l’intéraction de la protéine G.

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19
Q

quelle est la variabilité de la structure pour la famille A?

A

Dans 30% des RCPG de classe A, l’acide en position 6.30 est absent et d’autres intéractions polaires compense pour réguler l’activation.

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20
Q

combien de récepteurs sont associé à la famille B

A

15-33 récepteurs

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21
Q

quelles sont les 4 caractéristiques de la famille B

A
  1. liaison à 2 domaines
  2. mouvement clé
  3. poche de liaison flexible
  4. sites spécifiques
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22
Q

quelle est la liaison a 2 domaines de la famille B?

A

le domaine extracellulaire reconnait le C-terminal du peptide, oriantant le N-terminal vers le domaine transmembranaire pour activer le récepteurs.

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23
Q

quelle est le mouvement clé de la famille B?

A

Le domiane extracellulaire pivote, déplacant le C-terminal du peptide, tandis que le N-terminal s’insère dans une cavité en V du domaine transmembranaire.

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24
Q

caractérisation del a poche de liaison de la famille B

A

poche de liaison flexible: plus accessible aux solvants et adaptée aux ligands peptidiques volumineux.

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25
quels sont les sites spécifiques des RCPG de la famille B?
présence d'une poche pour les antagoniste et d'un site commun pour les modulateurs allostériques.
26
quelle est le processus d'activation de la famille B?
1. liaison du ligand 2. réarrangements du réseau polaire central 3. déstabilisation et déplacement de TM6 4. ouverture d'une cavité pour protéine Galpha simulateur
27
quelle est la structure unique de la famille C
grand domaine extracellulaire formant un dimère, avec une poche de liaison orthosérique.
28
activation de la famille C
agoniste stabilise le venus flytrap domain (VFT), rapprochant les sous-unités et induisant un réarragement du domaine transmembranaire.
29
famille F
- 1 seul récepteurs dans la famille F: le récepteur SMO (smoothened receptor) qui a été validé comme cible thérapeutique avec des antagonistes de petits molécules approuvés approuvés en tant qu'agents antinéoplasiques. - autres récepteurs sont les récepeurs Frizzled (FZD1-10) qui médiatisent la signilisation Wnt, essentielle au développement embryonnaire et aux organismes adultes.
30
quelle est le dogme du fonctionnement des récepteurs couplés aux protéines G
31
quels sont les 4 domaines de la sous-unité alpha?
1. domaine de liaison pour les nucléotides (GTP/GDP) = dans la poche 2. domaine de liaison avec la sous-unité bêta-gamma = dans la partie amino-terminale 3. domaine de liaison avec le récepteur = dans la partie carboxy-terminale 4. domaine de liaison avec l'effecteur = 3 région différentes : alpha1, alpha2,alpha3
32
quelles sont les 4 types de protéines G (sous-unité alpha)?
1. Gs = simulatrice 2. Gi = inhibitrice 3. Gq 4. G12/13
33
fonction de Gs
activation de l'adénylate cyclase
34
structure de la protéine kinase A et mode d'action
- 2 sous-unité catalytiques -2 sous-unités régulatrice si le taux d'AMPc est bas = les 4 sous-unités de la protéine kinase A sont associées.à si le taux d'AMPc est haut = AMPc se lie à la sous unité régulatrice et produit un changement de conformation qui libère les sous-unités catalytiques de la protéine kinase A. Ces unités catalytiques phosphorylent leur substrat et induisent un activité biologique.
35
fonction de Gi
inhibe l'adénylate cyclase
36
fonction de Gq
activation de la phospholipase C (PLC)
37
fonction de G12/13
activation de la petite protéine Rho
38
est ce que la dissociation des sous-uités bêta et gamma de la protéine G est possible?
oui mais seulement avec des conditions dénaturantes.
39
4 caractéristiques de la structure de la sous-unité bêta?
1. contient une hélice alpha NH2-terminal (20 a.a) 2. possède 7 séquences répétitives (WD repeats) impliquées dans l'assemblage 3. forme un anneau de feuillets bêta antiparallèles 4. stabilisation par un velcro snap au niveau de la 7e lame.
40
sous quelle condition il ya une intéraction entre la sous-unité bêta, alpha et gamma?
uniquement lorsque la sous-unité alpha est lié au GDP. 1.La liaison du GDP entraîne un désorde dans les régions switch de alpha 2. exposition d'un microdomaine reconnu par bêta-alpha 3. bêta interagit avec switch I et II de alpha-GDP, masquant le site effecteur et emprissonnant GDP.
41
caractéristiques de la structure de la sous-unité gamma
contient un motif CAAX permettant la prénylation: ajout d'un groupement isoprénoïde, soit un groupement lipidique qui permet l'ancrage membranaire.
42
deux types de sous unité gamma et leur particularité
gamma1: ajout d'un groupe fanesyl gamma2: ajout d'un groupe géranylgéranyle
43
quelles sont les 3 fonctions biologiques de bêta-alpha?
1. activation de l'adenyl cyclase 2/4 en présence de Galpha simulatrice 2. activation de PLC- bêta 2 3. GRK recruté à la membrane via le domaine PH du bêta-alpha
44
quels sont les spécificités des isoformes bêta-gama?
Bêta1-gamma1= se couple efficacement avec la rhodopsine bêta2-gamma2= inhibe sélectivement les canaux calciques de type T
45
quels sont les 4 impact des mutations sur les récepteurs?
1. gains de fonction 2. perte de fonction 3. modification de la spécificité du ligands 4. retard dans la désensibilisation
46
quelle est l'impact de la majorité des mutations des récepeturs? combien sont associé à des gains de fonction?
la majorité des mutations induisent une perte de fonction et plus de 100 mutations connues sont associés à des gains de fonction.
47
quels sont les 3 mécanismes de modulation des récepteurs?
1. défauts pré-receptoriels 2. défauts réceptoriels 3. défauts post-réceptoriels
48
nommer 3 mécanismes de défauts pré-réceptoriels
1. modification de la structure moléculaire de l'hormone 2. présence d'anti-corps anti-récepteur 3. présence d'anti-crops anti-hormone
49
nommer 4 mécanismes de défauts réceptoriel
1. absence de récepteurs 2. diminution du nombre de récepteurs 3. augmentation du nombre de récepteurs 4. diminution de l'affinité du ligand pour le récepteur
50
quels sont les 3 mécanismes de désensibilisation
1. découplage = désensibilisation homologue et désensibilisation hétérologue 2. séquestration= internalisation des récepteurs 3. régulation négative
51
définition désensibilisation hétérologue
mécanisme de régulation des récepteurs dans lequel l'activation d'un récepteur spécifique entraîne la phosphorylation d'un autre récepteur, ce qui le désensibilise.
52
définition désensibilisation homologue
mécanisme de régulation des récepteurs où un récepteur active se fait phosphoryler par GRK et la phosphorylation du récepteur engendre la liaison d'une arrestine qui empêche l'intéraction entre le récepteur et la protéine G, bloquant la signialisation.
53
quels sont les 5 étapes expérimentales pour étudier la désensibilisation hétérologue?
1. activation d'un récepteur 2. arrêt de la réaction 3. préparation membranaire 4. stimulation des récepteurs avec agonistes 5.. mesure de la réponse
54
4 étapes de la désensibilisation homologue
1. un ligand active un récepteur 2. le récepteur est phosphorylé par une GRK 3. une phosphorylation recrute une arrestine 4. l'arrestine empêche l'intéraction entre le récepteur et la protéine G, bloquant la signialisation.
55
récepteurs sauvage vs recepteur tronqué vs récepteur muté
récepteur sauvage: désensibilisation récepteur tronqué: étant donner que la chaîne C-terminal est completement enlevé et qu'elle est essentielle pour la phosphorylation du récepteur, il n'y a pas de désensibilisation récepteur muté: désensibilisation partielle: selon le site qui est muté la désensibilisation peut être affectée si c'est un site critique pour la phosphorylation.
56
quelles sont les 3 domaines de la GRK?
1. domaine de reconnaissance 2. domaine catalytique 3. domaine d'intéraction protéine/protéines
57
l'internalisation des récepteurs dépend de 4 facteurs, lesquels?
1. récepteurs spécifiques 2. cellules spécifiques 3. état métaboliques de la cellule 4. facteurs cellulaires spécifiques
58
après l'internalisation des récepteurs, où sont ils envoyés (3 options)
1. recyclés 2. dégradés 3. envoyé vers d'autres compartiments intracellulaires
59
quelles sont les 3 différentes voies d'internalisation des récepteurs?
1. vésicules de clathrine 2. lipid rafts/caveole 3. migration mixte
60
quelles sont les 4 fonctions des microdomaines lipidiques/caveole
1. agit comme endroit dans leqeul les récepteurs accomplissent une tâche de signialisation spécifique (présente des molécules spécifiques) 2. protection des récepteurs contre un internalisation rapide 3. cavéoline peut réguler l'activité constitutive des récepteurs 4. changement de la voie d'internalisation pourrait affecter la destination final du récepteur
61
quel mécanisme est utilisé pour la séquestration des récepteurs phosphorylé par la GRK?
lipid rafts/caveole
62
quel mécanisme est utilisé pour la séquestration des récepteurs phosphorylé par la PKA?
vésicule de clathrine
63
est ce que ce sont les recepteurs lié a bêta-arrestine 1 ou bêta-arrestines 2 qui sont séquestré de façon plus efficace?
bêta2-arrestine
64
est ce que ce sont les récepteurs liés au bêta-arrestine 1 ou 2 qui subissent une séquestration plus importantes?
65
rôle de l'ubiquination
rôle dans le devenir du récepteur: soit la dégradation ou le recyclage
66
ubiquitine
molécule de 8 kDa (76 a.a) qui s'ajoute à un résidu de lysine de la protéine
67
effet de l'ajout de plusieurs ubiquitine sur un récepteur
ciblage vers la dégradation
68
effet de l'ubiquitination de la bêta-arrestine
dégradation du récepteur
69
VRAI OU FAUX: la bêta-arrestine peut aussi aider à faire dégrader d'autres types de recepteurs (autre que RCPG)
VRAI: elle recrute E3 ubiquitine ligase sur les récepteurs IGF qui sera ainsi marqué pour être réduit.
70
récepteur tyrosine-kinase
recepeutrs de croissance épidermique - action mitotique quand le récepeur est activé - le ligand se fixe sur un dimère du récepteur et induit son autophosphorylation - active Grb2-SOS et finalement MAP kinase
71
comment se fait l'augmentation du nombre de récepteurs
1. transplantation 2. présence d'un antagoniste (agoniste inverse)
72
quels sont les 4 protéines favorisant l'expression des récepteurs à la membrane?
1. chaperonnes moléculaires 2. protéines facilitants le transporteurs des récepteurs vers la membrane: RAMPs et GASP 3. protéines ancrant les récepteurs à la membrane: NHERF et Homer 4. facteurs de signialisation et de maturation des récepteurs: Rab GTPases, ARf6, bêta-arrestines

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