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ZzzBiochimie (1) > Cycle de Krebs > Flashcards

Cycle de Krebs Flashcards

(107 cards)

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1
Q

Dans le glycolyse, quels sont les enzymes des 3 réactions IRRÉVERSIBLE

A

Réaction #1 : Glucose —» Glucose-6-phosphate
HEXOKINASE

Réaction #3 : Fructose-6-phosphate —» Fructose-1,6-biphosphate
PHOSPHOFRUCTOKINASE 1

Réaction #10 (dernière) : Pyruvate-2-phosphate —» Pyruvate
PYRUVATE KINASE

Ce sont des réactions qui sont régulées dans le cycle de KREBS

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Q

Quel est le mécanisme de régulation de l’Hexokinase?

Rappel:
Réaction #1 : Glucose —» Glucose-6-phosphate (Seulement ajout de PO3- sur le glucose 6)
HEXOKINASE

A

Rétroaction négative avec le Glucose-6-phosphate (produit de la réaction 1 à partir du glucose)

L’augmentation de la concentration de Glucose-6-phosphate va faire diminuer la concentration d’Hexokinase

Juste ça

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3
Q

Vrai ou faux

La glucokinase du foie et du pancréas ne sont pas inhibées par le G6P

A

Vrai
C’est l’exception, car l’hexokinase est remplacé par la glucokinase

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4
Q

Qu’est-ce que la néoglucogénèse?
Quelle molécule stimule la néoglucogénèse?

A

La néoglucogenèse est la formation de glucose à partir de précurseurs non glucidiques tels que le pyruvate, le lactate, le glycérol et la plupart des acides aminés.
Inverse de la glycolyse : Pyruvate —» Glucose

Stimulée par le GLUCAGON

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Q

Vrai ou faux
La réaction #3 de la glycolyse est très lente?

Rappel:
Réaction #3 : Fructose-6-phosphate —» Fructose-1,6-biphosphate
PHOSPHOFRUCTOKINASE 1

A

Vrai

Vient de la video YouTube

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6
Q

Vrai ou faux
Si on biosynthétise le Fructose-2,6-biophosphate, ça active la PFK1 (Fructose-6-phosphate —» Fructose-1,6-biphosphate) et inhibe la Fructose-1,6-biphosphatASE (Fructose-1,6-biphosphate —» Fructose-6-phosphate)

A

Vrai

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7
Q

En gros, qu’est-ce que va permettre au niveau moléculaire la liaison du glucagon sur les cellules lors d’une hypoglycémie?

A

L’activation de 2 PROTÉINES kinase kinases
(Formation de protéine kinase-AMPc)

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8
Q

Pourquoi dans une situation d’hypoglycémie, on arrête la glycolyse et on va faire de la néoglucogénèse?

A

Glyco (glcide) lyse (bris) –» brise des glucides
Hypoglycémie –» glucide faible = pas de glucide a briser
donc glucagon et libéré, activé la PROTÉINE kinase en la physophorylant, qui elle va phosphoryler la PYRUVATE kinase en la phosphorylant, empêchant ainsi la formation de pyruvate, donc de la glycolyse, pour allé former à la place des glucides dans le foie, parce qu’on en manque.

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9
Q

Qu’est-ce qui bloque (effecteur inhibiteur) la PYRUVATE kinase (réaction 10, formation pyruvate) autre que la PROTÉINE kinase? ( 3 réponses)

A
  1. ATP (charge en É de la cellule est haute)
  2. Alanine
  3. Acétyl-CoA (via beta-oxydation des acides gras)
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10
Q

Quel ion est impliqué dans la libération d’insuline?

A

Ca 2+
Son entrée dans la cellule stiumule l’exocytose d’insuline

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11
Q

SI tu veux faire de la glycolyse (glucose –» pyruvate), tu dois _______ le PFK1 et _____ la Fructo-1,6-biphosphatASE

SI tu veux faire de la néoglucogénèse pyruvate –» glucose) , tu dois _______ le PFK1 et _____ la Fructo-1,6-biphosphatASE

A

SI tu veux faire de la glycolyse (glucose –» pyruvate), tu dois activer le PFK1 et inhiber la Fructo-1,6-biphosphatASE

SI tu veux faire de la néoglucogénèse pyruvate –» glucose) , tu dois inhiber le PFK1 et activer la Fructo-1,6-biphosphatASE

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12
Q

Vrai ou faux
Si on enlève la F-2,6-Biphosphate, on stimule la néoglucogénèse?

A

Vrai
Car on permet l’action de la Fructose-1,6-biphosphatASE qui fait :
Fructose-1,6-biphosphate —» Fructose-6-phosphate
Cette réaction va dans le sens inverse de la glycolyse, où l’ordre des 2 molécule devrait normalement être inversée

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13
Q

Comment fonctionne la régulation de la PFK1

A

On utilise une aprtie du Fructose-6-phosphate et grâce au PFK 2, on crée du Fructose-2,6-biphosphate qui elle va activer la PFK1 (et inhiber la Fruct-1,6-biphosphatase) et ainsi stimuler encore plus la glycolyse grâce à la réaction #3 (Fructose-6-phosphate —» Fructose-1,6-biphosphate)

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14
Q

Quelles sont les enzymes inverses (qui font les réactions inverses) des PFK 1 et PFK 2

A

PFK 1 —» Fructose-1,6-biphosphatASE
PFK 2 —» Fructose-2,6-biphosphatASE

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15
Q

Vrai ou faux
La phosphorylation peut parfois activé et parfois inhibé la glycolyse

A

Vrai

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16
Q

Vrai ou faux
La régulation des ces enzymes

PFK 2 et Fructose-2,6-biphosphatASE

permet de savoir si on fait de la glycolyse ou de la néoglucogénèse

A

Vrai
Leur présence vont dicté la présence de Fructose-2,6-biphosphate, qui elle sa présence va stimuler la PFK1 (glycolyse) ou son absence va permettre l’action de la Fructose-1,6-biphosphatASE, donc la néoglucogénèse (donc inhibé la glycolyse)

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17
Q

Nomme un exemple où la phosphorylation active la glycolyse

A

Activation de la protéine kinase

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18
Q

Nomme un exemple où la phosphorylation inhibe la glycolyse

A

Pyruvate kinase

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19
Q

Quel la différence entre les réactifs d’une glycolyse aérobique et une glycolyse anaérobique?

A

Dans les 2, il y a Glucose, ADP et Pi, mais …

Dans anaérobique : NAD+
Dans aérobique : O2

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20
Q

Vrai ou faux
La glycolyse est une combustion total sans déchet?

A

Vrai

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21
Q

Pourquoi on dit qu’une combustion est complète ou incomplète

A

S’il reste du carbone après une réaction, la réaction est incomplète et la production d’É est moindre
Ex; Fermation lactique : il reste de l’Acide lactique après

Exemple de réaction complète: glycolyse aérobique: il reste CO2 et H2O + bcp É

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22
Q

À quelle endroit entre respectivement la galactose et le fructose dans les étapes de la glycolyse?

A

Galactose : Glucose-6-phosphate (Étape 2)

Fructose :
Foie : G3P
Muscles et adipocytes: Fructose-6-phosphate

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23
Q

Quelle est la source d’énergie principale des nouveaux nés?

A

Le dissacharide appelé Lactose

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24
Q

Qu’est-ce qui arrive chez un adulte ayant une déficience en lactAse (enzyme qui dégrade le lactose)?

A

Incapacité à dégrader le lactose —» Accumulation de lactose dans a lumière intestinale —» Distension abdominale + Augmentation de la pression osmotique —» Diarrhée aqueuse —» déshydratation

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25
Quel est le traitement pour les adultes ayant une déficience en lactAse, donc une intolérance au lactose?
Du lactase PO
26
Quoi les 2 produits de la dégradation du lactose?
Galactose et Glucose
27
Quoi les 4 choses qui inhibe la lactase?
1) pH acide 2) Galactose 3) Fructose 4) Glucose C’est comme cela qu’est régulé le lactase intestinale
28
Qu’est-ce que ca veut dire que le cycle de Krebs est Amphibolique?
Il peut faire de la catabolisme et de l’anabolisme
29
Quelles sont, globalement, les 3 étapes du cycle de Krebs?
1. ENTRÉE du pyruvate dans la mitochondrie 2. DÉCARBOXYLATION du pyruvate dans la mitochondrie 3. OXYDATION du citrate (C —» CO2 et régénération de l’oxaloacétate)
30
Le Lactose va se diviser en ____- et en ____ grâce à une enzyme appelée ______.
Le Lactose va se diviser en _Galactose_ et en _Glucose_ grâce à une enzyme appelée _LactASE_.
31
Le Lactose est divisé en 2 molécules, la glucose et la galactose, mais au final, ces 2 molécules sont se rejoindre à la même étape de la glycolyse. Laquelle?
Glucose-6-phosphate (étape 2) Galactose va emprunter plus d'étapes pour s'y rendre, tandis que le glucose lui va se rendre direct avec l'hexokinase (étape 1 de la glycolyse)
32
La transformation du glucose-6-phosphate en pyruvate se fait où?
Dans le cytosol
33
Quel est le type de transport par lequel pénètre le pyruvate dans la mitochondrie?
1. À travers le MEM: De manière passive par les porines 2. À travers la MIM: Transport actif en symbort avec les H+ de l’espace intermembranaire mitochondriale à travers translocase du pyruvate
34
Quelles sont les 3 enzymes participant à la Décarboxylation du pyruvate?
1. Pyruvate décarboxylase 2. Dihydrolipoyl transacétylase 3. Dihydrolipoyl dehydrogenase
35
Quels sont les 5 co-enzymes participant à la Décarboxylation du pyruvate?
1. Thiamine pyrophosphate 2. Acide lipoïque 3. CoA 4. NAD+ 5. FAD+
36
Dans le complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase, les structures (3 enzymes et 5-coenzymes) sont associés de manière __________.
Non covalente
37
C'est quoi l'avantage que la décarboxylation du pyruvate se fasse par un complexe pluri-enzymatique?
La catalyse est plus efficace, car tout se fait un après l'autre et les molécules ne perdent pas de temps à se promener
38
C'est quoi le désavanatge que la décarboxylation du pyruvate se fasse par un complexe pluri-enzymatique?
Les 3 enzymes et co-enzymes qui forment le complexe plurienzymatique ne peuvent pas participer à d'autres voies métaboliques
39
Quelle est la première étape de la décarboxylation de la pyruvate?
Pyruvate + Thiamine pyrophosphate*— (pyruvate décarboxylase**)—» Hydroxyethyl TPP + CO2 3 carbones —» 2 carbones (éthyl) *Co-enzyme **Enzyme
40
Quelle est la deuxième étape de la décarboxylation de la pyruvate?
Hydroxyethyl TPP + acide lipodïque* — (dihydrolipoyl transacetylase**) —» Acétyl dihydrolipoamide *Enzyme **Co-enzyme
41
Quelle est la troisième étape de la décarboxylation de la pyruvate?
Acétyl dihydrolipoamide + CoA** —(dihydrolipoyl transacetylase*) —» Acétyl-CoA + dihydrolipoamide *Enzyme **Co-enzyme
42
Quoi l'étape de la décarboxylation de la pyruvate qui crée du Co2? Étape 1, 2, 3 ou 4?
Étape 1
42
Quelle est la quatrième étape de la décarboxylation de la pyruvate?
Reoxidation de la Dihydrolipoamide Dihydrolipoamide + NAD+** — (Dihydrolipoyl dehydrogenase*) —» acide lipoïque*** + NADH2 *Enzyme **Co-enzyme **La décarboxylation du Dihydrolipoamide en acide lipoïque va crée un pont disulfure intracaténaire dans l’acide lipoïque
43
Qu’est-ce que va causer un empoisonnement à l’ArseniTe?
Une inhibition de la dihydrolopoyle dihydrogénase (enzyme de la 4e réaction de la décarboxylation du Pyruvate) Dihydrolipoamide + NAD+ — (Dihydrolipoyl dehydrogenase*) —» acide lipoïque** + NADH2
44
Quel est l’antidote de la lewistite?
L’acide lipoïque en qt +++ Ou BAL (British Anti-Lewistite) ou 2,3-dimercapto**_propanol* *Propanol —» 3 carbones ** Dimercapto —» propyl avec 2 Souffres et 1 Hydroxyde (-OH)
45
Quelle est la composition du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase
24 pyruvate decarboxylase (Étape 2) 8 dihydrolipoyl transacetylase (lipoide reductase-transacetylase) (étape 2-3) 12 dihydrolipoyl dehydrogenase (étape 4)
46
Dans tout le cycle de Krebs, quel est le seul moment où on a un pentose?
Lorsque la molécule est : a-ketoglutarate
47
Chaque NADH produit ___ ATP
3
48
Quelle est le truc mémotechnique pour mémoriser les 8 produits intermédiaires du cycle de Krebs
La CIA : Citrate, Isocitrate et a-ketoglutarate Suspecte : Succinyl CoA un Suspect : Succinate qui Fume : Fumarate des Malboros : Malate Oxydés : Oxaloacétate
49
acetyl CoA (___Carbones) + oxaloacetate (__Carbones) -----» ______ (6 Cabones)
acetyl CoA (_2_Carbones) + oxaloacetate (_4_Carbones) -----» _Citrate_ (6 Cabones)
50
Vrai ou faux Le GTP a la même valeur énergétique que l’ATP
Vrai
51
Le bilan énergétique de la glycolyse est ___ fois supérieur en présence d’O2
5 fois supérieur
52
Vrai ou faux Dans le cycle de Krebs, ce ne sont pas les C entrant qui sortent
Vrai
53
Pourquoi on dit que le cycle de Krebs fonctionne comme un enzyme?
Parce qu’au final on revient toujours à l’oxaloacétate
54
La vitesse de dégradation de l’acétal CoA dépend de quoi?
La concentration des intermédiaires du cycle
55
Que signifie la caractéristique anaplérotique des réaction? Que signifie la caractéristique cataplérotique des réaction?
Anaplérotique: Signifie qu’il forme de molécules particulière à partir des intermédiaires du cycle de Krebs Cataplérotique: Détruit des molécules particulières en molécules intermédiaire du cycle de krebs
56
Quoi les 5 éléments qui vont favoriser le cycle de Krebs?
Ces 5 éléments vont inhiber la PDH kinase, l’enzyme qui inactive le complexe pyruvate DH en le phosphorylant (ajoutant un Pi). Avec ces éléments, c’est comme si on disait qu’on manquait d’É, donc le cycle de Krebs sera stimulé Pyruvate NAD+ CoA_SH ADH Ca2+
57
Quels sont les 3 éléments qui vont inhiber le cycle de Krebs?
NADH ATP Acetyl-CoA Il STIMULE la PDH kinase, l’enzyme qui inhibe le complexe pyruvate DH en la phosphorylant (Ajoutant un Pi)
58
Quoi le nom de l’enzyme qui inactive le complexe pyruvate DH?
Pyruvate DH kinase
59
Quoi le nom de l’enzyme qui active le complexe pyruvate DH?
Pyruvate DH phosphatase
60
Qu’est-ce que fait le dichloroacétate contre le cancer?
Il inhibe la pyruvate déshydrogénase kinase (PDH kinase) mitochondriale, donc emêche l'inactivation de la pyruvate DH, et donc permet le cycle de Krebs
61
Dans le cycle de Krebs, l’isocitrate va se devenir l’a-cétoglutarate grâce à quel enzyme?
Isocitrate DH DH = déshydrogénase = perte de H+ = quelqu’un doit capté ce H+ = NAD+ —» NADH
62
Qu’est ce qui inhibe ou active l’isocitrate DH? (isocitrate --» a-kétoglutarate)
Inhibe : ATP + NADH (trop d’É = inhibe Krebs) Stimule: ADP + Ca2+ (Manque É = stimule Krebs)
63
Dans le cycle de Krebs, c’est quoi l’enzyme entre a-cetoglutarate et succinyl-CoA?
A-cétoglutarate DH DH = déshydrogénase = perte de H+ = quelqu’un doit capté ce H+ = NAD+ —» NADH
64
Qu’est-ce qui inhibe ou stimule l’enzyme A-cétoglutarate DH?
Inhibe : ATP, NADH ou succinyl CoA (Trop d,É = inhibe Krebs) Stimule : Ca2+
65
Vrai ou faux Les mitochondries viennent toujours de la mère?
Vrai
66
À quoi est comparable la taille d’une mitochondrie??
À celle du bactérie
67
Que permet l’invagination de la membrane interne des mitochondries?
Augmenter la surface de contact
68
Vrai ou faux Il peut y avoir des porosité sur la membrane interne et externe des mitochondries?
FAUX Membrane INTERNE —» PAS DE POROSITÉ —» Elle doit être intègre, car c’est là qu’a lieu la chaine d’électron et tous doivent passé dans les canaux prévu. S’il y a un leak à travers la membrane —» potentiel de membrane va s’égaliser
69
Où est-ce que la concentration des protons est la plus élevée, dans la matrice mitochondriale ou dans l’espace inter membranaire mitochondriale?
Espace intermembranaire
70
Entre la membrane externe et interne mitochondriale, laquelle possède le plus de protéines?
Membrane interne
71
Entre la membrane externe et interne mitochondriale, laquelle a la plus grande surface?
Membrane interne
72
Pourquoi la composition du cytosol et de l'espace intermembranaire de la mitochondrie est comparable en terme de métabolite et d’ions?
Parce que la membrane mitochondriale externe est perméable et permet un passage libre des ions et métabolites hydrosolubles de petites tailles
73
Qu’est-ce que contient la matrice mitochondriale?
- Complexe de la pyruvate DH - Enzyme du cycle de Krebs (sauf succinate DH) - Enzyme d’oxydation des acides gras
74
Quelle est la seule enzyme du cycle de Krebs qui n’est pas dans la matrice mitochondriale? Où est-elle dans ce cas?
Succinate DH* —» Elle est dans la membrane mitochondriale interne * Succinate —Succinate DH—» Fumarate
75
Vrai ou faux Les électrons voyagent toujours en paire?
Vrai
76
Qu’est-ce qui se passe avec l’É libre (emmagasinée) lorsque la phosphorylation oxydative avance?
Elle diminue de plus en plus On se promène de l’entropie maximum à l’entropie minimum
77
Comment sont produits les ROS (Reactive Oxygen Species)?
Lorsque des électrons de la chaine d’électrons s’échappent
78
Qu’est-ce que vont détruire les oxygènes radicalaires?
Elles vont oxyder la membrane mitochondriale interne Elle vont détruire l’ADN mitochondriales
78
Nomme 3 sortes d’oxygène radicalaires (ROS (Reactive Oxygen Species)
O2- (O2 lié à un électron) H2O2 OH
79
Qu’est-ce qui arrive si la MIM est trouée?
La communication entre la chaine d’électron et l’ATP synthèse va être brisée, car les H+ vont entrer dans la cellule par le moyen le plus facile (les trous de manière passive) et non par l’ATP synthase donc la production d’ATP ne pourra pas avoir lieu
80
Quoi les 2 types d’agents découplants de la chaine respiratoire?
Artificiel : 2,4-dinitrophénol --» fait entrer les H+ dans la matrice --» c'est bad) Naturel : thermogénine
81
Comment voyage l’APD et l’ATP dans le MEM et la MIM?
MEM : passive par les porines MIM : Antiport voltage dépendant (ADP entrent et ATP sortent)
82
Comment voyage le pyruvate et le phosphate dans le MEM et la MIM?
Ils vont être importé par le gradient de pH avec les H+
83
Si on est actif, nos mitochondries sont _____ Si on est au repos, nos mitochondries sont au _____.
Si on est actif, nos mitochondries sont _actifs_. Si on est au repos, nos mitochondries sont au _repos_. Les mitochondries fonctionnent selon notre besoin
84
Quoi le seul enzyme du cycle de Krebs qui forment du FADH2?
Succinate deshydrogénase (complexe II de la chaine de transport des électrons, situé dans la MIM)
85
Vrai ou faux Une petite quantité d'intermédiaire suffit pour métaboliser un grand nombre d'acétyl-CoA
Vrai
86
L'a-kétoglutarate vient de la transamination de quelle composé?
Glutamate
87
L'oxaloactétate vient de la transamination de quelle composé?
Aspartate (transamination)
88
Vrai ou faux La régulation du complexe de la pyruvate déshydrogenase de fait principalement par le régulation de la PDH KINASE et non par la PDH phosphatase?
Vrai La PDH kinase est réguler, tandis que la PDH phosphatase est très peu régulée
89
Qu'est-ce que la stromatolithe?
O2 + Fe = rouille minerai de fer Une quantité de Fe en surplus permet de dégager plus d'O2 dans l'atmosphère
90
Qu'est-ce qu'un couple rédox?
Une association entre un oxydant et un réducteur
91
Vrai ou faux Le NAD+ a un pouvoir réducteur?
Vrai Il peut être réduit, donc recevoir des H+
92
Vrai ou faux La phosphorylation oxydative permet de regénérer les NAD+ et les FAD+?
Vrai
93
Quel complexe (protéine_ de la MIM qui fait la conversion du succinate en fumarate dans le cycle de Krebs (seule réaction qui a lieu dans la MIM et qui implique du FADH2)?
Complexe II (Succinate DesHydrogénase (DH)) qui lui après va transférer les électrons du FADH2 vers la conenzyme Q
94
Vrai ou faux Le complexe II de la chaine d'éelctron est le seul qui ne pompe pas de proton dans l'espace intermembranaire?
Vrai
95
Comment s'appelle le complexe V de la chaine de transport d'électron? Qu'est-ce qu'il permet?
ATP synthase Il permet le passage passif des protons vers la matrice
96
Le complexe III de la chaine de transport des électrons transfert les électrons de ________ à _________.
coenzyme Q vers le cytochrome C
97
Le complexe IV de la chaine de transport des électrons transfert les électrons du ________ à _________.
cytochrome C à O2
98
Combien de H+ (protons) expulse chaque complexe de la chaine de transport des électrons?
Complexe I : 4 H+ Complexe II : 0 Complexe III : 4 H+ Complexe IV : 2 H+
99
Dans l'ATP synthase (complexe V de la chaine de transport des é), quelle partie est la sous-unité phosphorylante et quelle partie est un canal transmembranaire transporteur de H+?
Partie F0 = canal transmembranaire transporteur de H+ Partie F1 : sous-unité phosphorylante
100
Dans l'ATP synthase (complexe V de la chaine de transport des é), quelle partie est dans la matrice mitochondriale et quelle partie est dans la MIM?
Matrice = partie F1 MIM = partie F0
101
Dans l'ATP synthase, qu'est-ce qui induit la synthèse d'ATP?
Le changement de conformation de la partie F1. Lors que les protons passent à travers la partie F0 de la MIM, le cylindre tourne et les sous-unités beta de F1 changent de conformation au fur et à mesure, induisant la synthèse d'ATP
102
De quoi est formée la partie F1 de l'ATP synthase?
3 sous-unités alpha 3 sous-unités beta
103
La navette du ___________ est très rapide, mais son rendement n'est pas maximal. tandis que.. La navette du ___________ a un rendement maximal, mais est plus lent
La navette du _glycérol-3-phosphate_ est très rapide, mais son rendement n'est pas maximal. tandis que.. La navette du _malate-aspartate_ a un rendement maximal, mais est plus lent
104
Explique moi brievement la navette du glycérol-3-phosphate
Le glycérol-3-phosphate donne 2 H+ a un FAD pour devenir le dihydroxyacetone phosphate (à lieu où le complexe II de la chaine de transport des é) Le dihydroxyacetone phosphate recoit des H+ du NADH pour redevenir le glycérol-3-phosphate
105
Dans la navette malate... Lorsque le Glutamate entre, l'______ sort, et ce, par la ____________. Lorsque le Malate entre, le _______ sort, et ce, par la ____________.
Dans la navette malate... Lorsque le Glutamate entre, l'_Aspartate_ sort, et ce, par la _Glutamate aspartase translocase_. Lorsque le Malate entre, l'_a-kétoglutarate_ sort, et ce, par la _dicarboxylate translocase_.

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