DAG 1 Flashcards
(63 cards)
DNA strukur?
DNA är uppbyggd av en sockergrupp som binder till kvävebas vid 3’, och en fosfatgrupp vid 5’. Kvävebaserna är tymin, cytosin, adenin och guanin (T, C, A och G), förutom vid RNA – då bytes T ut emot Uracil (U). § Dubbelsträngat med vätebindingar i mellan
Vad gör histoner?
Histoner hjälper till vid paketering av DNA. Olika sorters histoner bildar tillsammans nuklesomer – vilka DNA strängen tajt kan rullas runtèkromosomer. Kromatider skyddar DNA under mitos
Hur påverkar histoneras av genuttryck?
Histoner kan ändra genuttrycket igenom att ändra strukten på DNA. Exempelvis så kan aminosyror på H3 metyleras och deacetyleras – vilket kondensera kromatiet. Acetylering och demetylering, som öppnar kromatiet sittet också på histonerna.
DNA-metyliging påverkar vilken sekvens och hur?
En metyhlgrupp adderas till nukleotider § Sker till cytosin i CG-sekvens o Gör att gener tystnar enzymer drar till sig proteiner som blockerar genutrycket
Hur sker replikation?
De vätebindningar som finns mellan de två DNA strängarna. Dessa bryts av proteinet Helicase(som aktiveras av cdk) som binder in till starsekvensen och delar kedjan. Fäster på ”origens of replikations” (AT rik delè2 och inte 3 vätebindningar) 2. Strängarna vill koppla samman igen, men Singel-stranging binding (SSB) binder in istället så kedjorna inte ska falla tillsammas. Helicase stressas DNA och skapar hög energi. DNA gyros läggs då till för att neutralisera. 4. Ett protein(RNA primer) binder in till den fria stängen. 5. RNA primers fungera som en signal för DNA-polymeras, så den vet var den ska binda in. 6. DNA-polymeras binder in fria kvävgaser.
Vad är ORC
ORC sitter vid helicaset utgångspunkt. CDK aktiverar helicas, samtidigt som de inaktivera ORC ==> gör att replikation bara sker en gång
Vad är leading strand?
DNA-polymeras läser bara av föräldrar strängen i 3’è5’ riktning. Detta skapar dottersträng i 5’è3’ riktning, även kallad leading strand.
Vad är lagging strand?
Laging-strand är den sträng som blidas i 5’è3’. Sker igenom att RNA-primers sätts ur på flera ställen längs stränge och bygger på kvävebaser i 3’è5’ riktning. Varje del som kopplas på kallas Okazaki fragment. Det sätts sedan ihop av DNA-ligase, som ersätter RNA- primers.
Vad är telomerer?
Vid slutet av DNA sekvens finns upprepade delar av TTAGGG flera hundra gånger. Denna del kalas för telomerer och fungera som skydd så kromosomer inte brytts ner helt.
Vad är replikations problemet?
DNA på slutet av kromosomen kan inte bli kopierad heltèkortare kromosom • Lagging strand är uppgjord av små delar (okazaki) som alla har en RNA-primer o I överiga delar av DNA så blir primerna utbytta av DNAèblir hela slutet av kromosomen så blir det en liten vit av DNA som inte täcks av okazakt o Det går inte att starta okazakt fragment för primers skulle bara falla utanför • èen liten del blir inte kopierad o èkortare kromosomer
Hur är telomer i verkligheten?
Del i slutet av kromosom som skyddar • Cellen vill reparera felet med överhänget (gap i bild ovan) o Men teolmerna skyddas igenom att överhänget binder till andra dna-strängen i form av en lopp.
Vad är senescenes?
När telomer blir korta så kommer de till ett stadie där – om de fortsätter förkortas – gör så att DNA kommer börjat skadas. Detta vill inte DNA och gör då en ”insats”, vilket är att den ger upp sin förmåga att delas. Det blir så den senesence cell. Görs med p53. • Replicativ senesence o När teolmoer blir förkorta (beror på fibroblasterna) • Hyflick-gränsen är antal gånger cellen kan delas (ca 60st).
Vad är telomeras?
Vissa celler har förmågan att mothäva telomer förkortningen igenom telomeras (ett enzym som förlänger telomerna på kromosomerna. Celler med telomeras är könsceller och viss Fungera: • Enzymet bindet till en särskild RNA-molekyl som innehåller en sekvens kvävebaser som är komplementa till telomer raden (TTAGGG)). • Den lägger till kvävebaser till den överhängade sytängen igenom att använda speciella RNA-moleylen som mall • När överhängade är tillräckligt lång så bildas på normalt sätt (med primers och polymeras) en dubbelsträng DNA Primers kanske inte fäster rätt och kan då inte blir utbytt av DNA, så en överhäng kommer finnas – men hela längden på teolomerna är nu längre.
Vad är transpkiptionsfactor?
Är protien som hjälper till att stänga av eller sätta på speciella gener. Detta gör de genom att binda till DNA. Activators o De som ökar transcription • Repressor o De som minskar transcription
Hur sker transkpitons iniation=
TBP (tata binding Protein) sätter sig på Tataa, o Detta är ca 25-30 bp före startförkvensen • TF2D fäster på TBP • TF2B fäster på TF2D • RNA-pol2 fäster på alla o RNA har en CTD ”svans” som innehåler 52st AA upprepningar o ègör att den kan fostfoliera • TF2F sätter sig på RNA-poly • TF2E sätter sig på • TF2H(innehåler kinases) sätter på och ger ATP (tre fosfat) till CTD på RNA-polyö Det gör att helicas (som finns i TF2H släpps ut) • Helicas ”smälter” DNA Strängen
Hur sker transkprions elongation?
DNA strängen delas • TG2H släpper ifrån polymerasèden går ifrån 5’ till 3’ • Det är översta strängen (den som går ifrån 5’è3’) som icke kodar o VILKET är den vi läser av till mRNA • mRNA sträng kommer ut ifrån RNA-Pol 2
Vad är 5’ caping? gjort av? funktion=
skyddade del på 5’ består av: trifosfat för energi + huanin och metylgrupp funktion: - att ta sig ut ur kärnana - skyddar mRNA -transport av mRNA - posetion på ribosomen
hur sker splicing
när RNA kommer ut har det 3 speciella punkter, vilka är: 1. Splcie donor (AG|G) 2. Branch point (A) 3. Splice acceptor (AG|G) Small nuclear RiboNucleo Proteins (Snurps) binder in till mRNA • U1snRNP sätter sig vid splice donor • Branch point binding protein (BBP) sätter sig vid A • Med hjälp av flera andra U protein så börja en loop bilas. • U2 ger bort en OH-grupp som fäster in vid AG och bryter upp bindningen mellan AG|G o Leder till att G ändan är Fri • AG binder till G vid Splice acceptior (mellan G|G) • Det fria svansen med G i ändan (som innan fäste vid splice doner) fäster vid A • eskapar lariat ( och Spliced mRNA

Vad är alternativ sprlicng
Man måste ta dem i ordning. Man hoppar alltså inte fram och tillbaka, utan tar dem i ordning. • Måste ha med start och slut eftersom annars kommer inte CAP med • Det måste bli jämna kvävebas trippleter. o GA och TAGT bildar 6stè2 trippleter o GA och TCG bildar 5stègår ej jämn ut på 3
Vad är transkripation termiantion?
CTD hopapr av Clavage faktor Poly A
Vad är deaminering
avlägsande av en amiogrupp (NH2).
Vad är microDNA
microRNA delen fäster på mRNA o om den passar § bryter ner mRNAèvidare till translation o om den inte passar § sitter kvar på mRNAèförhindrar tranlation
Olika RNA?
mRNA a. molekylen som bär kodningen ifrån kärnan till cytoplasma 2. rRNA a. Står för Ribosomal RNA b. Är byggsten i ribosomen och aktiv vid translation 3. tRNA a. Samlar och leverar amiosyror ifrån cytoplasma till ribosom
vad är ribosimen?
Det är här tranlation sker
• Består av 2 delar (subunites) som består av protein och rRNA o Small subunit som är 40s stor o Large subunit som är 60s stor • Small och Large och mRNA bildar tillsammans Ribosomen

