DNA, KROMATIN, KROMOSOMI Flashcards
(10 cards)
organizacija
replikacija
struktura kromatina
-organizacija
nukleotid= baza + sladkor + fosfatna skupina
5’prosta fosfatna skupina
3’deoksiriboza
-replikacija
starševska DNA se razklene
matrična veriga dobi svojo komplementarno
-struktura kromatina
nukleosomi= okoli njih se navija DNA
nukleosom = DNA + histoni
kromatin= 1/3 DNA + 1/3 histoni + 1/3 nehistonski proteini (strukturni, regulatorni, encimi)
kromatin v interfazi celic v različni obliki
Zgradba NUKLEOSOMA
DNA + histoni
8 histonov gradi HISTONSKI OKTAMER
-H2A, H2B, H3, H4
diagonalno razporejeni
na zunanji strani veliko (+) naboja
histoni so bazični
DNA je okrog histonskega oktamera zavita 1,7 x
G, C nukleotidi raje zunaj
N-terminalni histonski repki
na histonske repe lahko določeni encimi pripnejo različne skupine
pride do metilacij, acetilacij, fosforilacij, ubikvitinacij
Histonshi repki imajo pomembro vlogo pri pakiranju v 30nm kromatinsko nit
Vloga H1 : prepreči, da bi se po 1,7x ovitju DNA, ki iztopa prepletla
Nukleosomi so DINAMIČNI
Nukleosomi so DINAMIČNI – Spremembe v strukturi kromatina so lahko:
I. spontane
II. od ATP odvisne
I. Ko je nukleosom odvit, je omogočena povezava z DNA-vezavnimi proteini
II. od ATP odvisni kromatinski preoblikovalni kompleksi -
ob porabi ATP regulira povezave med DNA in histoni
1. Vplivajo na pozicijo nukleosomov vzdolž DNA
2. Omogočajo drsenje nukleosomov – DNA postane dostopna še za druge proteine
3. Odstranjevanje nukleosomov
4. Zamenjava histonov
5. Postranslacijska modifikacija
Izvori podvojevanje:
Osnovna enota podvojevanja DNA (replikacije) = REPLIKON
Izvori podvojevanja (25000-100000/genom) določajo:
1. mesto začetka podvojevanja – ORI (origin of replication)
2. čas replikacije DNA
podvojevalne vilice vedno nova veriga 5’ proti 3’
Encimi, ki sodelujejo pri podvojevanju DNA
1. DNA helikaza
2. DNA primaza
3. DNA sponka
4. DNA polimeraza (je tudi eksonukleaza)
5. DNA topoizomeraza II
sprosti napetost ker s eves čas zavija
6. DNA ligaza
Kdaj in kako nastanejo novi nukleosomi med podvojevanjem DNA?
KDAJ? Nastajanje nukleosomov takoj po podvojitvi DNA.
KAKO? Histonski šaperoni obnovijo histonski oktamer s starševskimi ali novimi
dimeri H2A-H2B ali tetrameri H3-H4.
KROMOSOMI
interfaza
metafaza
interfaza: gostejši kromatin pod jedrno ovojnico
metafaza: zelo zgoščeni
Kondenzacija kromatina s
pomočjo KONDENZINOV
KOHEZINI držijo sestrski
kromatidi skupaj (v metafazi
le še v področju centromere)
Tri ključna mesta v zgradbi kromosoma:
- centromera (α-satelitna DNA) s kinetohorom
- telomera
- izvori podvojevanja (replikacij)
telomere
TELOMERE = krajišča linearnih kromosomov
- prisotne ponovitve (TTAGGG)n
- dolžina telomer je variabilna
- heterokromatinsko področje (izredno
malo genov)
Podvojevanje telomer poteka s pomočjo TELOMERAZE
- TELOMERAZA uporabi RNA osnovo za sintezo DNA
- TELOMERAZA je aktivna v:
-matičnih celicah
-rakavih celicah
SUBTELOMERE = krajši predel DNA v bližini telomer
-So prehod med z geni-bogatimi področji in telomernimi ponovitvami
~ 1/2 subtelomernih genov spada v MULTIGENSKO DRUŽINO (= skupino
genov z zelo podobno sekvenco, ki ležijo drug zraven drugega).
v multigenskih družinah so tudi PSEVDOGENI (=imajo zelo podobno
sekvenco kot protein-kodirajoči geni, vendar se ne prepisujejo v proteine,
čeprav njihova transkripcija poteka.)
Propad ali neodvisnost kromosoma Y?
PAR: psevdoavtosomna regija (PseudoAutosomal Region)
omogočajo de se X in Y kromosoma poravnata
MSY: za moške specifična regija na Y (Male-specific region Y)
Kako si kromosom Y sam pomaga pri
popravljanju napak?
Mutacija je popravljena s pomočjo palindromskega zapisa na drugem kraku kromosoma Y
Zagotavljanje „preživetja kromosoma Y“ z
intenzivno rekombinacijo znotraj
palindromskih zaporedij v kromosomu Y.
Kromosom Y ima tako 2 obliki rekombinacije:
1) Rekombinacijo s kromosomom X v
psevdoavtosomnih regijah PAR.
2) Rekombinacijo znotraj kromosoma Y.
