Egzamin Flashcards
(86 cards)
Pseudogeny
zmienione elementy rodzin genowych, nie produkujące biologicznie aktywnego białka. Są one zmutowanymi wersjami genów wyjściowych.
Przetworzone pseudogeny
kopie mRNA przepisane na DNA, nie mają promotora i intronów.
Powtórzenia tandemowe
wielokrotne powtórzenia sekwencji nukleotydów występujące bezpośrednio po sobie.
Transpozony
„skaczące geny”, sekwencje DNA przemieszczające się pomiędzy różnymi pozycjami wewnątrz genomu danej komórki.
Typ I – retrotranspozony, przenoszą się przez transkrypcję do RNA i odwrotną transkrypcję z powrotem do DNA.
Typ II - przenoszą się przez działanie transpozazy.
VNTR
polimorfizm liczby powtórzeń tandemowych (variable number of tandem repeats).
Długość powtórzeń mikrosatelitarnego DNA jest cechą osobniczą. Stosując PCR można analizować VNTR i tym samym identyfikować daną osobę.
Ze względu na dużą ilość mitochondriów w komórce mówimy o
heteropalzmii lub homoplazmii
Miejsca inicjacji replikacji
Replikacja rozpoczyna się w specyficznych miejscach inicjacji nazywanych ori (ang. origin).
W genomie Prokaryota występuje jedno takie miejsce u Eukaryota jest ich wiele.
Miejsca inicjacji replikacji są bogate w pary A-T. Są one związane dwoma wiązaniami wodorowymi, co ułatwia ich rozdzielnie (w porównaniu do par C-G).
Miejsca inicjacji rozpoznawane są przez białka inicjujące replikację.
Gyraza (topoizomeraza)
przecina chwilowo jedną (I DNA topoizomeraza) lub dwie (II DNA topoizomeraza) nici DNA umożliwiając swobodną rotację („problem zwinięcia”)
Helikaza
rozrywa wiąz. H i rozwijaja podwójną helisę DNA.
Prymaza
dokonuje syntezy primerów, co pozwala na syntezę fragmentów Okazaki.
Polimerazy DNA
dokonują syntezy nowych nici DNA, sprawdzają poprawność procesu, dokonują korekty, uzupełniają luki po starterach.
Ligaza
łączy fragmenty Okazaki na nici opóźnionej
Białka wiążące pojedynczą nić (SSB - ang. Single Strand Binding proteins)
wiążą się z rozplecionymi nićmi DNA, stabilizuję je i zapobiegają tworzeniu struktury spinki do włosów.
Egzonukleaza
enzym posiadający zdolność do hydrolizy wiązania fosfodiestrowego na końcu 3’ lub 5’ łańcucha DNA.
Endonukleaza
enzym posiadający zdolność do hydrolizy wiązania fosfodiestrowego wewnątrz łańcucha DNA.
Topoizomeraza I
u E. coli relaksuje ujemne superskręty kolistej cząsteczki DNA.
T. I łączy się z DNA za pośrednictwem tyrozyny i przecina jedną nić
Topoizomeraza II
relaksuje ujemne i dodatnie superskręty DNA.
T. II łączy się z dwoma nićmi i przecina obie. CH Przekształca superskręty dodatnie na ujemne.
T. II pozwala również na rozdzielenie nici
potomnych po replikacji.
W procesie terminacji uczestniczy tez białko Tus
Jest ono inhibitorem helikazy DNA.
Białko Rho
heksamer oddziałujący z sekwencją rut w transkrypcie RNA.
Aby intron był poprawnie wycięty…
musi zawierać sekwencję GU na końcu 5’ i sekwencję AG na końcu 3’. Wewnątrz intronu musi też istnieć tzw. miejsce rozgałęzienia, w którym znajduje się nukleotyd adeninowy (A) odległy o 18-40 nukleotydów od miejsca cięcia 3
Białka produkowane w ilościach zależnych od warunków środowiska
fakultatywne, dostosowawcze
Białka produkowane w sposób ciągły
konstytutywne
Operony indukowane
zawierają geny białek szlaków katabolitycznych, ich ekspresja jest indukowana przez obecność substratu.
Operony hamowane
zawierają geny enzymów szlaków biosyntezy, ich ekspresja jest hamowana przez wzrost stężenia produktu. Produkt może też kontrolować ekspresję operonów przez atenuację.
