Eksamensspørgsmål - ordinær eksamen 2022 (årgang) Flashcards

1
Q

Opstil de følgende strukturer efter stigende størrelse
1. Mitochondrie (tværsnit)
2. Ribosom
3. Dyrecelle
4. Glucose-molekyle
5. Nucleus

A

Rækkefølgen er 4-2-1-5-3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Angiv cirka-størrelsen af en dyrecelle

A

10 μm, alt mellem 5 og 100 μm godkendes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Forklar den atomare baggrund for resonans og eksemplificer betydningen af det.

A

Resonansbegrebet bruges primært til at forklare hvordan et elektronpar kan deles mellem
to atomer i et molekyle (delokaliserede elektroner godkendes også). Eksempel på resonans:
Acetationen er en hybrid mellem nedenstående resonansformer og stabiliseringen af acetationen
sænker pKa for eddikesyre i forhold til den ethanol.

Se eksemplet i ordinær eksamen 2022

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Definer begreberne elektrofil og nukleofil og giv et eksempel på hver.

A

Nukleofil: En forbindelse der har et elektronrigt atom og kan danne en binding ved at donere et
elektronpar til et positivt polariseret elektronfattigt atom. Elektrofil: Vil gerne modtage et elektronpar
fra en nukleofil, f.eks H+

Nukleofil: OH-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Forklar begrebet buffer

A

En buffer er en vandig opløsning bestående af en blanding af en svag syre og dens
korresponderende base i forholdet 0,1-10.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

I hvilket pH område har bufferen størst effekt?

A

pH i en buffer ændres kun ganske lidt hvis en lille mængde af en stærk syre eller en stærk base
tilsættes til den i området pKa-1<pH<pKa+1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Optegn strukturen på en forbindelse der udviser E,Z-isomeri, og forklar hvorfor den har denne
isomeri.

A

Se eksempel i ordinær eksamen 2022

Det er C med dobbeltbinding
Højre side: øverst CH3, nederst H
Venstre side: øverst CH3, nederst CH3CH2

For at der er tale om E-Z-isomeri må de to grupper der er bundet til C i dobbeltbindingen ikke være ens

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Forklar, hvorfor aminer generelt er baser, men amider og aromatiske aminer ikke er det.

A

Aminer, hvor nitrogenet sidder på et Carbon-atom, har et elektronrigt område omkring N-atomer,
mens N-atomet er elektronfattigt i amider, idet O-atomet er mere elektronegativt end N-atomet.
Aminer vil derfor kunne acceptere H+ og dermed virke som base, mens de i amider ikke har samme
egenskab

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Opskriv strukturformlen af hhv. acyl- og acetyl-grupper

A

Acyl: C med dobbeltbinding til O, en R gruppe og en bindingstreg med hakker hen over

Acetyl: C med dobbeltbinding til O, en CH3 gruppe og en bindingstreg med hakker hen over

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Beskriv den elektroniske struktur af en carbonylgruppe

A

Carbonylgrupppen er sp2
-hybridiseret og trigonal plan, dvs ikke særlig sterisk hindret. Det
elektronegative oxygenatom polariserer carbonylgruppen og gør carbonatomet mere elektrofilt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Beskriv nucleofil acyl substitution for acetyl-CoA

A

Se eksempel i ordinær eksamen 2022

Y er en elektrontiltrækkende gruppe som S-CoA. Den nucleofile, der kan være OH-
, danner en
intermediærforbindelse hvor carbonylgruppens elektron midlertidigt gør oxygenet negativt ladet,
men hvor det elektrontiltrækkende svovl-atom gør at CoA kommer til at fungere som leaving gruppe
(CoA-S-
) hvorved der dannes eddikesyre og CoA-SH. Thioesterbindingen brydes med andre ord ved
en nuclefil acyl substitution

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Forklar forskellen på aldoser og ketoser samt betydningen af prefix tri, tetr, pent og hex

A

Aldoser ineholder en aldehyd-gruppe, mens ketoser indeholder en keto-gruppe.
Præfixerne angiver hvor mange C-atomer, kulhydraterne indeholder (tri=3, tetr=4, pent=5, hex=6).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Redegør, gerne ved hjælp af en skitse, for den strukturelle forskel mellem maltose og
lactose.

A

Lactose er et disaccharid af galactose og glucose med en beta 1-4 glucosidbinding imellem (4-O-
(beta-D-galactopyranosyl)- beta-D-glucopyranose). Maltose er et disaccharid hvor et fructose-molekyle
og et glucose-molekyler med en alfa 1-4 glycosidbinding imellem (4-O-( alfa-D-glycopyranosyl)- beta-Dfructofuranosid).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Forklar hvad der forstås ved et anomere center samt de anomere former α og β.

A

Det anomere center er det C-atom, der indgår i hemi-acetal-ringslutningen og
som ved ringslutninen danner et nyt chiralt center. Ses ofte ved kulhydrater. I de anomere former
sidder OH-gruppen på det anomere center til forskellig side. Hvis den sidder på modsat side i
forhold til CH2OH gruppen på C4 sidder det alfa, men hvis de sidder til samme side (altså cis) så er det
en beta-form

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Definer hvad der forstås ved et lipid og klassificer kolesterol-molekylet.

A

Lipider er den fraktion af naturligt forekommende, hydrofobe molekyler (der
hovedsageligt består af H, C og O), der er opløselige i organiske opløsningsmidler som f.eks.
ethanol eller benzin. Kolesterol er et eksempel på den klasse af lipider, der ikke indeholder
esterbindinger (steroider godkendes også).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Forklar hvad der forstås ved en forsæbning og hvordan sæber virker

A

Forsæbning er basisk hydrolyse af tricacylglycerol
og frigivelse af glycerol samt dannelse af sæber, der er natrium- eller kalium-salte af fedtsyrer.
Sæber ”opløser” lipider i vand ved miscelle-dannelse, idet misceller er runde aggregater af
fedtsyrer, der vender deres polære hoveder ud mod vandet, mens de apolære vender ind mod
miscellens midte, hvor små mængder lipider findes og på den måde gøres mere vandopløselige

17
Q

Redegør for den generelle opbygning af en cellemembran.

A

En cellemembran består af et dobbeltlag af triacylglycerol, phospholipider og sphingolipider med
mættede og umættede acylgrupper og imellem dem cholesterol-molekyler. De 2 lag vender de
hydrofobe dele ind mod midten af membranen, mens de hydrofile dele vender ud mod det
omgivende vandige miljø. I cellemembranen findes desuden integrerede proteiner.

18
Q

Redegør for begreberne C- og N-terminal.

A

et proteins C-terminale ende er den ende hvor der sidder en fri carboxylsyregruppe, mens
N-terminale ende er den ende hvor der sidder en fri amino-gruppe.

19
Q

Forklar, gerne ved hjælp af en skitse, hvad der forstås ved en fosforylering på serin i
position 10 i et protein?

A

Ved fosforylering forstås at
der dannes en fosfatesterbinding på OH-gruppen i den serin, der sidder i position 10 i forhold til
proteinets N-terminale ende

20
Q

Forklar hvordan fosforylering kan regulere et enzyms aktivitet.

A

De 2 negative ladninger på fosfatgruppen medfører en
konformationsændring, f.eks. ved at tiltrække positivt ladede aminosyrers sidekæder. Derved kan
affiniteten mellem ligand og enzymets aktive site ændres, hvorved enzymets aktivitet ændres.

21
Q

Beskriv opbygningen af DNA og RNA samt mindst 3 væsentlige forskelle mellem dem.

A

Nævne de 4 baser adenin, guanin, thymin og cytosin, 2´-deoxyribose og
phosphodiesterbindingerne mellem nucleotiderne for DNA, Uracil i stedet for thymin og ribose i
stedet for deoxyribose for RNA. Hydrogenbindinger holder strenge sammen i DNA, 3 mellem GC, 2
mellem AT hvilket giver DNA en stabil dobbelthelixstruktur, mens hydrogenbindinger kun optræder
lokalt i RNA-molekyler således at de ikke giver stabile RNA-dobbelthelix molekyler, men i stedet en
stabil konformation af RNA-strengen.

22
Q

En diploid celle fra en ko har en karyotype med 60 kromosomer. Hvor mange kromosomer vil
der i alt være i en haploid celle (kønscelle) fra en ko?

A

30

23
Q

Forklar, gerne ved hjælp af en skitse, hvordan DNA-replikationen foregår på (1) leading
strand og (2) lagging strand.

A

(a-1) Den nye DNA streng syntetiseres kontinuerligt, dvs ved påsætning af komplementære
deoxynucleotider på 3’-enden af RNA primeren under anvendelse af den gamle streng som
skabelonstreng. Syntesen slutter først når den støder på 5’-enden af en eksisterende primer,
hvorefter hullet i fosfatrygraden lukkes af en ligase og RNA primeren erstattes af en tilsvarende
DNA sekvens. (a-2) Den nye DNA-streng på lagging strand syntetiseres i små bidder (Okazaki
fragmenter) med en RNA-primer som udgangspunkt for hvert fragment. RNA primeren fjernes
efterfølgende, samtidigt med at nabo-fragmentets 3’-ende forlænges. Til sidst ligeres nicks mellem
fragmenterne med en ligase, så der opnås en sammenhængende DNA streng.

24
Q

I PCR binder de to DNA-primere sig ved 60 oC til hver sin DNA enkeltstreng. Beskriv, gerne
ved hjælp af en skitse, hvad der sker når temperaturen efterfølgende hæves til 72 oC.

A

Taq DNA polymerasen starter DNA syntesen ud fra primerens 3’ende. Enzymet har optimum
ved 72 oC, så hovedparten af elongeringen (forlængelse af DNA primeren) ud fra den
komplementære streng sker ved denne temperatur. På den måde dannes det DNA-stykke, som
primerne flankerer, på begge enkeltstrenge og i hver cyklus. I 1. cyklus går DNA syntesen forbi den
modsatrettede primers bindingsekvens.

25
Q

Forklar virkningsmekanismen bag RNAi i cellens forsvar mod fremmede RNA-molekyler, der
trænger ind som følge af en virusinfektion.

A

Når fremmede RNA-molekyler kommer ind i cellens cytoplasma vil de blive nedbrudt af
et protein-enzym kaldet Dicer, idet dette enzym genkender virussens dobbeltstrengede RNA
som et celle-fremmed RNA-molekyle, og nedbryder det til korte (ca. 22bp) dobbeltstrengede
RNA-molekyler kaldet siRNA. Disse optages af RISC-proteiner, der fjerner den ene RNA-streng
og bruger den tilbageblevne RNA-streng til specifik genkendelse og destruktion af
komplementære virus-RNA-molekyler

26
Q

Forklar hvordan en transskriptionsfaktor af protein-natur kan binde sig til en specifik DNA- sekvens, f.eks. en bestemt promotor-sekvens, uden at åbne den dobbeltstrengede helix- struktur?

A

Transskriptionsfaktor-proteinets form gør at det i et domæne passer perfekt i dobbelt- helix’s major groove ud for den specifikke promoter-sekvens og derved kan komme til at danne
mange svage non-kovalente bindinger (så som hydrogen-bindinger), der tilsammen danner en stabil tilhæftning af proteinet.