Epigenetica Flashcards

1
Q

Quien formulo el concepto de Epigenetica:

A

Conrad Hal Waddington en 1942

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2
Q

“El paisaje epigenético de Waddington”, que es?

A

En la cima entonces se encuentra el cigoto totipotencial (capacidad de formar cualquier tipo de célula en ese momento). Empiezan a ocurrir divisiones celulares y más o menos a la mitad de la pendiente se empieza a perder esa capacidad de totipotencia (pluripotencia: tiene una capacidad un poco más limitada que la anterior) porque empieza a agarrar una línea.Todas las células al final de la colina ya se encuentran maduras, pero no son iguales entre sí. ¿Por qué si todas tienen
un origen en común, no se pueden devolver o sí? Lo único certero era que todas tenían el mismo material genético,
pero se estaban generando cosas diferentes. A partir de esto se empieza a hablar de la epigenética.

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3
Q

Cual es el ejemplo de células de iPS?

A

Son células maduras reprogramadas (retroceden
en la colina) a un estado de pluripotencia inducida. Descubiertas por Shinya Yamanaka. Fue el primero en lograr
retroceder por la colina. Plantea obtener nuevas células diferentes a partir de totipotencia o pluripotencia. Se enfoca
en factores de transcripción o proteínas importantes con participación relevante durante el desarrollo.

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4
Q

Factores de transcripción de las células iPS:

A

Factores: Sox2, Oct3/4, Klf4 y c-Myc.

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5
Q

Cual es la función del ADN?

A

Almacenamiento de información.

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6
Q

¿Qué significa que un gen se exprese?

A

Que esa información que va a ser leída, que pueda ser transcrita, pueda ser
modificada, pueda ir al citoplasma, pueda ser leída por un ribosoma y convertirse en proteína, en la mayoría de los
casos, o en general un producto génico funcional

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7
Q

Que determina la información epigenetica?

A

Determina si, cuando y como debe leerse una información genética en particular.

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8
Q

Que es el epigenoma:

A

Es la información epigenética global de un organismo

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9
Q

Cuales son los mecanismos en epigenetica:

A
  1. Remodelación de la cromatina: expresión génica.
  2. Metilación del ADN en sitios CpG para convertir citosina en 5-metilcitosina. Catalizado por metiltransferasas.
  3. Modificación post-transcripcional de las histonas: acetilación, metilación, fosforilación (código de histonas).
  4. ARNnc: inactivación del cromosoma X. ARN no codificante.
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10
Q

Cual es un proceso relacionado con la epigenetica:

A
  1. Impronta genómica
    a. 1.1 Expresión alélica diferencial
    b. 1.1 Disomías Uniparentales
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11
Q

Mecanismos de control epigenético

A

principales
procesos: metilación del ADN, modificación de histonas y
ARNs no codificantes; juntos van a tener efectos como
cambios conformacionales sobre la cromatina y al final lo
que se quiere es la regulación de la expresión génica.

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12
Q

LA regulación de la expresión genética se produce por:

A
  • Ambiente
  • Metilacion del ADN
  • Modificaciones de Histonas
  • Cambios conformaciones de la cromatina
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13
Q

Explique el procese de la remodelación de la cromatina

A

Inicia con el gradiente de empaquetamiento del
material genético: Se encuentra el ADN con un
montón de proteínas formando nucleosomas,
proteínas histónicas → fibras de ADN → los bucles
→ hasta llegar al cromosoma en sí.
En todos estos niveles hay procesos de regulación,
niveles de empaquetamiento, etc. Al hablar de
expresión, hay regulación específica en varios
niveles: en la transcripción, cuando se da la
regulación del ARNm, al salir del núcleo, cuando va
al ribosoma, cuando empieza la traducción y en
cambios post traduccionales.
Al hablar de epigenética, se centra en la regulación
de la transcripción. En esta parte se decide si la
cromatina se abre o se cierre para que se exprese o
no el gen o genes.
Entonces, hay proteínas remodeladoras que
generan cambios en la composición de los
nucleosomas para permitir el acceso o no de
factores que van a promover la transcripción de los
genes. Son proteínas que desplazan grupos de
nucleosomas para habilitar secuencias de ADN,
permitiendo un acceso más rápido para las
proteínas que van a llegar a transcribir. También hay variantes de histonas, octámeros, que van a formar el
nucleosoma diferente y va a permitir que se abra o no se abra, se cierre o empaquete más. Finalmente hay cambios
en las colas de las histonas (detallados más adelante).
Al final, todos estos cambios buscan que es regule la actividad del gen, que se bloquee o que se active.

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14
Q

Que es la metilacion del ADN?

A

Adición de grupos metilo a citosinas adyacentes a guaninas (CpG). La “P” hace referencia al enlace fosfodiéster. No
quiere decir que otras bases nitrogenadas no sufran una metilación. Mediado por las siguientes enzimas:

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15
Q

Para que funciona la DNMT1 en la metilacion del ADN?

A

es de mantenimiento. Se encarga de conservar en patrón de metilación en la cadena recién
sintetizada.

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16
Q

Para que funciona la DNMT 3 A, 3B y 3L en la metilacion del ADN?

A

patrones de metilación nuevos durante el desarrollo

o por condiciones ambientales específicas.

17
Q

Que son las Islas CpG:

A

Regiones de al menos 500 (entre 500 – 4000) pares de bases con un contenido de C + G de al menos 55%.

18
Q

Si hay un promotor metilado que pasa con el gen?

A

No se expresa

19
Q

Si hay un promotor no metilado que pasa con el gen?

A

El gen se expresa

20
Q

La metilacion del ADN altera la expresión de dos maneras:

A

Una genera una configuración abierta: cuando el ADN no está metilado y las histonas están acetiladas los
genes pueden ser transcritos porque los nucleosomas están más separados entre sí, generando que la
secuencia de ADN quede mucho más expuesta y que tenga mayor acceso.
Configuración cerrada: ADN metilado en las islas CpG (puntos negros de la imagen) y las histonas están
desacetiladas entonces los genes no pueden ser transcritos porque todo está demasiado compactado como
ocurre en la heterocromatina.

21
Q

Que es el MeCP2:

A

Proteínas de unión a ADN metilado, mas reconocida.

22
Q

De que se encargan las proteínas de union a ADN Metilado:

A
  • Se hacen represoras de los procesos de transcripción, llegan un montón de proteínas (50-90) que van a impedir
    el avance de la transcripción, por lo que no habría un producto génico funcional al final.
  • Por unión de otras, de las condiciones del medio o estímulo que se esté generando, se van a unir enzimas que
    van a activar el proceso de transcripción y van a buscar que la proteína se vaya, que salga del complejo y se
    permita el acceso a la región para que se dé la expresión.