Épigénétique

Question 0

Quelle était la conception antérieure de l’expression génétique?

Answer 0

La liaison de facteurs de transcription et d’activateurs sur un promoteur induit l’utiliation de l’ARN polymérase II et de ses cofacteurs pour synthétiser l’ARN. L’expression du gène dépend uniquement de la séquence en acides nucléiques.

Question 1

Définition d’épigénétique

Answer 1

Études des caractères, tels que les changements des états de transcription des gènes, qui sont héritables au cours des divisons cellulaire mais qui n’impliquent aucun changement des la séquence d’ADN

Question 2

Qu’est ce que l’épigénétique ajoute au concept d’expression génétique

Answer 2

L’expression dépend aussi de l’état local de la chromatine

Question 3

Définition de l’épigénétique

Answer 3

Études des caractères, tels les changements des états de transcription des gènes qui sont héritables au cours des divisions cellulaires mais qui n’impliquent aucun changement dans la séquence d’ADN.

Question 4

Définition Épigénotype

Answer 4

Modification épigénétique correspondant à un état de transcription particulier d’un gène.
Méthylation de l’ADN
Modification des histones

Question 5

Définition Hérédité génétique

Answer 5

Transmission de génération en génération d’une maladie liés à une modification de l’ADN ou du nombre de chromosomes

Question 6

Définition hérédité épigénétique

Answer 6

Modification transmissible de l’expression des gènes qui ne résultent pas de modifications de la séquence d’ADN

Question 7

Comparer Génétique et Épigénétique avec les structures étudiées et l’aspect des gènes étudiées

Answer 7

Génétique: ADN et Composition

Épigénétique: Chromatine et Expression

Question 8

Quelle est l’unité de base de la chromatine

Answer 8

Nucléosome

Question 9

Qu’est ce qu’un nucléosome

Answer 9

Association régulière entre l’ADN et 8 histone (octamère).

Plus petit niveau d’organisation de la chromatine

Question 10

Parler de la structure du nucléosome

Answer 10

Les histones de l’octamère: (H2A, HSB, H3, H4) x2. Chargé (+)
Chaque histone possède un domaine de pliage formé de 3 hélice a
ADN chargée (-)

Question 11

Parler de l’assemblage du nucléosome

Answer 11

1. Formation d’un tetramère d’histone (H3 +H4) X2
2. Le tétramère se lie à l’ADN double brin
3. Recrute 2 dimère H2A-H2B
4. Les queues N-terminales des histones permettent de stabiliser l’enroulement de l’ADN
5. Les histones H1 stimule la formation de fibre de 30 nm
6. 1 H1 rapproche les nucléosomes
7. 2 N-terminal de H1 stabilise la structure

Question 12

Quel est le role de la chromatine

Answer 12

Compaction de l’ADN
Protection de l’ADN (enroulement expose un min, ADN au DNAses
Régulation de l’expression génique

Question 13

Identifier et définir les types de chromatines

Answer 13

Euchromatine: ADN actif, structure décondensée permettant l’expression génique
Hétérochromatine: ADN inactif, condensé à des fins structurelles
Hétérochromatine constitutive: pas exprimé, autour du centromère et du télomère
Hétérochromatine facultative: contient des gènes éteints

Question 14

Définir et expliquer les états physique possible d’un gène

Answer 14

Réprimé: chromatine condensée, pas d’activité transcriptionnelle, accès limité de la machinerie transcript. au promoteur
Basal: activité transcriptionnelle constante mais faible, chromatine ouverte mais absence de certain facteur de transcription et d’activateurs sur le promoteur du gène qui augmenterait l’activité transcript.
Induit: activité transcript. intense, chromatine ouverte et certains signaux provoque la liaison de facteurs de transcrip. et d’activateurs sur le promoteur du gène augmentant la transcription

Question 15

Quelles sont les modifications d’histones possible

Answer 15

Queue N-terminales spécifiquement modifiées
Modification post traductionnelles réversible
Transfert des résidus sur les histones

Question 16

Quelles sont les modifications post-traductionnelles réversibles

Answer 16

Métylation (3x CH3 sur Lys ou Arg. enzyme HMT)
Acétylation (-CH3CO sur Lys. enzyme HAT)
Phosphorylation (group phos sur Ser par kinase)
Ubiquination (ubiquitine sur Lys par ligase)
Sumoylation (protéine Sumo par enzyme E1, E2, E3)

Question 17

Quelles sont les formes d’ubiquination et favorise quoi

Answer 17

Monoubiquination
Polyubiquination
Favorise la réparation des dommages de l’ADN

Question 18

Developer sur sumoylation

Answer 18

Interaction protéine-protéine

Localisation intracellulaire

Question 19

La méthylation est concentré…

Answer 19

au niveau des ilots CpG (dans les promoteurs)

Question 20

Comment la méthylation reprime l’expression

Answer 20

Direct. masque séquence reconnue par les facteurs de transcript.
Indirect. recrute protéine inhibitrice de la transcript. (MBD)

Question 21

Quels sont les mécanismes de la méthylation

Answer 21

Inhibe la liaison des facteurs de transcript.
MBP protéines recrutent des répresseurs
DNMT recrutent des enzymes de modification des histones
MBP inhibe l’élongation transcriptionnelle

Question 22

Quelle sont les enzyme et fonction de la méthylation

Answer 22

DNMT 1: maintenance de la méthylation
DNMT 2: inconnu
DNMT 3: méthylation répliquée selon semi-conservatif
a: seq régulatrice b: seq centromériques

Question 23

Nommer des pathologies et cause-conséquence de méthylation

Answer 23

Syndrome ICF: perte fonction DNMT 3b, immunodéficience, instabilité centromérique, dysmorphie faciale

Syndrome RETT: perte fonction MeCP2, arrêt du développement, hyperventilation, épilespie, position des mains

Question 24

À quoi sert l’empreinte parentale

Answer 24

Empêche la partogénèse (multiplication d’un gamète femelle non fécondé)

Question 25

Comment sont exprimé les gène sous l’empreinte parentales

Answer 25

Monoallélique (maternel ou paternel inactif)

Question 26

Ou et quand à lieu l’empreinte parentale

Answer 26

Pendent la production des gamète
H19 est inactivé par méthylation (mâle)
Igf2 est inactivé par méthylation (femelle)

Question 27

Nommer pathologie de l’empreinte parentale et conséquences

Answer 27

Syndrome de Wiedmann-Beckwith
Empreinte sur un gène normalement actif: patho diffé selon contibution: Prader-will perte contribution mater, Angelman perte contribution pater.
Augmente susceptible à une maladie: un gène actif peut être malade, si survient pendant embryo, désordre métabo et neuro, cancer.

Question 28

Différencier chromosome X et Y

Answer 28

X: plus de paire de bases, pas d’hétérochromatine, contient des gènes pour les deux sexes

Y: moins de paires de base, 50% hétérochromatine, contient gène unique male.

Question 29

Qu’est ce qu’un corpuscule de Barr (caractéristiques)

Answer 29

Chromosome X inactivé condensé pendant interphase
Inactivation au hasard. (mosaïque des cellules femmes)
Inactivation permanente
Inactivation survient en embryo très tot.
Réplication tardive en phase S

Question 30

Quels sont les mécanismes d’inactivations

Answer 30

Hyperméthylation: Ajout massif méthyles sur CpG et H3

Hypoacétylation: Enlever acétyles sur H4 et resserre ADN autour nucléosome

Question 31

Quels sont les processus d’inactivation du X

Answer 31

Initiation: Transcript gène XIST du centre d’inactivation, ARNm reste dans le noyau
Propogation: Accumulation XIST et se propage sur les deux bras
Maintenance: Hyperméthylation et Hypoacétylation

Question 32

Régulation de l’inactivation du X

Answer 32

1 X doit être actif ( 2X = mort)
Homme= aucune inactivation
Femme= XIST sur un chromosome

Question 33

En quoi consiste test chromatine sexuelle

Answer 33

Frottis buccal pour compter le nombre de corpuscule de Barr visible en périphérie

Question 34

Quelles parties du chromosome X peuvent échapper à l’inactivation

Answer 34

Région pseudo-autosomale homologues au Y
Region qui contient le gene XIST
Autres gènes ayant un rôle spécifique chez la femme

Question 35

Maladie et inactivation du X

Answer 35

Lyonisation favorable: Majorité des cellules inactivent le X malade, donc femme hétérozygote pas malade

Lyonisation défavorable: Majorité des cellules inactive le X sain donc femme hétérozygote malade