Exam Flashcards
(297 cards)
1
Q
modelis - tai?
A
teorinė realaus pasaulio abstrakcija
2
Q
2 modelio paskirtys
A
- sumažinti situacijos sudėtingumą, kad būtų galima pastebėti gilesnius reiškinius
- iškelti hipotezes, kurias galima patikrinti eksperimentais ir stebėjimais
3
Q
modelių nauda (3)
A
- apibrėžia parametrus, į kuriuos reikia atsižvelgti;
- apibendrina rezultatus;
- nuspėja, kaip sistema veiks ateity
4
Q
modelių skirstymas (3)
A
- verbaliniai
- imitaciniai
- analiziniai (HV)
5
Q
prielaidų tikslas
A
modelį padaryti parankesnį matematiniam apdorojimui bei lengviau suprantamą
6
Q
HV modelio principas
A
idealioje arba realioje pop., kuri yra pusiausvyroje, alelių ir genotipų dažniai iš kartos į kartą nesikeičia
7
Q
prielaidos HV modeliui (8)
A
- org. yra diploidinis, dauginasi lytiškai, jam būdingos diskrečios kartos;
- alelių dažniai abiejose lytyse vienodi;
- veikia Mendelio segregacijos dėsnis (aleliai į gametas segreguoja atskirai, pusė gametų turi vieną alelį, kita pusė - kitą);
- atsitiktinis kryžminimasis (nagrinėjamo lokuso, bet nebūtinai kitų lokusų atžvilgiu);
- nevyksta mutacijos;
- nevyksta migracija;
- nevyksta genų dreifas (nes labai didelė pop.);
- nevyksta gamtinė atranka (nėra išgyvenamumo ar reprodukcinės sėkmės skirtumų)
8
Q
HV modelio esmė
A
kai kryžminimas atsitiktinis, F1 kartos palikuonių GENOTIPŲ dažniai gali būti apskaičiuojami iš tėvų ALELIŲ dažnių
9
Q
kokiu atveju heterozigotai yra dažnesni už bet kokį homozigotą?
A
esant tarpiniams alelių dažniams
10
Q
kada būna didžiausias heterozigotų dažnis?
A
kai abiejų alelių dažnis lygus 0,5
11
Q
kas yra alelio dažnio kvadratas?
A
genotipo dažnis
12
Q
kodėl tikrinama HVP? (2)
A
- nuokrypio priežastis - svarbus evoliucinis/ekologinis procesas
- jei nėra patikimo nuokrypio, negali tvirtinti, kad nė viena prielaida nebuvo pažeista
13
Q
kuo didesnė X2 kriterijaus reikšmė, tuo…
A
didesnė tikimybė, kad skirtumas nėra atsitiktinis ir pop. nėra HVP
14
Q
kokiai P reikšmei esant rezultatai yra statistiškai patikimi?
A
mažiau nei 0,05
15
Q
kam lygus laisvės laipsnis?
A
genotipų ir alelių sk. skirtumui
16
Q
kokia turi būti P reikšmė, kad HVP hipotezė būtų atmetama?
A
mažiau nei 0,05
17
Q
kokia X2 reikšmė turi būti bialeliniam lokusui, kad atmestume HVP?
A
daugiau nei 3,84
18
Q
kokia X2 reikšmė turi būti trialeliniam lokusui, kad atmestume HVP?
A
daugiau nei 7,82
19
Q
pagal ką galima apskaičiuoti alelių dažnius, jei yra HVP?
A
pagal recesyvių homozigotų dažnį
20
Q
kurioje lytyje dažniau aptinkami recesyviųjų genų nulemti fenotipai?
A
heterogametinėje
21
Q
kas būdinga mažoms imtims? (4)
A
- sistemingas nuokrypis nuo HVP;
- mažiau genotipų negu iš tiesų yra;
- padidėja heterozigotų, sumažėja homozigotų;
- vietoj X2 testo siūlomas exact testas
22
Q
kam dar (be HVP mažoms populiacijoms) yra naudojamas exact testas? (2)
A
- vertinant heterozigotų deficitą;
2. vertinant heterozigotų perviršį
23
Q
kokioms 3 prielaidoms esant genų dreifas tiesiogiai priklauso nuo individų sk. subpopuliacijoje?
A
- abiejų lyčių ind. sk. vienodas;
- kiekvieno individo lyt. ląst. galimybės formuoti palikuonis vienodos;
- subpopuliacijos dydis keičiantis kartoms lieka pastovus
24
Q
kokiu atveju genų dreifo dydis nusakomas efektyviu populiacijos dydžiu (Ne)?
A
jei pažeistos genų dreifo sąlygos
25
kas yra efektyvus populiacijos dydis?
idealios populiacijos dydis, ji patiria tokio paties dydžio genų dreifą kaip ir atitinkama reali populiacija
26
kokiu atveju Ne (efektyvus pop. dydis) bus mažesnis už faktinį pop. dydį pagal individų sk. (N)?
kai pažeistos genų dreifo sąlygos
27
kokiu atveju lyčių santykis turi didelę įtaką Ne (efektyviam pop. dydžiui)?
kai labai žymus skirtumas tarp skirtingų lyčių individų dažnių populiacijoje
28
koks apytiksliai bus Ne, kai yra labai dideli lyčių santykio skirtumai?
apie 4x retesnės lyties individų sk.
29
kas nutinka, kai individų reprodukcinės sėkmės dispersija didesnė už atsitiktinai tikėtiną?
sumažėja Ne (nes individų įnašas į genofondą nevienodas)
30
Ne = Na sąlygos (3)
1. kiekvienas individas palieka po vieną palikuonį;
2. kiekviena šeima palieka po 2 palikuonis;
3. kiekvienas individas prie kitos kartos atsiradimo prisideda 2 gametomis
31
Ne mažėjimo sąlygos (2)
1. žymiai skiriantis patinų ir patelių reprodukcinei sėkmei
| 2. didėjant reprodukcinės sėkmės dispersijai
32
kas aprašoma pagal Puasono skirstinį?
šeimos palikuonių dydis
33
kas yra butelio kaklelio efektas?
žymus pop. dydžio sumažėjimas
34
kada naudojamas harmoninis pop. dydžio vidurkis?
kai pop. dydis svyruoja skaičiuojant Ne
35
per kokius reiškinius prarandama genetinė įvairovė butelio kaklelio efekto atveju? (3)
1. heterozigotiškumą
2. alelių sk. lokuse
3. genotipų įvairovę
36
kur bus stipresnis butelio kaklelio efektas heterozigotiškumo praradimui?
rūšyse, kuriose būdingas mažesnis augimo tempas
37
kas gali nutikti dėl butelio kaklelio efekto?
gali būti prarasti retai pasitaikantys aleliai
38
kada mažėja alelio praradimo tikimybė?
esant lygiems alelių dažniams
39
kas yra įkūrėjo (pradininko) efektas?
kai nedidelis emigrantų sk. įkuria naują populiaciją
40
kas yra genų dreifo priežatis naujai susikūrusioje subpopuliacijoje?
mažas emigrantų sk.
41
pradininko efekto padariniai (2)
1. alelių dažnio pasikeitimas
| 2. genetinės įvairovės sumažėjimas
42
ką reiškia retų alelių nebuvimas?
kad populiacija neseniai patyrė butelio kalklelio arba pradininko efektą
43
kam butelio kaklelio ir įkūrėjo efektai turi didesnį poveikį: heterozigotiškumui ar alelio sk. praradimui?
alelių sk. praradimui
44
nuo ko priklauso Ne, kai metapopuliacija yra nepertraukiama? (2)
1. reprodukuojančių individų sk. ploto vnt.
| 2. reprodukuojančių individų gimimo vietų ir jų palikuonių gimimo vietų dispersijos
45
nucDNR ir mtDNR skirtumai (3)
1. individai yra haploidiniai pagal mt
2. mt paveldima per motinos liniją
2. mt nevyksta rekombinacija
46
kuriems genams Ne yra mažesnis?
mtDNR (nebent Nf/Nm santykis yra 7 ir daugiau)
47
kuriems genams genų dreifas turi didesnę įtaką?
mtDNR
48
kai lyčių santykis 1:1, koks Ne yra mtDNR ir nucDNR?
mtDNR 4 kartus mažesnis
49
kuriuos DNR žymenis geriau naudoti tiriant genų dreifo sukeltą neseną subpopuliacijų atsiskyrimą?
plastidžių, ne branduolio
50
kuo didesnis kūno dydis, tuo... (2)
1. mažesnė populiacija
| 2. ilgesni kartų periodai
51
ką leidžia įvertinti Ne/Na santykis?
genetinės įvairovės praradimą skirtingose rūšyse
52
Ne/Na santykis pop. ar rūšyse skiriasi priklausomai nuo... (2)
1. demografijos
| 2. gyvenimo istorijos
53
nuo ko priklauso genų dreifo dydis?
nuo efektyvaus pop. dydžio (Ne)
54
kas naudojamas diferenciacijai tarp subpop. išmatuoti?
Fst inbrydingo koef.
55
ką parodo Fst?
dalinį metapop. heteroz. sumažėjimą dėl subpop. diferenciacijos lyginant su tuo atveju, kai metapop. nebūtų susiskaidžiusi į subpop.
56
kuo mažesnis efektyvus pop. dydis (Ne), tuo...
intensyvesnis genų dreifas
57
nuo ko priklauso subpop. diferenciacijos mastas?
nuo subpop. dydžio
58
kas vyksta pop. dėl genų dreifo? (2)
1. tampa labiau inbrydinė
| 2. didėja homozigotiškumas (jei kryžminimas nėra atsitiktinis)
59
kokiose gamtinėse populiacijose (mažose ar didelėse) sparčiau mažėja heterozigotiškumas?
mažesnėse
60
kas yra tikrasis inbrydingas?
kryžminimasis tarp giminingų individų didesniu nei atsitiktinai dažniu
61
kuo panašus inbrydingas ir genų dreifas?
dėl abiejų padidėja homozigotiškumas
62
pagal ką skiriasi tikrasis imbrydingas ir inbrydingas dėl genų dreifo?
pagal poveikį genotipams
63
kaip tikrasis imbrydingas veikia homozigotų dažnį?
padidina abiejų homozigotų dažnius, subpop. nukrypsta nuo HVP
64
kaip imbrydingas dėl genų dreifo veikia homozigotų dažnį?
padidina tik vieno iš homozigotų dažnį, lieka HVP
65
dėl ko vyksta inbrydinė depresija?
dėl genų dreifo
66
kaip genų dreifas veikia žalingų alelių dažnius?
padidina
67
nuo ko priklauso aukštesniojo lygio požymis?
nuo daugelio žemesniojo lygio požymių
68
kokie požymiai yra veikiami didesnio sk. genų lokusų?
esantys aukštesniuose hierarchiniuose lygmenyse
69
kam daro įtaką žemesniojo lygio požymiai? (2)
1. išgyvenimui;
| 2. reprodukcijai
70
kokie gyvenimo ciklo požymiai nusako individo tinkamumą? (2)
1. išgyvenimas;
| 2. reprodukcija
71
tinkamumas - tai...
organizmo gebėjimas išgyventi, daugintis ir palikti palikuonių
72
pagal ką dažniausiai vertinamas ind. tinkamumas?
pagal palikuonių, paliktų per gyvenimą, sk.
73
kas yra diskretieji matomi polimorfizmai?
pirmieji pop. genetikos žymenys, kokybiniai požymiai
74
diskrečiųjų matomų polimorfizmų bruožai (3)
1. turi tik kelias ryškiai besiskiriančias morfas
2. sąlygoti 1 ar 2 lokusų
3. nepatiria stipraus aplinkos poveikio
75
2 diskrečiųjų matomų polimorfizmų panudojimo būdai
1. kaip žymenys
| 2. kaip adaptacijos
76
fenotipinių polimorfizmų trūkumai (6)
1. labai nedidelė dalis yra kontroliuojama 1 ar kelių lokusų ir patiria nedidelį aplinkos poveikį;
2. nedidelis gen. kintamumas;
3. neapima viso genomo;
4. vieno geno poveikį gali nustelbti kitas;
5. genų poveikis gali būti nustelbtas aplinkos;
6. dauguma yra kiekybiniai (ne kokybiniai)
77
pagal kokį skirstinį išsidėsto dauguma tolydžių požymių (kai fenotipai sugrupuoti į intervalus ir pateikti stulpeline diagrama)?
normalųjį
78
kokie yra dauguma matomų polimorfizmų? (2)
1. tolydieji;
| 2. multifaktorialiniai
79
ką reiškia "tolydieji" polimorfizmai?
kiekybiniai
80
ką reiškia multifaktorialiniai?
jiems daro įtaką daug genų arba aplinkos faktorių
81
dažnai ar retai gamtoje yra sutinkami diskretieji matomi polimorfizmai?
retai
82
kada dažniau yra aptinkami diskretieji matomi polimorfizmai: studijuojant genus bei jų produktus ar fenotipus?
genus bei jų produktus
83
4 rūšių fenotipinis kintamumas?
1. spalvų polimorfizmas;
2. morfologinis p.;
3. elgsenos p.;
4. fenologinis p.
84
pilkos ir raudonos morfų atveju, kuris yra dominantinis?
raudonas
85
kaip paveldimas pelėdų kailio spalvos požymis?
pagal vieną bialelinį lokusą
86
koks alelis lemia lokių kailio spalvą?
recesyvinis autosominis
87
pleotropija - tai...
reiškinys, kai vienas genas veikia daugiau nei vieną skirtingą fenotipinę savybę
88
fluktuojančios asimetrijos priežastis
atsitiktiniai fiziologiniai skirtumai individų vystymosi metu
89
kas lemia paukščių migracinę elgseną?
multilokusinė sistema
90
fenologija - tai...
biologinių įvykių laiko parinkimas, kuris susijęs su klimatinėmis ar aplinkos variacijomis
91
pagr. fenologinės savybės gyvūnams (5)
1. migracijos;
2. kiaušinių dėjimo;
3. veisimosi;
4. šėrimosi;
5. žiemos miego laikas
92
ką gali sukurti reprodukcinio laiko skirtumai rūšies viduje? (2)
reprodukcinius barjerus;
| 2 rūšių susidarymą iš rūšies reprodukciškai pagal laiką izoliuotų pop. (simpatrinis rūšių susidarymo būdas)
93
chromosomų įvairovės tyrimų metu naudojamų žymenų rūšys (4)
1. morfologiniai;
2. baltymų polimorfizmas;
3. imunogenetiniai;
4. DNR
94
kur dažniausiai pasitaiko poliploidija? (4)
1. bestuburiuose;
2. žuvyse;
3. varliagyviuose;
4. driežuose
95
ar artimai giminingos rūšys dauguma turi vienodą chrom. rinkinį, ar skirtingą?
skirtingą
96
koks yra paukščių patelių lytinių chrom. rinkinys?
heterogametinis
97
koks yra paukščių patinų lytinių chrom. rinkinys?
homogametinis
98
ką dažnai sukelia chrom. rinkinio skirtumai?
sumažėjusį palikuonių vaisingumą
99
pagal ką elektroforezės metu diferencijuojamos makromolekulės? (4)
1. krūvį;
2. dydį;
3. formą;
4. molekulinį svorį
100
nuo ko elektroforezėje priklauso judėjimo greitis? (9)
judančios molekulės:
1. krūvio;
2. formos;
3. dydžio;
4. molek. masės;
5. matricos (terpės);
6. matricos konc.;
7. buferio konc.;
8. temp.;
9. įtampos
101
nuo ko priklauso elektroforezinis judrumas?
polimero tankumo
102
polimerų pvz (4)
1. krakmolas;
2. agarozė;
3. acetatceliuliozė;
4. poliakrilamidas
103
kas naudojama juostų išryškinimui? (3)
1. chem. dažai;
2. radioaktyvios medž.;
3. fluorescuojančios medž.
104
kokie tirpūs fermentai naudojami elektroforezėje? (2)
1. izofermentai;
| 2. aloenzimai
105
kokie dažniausiai yra izofermentai: kodominuojantys ar dominuojantys žymenys?
kodominuojantys
106
baltymų elektroforezės pranašumai (4)
1. kodominavimas;
2. tiria daug lokusų;
3. greita, pigu, paprasta;
4. rezultatų atkartojamumas
107
baltymų elektroforezės trūkumai (7)
1. ištiriama nedidelė DNR dalis;
2. neatskleidžia intronų kintamumo;
3. tik spec. genų rinkiniui, kuris koduoja vand. tirpius baltymus;
4. daugeliui baltymų negalima naudoti spec. dažų;
5. kai kurios aminor. variacijos neatsiskindi rezultatuose;
6. pakitimai 3iojoje kodono pozicijoje dažnai nesukelia pakitimų baltymo aminor. sekoje;
7. reikia daug medžiagos
108
kam nustatytas mažiausias, vidutinis ir didžiausias izofermentų genetinio kintamumo mastas? (3)
mažiausias - stuburiniams;
vid. - augalams;
didž. - bestuburiams
109
kur randami I gr. fermentai?
audiniuose ir kūno skysčiuose
110
II gr. fermentų bruožai (2)
1. įtraukti į centrinius metabolinius procesus;
| 2. mažas specifiškumas substratui
111
Darvino teiginiai (3)
1. rūšims būdinga daugiau palikuonių nei gali išgyventi;
2. individai skiriasi pagal fenotipus ir tai turi įtakos išgyvenamumui ir dauginimuisi;
geriau prisitaikę ind. sulauks daugiau palikuonių
112
gamtinė atranka - tai...
laipsniškas procesas, kurio metu sąveikaujant su aplinka keičiasi genotipų dažnis pop.
113
kam svarbūs vietinių adaptyvių pop. genetiniai skirtumai?
rūšies išlikimui
114
kaip adaptacijos veikia vietinių pop. adaptyvumą?
sumažina
115
gamtinės atrankos priežastis
individų tinkamumo skirtumai, kuriuos lemia nevienodi individų genotipai ir fenotipai
116
ką nusako gyvybingumas?
zigotos išgyvenimą iki reproduktyvaus amžiaus
117
griežta atranka - tai...
išgyvenimo skirtumai esant skirtingiems genotipams
118
švelni atranka - tai...
vaisingumo skirtumai esant skirtingiems genotipams
119
koks tinkamumas (absoliutus ar santykinis) yra svarbus lyginant genotipus?
santykinis
120
ką parodo atrankos koef. s?
gamtinės atrankos, veikiančios prieš tam tikrą genotipą, mastą
121
3 pagr. gamtinės genotipų atrankos modeliai (tipai)
1. kryptinė atranka;
2. heterozigotų pranašumas (superdominavimas);
3. homosigotų pranašumas
122
3 pranašumą teikiančio alelio rūšys
1. dominuojantis;
2. adityvusis;
3. recesyvusis
123
kodėl alelis neužfiksuojamas visiško dominavimo atveju?
pranašumą suteikiančio alelio dažnis aukštas, o reto žalingo reces. alelio atsargos yra heterozigotose, todėl nepalankūs padariniai fenotipui nepasireiškia ir nepastebimi gamtinės atrankos
124
greitai ar lėtai yra įtvirtinamas pranašumą teikiantis recesyvus alelis?
lėtai
125
koks turi būti minimalus dažnis, kad homozigotų sk. būtų pastebimas?
0,2
126
kur dingsta dominuojantis žalingas alelis?
kadangi jis fenotipiškai visad pasireiškia, jį efektyviai pašalina gamtinė atranka
127
dėl ko palankios recesyvios mutacijos dingsta dar prieš pasireiškiant reikšmingame homozigotų skaičiuje?
jos prarandamos dėl genų dreifo
128
kokiais atvejais palaunkaus recesyvaus alelio praradimas yra mažiau tikėtinas? (2)
1. didėjant Ne;
| 2. veikiant inbrydingui
129
kurie dažnesni:palankūs dominuojantys ar recesyviniai aleliai?
dominuojantys, ofc
130
kas vyksta, kai atranka veikia prieš žalingą dominuojantį alelį? (3)
1. išvyksta AA;
2. išnyksta Aa;
3. recesyvus fiksuojamas
131
kas vyksta, kai atranka veikia prieš žalingą recesyvųjį alelį? (2)
1. recesyvas palaikomas heterozigotuose;
| 2. dominantinis NEFIKSUOJAMAS
132
kada alelio dažnio kitimas gali būti pusiausvyrinis?
kai delta p=0
133
kas yra nestabili pusiausvyra?
reiškinys, kai:
- pradinis alelio dažnis artimas pusiausv. reikšm., bet nelygus
- tolimesnėse kartose vis labiau tolstama nuo pusiausvyrinės reikšmės
134
kas yra lokaliai stabili pusiausvyra?
reiškinys, kai:
- pradinis alelio dažnis artimas pusiausv. reikšm., bet nelygus
- tolimesnėse kartose vis labiau artėjama prie pusiauvyrinės reikšmės
135
kas yra globaliai stabili pusiausvyra?
kad ir koks pradinis alelio dažnis, vis tiek artės prie pusiausvyrinės reikšmės
136
kokiu atveju būna pusiausvyra esant 1 aleliui populiacijoje? (2)
1. nevykstant mutacijoms
| 2. nevykstant migracijai
137
nestabilios pusiausvyros skaitinė išraiška
p=0
138
globaliai stabilios pusiausvyros skaitinė išraiška
p=1
139
superdominavimas (heterozigotų pranašumas) - tai...
heterozigotinio genotipo tinkamumas yra didesnis už abiejų homozigotinių
140
svarb. superdominavimo savybė
abu aleliai palaikomi stabilioje pusiausvyroje
141
kokiu atveju heteroz pranašumas nėra būtinas ir pakankamas veiksnys palaikant alelių polimorfizmą?
kai lokuse 2 ar daugiau alelių
142
heterozė - tai...
reiškinys, kai F1 kartos tinkamumas yra didesnis nei tėvinių linijų ar subpop.
143
kokiais 2 atvejais pasireiškia heterozė?
1. sukryžminus laboratorines inbrydines linijas;
| 2. kryžminantis anksčiau izoliuotoms gamtinėms subpop.
144
kas yra heterozės priešingybė?
inbrydinė depresija
145
kuo skiriasi heterozė nuo superdominavimo?
heterozę lemia daug lokusų, o superdominavimas fiksuojamas viename
146
kur plačiai taikoma heterozė?
augalininkystėje
147
kokia pusiausvyra pasireiškia homozigotų pranašumo atveju?
nestabili
148
ar homozigotų pranašumas palaiko gamtinėse populiacijose genetinį kintamumą?
ne
149
kokia gali būti tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio?
teigiama ir neigiama
150
ką reiškia teigiama tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio?
didėja genotipo tinkamumas, didėja ir genotipo dažnis
151
ką reiškia neigiama tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio?
mažėja genotipo tinkamumas, bet didėja genotipo dažnis
152
ką sukelia teigiama tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio?
greitą alelio fiksaciją
153
gynybinė mimikrija - tai...
reiškinys, kai plėšrūnas išmoksta vengti dažnai pasitaikančio fenotipo ir puola reto fenotipo ind.
154
ką daro neigiama tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio?
padeda išlaikyti retus alelius, pop. polimorfizmą
155
kuri (neigiama ar teigiama) tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio yra dažna gamtoje?
neigiama
156
kokiais pvz pasireiškia neigiama tinkamumo priklausomybė nuo genotipo dažnio? (4)
1. plėšrūno-aukos santykiai;
2. parazito-šeimininko santykiai;
3. neigiamas pasirinktinis kryžminimasis;
4. augalų nesuderinamumas
157
kodėl padidėja retesnių aukų ir šeimininkų tinkamumas?
nes plėšrūnai ri parazitai yra labiau prisitaikę prie dažnų aukų ir šeimininkų
158
kas vyksta esant stipresnei gamtinei atrankai?
greičiau pasiekiama alelių dažnių pusiausvyra
159
Haldano filtras - tai...
reiškinys, kurio metu jei būtų atsižvelgta į genų dreifą, daugelis palankių recesyvių alelių būtų prarasti anksčiau, nei pradėtų rodytis jų dažnis
160
kas yra pagr. priemonė tiriant vidupop. ir tarppop. genetinį kintamumą?
genetiniai žymenys
161
kas dažniausiai naudojama gyvūnų pop. tyrimuose? (2)
1. mtDNR sekų palyginimas;
| 2. mikrosatelitiniai žymenys
162
2 žymenų tipai pagal paveldėjimo pobūdį
1. kodominuojantys;
| 2. dominantiniai
163
kodominuojantys žymenys - tai...
heterozigotos gali būti atskirtos nuo homozigotų
164
kurie žymenys yra informatyvesni?
kodominuojantys
165
dominantiniai žymenys - tai...
heterozigotų negalima atskirti nuo zigotų, gelyje lokuse būdingi tik 2 genotipai (tas, kur skaičiuodavom juostų nebuvimus - nulinius genotipus)
166
RFLP iššifravimas :D
restrikcinių fragmentų ilgio polimorfizmai
167
RFLP eiga (3)
1. DNR sumaišomas su restrikcijos endonukleazėm;
2. jos kerpa DNR spec. vietose;
3. fragmentai vizualizuojami (elektroforezė, Southern blotas, radioaktyvūs/fluorescuojantys DNR fragmentai)
168
RFLP pliusai (4)
1. kodominuojantys;
2. nemažas kintamumo mastas;
3. nustatomi kelių nukleotidų sekų skirtumai;
4. atkartojami rez.
169
RFLP minusai (4)
1. sudėtinga;
2. didesnis DNR kiekis nei PGR;
3. aukšta DNR kokybė;
4. sunku parinkti restriktazių kombinacijas
170
PGR etapai (3)
1. denatūracija;
2. pradmenų prikibimas;
3. sintezė
171
kam reikalingi magnio jonai PGR? (4)
1. polimerazės aktyvumui;
2. polimerazės tikslumui;
3. pradmenų prilipimui;
4. matricos denatūracijai
172
kuo ilgesnis fragmentas amplifikuojamas, tuo...
ilgesnis sintezės laikas
173
ką sąlygotų per didelė dNTP konc. PGR?
nekomplementarių nukleotidų įjugimą
174
kas bus, jei pradmenų hibridizacijos temp. bus per žema?
DNR susijungs pati su savim
175
kas bus, jei pradmenų hibridizacijos temp. bus per aukšta?
mažas produkto kiekis
176
kas naudojama kaip neigiama kontrolė PGR?
PGR mišinys be DNR
177
kas naudojama kaip teigiama kontrolė PGR?
žinomo ilgio DNR pvz
178
kam reikalingi PGR priedai? (2)
1. kad padidintų amplifikuojamo produkto kiekį;
| 2. kad sumažintų nepageidaujamų nespecifinių prod. konc.
179
PGR priedų pvz (4)
1. BSA;
2. DMSO;
3. betainas;
4. formamidas
180
lizdinės PGR esmė
atliekamos 2 PGR reakcijos, pirmos reakcijos produktas yra matrica antrajai reakcijai
181
kada naudojama karšto taško PGR? (2)
1. norint sumažinti pašalinių prod. kiekį;
| 2. reakcijos jautrumo padidinimui
182
kada naudojama asimetrinė PGR? (2)
kai norima padauginti vieną grandinę
183
RAPD iššifravimas
atsitiktnai aplifikuota polimorfinė DNR
184
kokio ilgio pradmenys naudojami RAPD?
atsitiktiniai, 10 bp
185
kokie žymenys naudojami RAPD?
dominuojantys
186
3 RAPD modifikacijos, patobulinimai
1. vieno pradmens amplifikuotas regionas;
2. nustatytos sekos amplifikuotas regionas;
3. amplifikuotos skilimo vietos polimorfizmas
187
amplifikuotos skilimo vietos polimorfizmo esmė (4)
1. polimorfiniame regione pastebimas restrikcijos kirpimo vietų polimorfizmas;
2. derinama su RFLP;
3. kodominuojantis žymuo;
4. nereikia spec. dažymo
188
RAPD pliusai (3)
1. greitas;
2. atsitiktiniai pradmenys;
3. nereikia gen. info apie rūšį
189
RAPD minusai (3)
1. dominantinis žymuo;
2. neatkartojami rez.;
3. sėkmė priklauso nuo PGR ir DNR kokybės
190
AFLP iššifravimas
amplifikuotų fragmentų ilgio polimorfizmas
191
AFLP=
RAPD + RFLP
192
AFLP esmė (5)
1. karpo restriktazės;
2. PGR;
3. atsitiktiniai pradmenys;
4. mažesni fragmentai nei RFLP;
5. lengvesnis atkartojamumas nei RAPD
193
ką gelyje atitinka juosta AFLP ir RAPD?
atskiras genomo vietas (ne skirtingus to paties lokuso alelius)
194
AFLP pliusai (6)
1. atkartojamumas;
2. greitas;
3. mažai darbo;
4. generuoja daug fragmentų;
5. nereikia iš anksto žinoti sekų;
6. automatizuotas
195
AFLP minusai (2)
1. dominuojantys žymenys;
| 2. sunku vertinti
196
VNTR iššifravimas
varijuojantis pasikartojančių tandemų kiekis
197
kas įeina į VNTR?
minisatelitai ir mikrosatelitai
198
kartotinio vnt ilgis minisatelituose
10-70 bp
199
kartotinio vnt ilgis mikrosatelituose
mažiau nei 10 bp
200
kiek kartų VNTR pasikartoja kartotiniai vienetai?
5-50
201
minisatelitų ilgis
500-3000 bp
202
kur randami minisatelitai? (2)
telomerose, centromerose
203
kur dažniausiai identifikuojami minisatelitai?
didelės konc. denatūruojančiuose poliakrilamido geliuose
204
minisatelitų pliusai
naudojami kaip pirštų antspaudai (identifikavimas, tėvystė)
205
minisatelitų minusai (2)
1. tiriami keliuose lokusuose vienu metu, todėl kartais negalima nustatyti, kuriam lokusui priklauso;
2. reikia geros DNR kokybės
206
kaip konstruojami mikrosatelitų pradmenys?
kad būtų komplementarūs šoninėms sekoms, esančioms už pasikatojančio vnt iš abiejų pusių
207
kur mikrosatelitai būna polimorfiniai?
mažose pop., nykstančiose rūšyse
208
mikrosatelitinio prod. ilgis
75-300 bp
209
mikrosatelitų pliusai (8)
1. kodominantinis paveldėjimas;
2. išsibarstymas po genomą;
3. aukštas polimorfizmo lygis;
4. daug alelių;
5. aukštas heterozigotiškumo lygis;
6. aukštas mutacijų tempas;
7. automatizuota analizė;
8. daugkartinis naudojimas
210
mikrosatelitų minusai (4)
1. nuliniai aleliai;
2. klaidingai nustatomos heterozigotos;
3. per daug alelių;
4. specifiški rūšiai
211
ko dažniausiai daugiau: transversijų ar tranzicijų?
transversijų
212
kokie gali būti SNP pagal selektyvumą?
neutralūs arba turėti fenotipinį efektą
213
kuo dažniausiai paremtos genotipavimo metodikos?
sekoskaita
214
SNP pranašumai, lyginant su mikrosatelitais (2)
1. lengviau standartizuoti rez. tarp laboratorijų;
| 2. galima tirti labai degradavusias DNR
215
SNP trūkumai, lyginant su mikrosatelitais (2)
ne toks greitas; negalima atlikti su daug individų
216
kur taikomas NKS? (5)
1. DNR sekvenavimui;
2. transkriptomikoje;
3. epigenomikoje;
4. metagenomikoje;
5. DNR-baltymų ryšių tyrimuose
217
genų dreifas - tai...
atsitiktiniai alelių dažnio svyravimai dėl imties paklaidos
218
kur labai dažnai pasireiškia genų dreifas?
mažose pop.
219
genų dreifo padariniai (4)
1. alelių dažniai svyruoja;
2. alelių dažnių svyravimo priklauso nuo imties dydžio;
3. alelio fiksacija arba praradimas;
4. genetinė diferenciacija tarp skirtingų subpop.
220
8 Raito0Fišerio genų dreifo modelio prielaidos
1. diskrečios kartos;
2. vienodas abiejų lyčių ind. sk.;
3. vienoda kryžminimosi tikimybė;
4. per kartas lieka pastovus ind. sk.;
5. atsitiktinis kryžminimasis;
6. nevyksta migracija;
7. nėra mutacijų;
8. neveikia gamtinė atranka
221
nuo ko priklauso alelio fiksacija ar praradimas?
nuo imties dydžio
222
koks pradinis alelio dažnis reiškia alelio praradimą?
mažiau nei 0,5
223
koks pradinis alelio dažnis reiškia alelio fiksavimą?
daugiau nei 0,5
224
kas, jei pradinis alelio dažnis lygus 0,5?
dažnio pokyčio kryptis yra atsitiktinė
225
kam lygi alelio fiksacijos tikimybė?
pradiniam dažniui
226
kam lygi alelio praradimo tikimybė?
1-pradinis alelio dažnis
227
genų dreifo padariniai gamtinėse pop. (2)
1. alelių dažnių pokytis;
| 2. genetinės įvairovės praradimas (per alelių sk. lokuse ir heterozigotiškumo mažėjimą)
228
kaip genų dreifas veikia mažas pop.?
1. labiau :D
2. iš kartos į kartą didesnis alelių dažnių svyravimas;
3. didesnė gen. įvairovės praradimo tikimybė
229
kada alelių dažnių svyravimo iš kartos į kartą standartinė paklaida bus didžiausia?
kai alelių dažniai lygūs
230
kas yra svarbiausia evoliucinė jėga, nulemianti naujai atsiradusios mutacijos likimą?
genų dreifas
231
apie ką yra 2 neutralumo teorijos prognozės?
1. polimorfizmo kiekį, esantį vienos rūšies pop. sekose;
| 2. rūšies tirtų sekų divergencijos mastą ir dažnį
232
divergencija - tai...
fiksuoti genetiniai skirtumai, akumuliuoti tarp 2 visiškai izoliuotų linijų, kurios buvo identiškos prieš atsiskiriant nuo benro protėvio
233
kodėl mutacijos fiksacijos laikas varijuoja?
nes genų dreifas yra stochastinis (atsitiktinis) procesas
234
koks yra fiksacijos laiko standartinis nuokrypis?
2,15Ne kartų
235
dėl ko populiacijoje palaikomas polimorfizmas?
nes mutacijos segreguoja prieš fiksaciją/praradimą
236
3 atvejai, kurių metu pagal neutralumo teoriją atsiranda polimorfizmas
1. kai stiprus didelio naujos mutacijos dažnio genų dreifas;
2. kai nedažnos mutacijos - dėl didelio Ne, kuris ilgina mutacijos gyvavimo laiką;
3. dėl vidutinių mutacijų ir genų dreifo lygio
237
dėl ko atsiranda genetinė divergencija?
dėl pakaitų, kurios bėgant laikui sukaupiamos abiejose DNR sekose
238
kodėl kiekviena seka skiriasi nuo jos protėvio ir seserinės sekos?
nes kiekviena fiksuota mutacija sukelia sekoje bazių porų pokyčius atsitiktinėse nukleotidų pozicijose
239
pradinis naujos mutacijos dažnis diploidiniuose ind. arba esant genų dreifui naujo neutralaus alelio fiksavimo dažnis
1/2N
240
kam lygi neutralios mutacijos fiksacijos tikimybė per kiekvieną generaciją?
mutacijos dažniui
241
3 naujų mutacijų tipai beveik neutralioje teorijoje
1. neutralios;
2. veikiamos stiprios teigiamos/neigiamos gamtinės atrankos;
3. silpnai veikiamos gamt. atrankos lyginant su genų dreifu
242
nuo ko priklauso beveik neutralių mutacijų dažnis?
nuo Ne
243
koks Ne s koef. bus, kai atranka neigiama ir veikia prieš žalingą alelį?
neigiamas
244
koks Ne s koef. bus, kaip gamtinė atranka lemia mutacijos fiksavimo tikimybę?
teigiamas ir dedelis
245
2 neutralumo teorijos punktai
1. mutacijos fiksavimo tikimybė priklauso tik nuo Ne;
| 2. mutavimo dažnis NEPRIKLAUSO nuo Ne ir gamtinės atrankos
246
kas yra mažiausias genomo vnt?
homologinė nukleotido vieta
247
kas yra nukleotidų polimorfizmas?
genetinis kintamumas, pasireiškiantis DNR sekų, turinčių skirtingus nukleotidus, buvimu
248
kas žymima pi?
heterozigotiškumo matas, nukleotidų įvairovė (vidutinis porinis skirtumas)
249
apskaičiuojant nukleotidų įvairovę, kuo dažniau tam tikra seka pasikartos, tuo...
dažniau ji bus įtraukta į porinį palyginimą
250
kaip keisis p atstumas laikui bėgant tarp sekų iš visiškai skirtingų pop.?
didės
251
prisotinimas - tai...
reiškinys, nusakantis, kada DNR sekų divergencija sulėtėja ir pasiekia plato, net jei laikas nuo divergencijos pradžios didėja
252
kodėl yra pasiekiamas prisotinimas?
nes atsiranda daug pakaitų toje pačioje nukleotidų pozicijoje (MULTIPLE HITS)
253
nukleotidų pakaitų modelių pvz (5)
1. F81;
2. K80;
3. HKY;
4. SYM;
5. GTR
254
ką sako molekulinio laikrodžio hipotezė?
divergencija vyksta pastoviu greičiu taip, kad jos mastas tarp rūšių yra proporcingas rūšių atsiskyrimo laikui
255
pagr. molek. laikrodžio panaudojimas
nustatyti divergencijos tarp rūšių laiką
256
mutacijos pagal kryptį (2)
1. tiesioginės;
| 2. grįžtamosios
257
kokio tipo mutacijos dažniausiai būna grįžtamos?
taškinės
258
persimoniškai informatyvios vietos - tai...
tokios vietos, kurios imtyje turi mažiausiai 2 skirtingus nukleotidus ir mažiausiai 2 nukleot. pasitaiko 2 ar daugiau kartų
259
kam dažniausiai būdingas horizontalus genų perdavimas?
prokariotams
260
kurie pokyčiai veikia lėčiausiai: dėl mutacijų, dėl genų srauto ar dėl genų dreifo?
dėl mutacijų
261
koks pelių kailio sp. mutacijų lokuso ilgis?
1000 bp
262
nuo ko priklauso absoliutus mutacijų sk. per kartą? (3)
1. mutavimo dažnio;
2. genomo dydžio;
3. pop. dydžio
263
kuri, mtDNR ar nucDNR, mutuoja dažniau?
mtDNR
264
kas lemia mikrosatelitų mutacijas?
1. neteisinga replikacija;
| 2. rekombinacija
265
3 alelių mutavimo modeliai
1. begalinis
2. k
3. laipsniškas
266
2 DNR mutavimo modeliai
1. neribotų vietų;
| 2. ribotų vietų
267
kieno mutavimas aprašomas pagal laipsnišką mutavimo modelį?
mikrosatelitų
268
homoplazminiai aleliai - tai...
aleliai, identiški pagal sandarą, skirtingi pagal kilmę
269
kur vyksta mutacija pagal neribotų vietų modelį?
kiekvieną kartą skirtingoje vietoje
270
kur vyksta mutacija pagal ribotų vietų modelį?
toje pačioje vietoje daugiau nei 1 kartą
271
kodėl natūraliose pop. baltymus koduojančiuose DNR regionuose mutacijos nepasiekia didelio dažnio?
neleidžia gamtinė atranka
272
kas labiau kinta dėl mutacijų: egzonai ar intronai?
intronai
273
kurios, mt ar nuc, DNR genetinė įvairovė dėl butelio kaklelio efekto prarandama greičiau ir kodėl?
mtDNR, nes jos Ne mažesnė
274
kuo didesnis mutavimo dažnis, tuo...
greičiau atsistatys genetinė įvairovė
275
neatsitiktinio kryžminimo skirstymas (3)
1. teigiamas;
2. neigiamas;
3. inbrydingas
276
teigiamo neatsitiktinio kryžminimosi padariniai (3)
1. homozigotiškumo didėjimas;
2. heterozigotiškumo mažėjimas;
3. keičia genotipų dažnius nekeisdamas alelių dažnių
277
ar neigiamas pasirinktinis kryžminimasis gali keisti alelių dažnius?
taip
278
inbrydingo padarinys
pop. homozigotiškumas padidėja visuose lokusuose
279
ar inbrydingas gali keisti alelių dažnį?
ne
280
ką parodo inbrydingo koef. F?
mastą lyginant su atsitiktiniu kryžmimusi
281
inbredinė depresija - tai...
tinkamumo sumažėjimas, sąlygotas inbrydingo arba genų dreifo
282
ką skatina gamtinė atranka? (2)
tarpsubpopuliacinio kintamumo padidėjimą, diferenciacijos tarp subpopuliacijų mažėjimą
283
pusiausvyrinio žalingo alelio dažnis bus tuo didesnis, kuo...
alelis labiau resecyvus
284
diferencija mažėja, kai didėja...
Ne ir m (migravusių ind. dalis)
285
ką reiškia Mn<1?
nereikšmingas migracijos mastas, genų dreifas>genų srautas
286
ką reiškia Nm>4?
didelė migracija
287
jei genų srautas mažo laipsnio, ...
subpop. turi daug privačių alelių, vyksta didelė gen. diferenciacija
288
kuo labiau skiriasi s ir m, tuo...
didesnė diferenciacija
289
kryptinė atranka gali būti mažiau efektyvi dėl...
geno dreifo
290
panmiksinė pop. - tai...
pop., kurioje bet kuris ind. gali laisvai kryžmintis su bet kuriuo kitu tos pop. priešingos lyties ind.
291
genų srautas - tai...
genų judėjimas iš vienų subpop. į kitas vykstant migracijai
292
genų srauto padariniai (2)
1. mažina diferenciaciją;
| 2. didina vidupop. kintamumą
293
kam naudojamas Rst?
mikrosatelitams
294
ką matuoja D koef.?
nuokrypį nuo bendros diferenciacijos
295
ką lemia izoliacija dėl geo. atstumo?
1. heteroz. sumažėjimą (gen. kintamumo saugojimas);
2. Ne padidėjimą;
3. inbrydingą
296
izoliatų laužymas - tai...
heteroz. padidėjimas dėl atsitiktinio kryžminimosi metapop.
297
žemyno-salos modelio atveju pasireiškiantis reiškinys
atsitiktinis kryžm. (neveikia gamt. atranka, dreifas, mutacijos)
