Exam final 1 Flashcards

Question

Vrai ou Faux Les virus ont généralement, par la nature chimique de leur capside, un pI plus élevé que chez les bactéries et plus variable

Answer 1

 Réfère à la concentration d’ions positifs et négatifs d’une solution  La force ionique de l'air dans un sol insaturé en eau augmente la probabilité de fixation de la cellule aux colloïdes → la mobilité diminue  Après une pluie, la force ionique diminue et le débit d'eau augmente → les deux effets améliorent le transport microbien (rinçage)

Answer 2

* Ions monovalents (Ex. Na+) modifient structure physique de l’argile et mène à des sols compacts avec peu de mouvement d’eau * Ions divalents (Ex. Mg2+) mènent à des sols avec des agrégats et favorise les espaces poreux, + de mouvement d’eau

Answer 3

une diminution de la mobilité

Answer 4

favorise l'attachement des bactéries

Answer 5

peu d’attachement des bactéries

Answer 6

 Texture du sol  Structure  Porosité  Teneur en eau

Answer 7

protection contre la contamination bactérienne d’un site d’intérêt par la filtration et l’adhésion via des interactions hydrophobe à l’interface air-eau

Answer 8

 Advection: déplacement d'une masse d‘eau et de ses constituants. C’est le 1er responsable du transport microbien!  Dispersion: Résultat combiné du mélange mécanique et des diffusions moléculaires.

Answer 9

Résulte de la tortuosité (zigzag) du trajet et des différences de vitesse dans différents pores (linéaire vs. multiples obstacles)

Answer 10

 Définie comme étant la facilité d’un fluide à être transporter dans le sol  Conductivité grande > 4 cm/h  Conductivité faible < 0.4 cm/h

Answer 11

-> Le sable a une plus grande conductivité hydraulique que l’argile comme il contient des pores plus larges permettant à l’eau de circuler plus librement -> Les fissures, chenaux, craques présentes dans les sols font augmenter la conductivité hydraulique de ces derniers -> Les pratiques agriculturales, en changeant la structure et la chimie des sols, peuvent également affecter la conductivité hydraulique

Answer 12

 Basé sur des indicateurs fécaux généraux  Mesurer la pollution fécale totale Limites → Ne fait pas de distinction entre les sources

Answer 13

Utilisé pour faire la distinction entre les sources humaines et non humaines de contamination fécale

Answer 14

 Sources ponctuelles facilement identifiables, par ex. eaux usées brutes et traitées  Sources diffuses dans l'environnement et difficiles à identifier, par ex. ruissellement urbain, faune

Answer 15

Identification à la chaîne de chaque souche bactérienne cultivées à partir de diverses sources fécales et d'échantillons d’eau ➢ Comparaison ultérieure à la «bibliothèque» de souches bactériennes d'échantillons fécaux connus

Answer 16

* Nécessitent le développement d’indices biochimiques (phénotypiques) et de leurs empreintes digitales moléculaires (génotypiques) * Supposent que certaines souches de bactéries fécales sont associées à des animaux hôtes spécifiques * Chères et nécessitent du personnel expérimenté et du temps * Peut être temporellement et géographiquement spécifique

Answer 17

 Basé sur la détection d'un marqueur spécifique associé à un hôte spécifique ou d'un gène cible * Par ex. PCR, marqueur spécifique aux bactéroïdes  La cible du gène doit être spécifique à une population hôte (ex. humaine, porcine, bovine, etc) * En revanche, doit souvent être calibrée pour tenir compte de la variabilité du marqueur au sein d’une population donnée  Généralement plus rapide que les méthodes dépendantes de bases de données

Answer 18

-Méthode dépendante des bases de données -Méthode indépendante des bases de données

Answer 19

-Méthode indépendante des bases de données -L’utilisation du qPCR est une méthode assez nouvelle pour faire du traçage de sources microbienne !

Answer 20

Bactéries anaérobies Gram négatif, non sporulées, non mobiles en forme de bâtonnets

Answer 21

* Abondant dans les excréments humains et animaux * Incapable de croître dans l'environnement * Degré élevé de spécificité de l'hôte

Answer 22

-Spécificité -Distribution dans la population de l’hôte (sensibilité du marqueur) -Stabilité temporelle dans l’hôte -Stabilité géographique -Persistance dans l’environnement -Uniformité -Évaluation quantitative -Pertinence p/r aux paramètres réglementaires ou Indicateur fécal bactérien (FIB)

Answer 23

 Coordination de l'expression génique au sein d'une seule population  Coordination de l'expression génique parmi les populations non apparentées  Évitement des réponses de défense de l'hôte  Coordination de l'expression des gènes de virulence  Inhibition de l’expression génique d’un concurrent  Inhibition ou stimulation de la colonisation de l'hôte

Answer 24

 Signalisation intraspécifique - Communication au sein d'une seule population  Signalisation interspécifique - Communication entre populations bactériennes  Signalisation inter-domaine - Communication entre bactéries et autres organismes

Answer 25

 Aptitude d'un micro-organisme (bactérie, archée, microchampignon, virus) à:  Détecter et réagir à des signaux moléculaires environnementaux indiquant la densité de population

Answer 26

des récepteurs protéiques intracellulaires qui reconnaissent les séquences d'ADN spécifiques des gènes et régulent leur expression.

Answer 27

 À faible densité de population, la concentration de ces signaux moléculaires est très faible, peu de molécules-signaux sont détectées avant d’être dégradées ou localement éliminées par diffusion; → le mode de fonctionnement (ou phénotype) des cellules reste donc stable, de type « individualiste »  À haute densité de population, la concentration locale de ces signaux molécules fait basculer les cellules vers un autre mode de fonctionnement (ou phénotype), ce qui leur permet de coordonner leur comportement collectif: → Phénotype dit « social » ou « coopératif

Answer 28

-Formation de spores par B.subtilis, déclencé par la limitation nutritionnelle -La cellule est désavantagé si elle s'implique dans la formation de spores en réponse à ce qui finalement est une brève fluctuation de la disponibilité des nutriments

Answer 29

*À l’opposé du quorum sensing se trouvent les signaux à courte portée qui nécessite un contact direct entre les cellules individuelle pour l’échange d’information * Cela peut se faire entre deux bactéries côtes-à-côtes,Peut se faire de manière intracellulaire, au sein de la bactérie, Peut se faire par des protéines qui vont inhibées ou dire qu’il faut mourir (créer l’apoptose).

Answer 30

Bactéries à Gram - Bioluminescence Détection du quorum chez Agrobacterium tumefaciens Bactérie Gram + Signaux universels (auto-inducteur 2&3) Muropeptides bactériens

Answer 31

 N-acyl homosérine lactone (HSL)  Ce sont les signaux moléculaires les mieux étudiés chez les Gram-  Se compose d'un groupement cyclique homosérine lactone connecté à une chaîne latérale d'AG  Spécificité du signal déterminée par la longueur de la chaîne latérale et les types / nombre de modifications de la chaîne latérale

Answer 32

-Production de lumière par certains organismes -Étudié chez la seiche -Mais, cellules productrices de lumière, dans les photophores, : ce sont des bactéries symbiotiques de l’espèce Vibrio fischeri, capables de bioluminescence → production de lumière sous contrôle du système neuroendocrinien de l’hôte

Answer 33

-Pathogène végétal omniprésent, très répandue dans le sol, et notamment dans la partie de sol colonisée par les racines des plantes - Large gamme d'hôtes (> 140 genres de plantes) - Cause la maladie de la galle du collet - Développement de galles, excroissances ressemblant à des tumeurs, en raison d'une division cellulaire excessive au site d'infection - Gènes d'induction tumorale trouvés sur un plasmide Ti de 180 kb -Une région d'ADN (ADN-T) est transférée à la plante en réponse aux signaux de la plante après la blessure

Answer 34

- N’utilise pas de N-acyl homosérine lactones (HSL) - L’hypothèse actuelle est que les bactéries à Gram positif n'ont pas de membrane externe poreuse et qu'une couche épaisse de peptidoglycane peut restreindre la diffusion des signaux HSL - Certaines bactéries utilisent des γ-butyrolactones - similaires aux HSL - La plupart utilisent de petits peptides, de petits acides aminés, comme principales molécules de communication

Answer 35

* Autoinducteur-2 (AI-2): - Famille de molécules de diester de furanosylborate -Produit par > 55 bactéries Gram-positives et Gram-négatives -Tous contiennent le gène de la synthase, luxS * Autoinducteur-3 (AI-3): - Chimiquement distinct de AI-2 - Sa structure exacte n'est pas encore connue

Answer 36

- Fragments formés par digestion enzymatique de la couche de peptidoglycane des bactéries - Certaines bactéries utilisent la détection des muropeptides pour signaler la présence d'antibiotiques dégradant la paroi cellulaire - Les bactéries qui forment des spores utilisent les muropeptides comme germinants pour déclencher la croissance végétative - Les eucaryotes peuvent utiliser des muropeptides pour détecter la présence d'une bactérie dans les tissus de l'hôte

Answer 37

 Exploitation des voies de transduction du signal par des composés de signalisation d'un organisme pour en modifier le comportement ou pour induire des changements dans la transcription génique d'un organisme d'un autre règne

Answer 38

-Capacité des bactéries à écouter leur hôte en répondant aux signaux de l'hôte - Interférence de la signalisation bactérienne via des signaux parasites produits par l'hôte (diminution de l’efficacité de communication entre bactéries) - Reconnaissance des signaux bactériens par l'hôte entraînant une modification de l'expression génique de l'hôte → requis pour une réponse immunitaire

Answer 39

-Décomposer les molécules de signal ou interférer autrement avec la signalisation -pour contrôler, limiter ou stopper ces activités microbiennes

Answer 40

-Aquaculture -Traitement de l'eau -Médecine -

Answer 41

quorum sensing

Answer 42

quorum sensing

Answer 43

quorum quenching

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