Exam Final

Question 1

Quelle est l’utilité du PCR simple?

Answer 1

Mettre en évidence une portion du gène cible

Question 2

Quelles informations peux-t-on retirer d’un PCR simple?

Answer 2

Présence ou non du gène

Estimation du poids moléculaire

Question 3

Quelle est l’utilité du PCR-RFLP?

Answer 3

Détecter la présence d’une mutation

Question 4

Quel réactif est essentiel au PCR-RFLP?

Answer 4

Enzymes de restriction spécifiques à la mutation recherchée

Question 5

Quel facteur est très limitant pour la technique du PCR-RFLP?

Answer 5

La mutation doit absolument créer ou enlever un site de restriction sur le gène

Question 6

Quelles sont les caractéristiques des séquences reconnues par les enzymes de restriction?

Answer 6

Ce sont des séquences palindromiques de 4 à 8 nt

Question 7

Quelles sont les 2 types de coupures possibles pour une enzyme de restriction?

Answer 7

Bouts francs (blunt ends) : au même niveau sur les deux brins
Bouts cohésifs (sticky ends) : coupures décalées

Question 8

Quel est l’avantage principal du PCR en temps réel?

Answer 8

C’est une analyse quantitative, on peux évaluer la quantité de copies du gène

Question 9

Quelle sont les particularités des amorces du qPCR?

Answer 9

Il y en a au moins trois dont une possède des fluorochromes qui seront mesurés par l’appareil

Question 10

Pourquoi la fluorescence n’est pas détectable dès le début du qPCR?

Answer 10

Car chaque fluorochrome est lié à un Quencher qui l’inhibe jusqu’a ce qu’il y ait amplification

Question 11

Que peux-t-on mettre en évidence en utilisant plusieurs sondes de couleurs différentes lors du qPCR?

Answer 11

Identification de SNP (single nucleotid polymorphism)

Mutations ponctuelles où un seul nucléotide est changé

Question 12

Quel est le principal avantage du multiplex?

Answer 12

Permet l’amplification de plusieurs séquences différentes à la fois

Question 13

Quelles sont les conditions à respecter pour faire un PCR multiplex?

Answer 13

Les fragments amplifiés doivent être de poids moléculaires différents
Les amorces doivent toutes êtres différentes et non-complémentaires

Question 14

Que mesure le RT-PCR?

Answer 14

L’expression des gènes

Question 15

À partir de quoi fait-on un RT-PCR?

Answer 15

ARNm

Question 16

Quelle enzyme est essentielle au RT-PCR et d’où vient-elle?

Answer 16

Reverse transcriptase qui vient des rétrovirus

Question 17

Nommez les différents types de PCR

Answer 17

Simple
RFLP ( restriction fragment lenght polymorphism)
En temps réel
Multiplex
RT-PCR

Question 18

Définition antigène?

Answer 18

Substance étrangère qui entraîne une réaction immunitaire lorsqu’elle est introduite dans l’organisme

Question 19

Comment nomme-t-on la partie de l’antigène reconnue par l’anticorps?

Answer 19

Épitope

Question 20

V ou F, chaque antigène possède une seule sorte d’épitope

Answer 20

Faux, un antigène peut avoir plusieurs épitopes différents

Question 21

Définition anticorps?

Answer 21

Protéine complexe utilisée par le système immunitaire pour détecter et neutraliser les agents pathogènes de manière spécifique

Question 22

Quelle cellule sécrète les anticorps?

Answer 22

Plasmocytes

Question 23

Comment nomme-t-on la région variable de l’anticorps qui sert à reconnaître les épitopes?

Answer 23

Paratopes

Question 24

Nommez les 2 situations où il peut y avoir une réaction immunitaire croisée

Answer 24

• Si 2 antigènes différents ont des épitopes en commun

- Si 2 épitopes ont une structure chimique semblable

Question 25

Nommez les types d'antigènes et leur définition

Answer 25

- Xenoantigène : Ag étranger à l'espèce - Alloantigène : molécule variable selon les individus d'une même espèce - Autoantigène : Ag du soi, non reconnu par le système immunitaire

Question 26

Quelles sont les 4 techniques de transfert et que transfèrent elles?

Answer 26

Northern blot : ARN Southern blot : ADN Western blot : protéines Eastern blot : lipides

Question 27

Nommez les grandes étapes d'un western blot

Answer 27

``` Préparation de l'échantillon SDS-PAGE Buvardage Blocage (pre hybridation) Hybridation Lavage Révélation des signaux ```

Question 28

Dans un western blot, que doit reconnaître l'anticorps primaire?

Answer 28

La protéine dénaturée et non la protéine native

Question 29

Quelle est la sonde utilisée dans un southern blot?

Answer 29

Un fragment d'ADN auquel on a marqué une base

Question 30

Quel principe physique est utilisé lors de l'étape du transfert d'un southern blot?

Answer 30

Capillarité

Question 31

Quels sont les inconvénients du southern blot?

Answer 31

Long Coûteux Reproductibilité difficile Besoin de bcp d'ADN

Question 32

Le northern blot a les memes étapes que le southern blot sauf une. Laquelle et pourquoi?

Answer 32

La dénaturation car l'ARN est déja simple brin

Question 33

À partir de quelles cellules peux-t-on faire un FISH?

Answer 33

Des cellules en métaphase

Question 34

Que permet de détecter le FISH?

Answer 34

Séquences particulières Oncogènes Translocation et fusion Trisomie

Question 35

Qu'est ce que le séquençage?

Answer 35

Technique permettant de déterminer l'ordre dans lequel se présente les quatres bases de façon successive dans un brin d'ADN ou d'ARN donné

Question 36

La méthode de Sanger utilise quels réactifs?

Answer 36

ADN simple brin et ddNTP

Question 37

Qu'est ce qu'un didésoxyribonucléotide?

Answer 37

C'est un nucléotide dépourvu du groupement OH en 3' donc aucun autre nucléotide peut se lier à cette extrémité

Question 38

Quelles sont les 3 types de mutations?

Answer 38

Génomique Chromosomique Génique ponctuelle

Question 39

Nommez les types de mutations chromosomiques

Answer 39

Duplication Inversion Deletion Translocation

Question 40

Nommez les types de mutations géniques ponctuelles

Answer 40

Non sens Chgmt cadre de lecture Silencieuse Faux sens

Question 41

Quelles sont les conditions pour qu'un allèle soit considéré polymorphique?

Answer 41

Plus d'un type d'allèle Fréquence de chacun des allèles doit être d'au moins 1% 2% de la population doit être hétérozygote

Question 42

Par quelle(s) méthode(s) peut on détecter les SNP (single nucleotid polymorphism)?

Answer 42

Séquençage | qPCR avec 2 sondes

Question 43

Nommez les caractéristiques d'un STR (short tandem repeat)

Answer 43

``` 1 à 7 nucléotides Se répète de 5 à 100 fois (moyenne 12 à 40) Très nombreux et polymorphes Répartis uniformément dans le génome Multi-allélique pour un même locus ```