Examen 1 Flashcards
(113 cards)
Utilité du dosage enzymatique en clinique
Indicatif de fonction des organes (foie, pancréas, muscles, etc)
Structure générale des acides aminés
Groupe NH3 (amine basique en N-ter)
Groupe carboxylique (acide en C-Ter)
Groupe R (variable, spécifique à a.a)
Quelle est la nature de liaison peptidique
Covalente, entre le groupe C-Ter d’un a.a avec le N-ter de l’autre a.a.
Quelles sont les utilités du groupe R des a.a ?
Détermine la structure secondaire tertiaire
Reconnaissance du substrat
Les acides aminés non polaires
Gly
Ala
Val
Leu
Met
IsoL
Les acides aminés aromatiques
Phe
Tyr
Tryp
Les acides aminés polaires mais non-chargés
Ser
Thr
Cys
Pro
Asparagine
Glutamine
Les acides aminés chargés (+)
Lys
Arg
His
Les acides aminés chargés (-)
Aspartate
Glutamate
Les niveaux de structures des protéines
- Primaire (chaine linéaire)
- Secondaire (hélice alpha et feuillet beta)
- Tertiaire (repliement 3D)
- Quaternaire (protéines constituées d’un assemblage de plusieurs sous-unités)
Interactions chimiques menant aux structures sec-ter-quat des protéines ?
- effet hydrophobe (le + important dans forme ter)
- liaisons ioniques
- pont H (complémentarité électronique)
- pont S-S
V ou F. Seule la structure quaternaire est réversible
F. La structure tertiaire et quaternaire sont réversibles, très important pour réguler l’activité enzymatique
Quelles sont les différentes façons qu’une protéine peut se dénaturer / perdre sa fonction ?
- haute T
- variation de pH
- grande [sel]
- solvant organique
Note : la [substrat] peut faire “varier” l’activité
Est-ce que toutes les enzymes oxydo-réductase utilise le NAD ou NADPH comme donneur d’é ?
While many do, some enzymes use other cofactors like FAD, FMN, cytochromes, or quinones, depending on the specific reaction
Rôle principal d’une enzyme
Augmenter la vitesse des réactions chimiques (catalyseur) en transformant le réactifs (substrat) en produit, sans changer de structure (réutilisable), en diminuant l’énergie de rxn
C’est quoi l’énergie d’activation dans une rxn chimique ?
énergie (ex chaleur) permettant aux molécules de réactifs de briser leurs liaisons initiales pour en créer de nouvelles
Degrés de spécificité d’une enzyme
- Absolue
- Quelques substrats
- Faible (Préférence de substrat)
Vrai ou faux, le site actif d’une protéine est spécifique à un substrat seulement
Faux (pas nécessairement) dans el sens où le site actif peut être extrêmement spécifique à un substrat (spécificité absolue), mais dans d’autres cas, il peut interagir avec une gamme de substrats. (ex trypsine
pourquoi par ex la trypsine n’a pas de spécificité dite absolue ?
la trypsine n’est pas limitée à une seule protéine spécifique comme substrat. Toute protéine ou polypeptide qui contient des résidus de lysine ou d’arginine peut être une cible pour la trypsine
Les activités catalytiques des enzymes peuvent varier en réponse à la concentration de substances autres que leurs substrats. Quels sont les avantages et inconvénients ?
- régulation fine (et rétro-contrôle)
- adaptabilités à l’environnement
- vulnérabilités aux perturbations
- risque de régulation aberrante
- cout energétique
De quelles façons le site actif est spécifique a une enzyme ? (Quels types de complementarité)
- complémentarité géométrique (forme physique complémentaire)
- complémentarité électronique (groupes chimiques qui attirent-interagissent, ex. pont H, pont S-S, groupe R chargés, groupe R ionique…)
Qu’est-ce qu’un cofacteur ?
Une substance (ion métallique ou coenzyme (petite molécule organique ex. vitamine) qui permettent le fonctionnement du site actif
Spécifiques aux apoenzymes :
Apoenzyme (inactive) + Cofacteur (ou coenzyme) = Holoenzyme (active)
Explique en quoi la chaleur dénature les protéines
Les ponts H deviennent déséquilibrés et se rompt (chaleur provoque mouvement des molécules jusqu’à certaine limite)
Explique en quoi un pH trop acide dénature les protéines
Les H+ lie le C-Ter des protéines donc l’attraction entre le C-Ter et N-Ter des protéines dans la structure tertiaire se rompt