Examen 1

Question 1

Définir l’autoécologie (écophysiologie).

Answer 1

Une espèce vivante avec son environnement. (conditions de subsistance et de vie idéale, les capacités de survie et de résistance, ses habitudes alimentaires, etc.)

Question 2

Définir la dynamique des populations (démoécologie).

Answer 2

Étude de l’évolution et de la structure des populations dans l’espace et dans le temps.

Question 3

Définir synécologie.

Answer 3

Étude des rapports entre les diverses espèces d’un même ensemble. C’est l’étude des écosystèmes.

Question 4

Définir biocénose.

Answer 4

Désigne la totalité des êtres vivants qui sont présents dans un écosystème donné. Le terme “communauté” est aussi employé.

Question 5

Définir biodiversité.

Answer 5

Désigne la richesse des espèces vivantes qui peuplent la biosphère dans son ensemble ou dans un écosystème en particulier.

Question 6

Définir biosphère.

Answer 6

Définit la région de la planète dans laquelle la vie est possible en permanence et qui renferme des êtres vivants. Se divise en 3 compartiments : lithosphère, hydrosphère et atmosphère.

Question 7

Définir biotope.

Answer 7

Composante d’un écosystème constitué par ses dimensions physico-chimiques et spatiales.

Question 8

Définir chaîne alimentaire

Answer 8

Terme désignant les relations trophiques qui unissent les organismes de niveau trophique différent à l’intérieur d’une même communauté (chaîne trophique).

Question 9

Définir cycles biogéochimiques

Answer 9

Processus qui caractérise la transformation de la matière et la circulation des éléments dans les écosystèmes et entre les divers compartiments de la biosphère.

Question 10

Définir facteurs abiotiques.

Answer 10

Désigne les facteurs écologiques de nature physico-chimique, dons indépendants des êtres vivants (paramètre non biologiques. Ex : température et hygrométrie.

Question 11

Définir facteurs biotiques

Answer 11

Ensemble des facteurs écologiques liés aux êtres vivnats : compétition, prédation, parasitisme, mutualisme par exemple.

Question 12

Définir habitat.

Answer 12

Lieu où vit l’espèce et son environnement immédiat à la fois abiotique et biotique.

Question 13

Définir niche écologique.

Answer 13

L’ensemble des paramètres qui caractérisent les exigences écologiques (climatiques, alimentaires, reproductives, etc.) propres à une espèce vivante et qui la différencie des espèces voisines d’un même peuplement. C’est la fonction d’une espèce dans un écosystème, sa profession

Question 14

Définir pollution.

Answer 14

Modification défavorable du milieu naturel causée directement ou indirectement par l’action humaine en causant des altérations de divers types.

Question 15

Définir population.

Answer 15

Ensemble des individus appartenant à une même espèce et occupant une même fraction de biotope et qui échangent librement entre eux leurs gènes dans les processus reproductifs

Question 16

Définir l’écologie microbienne.

Answer 16

Étude des microorganismes dans leur environnement

Question 17

Définir la microbiologie de l’environnement et donner des exemples.

Answer 17

• S’intéresse aux processus microbiens globaux (et non au microorganismes comme tels).
  Ex : Traitement des déchets, fertilisation des sols, récupération des métaux, contrôle des insectes, production d’aliments.

Question 18

Durant la Terre primitive, que contenait les océans (chimie) ?

Answer 18

H2S, Fe2+, métaux lourd

Question 19

En quoi consiste l’expérience de Miller ?

Answer 19

Reproduire les conditions de la Terre primitive. En mimant les gaz présents dans l’atmosphère à ce moment, on veut synthétiser les 22 acides aminés, des biomolécules et des polymères.

Question 20

Pourquoi l’ARN serait le dernier ancêtre commun ?

Answer 20

L’ARN est : thermorésistant, autoréplication, activité catalytique, compatible avec environnement fer/soufre

Question 21

Nommez deux avantages de l’encapsulation (membrane).

Answer 21

• Protection physique

- Rétention et concentration de composés et de macromolécules.

Question 22

Qui suis-je?

Bactérie phototrophe filamenteuse anoxigénique qui emprisonnent les sédiments

Answer 22

Stromatolites

Question 23

Qu’est-ce que la panspermie ?

Answer 23

Selon cette théorie, la vie sur Terre serait venue d’ailleurs (extrémophiles).

Question 24

Vrai ou faux.

La source d’énergie primitive serait le H2 provenant de la réaction entre le FeS et le H2S.

Answer 24

Vrai

Question 25

Qu'est ce qui a permit d'avoir de l'oxygène dans l'atmosphère ?

Answer 25

L'oxygène produit par les cyanobactéries provenant de la photosynthèse oxygénique. Ils utilisaient le H2O plus abondant au lieu du H2.

Question 26

Nommez deux conséquences de l'oxygène dans l'atmosphère.

Answer 26

- Métabolisme basé sur l'oxygène beaucoup plus performant ce qui amène une prolifération des espèces et de leur nombre. - Amène l'apparition de la couche d'ozone ce qui a permis l'apparition de la vie sur la surface de la Terre.

Question 27

Qu'est-ce qui est différent entre l'écologie microbienne et la microbiologie de l'environnement ?

Answer 27

Microbiologie de l'environnement ne s'intéresse pas directement aux microorganismes comme tels ni à leur place dans l'environnement. Elle s'intéresse aux processus microbiens globaux.

Question 28

Qu'est-ce que le principe d'incertitude d'Heisenberg ?

Answer 28

À l'échelle microscopique, l'action de mesurer un objet affecte l'objet et peut même le modifier.

Question 29

Vrai ou faux. | L'analyse faite sur un échantillon peut être généralisée à l'environnement.

Answer 29

Faux.

Question 30

Vrai ou faux. L'échantillonnage, les manipulations et les mesures n'introduisent pas tous des biais lors de l'interprétation des résultats.

Answer 30

Faux.

Question 31

Vrai ou faux. Lorsqu'on atteint un plateau, on atteint le max d'espèces avec la méthode utilisée. On a pas tous les espèces dans l'environnement.

Answer 31

Vrai.

Question 32

Pour avoir des résultats fiables, on veut qu'ils soient entre : a) LID (limite instrumentale de détection b) LDM (limite de détection de la méthode) c) LQM (limite de quantification de la méthode) d) LL (limite de linéarité)

Answer 32

entre c) et d)

Question 33

Que permet l'analyse de l'environnement (2) ?

Answer 33

- Permet une évaluation globale de l'activité d'une communauté microbienne donnée. - Permet la conception de milieu d'enrichissement.

Question 34

Quel antibiotique prometteur a été trouvé avec iShips et comment agit-il ?

Answer 34

Teixobactin : efficace contre les bactéries Gram+ et les mycobactéries. Il se lie à deux précurseurs de la paroi cellulaire (peptidoglycane et teichoic acid). - Incapable de générer des bactéries résistantes à cet antibiotique.

Question 35

Nommez une solution alternative aux microorganismes non cultivables.

Answer 35

Étude de l'ADN.

Question 36

Nommez trois limites à la microscopie.

Answer 36

1- limite de résolution (petite bactérie) 2- difficulté à distinguer (mort-vivant/cell.-matière) 3- Pas d'évaluation de la diversité

Question 37

Nommez des paramètres pouvant influencer l'hybridation d'une amorce/sonde (4).

Answer 37

- Son niveau de similarité avec la cible - les concentrations en ions - température - type de fixation de l'échantillon

Question 38

Vrai ou faux. | Avec la méthode FISH, il n'est pas nécessaire de connaître la séquence de l'ARNr 16S.

Answer 38

Faux.

Question 39

Définir ectosymbiote et endosymbiote.

Answer 39

ce sont deux type de contact (ne définit pas la nature de l'interaction. - Ectosymbiote : interaction entre deux microorganismes - endosymbiote : organisme vivant à l'intérieur d'un autre.

Question 40

Quel est la différence entre une relation positive et une relation négative?

Answer 40

- Relation positive : permet l'optimisation des ressources - Relation négative : permet le contrôle de l'utilisation des ressources disponibles en régulant les densités de populations.

Question 41

Complétez. - Interaction positive intra-population = _____. - Interaction négative intra-population = _____.

Answer 41

- Interaction positive intra-population = coopération. | - Interaction négative intra-population = compétition.

Question 42

Définir le neutraliste.

Answer 42

- Phénomène rare (voire purement théorique) - Pas d'interaction (faible densité de population, environnement à faible croissance, microorganismes en dormance (spores))

Question 43

Définir le mutualisme.

Answer 43

``` Synonyme : symbiose - relation mutuelle obligatoire - très spécifique - dépendant de l'autre pour vivre - résultat d'une longue co-évolution Ex : Lichens (algue ou cyanobactérie + champignon), Thermite mange le bois mais le digère pas. ```

Question 44

Vrai ou faux. | Certains organismes perdent des gènes car ils vivent en symbiose.

Answer 44

Vrai.

Question 45

Définir la protocoopération.

Answer 45

Synonyme : synergisme - relation mutuelle positive mais pas obligatoire. - Peu spécifique (peu importe le cuisinier c'est la bouffe qui est importante) - viable sans l'interactions

Question 46

Qu'est-ce que le synthophisme (cross-feeding) ?

Answer 46

Association de microorganismes dans laquelle la croissance des microorganismes dépend ou est améliorée par les nutriments, facteurs de croissance ou substrats fournis par les autres microorganismes. Ex : E. coli produit de la putrescine à cause de l'ornithine produit par un autre organisme.

Question 47

Définir le commensalisme.

Answer 47

- Profite de l'autre sans lui nuire. - habituellement pas obligatoire - peu spécifique

Question 48

Le commensalisme survient si une population : ______.

Answer 48

- modifie un environnement avantageusement pour une autre population ou produit un facteur de croissance utilisé par un autre organisme. Ex : E. coli (ana. facultatif) aide Bactérioides (ana strict) / Flavobacterium brens produit cysteine pour L. pneumophila. - permet un changement d'état de la matière (insoluble=soluble) - Permet l'élimination d'un produit toxique - devient l'habitat d'un autre espèce (colonisation du corps humain)

Question 49

Définir le cométabolisme (fait partie du commensalisme).

Answer 49

Transformation d'un composé organique par un microorganisme qui est incapable de l'utiliser comme substrat pour produire de l'énergie ou pour l'utiliser comme éléments de constitution. Ex : Mycobacterium transforme un métabolite qui ne lui est pas utile, mais est utile à quelqu'un d'autre.

Question 50

Définir la compétition.

Answer 50

- Interaction négative entre deux population ou plus

Question 51

Qu'est-ce que le principe d'exclusion compétitive ?

Answer 51

- implique deux populations métaboliquement similaires voulant occuper le même espace - une population gagne, l'autre est exclue. - la vitesse de croissance élevée est un net avantage pour gagner la compétition.

Question 52

Qu'est-ce que la co-existence ?

Answer 52

- Possible lorsque plusieurs facteurs impliqués dans la compétition sont limitants. Ex : A. formosa a besoin de moins de PO4, tandis que C. meneghiniana a besoin de moins de SiO2. Lorsque les deux gaz deviennent limitant, les deux peuvent co-exister.

Question 53

Définir la prédation.

Answer 53

- Interaction de courte durée | - le prédateur mange et digère la proie.

Question 54

Vrai ou faux. | Les rencontres prédateurs-proies peuvent ne pas être au hasard.

Answer 54

Vrai (la chasse)

Question 55

Définir le parasitisme.

Answer 55

Le parasite se nourrit des ressources de l'hôte. - long contact (physique ou métabolique) - très spécifique Ex : des Amibes et L. pneumophila.

Question 56

Complétez. | L'hyperparasite est un ____ d'un ____.

Answer 56

L'hyperparasite est un parasite d'un parasite.

Question 57

Complétez. | Le ____ et le ____ sont plus importants à forte densité et diminuent à faible densité.

Answer 57

Le parasitisme et la prédation.

Question 58

De quelles façons le parasitisme et la prédation permettent le contrôle des populations (3) ?

Answer 58

- impliquent la notion de feedback négatif - permettent de préserver les ressources du milieu - augmentent le recyclage de la matière

Question 59

Définir l'amensalisme.

Answer 59

- Microorganismes produisant une substance toxique (avantage compétitif). - composés possiblement impliqués : Acides organique (lactique, acétique), O2, Alcool, ammoniaque, antibiotique, bactériocine

Question 60

Nommez les deux avantages de l'amensalisme dans un environnement.

Answer 60

- Peut prévenir la colonisation d'un habitat par un second organisme (production acide dans le conduit vaginal) - permet de préserver les ressources d'un habitat.

Question 61

Comment les bactériocines agissent-ils ?

Answer 61

- gènes présents généralement sur plasmides ou transposons - peptides et protéines de bas poids moléculaires - s'insère dans la membrane d'autre microorganismes --> lyse et mort - agissent sur microorganismes apparentés au producteur - action à spectre très restreint.

Question 62

Vrai ou faux. | Les microorganismes ont souvent des interactions non complexes.

Answer 62

Faux.

Question 63

Qu'est-ce qu'un guilde ?

Answer 63

Ensemble de populations (de microorganismes) métaboliquement apparentés

Question 64

La structure d'une communauté dépend de quoi ? (2)

Answer 64

- conditions environnementales (température, pH entre 5 et 9, pression osmotique, O2) - Ressources disponibles ( nutriments...)

Question 65

Complétez. La ____ doit être occupée pour maintenir la _____ de la _____.

Answer 65

La niche doit être occupée pour maintenir la stabilité de la communauté.

Question 66

Complétez. Le nombre de niche détermine la _____ .

Answer 66

Le nombre de niche détermine la diversité.

Question 67

Qu'est-ce que le climax ?

Answer 67

Stade ultime et à l'équilibre d'une succession évolutive de communautés dans un milieu donné

Question 68

Qu'est-ce qu'une succession primaire ?

Answer 68

- succession de communauté dans un environnement initialement vierge (non colonisé) Ex : tube digestif d'un nouveau né roches volcaniques nouvellement formées nouvelle plomberie d'une maison

Question 69

Qu'est-ce qu'une succession secondaire ?

Answer 69

- succession de communauté dans un environnement déjà occupé, mais qui a subi un évènement catastrophique Ex : recolonisation du tube digestif après un traitement aux antibiotiques / la peau après une douche ou un bain / cuir chevelu après un shampoing.

Question 70

Qu'est-ce qu'une succession autogénique ?

Answer 70

- Succession provoquée par l'action des organismes sur l'habitat (organismes provoquent eux-même la succession) Ex : ana facultatif aide ana stricte / formation d'un biofilm

Question 71

Qu'est-ce qu'une succession allogénique ?

Answer 71

- Succession provoqué par des modifications de l'habitat par des facteurs environnementaux. Ex : saisons

Question 72

Qu'est-ce qu'une succession autotrophique ?

Answer 72

- Production de matière organique plus grande que le taux de respiration - accumulation de matière

Question 73

Qu'est-ce qu'une succession hétérotrophique ?

Answer 73

production de matière est plus petite que le taux de respiration - utilisation, consommation de la matière (ne produit pas de matière) Ex : composte

Question 74

Décrivez un organisme de type R.

Answer 74

- grande capacité de reproduction et de croissance - souvent colonisateur initial - reproduction efficace à faible densité de population - dominant si ressources illimitées - subissent variations extrême de population - souvent membre transitoire d'une communauté

Question 75

Décrivez un organisme de type K.

Answer 75

- taux de reproduction faible - adapté à l'environnement - utilisation optimal des ressources - efficace dans un environnement limité en ressources - membre plus stable et permanent d'une communauté.

Question 76

Vrai ou faux. | Les microorganismes de type K sont seulement visible à l'échelle macro.

Answer 76

Faux. À l'échelle macro, tous les microorganismes sont des types r.