EXAMEN Flashcards

(80 cards)

1
Q

¿Qué ciencia ómica estudia el patrón genómico?

A

genomica

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Q

Técnica que permite investigar patrones de expresión genética dentro de los
tejidos preservando al mismo tiempo su contexto espacial.

A

Transcriptómica espacial

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3
Q

Cuáles son los tiipos de sustitución de una variante:

A

Sin sentido y con sentido

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4
Q

¿Cómo se originaron los cromosomas sexuales?

A

Cambios en los rearreglos genómicos autosómicos.

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5
Q

Técnica útil para identificar el efecto de un miRNA sobre una proteína blanco:

A

Western blot

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6
Q

Probabilidad de que 2 hermanos no gemelos compartan algo genético

A
  • 25%, un alelo del papá y otro de la mamá
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7
Q

¿Por qué se puede dar el número de copias?

A

Duplicación segmental, cambia el número de copias de un gen, sin duplicación no se puede cambiar el número de veces que aparece un gen.

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8
Q

¿Un SNV es un SNP?

A

Si, pero un SNP no es un SNV

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9
Q

¿Dónde se produce la mayor fuente de generación de haplotipos?

A

Meiosis

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10
Q

Mayor fuente de generación de haplotipos en el genoma humano:

A

Reproducción sexual (meiosis)

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11
Q

La reproducción sexual es la mayor fuente de generación de este tipo de variaciones genéticas.

A

Haplotipos

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12
Q

¿Cómo se llamó el proyecto que sirvió para identificar haplotipos del genoma humano?

A

Hapmap

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13
Q

¿Qué hace el grupo metilo con la epigenética?

A

Disminuye en la transcripción por lo tanto la transcripción
Hipometilación, es un agente hipometilante (quita metilos)

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14
Q

¿Qué provoca la hipometilación?

A

Incremento en la expresión

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15
Q

Mecanismos por los cuales una proteína mal plegada puede causar enfermedad.

A
  • Pérdida o función de ganancia.
  • Acumulación de beta amiloide
  • Cambio de localización
  • Toxicidad
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16
Q

Tipo de proteína que ayuda al plegamiento de otras proteínas recién formadas en la síntesis de proteínas

A

Chaperona

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17
Q

Nombra un elemento celular que ayuda al plegamiento celular:

A

Pro chaperonas

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18
Q

¿Qué hace CRISPR-cas9?

A

Permite modificar de forma específica cualquier parte del genoma. (Cas9 corta el ADN no de manera general, RNA guía identifica a Cas9. Puede cambiar la expresión de genes, cambiar la secuencia de genes, poner una secuencia en vez de otra).

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19
Q

Primer método de secuenciación:

A

Sanger

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20
Q

Estrategia utilizada para definir si un cambio en un nucleótido es un SNV o SNP:

A

Analizar la región por SANGER en miembros de la misma etnia.

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21
Q

Base de datos donde se ve función de localización:

A

GenSCbi

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22
Q

¿Qué pasa en la espetometría MALDI-TOF?

A

Ioniza la muestra y se mide la velocidad de vuelo de los iones, permite identificar qué proteína es.

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23
Q

Método para determinar el estado de fosforilación de una proteína:

A

Western Blot

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24
Q

Técnica que identifica proteínas desconocidas mediante su separación según su cociente m/z y comparación con resultados teóricos.

A

MALDI-TOF: puede haber hiperfosforilación.

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25
Si se hace un Western Blot y se encuentra una proteína solo en el paciente enfermo ¿Qué se puede decir de esa proteína?:
Que es un biomarcador de cáncer
26
¿Qué pasa cuándo se usa biotinilación en el western blot?
Se pega y cambia de color
27
¿Qué es un biomarcador y cómo se define?
Ayuda a distinguir entre un enfermo sano y uno enfermo.
28
¿Qué sucede cuando se usa el anticuerpo primario más el secundario quimioluminiscente o mutilinado?
Etiqueta molecular
29
¿Cómo funciona un microarreglo
Marca y se hibrida en una placa
30
Se quiere comparar la expresión génica entre células de cerebro con Alzheimer y uno sano, mediante un microarreglo. ¿Cuál será el protocolo experimental más adecuado?
El cDNA total de las células cerebrales de ambos casos, se marca y se hibrida en placa.
31
¿Con un microarreglo puedo obtener la secuencia de DNA por hibridación?
No, porque tienes que poder marcarlo
32
. ¿Cuál de las siguientes características NO es posible hacer con unn microarreglo de DNA?
Obtener la secuencia de ADN por hibridación.
33
¿Cómo se le llama a la ciencia que hace la integración y análisis de datos ómicos?
Biología de sistemas
34
Método para ver patrones de metilación de DNA:
MeDIP seq
35
. ¿Qué se acumula en el Alzheimer?
B amiloide y TAU
36
¿Cómo determinó la identidad de una proteína?
Espectrofotometría. Espectrometría de masas.
37
La unión de GTR al ADN afecta a la expresión de los genes relacionados con el desarrollo de cáncer, por lo que GTR es:
Diana terapéutica.
38
Se detectan 2 proteínas que sólo están en una bacteria patógena y se sospecha que serían potenciales dianas terapéuticas. Decida cuál de las siguientes técnicas es la más apropiada para determinar la identidad de estas proteínas:
Espectrometría de masas
39
¿Cuál es el objetivo de las ciencias ómicas al identificar biomarcadores?
Diagnóstico menos invasivo
40
Es un paso indispensable para obtener la secuencia de DNA de una especie nueva:
Alineamiento de secuencias
41
Modificación que puede explicar algunas de las variaciones genómicas entre personas:
CNV
42
Es un tipo de variación en el número de copias o CNV:
Duplicación segmental.
43
Da información sobre la fosforilación de una proteína:
La metilación de las citocinas del promotor de un gen.
44
De acuerdo a ENCODE ¿Qué producto se genera a partir de qué componente?
Proteína a partir de un CDS
45
Producto funcional de una secuencia codificante (CDS):
Proteína
46
Su objetivo era crear un mapa de todos los elementos funcionales del genoma humano:
ENCODE
47
SNV que puede causar que una proteína no se exprese:
Sin sentido en estado homocigoto
48
Se realizó un estudio de proteómica en tejido tumoral y se demostró que en dicho tejido no hay presencia de la proteína FDT , la cual es codificada por el gen RAC. ¿Cómo se explicaría la ausencia de la proteína?
Un SNV sin sentido en estado homocigoto.
49
Una variación que puede ser rara en una población pero común en otra diferente:
SNV
50
Secuencia repetida en tándem (pueden ser tripletes) que puede asociarse a una enfermedad: Elementos repetidos en el genoma utilizados para diseñar una prueba de paternidad (son altamente variables entre individuos)
Microsatélites
51
Lugar del ADN donde una secuencia corta de nucleótidos se organiza como una repetición de longitud entre individuos.
VNTRS→ Variable number of tandem repeats
52
Secuencia repetida en tándem (pueden ser tripletes) que puede asociarse a una enfermedad:
FALSO
53
Método para ver la expresión diferencial de la mayor cantidad posible de genes en dos muestras (enfermo vs sano)
RNA seq
54
Paso indispensable para obtener la secuencia de DNA de una especie nueva:
Alineamiento de secuencias
55
IncRNA (log non coding RNA) es menor a 200 nucleótidos
FALSO
56
Se sabe que la proteína A y la proteína B interactúan. Al estudiarlos los investigadores ntas que la proteína A adquiere su conformación nativa únicamente cuando la proteína B está presente en la solución. Sin embargo, la proteína B puede tomar su conformación nativa a pesar de que la proteína A no esté presente en la solución. Por lo tanto la proteína B funciona como:
Una chaperona molecular de la proteína A
57
Se mapea la secuencia de un RNA mensajero al genoma de referencia. Se obtiene 100% de correspondencia a una región de 3 fragmentos discontinuos. Este resultado implica que el gen correspondiente a ese ARN mensajero:
Tiene al menos 3 exones y 2 intrones.
58
Se mapea la secuencia de un RNA mensajero al genoma de referencia. Se obtiene 100% de correspondencia a una región de 4 fragmentos discontinuos lo que implica que el gen tiene:
Al menos 4 exones y 3 intrones
59
El síndrome del X frágil está causado por la expansión anómala de fragmentos de DNA repetitivos. Se produce por la expansión de un fragmento del gen FMR1 que normalmente contiene entre 5 y 40 repeticiones del triplete CGG, pero que en los pacientes presenta más de 200 repeticiones CGG. La expansión del triplete inactiva el gen e impide que se produzca proteína normal, lo que afecta el funcionamiento del sistema nervioso y da lugar a la enfermedad. ¿Cuál es la técnica más apropiada (menor costo y mayor rapidez) para diagnosticar esta patología?
PCR del gen para detectar cambios en su tamaño.
60
Cuando las proteínas antiangiogénicas sFTL1 se sobreexpresan en la placenta, desencadenan la preeclampsia. Estas proteínas se pueden medir en la orina de madres gestantes. ¿Cuál puede ser una utilidad médica de las proteínas sFLT1:
Sirven como biomarcadores moleculares de diagnóstico de preeclampsia y como blancos terapéuticos de tratamiento de esta condición.
61
# IMAGEN En el siguiente cluster jerárquico se muestran los perfiles de expresión de miRNAS entre casosde HSE y controles. ¿Cuál de los siguientes miRNAs sería el biomarcador más adecuado para HSE?
A
62
# imagen La forma esporádica de la enfermedad de la Reina de Corazones es causada muchas veces por el intercambio entre un fragmento del cromosoma 20 con un fragmento del cromosoma 4 como se muestra en esta figura. Este Intercambio hace que el gen se transcriba más activamente de lo debido. Estos casos son el resultado de:
La translocación recíproca entre el cromosoma 4 el 20.
63
Se tiene a un paciente que presenta un cuadro clínico consistente con variantes en 58 posibles genes. Al no haber antecedentes familiares, se sospecha de una mutación de NOVO. ¿Cuál estrategia es la más costo-efectiva para diagnosticar la causa del padecimiento?
Secuenciar los 58 genes por illumina.
64
# imagen Se realizó un estudio de microarreglo para encontrar la posible causa de una enfermedad rara en una familia. Se muestra el resultado que se obtuvo para el cromosoma 2 en los integrantes de la familia que presentan la enfermedad. De acuerdo a esta imagen ¿Cuál podría ser la causa de la enfermedad?
Hay una deleción en 2q24 que podría estar involucrada en el desarrollo de la enfermedad
65
Principales formas de variación del genoma:
Polimorfismo de secuencia y de longitud.
66
Uno de sus objetivos, el cual surgió ya empezado el proyecto fue el de guardar los datos en bases de acceso libre y gratuito. Su fin último era determinar todos los nucleótidos contenidos en el ADN humano:
Proyecto del genoma humano
67
Técnica utilizada para la detección de duplicaciones o deleciones en un genoma:
Multiplex ligation-dependent probe amplification (MPLA)
68
Un RNA no codificante de 22 nucleótidos detectado en un tejido enfermo,tendrá como función:
Silenciamiento de la expresión génica
69
Enzima que copia el RNA en DNA complementario:
Transcriptasa inversa
70
Mediante un qPCR se detectan los CT de varios pacientes con una infección viral. ¿A qué paciente (mayor o menor CT) le darás más antiviral?
Al paciente con menor CT
71
Su objetivo inicial fue catalogar la variación genética en la especie humana.
Proyecto 1000 genomas.
72
Revela las relaciones causa-efecto entre genotipo y fenotipo o enfermedad:
GWAS
73
¿Qué revelan un análisis de GWAS?
Variantes del DNA → SNPs
74
Estudia en su conjunto las distintas moléculas que componen y permiten la función de un organismo, y las redes de interacción entre ellas.
CIENCIAS ÓMICAS
75
Se refiere a la aplicación práctica de las ciencias para resolver cuestiones jurídicas:
Forense
76
Actualmente, este es el uso de la medicina personalizada:
Farmacogenómica
77
Estudio para el diagnóstico de una enfermedad causada por varios genes:
Secuenciación del panel de genes.
78
Técnica usada para el estudio de enfermedades que son muy diferentes a nivel genético y de fenotipo:
Secuenciación masiva
79
Una variante de este tipo (sentido) cambia el aminoácido:
Sustitución en sentido contrario
80
¿Qué técnica se puede usar para realizar la unión de secuencias de ADN provenientes de 2 organismos distintos que normalmente NO se encuentran juntos (generar un DNA quimérico):
DNA recombinante