Examen 3 Flashcards

(50 cards)

1
Q

Les groupes taxonomiques sont définis comme des ____________

A

Taxons

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Q

Le but de la taxonomie est d’(a) ___________ des (b) ___________ naturels d’organismes présentant des (c) caractères (c) ______________

A

a) établir
b) groupes naturels
c) communs

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3
Q

Sur quoi est basée la taxonomie ?

A

sur la proportion des caractères communs

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4
Q

Vrai ou faux? Un organisme peut faire partie de deux taxons.

A

Faux, un seul taxon –> taxonomie = non-chevauchante

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Q

Donner les taxons du plus grand au plus petit.

A
Domaine
règne
sous-embranchement
embranchement
classe
ordre
famille
espéce
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6
Q

Quels sont les utilités de la taxonomie ? (3)

A
  1. identification (description + caractérisation)
  2. nomenclature (noms)
  3. classification (arrangements et relations inter-groupes)
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7
Q

Qu’est-ce qu’une souche (isolat) ? + exemple

A

Tous les descendants d’une culture pure, ex.: culture pure de Legionella pneumophila provenant d’un cas de Légionellose à Québec (2013)

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8
Q

Une espèce est un groupe de souches dont les caractéristiques sont _________ identiques

A

presque

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9
Q

Qu’est-ce qu’un taxon de base?

A

groupe homogène différent des autres groupes

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10
Q

Comment nomme-t-on la 1re souche qui possède toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce?

A

souche-type

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11
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type morphologique? + exemples (4)

A
  • taille, forme, arrangement
  • structure cellulaire
  • membrane (types de lipide, alcools…)
  • paroi cellulaire (polysaccharides, peptidoglycanes)
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12
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type physiologique? + exemples (2)

A
  • éléments nutritifs: exigences nutritionnelles = milieu de culture, source de C, facteur de croissance
  • conditions d’incubation = Température, O2, lumière
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13
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type métabolique? + exemples (2)

A
  • produits finaux de la fermentation (indentification et qté)
  • enzymes extracellulaires (protéases, exotoxines, hémolysines)
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14
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type génétique? (7)

A
  • composition G+C% (G+C% augmente = Tm [température de fusion] augmente)
  • Spectrophotomètre UV (260 nm)
  • Séquences nucléotidiques
  • nombre de chromosomes
  • plasmides
  • taille, nombre, gènes plasmidiques
  • caractéristiques non-essentielles ( ex.: production toxines, résistance antibiotiques)
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15
Q

Donnez deux exemples de composition G+C%

A

plantes et animaux = 30-50%

M-O = 25-80%

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16
Q

La composition G+C% est-elle exclusive à l’espèce?

A

Non, valeur typique mais pas exclusive

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17
Q

Vrai ou faux? Les valeurs intragenre de G+C% peuvent varier beaucoup ?

A

Faux, elles sont très similaires

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18
Q

Qu’est-ce qu’une plasmide?

A

molécule d’ADN extrachromosomique circulaire chez les organismes bactériens et archae

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19
Q

Une plasmide est une molécule ____________

A

autoréplicative

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20
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type “interactions avec l’hôte? + exemples (2)

A
  • pathogénicité (capacité de provoque maladie chez différents hotes, spécificité d’hôte)
  • symbiose (plantes, poissons)
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21
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type écologique? + exemples (2)

A
  • habitat d’où provient l’isolat

- niche écologique

22
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type moléculaire + exemples (5)

A
  • comparaison de séquences protéiques et nucléiques
  • gènes conservés
  • protéines conservées
  • homologie des séquences–> organismes apparentés
  • Hybridation d’acides nucléiques (ADN-ADN) (même espèces, espèces apparentées)
23
Q

Qui s’occupe de l’attribution des noms aux nouveaux organismes?

A

le comité international

24
Q

La nomenclature linnéenne (Carl Von Linnaeus) est dite ___________ car elle utilise 2 mots

25
Quels sont les deux taxons utilisés dans la nomenclature linnéenne ?
le genre et l'espèce ex.: Mycobacterium tuberculosis
26
La classification des organismes se fait selon les (a)______________ et permet de voir les (b) _____________
a) caractères communs | b) liens évolutifs (déduits)
27
La classification des organismes peut être _______ (4 réponses)
1) naturelle 2) phénétique 3) numérique 4) phylogénétique
28
Sur quoi se base la classification "naturelle"?
la nature biologique des organismes et l'anatomie
29
Sur quoi se base la classification "phénétique"?
Ce qui "parait" = similarité des caractères phénotypiques (morphologiques, métaboliques, génétiques)
30
Sur quoi se base la classification "numérique"?
- comparaison de plusieurs organismes - 2 par 2 - nb de caractères minimum = 50 - coefficient d'appariement - pourcentages de similarité - -- >nb caract. similaires/nb total de caract. X 100
31
Quelles sont les caractéristiques de la classification numérique? Quelle est sa limite?
- uniforme - pertinence biologique - non-équivalente - présence de capsule vs similarité fonctionnelle de l'ADN polymérase - Limite = ***pondération des caractères***
32
Sur quoi se base la classification "phylogénétique"?
- ancêtre commun - comparaison d'espèces distantes - procaryotes: fossiles utiles rares - relations évolutives probables - comparaison de séquences de gènes/ protéines conservées - chronomètres moléculaires - mutations = au hasard - ARN ribosomique (régions conservées = essentielles à la fonction) (régions variables = mutations-->n'altérent pas la fonction--> nb de différences proportionnelles au temps depuis la divergence d'un ancêtre commun.
33
Les noeuds dans l'arbre phylogénétique sont des ____________________
événements de divergence
34
Les outils bioinformatiques sont en (a) __________ constant et fonctionnent avec la (b) ____________ des séquences génomiques.
a) développement | b) disponibilité
35
Classification polyphasique - informations __________ et ___________ - plus complètes - remaniements _____________ - ______________ de la notion d'espèce (ex.: % d'identité des séquences génomiques)
- informations PHÉNÉTIQUES et PHYLOGÉNÉTIQUES - plus complètes - remaniements CONTINUS - RÉ-ÉVALUATION de la notion d'espèce (ex.: % d'identité des séquences génomiques) --> bonobo/chimpanzé/humain = > 99% séquences semblables
36
Linnaeus (1753) = (a) ___ règnes | Haeckel (1865) = (b) ___ règnes
a) 2 = animaux, plantes | b) protistes --> bactéries, levures, protozoaires, algues
37
``` Whittaker (1969): nutrition + organisation cellulaire nutrition: - - - - organisation cellulaire - - 5 ______ = évolution originelle unidirectionnelle ```
``` Whittaker (1969): nutrition + organisation cellulaire nutrition: - photosynthèse - absorption (soluble) - ingestion (solide) - organisation cellulaire - eucaryotes, procaryotes - 5 RÈGNES = évolution originelle unidirectionnelle ```
38
Woese = 3 domaines, quels sont-ils?
1) Eucarya [ 2) Bacteria 3) Archaea ] = procaryotes voies évolutives divergentes
39
Origine des organelles | Donnes les caractéristiques des mitochondries et chloroplastes (4)
- autoréplicatives - chromosomes circulaires, uniques - Gènes ARNr - apparentés aux eubactèries
40
Théorie de l'endosymbiose Des (a) __________ seraient ancêtres des mitochondries alors que des (b) __________ seraient ancêtres des chloroplastes
a) bactéries (respiration cellulaire) | b) cyanobactéries (photosynthèse)
41
Vrai ou faux ? Les archaes ont une diversité morphologique et physiologique élevée
vrai
42
Nommes les types de reproduction des archaes (3)
fission binaire, bourgeonnement, fragmentation
43
les archaes vivent dans des environnements __________ et _________ extrêmes
aquatiques et terrestres
44
Les archaes sont faciles ou difficiles à cultiver?
difficile
45
La paroi cellulaire des archaes - fonctions similaires - pseudomuréine, autres ________ ou ___________ - Gr+ : _________ , _________ , ___________ - Gr- : - Couche de protéine ou de ___________ - présence de __________ externe (sauf exception)
La paroi cellulaire des archaes - fonctions similaires - pseudomuréine, autres POLYSACCHARIDES ou PROTÉINES - Gr+ :ÉPAISSE , UNIFORME , RIGIDE - Gr- : COUCHE S ATTACHÉE À MEMBRANE CYTO - Couche de protéine ou de LIPOPROTÉINES - présence de MEMBRANE externe (sauf exception) --> quelques espèces sans paroi
46
Nommez les caractéristiques de la membrane cytoplasmique des archae ? (5)
- fonctions similaires - lipides différents - alcools - monocouche augmente rigidité - lipides diff --> ex.: thaumarcéol indicateur de thaumarceota dans le picoplancton
47
Génétique et biologie moléculaire chromosomes 1) unique, _________ 2) taille est > ou < que eubactéries ? 3) G+C% = ? 4) gênes _______ des eubactéries ( fonctions ________ ) 5) Quelques __________ 6) Mécanisme d' _________ d'ADN
Génétique et biologie moléculaire 1) unique, CIRCULAIRE 2) taille est < que eubactéries 3) G+C% = 21-68% 4) gênes DIFFÉRENTS des eubactéries ( fonctions INCONNUES ) 5) Quelques PLASMIDES 6) Mécanisme d' ÉCHANGE d'ADN
48
Génétique et biologie moléculaire ribosomes 1) 70S = __________ 2) traduction --> _________ 3) Abio s --> ribosomes = _________ 4) sensibles : ___________ 5) résistants : __________ et __________ 6) transcription et ___________ = eucaryotes ---> supporte arbre de la vie
Génétique et biologie moléculaire ribosomes 1) 70S = EUBACTÉRIES 2) traduction --> EUCARYOTES 3) Abio s --> ribosomes =EUCARYOTES 4) sensibles : ANISOMYCINE 5) résistants : KANAMYCINE et CHLORAMPHÉNICOL 6) transcription et RÉPLICATION = eucaryotes ---> supporte arbre de la vie
49
Génétique et biologie moléculaire des archaes Les acides aminés sont ______ et ________
rares et uniques
50
``` Archées ---> Crenarchaeota Thermophiles - ______________ (source d'O2) - Habitats = - Sulfolobus - Pyrodictium: ___________ = 105-110 degrés - Geogemma = 121 degrés ``` Psychropiles
Archées ---> Crenarchaeota Thermophiles - ANAÉROBIES STRICTES(source d'O2) - Habitats = SOURCES SULFUREUSES, PICOPLANCTONS OU SOLFATARES (VOLCANS) - Sulfolobus - Pyrodictium: FOSSE ABYSSALE = 105-110 degrés - Geogemma = 121 degrés Psychrophiles