Expresión génica Flashcards

(57 cards)

1
Q

Diferentes células en un orgnismo multicelular pueden:

A

Expresar grupos muy diversos de genes, aún conteniendo el mismo DNA

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Q

El grupo de genes expresados en una determinada célula es:

A

El grupo de proteínas y RNA funcionales que contiene

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Q

Forma por la cual una célula controla qué genes se expresan

A

Regulación génica

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4
Q

Controles de expresión génica (6)

A
  • Transcripcional
  • Procesamiento del RNA
  • Transporte y localización del RNA
  • Postraduccional
  • Degradación del mRNA
  • Actividad protéica
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Q

Regulación en cis

Regulación de expresión génica a nivel transcripcional

A

Secuencia contigua a un gen que tenga efecto regulador sobre la tasa de trasncripción de ese gen
- Potenciadores
- Silenciadores

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6
Q

Regulación en trans

Regulación de expresión génica a nivel transcripcional

A

La mayoría de secuencias reguladoras no pueden por sí solas modificar la velocidad de transcripción, necesitan proteínas reguladoras
- Factores de transcripción

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7
Q

Proteínas pueden reconocer DNA con gran afinidad por:

Reconocimiento del DNA por proteínas

A

Los dominios de unión al DNA

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8
Q

Las proteínas reconocen:

Reconocimiento del DNA por proteínas

A

La superficie del ácido nucléico para identificar la secuencia de nucleótidos

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9
Q

Sitio donde mejor se puede reconocer la secuencia de nucleótidos

Reconocimiento del DNA por proteínas

A

Surco mayor del DNA

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10
Q

Estructuras de los factores de trasncripción (motivos) (4)

A
  • Motivo hélice-giro-hélice (HGH)
  • Motivo dedos de ZN
  • Motivo zipper de Leucina
  • Hélice-asa-hélice (HLH)
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11
Q

Motivo hélice-giro-hélice (2)

Estructuras de los factores de trasncripción

A
  • Proteínas de dos alpha hélice conectadas por cadena corta de a.a
  • Desarrollo embriónico
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12
Q

Motivo dedos de Zn (2)

Estructuras de los factores de trasncripción

A
  • Alpha hélice unida a Beta hélice por Zn
  • Receptores de hromonas esteroideas
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13
Q

Motivo zipper de Leucina

Estructuras de los factores de trasncripción

A

2 alpha hélices

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14
Q

Motivo hélice-ala-hélice

Estructuras de los factores de trasncripción

A

Alpha hélice conectada por un asa a otra alpha hélice

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15
Q

Regiones controladoras de genes (4)

A
  • Promotor (cis)
  • Secuencias regulatorias
  • Potenciadores
  • Silenciadores (cis)
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16
Q

Promotor

A
  • Sitio donde los factores de transcripción y RNA pol se ensamblan
  • Reconocido por el activador
  • Cis
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17
Q

Secuencias regulatorias

A

Sitio donde proteínas reguladoras se unen para controlar proceso de ensamblaje en promotor

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18
Q

Potenciadores

A

Atraen, posicionan y modifican factores de transcripción, mediador y RNA pol II hacia promotor

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19
Q

Silenciador

A
  • Disminuyen la transcripción en vez de estimularla
  • Cis
  • Reconocido por el represor
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20
Q

Activadores

A
  • Actúan directamente con factores de transcripción y pueden regular actividad de RNA pol II
  • Trans
  • Activa al promotor
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21
Q

La unión de factores de transcripción específicos a potenciadores:

Activadores

A

Responsable del control de expresión génica
- Desarrollo
- Diferenciación
- Respuesta de células a hormonas y fact. de crecimiento

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22
Q

Represores

A
  • Se unen a secuencias específicas dentro del DNA (silenciadores) para inhibir transcripción
  • Trans
  • Reconocen silenciadores
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23
Q

Los represores pueden inhibir:

A
  • Transcripción
  • Unión de otros factores de transcripción al DNA
24
Q

Función importante de represores:

A

Inhibir expresión de genes específicos de un tejido en tipos celulares inadecuados

25
La regulación de la transcripción por parte de represores y activadores es:
Un mecanismo que controla la expresión de genes eucariotas
26
Los activadores y represores regulan la transcripción de eucariotas: (2)
- Interactuando con factores de transcripción generales y otros componentes de la maquinaria transcripcional - Incuciendo cambios en la estructura de cromatina
27
La ______ no es suficiente para convertir el DNA en una plantilla accesible para transcripción
Descondensación de cromatina
28
Los genes permanecen:
Unidos a histonas y empaquetados en nucleosomas
29
Problema al que se enfrentam los factores de transcripción y RNA pol
La interacción con cromatina y no con DNA desnudo
30
Obstáculo para la transcripción
Enrollamiento de DNA
31
El enrollamiento de DNA afecta: (2)
- La capacidad de los factores de transcripción para unirse al DNA - La capacidad de RNA pol para transcribir
32
Adición de grupo metilo al carbono 5 de citosina (5mC)
Metilación del DNA
33
El grupo metilo siempre va en: | Metilación del DNA
Las citosinas que van después de una guanina
34
5mC equivale a: | Metilación del DNA
1% del DNA
35
La metilación del DNA confiere: (2)
- Cambio conformacional en la doble cadena del DNA - Variación espacial y temporal en la cromatina
36
Más metilación: | Metilación del DNA
Menos expresión génica
37
La metilación de un promotor o de secuencias reguladoras: | Metilación del DNA
Interfiere en inicio de transcripción
38
Actúan en secuencias C-G pareadas con secuencia C-G metilada | Metilación del DNA
Metiltransferasas
39
Eucromatina (4) | Empaquetamiento de DNA
- Ligeramente compactada - Regiones relativamente dispersas, poco condensadas que ocupan la amyor parte del núcleo - Alta acetilación - Cromatina activa transcripcional
40
Heterocromatina (4) | Empaquetamiento de DNA
- Regiones de cromatina densamente empaquetadas - Inactivas, no se expresan - Abundante en telómeros y centrómeros - Niveles altos de metilación
41
Heterocromatina facultativa | Empaquetamiento de DNA
Se expresan durante desarrollo y/o diferenciación, posteriormente se silencian
42
Heterocromatina constitutiva | Empaquetamiento de DNA
- Siempre condensada y silenciada - Telómeros y centrómeros
43
Dominios de histonas | Modificaciones de histonas
- Unirse a otras histonas y DNA - Amino terminal fuera del DNA, sufre modificaciones
44
Las histonas interaccionan con: | Modificaciones de histonas
Proteínas o complejos protéicos efectores o transductores
45
Acetilación de histonas (6) | Modificaciones de histonas
- Añade cargas negativas a histonas - Descompactación de cromatina - Facilita acoplamiento de factores de transcripción - Lisinas (H3K56) A. Acetiltransferasas de histonas (HAT): promueve transcripción B. Deacetilasas de histonas (HDAC): represores transcripcionales - Acetiltransferasas - Deacetilasas
46
Fosforilación de histonas | Modificaciones de histonas
- Serinas, treoninas y tirosinas - Incrementa carga negativa a histona - Favorece transcripción A. Cinasas B. Fosfatasas
47
Metilación de histonas | Modificaciones de histonas
- Metiltransferasas de lisina (HKMT) A. Lisina B. Puede activar o reprimir la transcripción de un gen - Metiltransferasas de Arginina A. Argininas B. Activación transcripcional - Demetilasas de histonas
48
La epigenética abarca:
Procesos y mecanismos moleculares que afectan a la regulación y expresión de genes, y que son heredables de unos organismos a otros
49
Mecanismos de regulación epigenética más comunes en humanos
- Metilación del DNA - Modificaciones post-traduccionales de histonas (fosfo, metil, acetilación)
50
Deacetilasas de histonas (HDAC)
Incrementan carga positiva Clase I, II, III, IV
51
Clase I (4) | Deacetilasas de histonas
- Represión de transcripción - Regulación epigenética - Regulación del ciclo celular - HDAC 1, 2, 3, 8
52
Clase II (5) | Deacetilasas de histonas
- Regulan tráfico de proteínas - Adhesión - Mov. celular - HDAC II A 4, 5, 7, 9 - HDAC II B 6, 10
53
Clase III (4) | Deacetilasas de histonas
- Formación de memoria - Represión de transcripción - Regulación epigenética - Sirtuinas
54
Expresión aberrante HDAC 1 | Deacetilasas de histonas
Cáncer de próstata, colon y mama
55
Expresión aberrante HDAC 2 (5) | Deacetilasas de histonas
- Carcinoma gástrico - Cáncer de cuello uterino - Carcinoma colorrectal - Displasia cervical - Sarcomas endometriales
56
Expresión aberrante HDAC 8 | Deacetilasas de histonas
Neuroblastoma y glioma
57
Inhibidores de HDAC (4)
- Vorinostat - Romidepsin - Belinostat - Panobinstat