f6 - RTKs

Question 1

hvad er de to overordnede receptorklasser

Answer 1

plasmamembranlokaliserede receptorer

intracellulære receptorer

Question 2

giv eksempler på plasmamembran lokaliserede receptorer

Answer 2

receptor-serin/threonin-kinaser
receptor-tyrosin-kinaser (RTK)
guanylylcyklase-receptorer
tyrosinkinase-koblede receptorer

(alle enzymkoblede)

Question 3

giv eksempler på intracellulære receptorer

Answer 3

vitamin d
østrogen
testosteron
cortisol
thyroidhormon

Question 4

hvad kaldes ekstracellulære signaler også

Answer 4

ligander eller signalmolekyler

(inkluderer hormoner & vækstfaktorer)

Question 5

hvad afgør en celles respons

Answer 5

ikke bare et, men en kombination af signaler

Question 6

ANP-domæner omdanner hvad?

Answer 6

GTP til cGMP via guanylylcyklase-domænerne

Question 7

cGMP aktiverer hvad

Answer 7

proteinkilder G (PKG)

Question 8

cGMP nedbrydes af hvad

Answer 8

fosfodiesteraser (PDE)

PDE5 er cGMP specifik

Question 9

hvordan virker intracellulære receptorer?

Answer 9

signal molekyle ankommer til celle

hvis receptor er i cytosol, rykkes den til nukleus efter signal har bundet

Question 10

hvorfor kaldes receptorerne enzymkoblede

Answer 10

de kobler til enzymer der påvirker acetylering af histoner (?)

Question 11

hvad kan receptor når signalmolekyle ikke er bundet

Answer 11

virke som transkriptionel repressor;

binder corepressor og corepressor bindende proteiner

Question 12

hvad sker med corepressor, når ligander kommer

Answer 12

konformation af receptor ændres
corepressor kan ikke længere binde
receptor får affinitet for coaktivatorer

Question 13

hvorfor er RTK ikke i sig selv velegnet til at overføre signal fra signalmolekyle til cytosol

Answer 13

har næsten altid kun et transmembran segment

Question 14

hvad sker der når signalmolekyle(r) binder

Answer 14

to RTK monomerer dimeriserer

• cytosolære tyrosinkinase domæner bringes tættere
• kan krydsfosforyleres med ATP som co-substrat

Question 15

hvordan kan RTK’er allerede være dimeriserede

Answer 15

via disulfid-binding mellem monomere

• bringes stadig tættere

Question 16

hvordan binder signalproteiner til de fosforylerede tyrosin-rester på den cytosolære side

Answer 16

via SH2-domæne, der har affinitet for fosfotyrosin-rester

Question 17

hvad er nogle berømte RTK’er

Answer 17

insulin (vigtig for metabolisme)
IGF-1 (vigtig for længdevækst)

Question 18

aktivering af RTK medfører hvad

Answer 18

krydsfosforylering
rekruttering/aktivering af cytosolære signalproteiner

Question 19

hvad er Ras

Answer 19

small GTP-binding protein
(og monomerisk GTPase; kan hydrolysere GTP)

Question 20

hvordan aktiveres Ras

Answer 20

ved binding af GTP, som stimuleres af Ras-GEF (guanine nucleotide exchange factor)

Question 21

hvad gør Ras-GEF

Answer 21

udskifter GDP til GTP på Ras

Question 22

hvordan inaktiveres Ras

Answer 22

hydrolyse af GTP til GDP + Pi
stimuleres af Ras-GAP (GTPase-activating protein)
HUSK! ikke udskiftning, men hydrolyse

Question 23

hvordan sidder Ras fast i plasmamembran

Answer 23

via lipid-anker

Question 24

Ras er ofte muteret i hvad

Answer 24

cancer

Question 25

hvad er et adaptorprotein

Answer 25

protein uden enzymatisk aktivitet, men som virker ved at binde til andre proteiner

Question 26

hvor aktiveres Ras

Answer 26

nedstrøms for aktiveret RTK

Question 27

hvad er MAPK

Answer 27

signaleringsmodul; består af flere kinaser - MAPKKK (Raf), MAPKK (MEK), MAPK (ERK) aktiveret af Ras

Question 28

hvordan aktiveres PI3K nedstrøms for RTK

Answer 28

ved binding til fosfotyrosin-rest på aktiveret RTK

Question 29

PI3K fosforylerer hvad?

Answer 29

inositolfosfolipider i plasmamembranen (PIP2 -> PIP3)

Question 30

PIP3 rekrutterer hvad

Answer 30

Akt og proteinkinase 1 til plasmamembran

Question 31

hvordan aktiveres Akt

Answer 31

ved fosforylering på en serin- & en threonin-rest ved proteinkinase 1 & 2

Question 32

hvordan aktiveres celleoverlevelse via Akt

Answer 32

protein Bcl2 er bundet til Bad og er inaktiv Akt fosforylerer Bad, som slipper Bcl2 fri Bcl2 fremmer celleoverlevelse ved at forhindre apoptose

Question 33

hvordan aktiveres cellevækst via Akt

Answer 33

Akt fosforylerer/hæmmer protein, der normalt holder Tor i inaktive form aktiveret Tor inhibere protein degradering og stimulerer protein syntese

Question 34

hvad gør fosforylering ved et protein

Answer 34

2 negative ladninger (-PO3-gruppe) introduceres; kovalent modifikation konformationsændring af det fosforylerede protein

Question 35

hvad kan fosforylering resulterer i

Answer 35

forøgelse eller reduktion af protein aktivitet

Question 36

hvordan kan fosforylering af protein detekteres

Answer 36

ved Wester blogs (immunoblotting)

Question 37

forklar western blot

Answer 37

prøve tages, køres ud i gel, separeres efter protein størrelse membran inkuberes med antistoffer kan også observere om protein vandrer anderledes i gel efter behandling (skyldes ændring fosforylering, kan det checkes ved behandling med fosfatase inden gelkørsel)

Question 38

hvilket antistof anvendes under immunoblotting

Answer 38

fsofospecifikt antistof; antistof der specifikt genkender bestemt fosforylering af bestemt protein

Question 39

hvad er crosstalk

Answer 39

visse signalstoffer og kinaser påvirkes både af GPCR og RTK signalering kan godt aktivere samme ting med forskellige signalstoffer og enzymer/kinaser

Question 40

hvad er et eksempel på crosstalk

Answer 40

signalering involverer to fosforylering af et protein via aktivering af to forskellige receptorer (A og B)

Question 41

hvad er notch

Answer 41

en plasmamembran lokaliseret receptor, som også er transkriptionsfaktor

Question 42

hvad sker ved binding af delta til notch

Answer 42

afklædning af cytosolære del af notch denne del translokerer til kernen regulerer notch-responsive gener - denne signalering kræver kun notch binding og protease til at kløve notch

Question 43

hvad sker når ethylen ikke er bundet til ethylen-receptor i ER membran

Answer 43

receptoren er aktiv aktiv receptor aktiverer associeret kinase, som forårsager nedbrydning af transkriptionsfaktor (ville ellers fremme ekspression af ethylen-responsive gener)

Question 44

hvad gør mutationen RasV12

Answer 44

glycin-12 bliver til valin resulterer i konstitutivt aktiv Ras kan ikke hydrolysere GTP fremmer celledeling på ukontrolleret måde

Question 45

hvad består ErbB-familien af RTK’er af

Answer 45

Her2-receptorer EGF-receptorer (epidermal growth factor)

Question 46

hvad sker der ved mutation i Her2-receptorer

Answer 46

valin-til-glutamin mutation i transmembrane domæne signalmolekyle-uafhængig dimerisering Her2-receptor er konstitutivt aktiv

Question 47

hvad sker der ved mutation i EGF-receptor

Answer 47

mutation medfører dannelse af stopkodon eliminerer meste af den ekstracellulære del af receptor medfører signalmolekyle-uafhængig dimerisering af trunkerede receptor konstitutivt aktiv