Fatores sigma e resposta ao stress

Question 1

Stresses ambientais levam a respostas … e … por ativação de genes …

Answer 1

• intracelulares
• extracelulares
• específicos

Question 2

A regulação por resposta a stress é feita a nível de vários … a partir de um …

Answer 2

• operões
• regulão

Question 3

Qual é a estratégia mais comum que as bactérias têm para regular a expressão genética?

Answer 3

Modificar a especificidade do promotor para a RNA polimerase através de fatores sigma alternativos

Question 4

Em bactérias, a expressão genética é fortemente regulada a nível da …

(trancrição, tradução, duplicação…)

Answer 4

Transcrição

Question 5

A iniciação da … é controlada por …

(1º - tradução, transcrição, …)

Answer 5

• Trascrição
• fatores sigma

Question 6

Para além dos fatores sigma existem os fatores sigma … . Qual a sua função?

Answer 6

• alternativos
• Regulam a expressão genética por modificar a especificidade do promotor RNAp

Question 7

ECF-sigma quer dizer …

Answer 7

Extra Cytoplasmic Function - sigma factors

Question 8

Os ECF-sigma são o grupo mais abundante de …

Answer 8

Factores sigma mantidos inativos por fatores anti-sigma específicos

Question 9

A regulação dos ECF-sigma é mais … que os fatores sigma.

Answer 9

• fina

Question 10

O invólucro celular bacteriano é constituído por:

Answer 10

• parede celular
• membrana celular
• membrana celular externa de Gram -

Question 11

Que tipos de stress está envolvido o invólucro celular bacteriano?

Answer 11

• Físico
• Químico
• Biológico (infeções)

Question 12

O invólucro celular bacteriano é uma estrutura vital? Quais são as suas funções?

Answer 12

Sim
* Respiração
* Adesão
* Secreção
* Transporte de nutrientes
* Manutenção pressão osmótica
* Manutenção da integridade celular

Manutenção da integridade e função do invólucro é essencial à sobrevivência

Question 13

A síntese da parede celular faz-se em que sentido?

Answer 13

De dentro para fora da célula

Question 14

A síntese da parede celular é feita pela ativação de um só gene?

Answer 14

Não, de vários genes (11)

slide 6

Question 15

Em bactérias Gram …, o stress induz a sobrexpressão de … . No estado … estas induzem a atividade de …

Answer 15

• Negativas
• Purinas (OMP’s)
• desenrolado
• sigma E

Slide 7

Question 16

Os fatores sigma são responsáveis importantes nos Mecanismos de Regulação …

Answer 16

Globais (GRM)

Question 17

Existem … mecanismos responsáveis pelo reconhecimento de sinais externos. Quais são?

Answer 17

3
* Sistema de 1 componente
* Sistema de 2 componentes
* Fatores sigma com função extracitoplasmática

Question 18

Os fatores sigma são responsáveis por recrutar … para a transcrição e apresentarem afinindade para com os …

Answer 18

• RNA polimerase
• promotores

Question 19

O fator sigma 70 é considerado …. uma vez que é reconhecido pela … dos promotores.

Answer 19

• house-keeping (regulação geral)
• maioria

Question 20

Os fatores anti-sigma são … ou … sensíveis a estímulos ambientais

Answer 20

• diretamente
• indiretamente

Question 21

Descreve o que acontece quando os fatores ECF-sigma são ativados.

Answer 21

• Fatores anti-sigma são libertados
• ECF-Sigma liga-se à RNAp
• EFC-Sigma reconhece determinados promotores
• Dá-se a transcrição de determinados regulões
• Estímulo de respostas adaptativas à sobrevivencia da cell.

Question 22

O ECF-sigma S é regulado em B. burgdorferi e S. typhimurium. Que MO apresenta uma cascata de fatores sigma mais complexa?

Slide 11

Answer 22

S. typhimurium

https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.0501417102

Question 23

O que depende a “escolha” do fator sigma a ser usado na transcrição?

Answer 23

• Do gene a ser transcrito
• Sinais ambientais necessário para iniciar a transcrição desse determinado gene.

Question 24

Os fatores sigma podem ser considerados … … que assistem a RNAp em ligar-se a determinados TSS(?). Depois desta ancoragem, o que acontece aos fatores sigma?

Answer 24

• Fatores de iniciação
• São libertados

Question 25

Uma holoenzima (RNAp) só tem esta designição quando ... está a ela ligado.

Answer 25

Fator sigma

Question 26

Cada RNAp tem exatamente ... subunidade(s) para fatores sigma

Answer 26

1

Question 27

Os fatores sigma são responsáveis pela ancoragem da RNAp a determinados ...

Answer 27

promotores

Question 28

Os fatores sigma estão divididos em ... grandes famílias:

Answer 28

2 * Sigma 70 * Sigma 54 (N)

Question 29

O sigma 70 é considerado um fator ... uma vez que é responsável pela transcrição durante ...

Answer 29

* primário * crescimento

Question 30

O sigma 70 é dividido em ... subfamílias:

Answer 30

2 * sigma 70 * sigma ECF

Question 31

O sigma 70 é constituído por ... domínios conservados. ## Footnote Estes domínios têm diferenças a nível ... , ... e ...

Answer 31

4 ## Footnote filogenético, estrutural e funcional

Question 32

A que subgrupo pertencem os Sigma ECF? Que subunidade falta a este grupo e qual é a consequência disso?

Answer 32

IV * Falta Sub 1 * Reconhecimento por nº menor de promotores em relação ao sigma 70 (grupos I, II, III)

Question 33

O fator sigma ECF apenas apresenta as subunidades ... e ... . Desta forma, a ativação de genes é mais ...

Answer 33

* 2 e 4 * fina/específica

Question 34

O grupo ... de fatores sigma 70 é mais ..., enquanto que os grupos ... têm funções mais ...

Answer 34

* 1 * geral * 2-4 * específicas

Question 35

Ao contrário do grupo ... do fator sigma 70, os grupos ... são **controlados** por ...

Answer 35

* 1 * 2-4 * fatores anti-sigma ## Footnote Têm um controlo mais fino da sua atividade transcriptacional

Question 36

Os fatores sigma-ECF são responsáveis pela resposta a sinais em que partes da cell? ## Footnote A que sinais respondem?

Answer 36

* membrana celular * periplasma * ambiente extracelular ## Footnote Misfolding das purinas (?), choque térmico, etc

Question 37

Os sigma-ECF regulam a síntese de ....

Answer 37

proteinas membranares/ secretadas

Question 38

Os fatores sigma ECF estão envolvidos em papeis biológicos como:

Answer 38

* resposta a stress pelo invólucro * transporte de ferro * stress oxidativo * resposta geral ao stress

Question 39

Sigma E é sinónimo de Sigma ...

Answer 39

ECF

Question 40

Sigma E está associado a que processo bacteriano? ## Footnote Em que bactérias?

Answer 40

Virulência ## Footnote *M. tuberculosis*, *E. coli* e *S. typhimurium*

Question 41

Na ausência de stress, como se encontra o fator sigma-ECF?

Answer 41

Inibido por fatores anti-sigma específicos.

Question 42

Na regulação do stress da sup. celular, os fatores sigma ... são regulados por ... . Onde se encontra a codificação para estes últimos?

Answer 42

* ECF * anti-sigma específicos Nos mesmos operões que os fatores ECF-Sigma

Question 43

Em *E. coli*, o fator sigma ..., é responsável por responder a distúrbios de ...

Answer 43

* E * Proteínas extramembranares (OMP) (misfolded/unfolded)

Question 44

Mutações em genes regulados por sigma E podem resultar:

Answer 44

Morte ## Footnote Slide 21

Question 45

Sigma E transcreve para imensas ... responsáveis por:

Answer 45

Enzimas * Síntese e transporte de fosfolípidos, ácidos grodos, lipopolissacarídeos e oligossacarídeos * proteínas do invólucro * ativação de genes responsáveis pelo transporte e montagem de LPS e OMPs na membrana extracelular

Question 46

Descreve o mecanismo de regulação de sigma-E

Answer 46

1. Stress na membrana extracelular 2. OMP sofrem misfold -> aumento de terminais C no periplasma 3. OMP misfolded ligam-se a proteases -> degradam RseA ligado a RseB 4. libertação do RseA e sigma E (complexo) 5. RseA-SigmaE é degradado libertando o Sigma-E | ppt 23 ## Footnote A **libertação de anti-sigma** é **despoletada** pelo **aumento de terminais C**

Question 47

RseA e RseB são exemplos de regulação ... do sigma-E

Answer 47

negativa