Fermentai Flashcards
(23 cards)
Kokios grupės medžiagos, priskiriamos prie fermentų, nėra baltymai?
Katalizinė RNR
Nuo ko priklauso fermentų katalizinis aktyvumas?
Nuo baltymo konformacijos. Visos 4 baltymų strūktūros yra labai svarbios fermentų kataliziniam aktyvumui.
Kokia yra kofermentų funkcija?
Pernešti specifines funkcines grupes.
Kas yra prostetinė grupė?
Kofermentas arba Me jonas, kuris yra kovalentiškai arba stipriai surištas su fermento baltymu.
Kas yra halofermentas (haloenzimas)?
Katalitiškai aktyvus fermentas, kartu suriškas su kofermentu ar metalo jonais.
Kas yra vadinama apoproteinu/apofermentu?
Haloenzimo baltyminė dalis.
Kokia yra pagrindinė termodinaminė sąvoka, biocheminių reakcijų termodinamikos kontenkste?
Laisvoji (Gibso) energija
Ką svarbu žinoti apie termodinaminį fermentų aktyvumą?
Kad fermentai nepaveikia pusiausvyros, bet keičia reakcijos greitį (didina jį).
Kas yra fermento perėjimo būsena?
Tai yra fazė/etapas, kuomet gali vykti ryšių nutraukimas, suformavimas, krūvio pasikeitimas ir kuriame gali vykti tiek reakcijos grįžimas į substratą, tiek tolimesnė reakcija iki produkto.
Koks yra skirtumas tarp reakcijos pradinės (ground state) ir perėjimo būsenos?
Aktyvacijos energija deltaG
Kaip fermentai geba mažinti aktyvacijos energijas ir greitinti reakcijas?
Per kovalentinius ir nekovalentinius ryšius, kurie formuojasi fermento-substrato komplekse aktyviajame centre.
Kas yra vadinama rišimo (binding) energija deltaGb?
Tai energija, gauta iš fermento-substrato komplekso sąveikos.
Rišimo energija yra didelis šaltinis laisvos energijos, naudojamos fermentų mažinti reakcijų aktyvacijos energiją.
Ar fermentas komplementarus substratui ar reakcijos perėjimo būsenai?
perėjimo būsenai.
Kokia yra fermentinės katalizės varomoji jėga?
Silpnos surišimo jėgos tarp fermento ir substrato.
Kas suteikia fermentui specifiškumo?
Rišimo energija.
Nuo ko priklauso fermentinių reakcijų greitis?
Nuo pH, temperatūros, aktyviklų, inhibitorių, koncentracijų.
kada fermentinės reakcijos greičio priklausomybė nuo substrato koncentracijos yra tiesinė?
kai substrato koncentracija yra maža.
Kodėl kintant pH keičiasi fermentinės reakcijos greitis?
Dėl baltymo molekulėje esančių polinių aminorūgščių šoninių grupių, kurių jonizacija priklauso nuo pH. Jos sudaro aktyvujį centrą, palaiko tretinę struktūrą.
Kokia stadija yra reakcijos greitį ribojanti stadija?
ES komplekso skilimas į E ir S.
Nuo ko nepriklauso reakcijos greitis?
nuo substrato koncentracijos.
kas rūgštinės - bazinės katalizės metu didina reakcijos greitį?
protonų pernaša
Apibūdinti elektrofilinę katalizę
fermento centro amino rūgščių šoninės grupės atakuoja elektrofilinius substrato centrus, susidaro tarpinis kovalentinis ES junginys, kuris vėliau atakuojamas H2O molekulės ir susidaro galutinis produktas.
