genetik

Question 1

Angelman / prader willie orsaker?

Answer 1

1. imprinting/deletion

2. uniparental disomy

Question 2

Huntingtons arv:

Answer 2

Autosomal dominant

Question 3

Duchennes arv:

Answer 3

x-länkat recessiv

Question 4

CF arv:

Answer 4

autosomalt recessiv

Question 5

Vad är missense, nonsens och tyst mutation?

Answer 5

Missens = Amiosyra byts ut mot en annan
Nonsens = prematurt stoppkodon pga AA
tyst mutation = mutation som i bp som inte påverkar vilket

Question 6

Vad är Val603Phe (V603F) för typ av mutation?

Answer 6

Missens

Question 7

Vad är Glu60Stop (E60X) för typ av mutation?

Answer 7

Nonsens

Question 8

Vad är ΔF508 för typ av mutation?

Answer 8

Deletion av kodon

Question 9

Vad är 394delTT för typ av mutation?

Answer 9

Deletion av två BP

Question 10

Beskriv haplotyp:

Answer 10

Den uppsättnings alleler som oftast ärvs från en förälder men som kan sitta nära varandra

Question 11

Vad vilka enzym styr acetylering/deacetylering?

Answer 11

HAT/HDAC

Question 12

Vad finns det för tre aktörer vid epigenetisk modifiering?

Answer 12

Writers - till exempel HAT; acetylerar, metylerar för att reglera transkription

Readers - binder in och tolkar de epigenetiska signalerna.

Erasures - HDAC tar bort epigenetiska modifieringar

Question 13

Beskriv epigenetisk modifiering genom icke-kodande RNA:

Answer 13

lncRNA finns i cis och trans.

Cis: tävlar om transkriptionsfaktorer samt har en roll i XIST vilket leder till x-kromosominaktivering

Trans: inhiberar proteiners funktion genom att binda upp dom.

miRNA:

tystar genom komplementär basparing.

Question 14

Vad är TAD?

Answer 14

Typologically accociated domain, en grupp av DNA som ligger varandra när det inte är celldelning. Kromosomerna ligger i öar och hålls frånskilda men DNA-delar kan ändå ligga nära varandra fysiskt trots det långa avståndet i antal baspar emellan. Dessa hålls på plats av insulatorprotein. Mutationer i TAD –> cancer.

Question 15

Beskriv x-chromosominaktivering:

Answer 15

Normalt hos kvinnor sker en x-kromosominaktivering genom aktivering av Xic. Då omger lncRNA en kromosom som kondenseras och lägger sig perifert i nukleus. Dessa kallas barr body.

Question 16

Anledning till skev x-kromosominaktivering.

Answer 16

Slump
Xic-mutation
x / autosomal translokation
Selektion för viabla celler

Question 17

X / autosomal translokation vad gör att den friska x-kromosomen tystas?

Answer 17

Vid X / autosomal translokation så sker en reciprok translokation mellan en X kromosom och en autosomal kromosom. Då skapas en x kromosom som är har autosomalt DNA på sig och en autosomal kromosom med x kromosomalt DNA. Tystas x-kromosomen utan translokation har det inte skett någon förlust av DNA och cellerna är viabla.

Question 18

Hur studerar man metylering?

Answer 18

1. Metyleringsspecifika restriktionsenzymer
2. bisulfitsekvensering
3. Metyleringsarrayer

Question 19

Beskriv Metyleringsspecifika restriktionsenzymer:

Answer 19

Enzymerna kan användas vid PCR. Då kan inte de genfragment som är metylerat klyvas, det leder till att man får genkopior på de DNA-fragment som är metylerade. Går bara att använda på kortare gensegment.

Question 20

Beskriv bisulfitsekvesering:

Answer 20

man tvättar DNA-sekvensen med bisulfit vilket leder till att Cystein spontant bildar Uracil som omvandlas till Thymin. Detta sker inte om Cystein är metylerat. Sedan är det bara att göra en sangersekvensering. Kan användas på större område än metyleringsspecifika restriktionsenzymer men inte lika stora som metyleringsarrayer.

Question 21

Farmakogenetik:

Answer 21

Genotyp spelar roll för hur vi metaboliserar läkemedel.

Question 22

Riktad behandling:

Answer 22

Om man vet genotyp behöver man anpassa lkm-behandlingen. Till exempel vid tyrosinkinas vid leukemi kan inhiberas på olika sett beroende på vilken fusion som gav upphov till leukemin.

Question 23

vilka x-kromosamala avvikelser finns det?

Answer 23

1. Klinerfelter 47, XXY,
2. Turner 45, X0
3. tripel x: 47, XXX
4. xx+13, patau syndrom

Question 24

Vad är centimorgan ett mått på?

Answer 24

Rekombinationsfrekvens; en centimorgan = 1% chans att rekombineras.

Question 25

Vad är LOD-score och hur kan det användas?

Answer 25

LOD score är ett mått på hur stor sannorlikhet att ett genetisk område nedärvs tillsammans med den sjuka allelen. Då kan man smalna av vilka gener som ligger bakom sjukdom.

Question 26

beskriv heritabilitet:

Answer 26

Är ett mått på genotyp-fenotyp korrelation. Det vill säga hur mycket en fenotyp bestäms av genetiska faktorer. Till exempel övervikt som är en produkt av både arv och miljö. heritabilitet är ett mått mellan 0-1. där 0.1 betyder 10%

Question 27

Beskriv tröskelvärde:

Answer 27

Många sjukdomar är polygena och beter sig därför inte enligt medelska sjukdomar. Det betyder att mutationer i många gener ger upphov till sjukdom. ifall mutationer i ett antal gener överstiger ett visst värde(tröskelvärdet) så kommer individen att bli sjuk.

Question 28

Genetiskt komplexa anlag kan vara:

Answer 28

Genetiskt betingade Multifaktorella Polygena

Question 29

Vad finns det för prenataltesting?

Answer 29

KUB: kombinerat ultraljud och blodprov --> blodprov med graviditetshormon + ul med vätskespalt i nacken. Fostervattentest: post 35 år invasivt medför viss risk för missfall 1-2 på 200 moderkaksprov: mäta kromosomrubbningar viss risk för missfall.

Question 30

Vad finns det för typer av genterapi?

Answer 30

Germline --> förändringar i könscell | Somatisk --> förändringar i icke-könscell

Question 31

Hur sker genterapin(3)?

Answer 31

Genutbyte, geninhibering och dödande av cell.

Question 32

Vad finns det för tekniker för genterapi(4)?

Answer 32

Fysiska metoder: receptormedierad endocytos, liposom och elektroporering. Vektorbaserad terapi: manipulerar vektorer i virus för att föra in visst DNA Cellterapi: Bygga organ i petriskål. Mitokondrieutbyte: ta ut ägg med muterad mtDNA och byta ut cellkärnan till en donators friska ägg.

Question 33

För vilka har man PGD?

Answer 33

Allvarliga monogena sjukdomar och kromosomala avvikelser: sjkdm: Autosomalt dominanta Dystrofia Myotonika Huntington Autosomalt recessiva Cystisk fibros SMA (Spinal muskelatrofi) X-bundna Duchennes muskeldystrofi Fragil X Balaserade translokationer.

Question 34

Hur går det till att skaffa barn genom PGD?

Answer 34

follikelstimulering mha hCG/FSH under 14 dagar (risk för OHSS). ägget tar ut och befruktas genom IVF eller ICSI. Blastomerebiopsi -> efter 3 dagar, tar upp en cell. Skjuter hål i zona pollucida och suger upp en cell. tar upp en polkropp mindre invasivt: tar upp en polkropp som bildats. Blastocystbiopsi -> Suger upp 5-10 trofektodermceller som skjuts av med laser.

Question 35

Vilka analysmetoder används vid PGD?

Answer 35

Vid monogena sjukdomar: Kopplingsanalys Kromosomala används FISH/NGS

Question 36

Berätta om PGS

Answer 36

PGS är preembryonic genetic screening. Där kollar man efter anuploida embryon vilket är vanligt, ffa om kvinnan har högre ålder. Sker mha NGS eller array

Question 37

Etiska frågor vid PDG

Answer 37

Många etiska frågor väcks av PGD. VIlka signaler sänder man till sjukdomsgrupperna? Vad är sjukdom och vad är egenskap, vem bestämmer vad som är okej för PGD? Det finns många sent debuterande sjukdomar, hur skall man förhålla sig till dem? Skall man få välja bort anlagsbärare? Det är en ojämlik tillgång till PGD över landet med olika antal tillåtna cykler Ska det vara tillåtet att rätta till felet i ett sjukt embryo? Med CRISPR-Cas9 skulle man kunna rätta till felet. Designade barn

Question 38

Vad är vogelsteinmodellen?

Answer 38

man kan se mutationers påverkan på cancerutveckling innan cancern har utvecklats. Det vill säga man kan se hur svår cancern kommer bli utifrån det genetiska materialet.

Question 39

Vad är Vogelgram klonal-expansionsteori?

Answer 39

En cell som ska gå i apoptos istället börjar dela sig.

Question 40

Beskriv kromosomer och fusionsgeners roll i cancerceller:

Answer 40

BCR-ABL kan bildas vid fusion av kromosom 9 och 22. EFtersom det inte finns normalt i celler så kan man köra en hård behandling.

Question 41

Cancer är progessionsprocess med en ackumulering av mutationer. Vilka mutationer kommer det då gälla? 8

Answer 41

1) Självförsörjande av tillväxtsignaler t ex RAS. Räcker med 1 mutation 2) Tumörsuppressorgener kräver 2 mutationer tex p51 3) Apoptos 4) Angiogenes och hypoxi. 5) Telomeras 6) Metastas 7) immun escape mutationer. Undvika immuförsvar. 8) Genomisk instabilitetsmutationer.

Question 42

Vilka typer av genetiska mutationer ser man vid cancer?

Answer 42

Oftast punktmutationer

Question 43

När ska man gå till cancergenetiskmottagning?

Answer 43

För att stark misstanke om ärftlig cancer skall föreligga måste patienten: Ha flera nära släktingar där minst två generationer på samma sida av släkten har eller har haft samma form av cancersjukdom Någon/några skall ha diagnosticerats i yngre ålder än vad som är vanligt för denna cancerform Ha olika cancerformer som är kopplade till varandra i släkten som till exempel bröst- och äggstockscancer eller tjocktarms- och kvinnlig underlivscancer.

Question 44

Bröst- och ovariecancer:

Answer 44

Vi känner till flera gener där mutationer kan orsaka ärftlig bröstcancer. BRCA1 och BRCA2 är de vanligaste. Båda är högriskgener för bröstcancer, och ger i genomsnitt 50-80% risk att utveckla sjukdomen. Förändringar i dessa gener ökar även risken för äggstockscancer till 30-60% vid BRCA1 mutation och till 10-20% vid BRCA2 mutation. Även mutationer i TP53-genen har förknippats med ärftlig bröstcancer.

Question 45

Malignt melanom hur genetiskt betingat?

Answer 45

5-10 % genetiskt betingade.

Question 46

Tjock/ändtarmscancer 2 genetiskt betingade?

Answer 46

Vad gäller tjock- och ändtarmscancer är den ena genen, APC-genen, dominant nedärvd och bärare av den kan få cancer redan i 20-årsåldern. Vanligtvis finns 1000-tals polyper i tjocktarmen men det finns varianter där man inte finner så många polyper. Den ger upphov till familjär adenomatös polypos (FAP). Den andra, MUTYH-genen, är recessiv, vilket innebär att mutationen måste ärvas från båda föräldrarna för att sjukdomen skall kunna bryta ut. Det innebär att man sällan ser MUTYH-associerad tjocktarmscancer i flera generationer. Sjukdomen kan debutera tidigt men inte i lika hög grad som APC-genen. MUTYH-associerad polypos kommer vanligtvis innebära ett mindre antal polyper än vid APC-polypos.

Question 47

Förebyggande åtgärder vid cancer:

Answer 47

1) Ett kontrollprogram, t.ex täta mammografikontroller, koloskopier eller PSA-test som syftar till tidig upptäckt och tidig behandling. 2) Profylaktisk operation där riskorgan opereras bort, t.ex bröstoperationer och borttagande av äggstockar vid ärftlig ökad risk för bröst- och äggstockscancer.