Génétique Flashcards
(114 cards)
1
Q
Quelles sont les étapes du CC
A
G0
1. G1
2. S
3. G2
4. M
2
Q
Quels sont les points de contrôle du CC
A
- Point de restriction G1/S (environnement ok)
- G2/M (ADN ok)
3
Q
Qu’est-ce qu’un centimorgan (cM)
A
Unité de mesure de distance génétique entre deux loci.
Un cM correspond environ à une fréquence de1% de recombinaison (une recombinaison toutes les 100 méioses).
4
Q
Qu’est-ce qu’un centromère
A
Constriction des chromosomes séparant le bras court (p) du bras long (q).
5
Q
Qu’est-ce qu’un déséquilibre de liaison
A
Situation dans laquelle 2 allèles correspondant à 2 locus distincts d’un même chromosome sont plus fréquemment associés en cis dans une même population que ne le voudrait le hasard
6
Q
Qu’est-ce qu’un diagnostic génétique direct
A
Analyse permettant de détecter directement au niveau de l’ADN les mutations responsables d’une pathologie.
7
Q
Qu’est-ce que le diagnostic génotypique indirect
A
Analyse permettant de pister un gène muté dans une famille à l’aide de l’étude familiale de plusieurs marqueurs génétiques flanquant le gène affecté
8
Q
Qu’est-ce que le diagnostic génotypique semi-direct
A
Analyse permettant de pister un gène muté dans une famille à l’aide de l’étude familiale de plusieurs marqueurs génétiques juxta- ou intra- géniques donc plus spécifiques et sensibles que ceux utilisés en diagnostic indirect.
9
Q
Que veut dire diploide
A
Jeu de chromosomes où chaque autosome est en double exemplaire et comportant deux chromosomes sexuels (état 2n).
10
Q
Qu’est-ce que la distance génétique
A
Sur une carte génétique désigne un intervalle entre deux locus, calculé d’après la fréquence des recombinaisons observées
11
Q
Qu’est-ce qu’un gène domestique
A
Gènes spécifiant des protéines nécessaires à des fonctions communes à toutes les cellules, et dont l’expression est par conséquent ubiquitaire
12
Q
Qu’est-ce que l’équilibre de liaison
A
Se dit de l’absence d’association allélique préférentielle pour deux locus d’un même chromosome, attestée par une distribution en cis conforme aux lois statistiques du hasard
13
Q
Qu’est-ce qu’un exon
A
Séquences d’ADN, codantes ou non, dispersées dans le gène et persistant sur l’ARN messager mûr après maturation du transcrit primaire
14
Q
Qu’est-ce que l’exome
A
Toutes les séquences codantes du génome
15
Q
Qu’est-ce que l’hétérogénéité génétique
A
Désigne les maladies génétiques où des anomalies multiples de l’ADN peuvent aboutir à une même pathologie, par polyallélisme (plusieurs mutations différentes peuvent affecter alternativement un même gène), par nonallélisme (des gènes différents peuvent être alternativement touchés), ou par polygénisme (des mutations siégeant simultanément sur plusieurs gènes participent conjointement au déterminisme pathologique).
16
Q
Qu’est-ce que l’informativité
A
Hétérozygote d’un RFLP permettant de distinguer les deux chromosomes d’une même paire, et en particulier de repérer un locus morbide sur l’un des deux
17
Q
Qu’est-ce que la liaison génétique
A
Co ségrégation de deux ou plusieurs allèles de marqueurs différents au cours des générations en raison de la proximité physique de leurs locus respectifs sur le génome.
18
Q
Qu’est-ce qu’un locus génétique
A
Partie du génome correspondant à un endroit précis et pouvant contenir tout aussi bien un gène qu’une séquence intergénique
19
Q
Qu’est-ce que la mosaique somatique
A
Situation exceptionnelle où toutes les cellule d’un individu n’ont pas la même constitution génétique
20
Q
Qu’est-ce qu’une mutation constitutive
A
Mutation présente dans toutes les cellules d’un individu donc, par définition, héritée de l’un des parents
21
Q
Qu’est-ce qu’une mutation faux sens
A
Mutation de l’ADN, située dans un exon, et entraînant la substitution d’un codon par un autre résultant ultimement en la substitution d’un acide aminé pour un autre dans la protéine codée par le gène
22
Q
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens
A
Mutation de l’ADN, située dans un exon, et entraînant l’apparition d’un codon de terminaison
23
Q
Qu’est-ce que la pénétrance
A
Pourcentage des sujets porteurs d’un gène dominant et exprimant la maladie
24
Q
Qu’est-ce que le polyallélisme
A
Mutations différentes affectant un même gène - donc alléliques - et déterminant une maladie dont l’expression clinique peut varier selon le type de lésion
25
Qu'est-ce que le RFLP
(Restriction Fragment Length Polymorphism) : Correspond à un endroit du génome où l'on retrouve, dans la population générale, des fragments de restriction (ADN) de taille différente selon les individus, habituellement dûs à la présence ou non d'un site de restriction polymorphique à l'une des extrémités du fragment de restriction
26
Qu'est-ce qu'un variant de nombre de copies
Sorte de polymorphisme (ou de mutation) où on n’observe pas le nombre normal de deux allèles (ou d’un allèle pour les séquence du chromosome Y et X chez l’homme) pour une séquence d’ADN donnée
27
Selon la loi de la ségrégation, quelles sont les chances d'avoir un hétérozygote de 2 parents hétérozygotes?
50%
28
De quoi est composé un acide nucléique
Base azoté + Sucre (ribose ou déoxyribose)
29
Quelles sont les bases purine
Adénine et guanine
30
Quelles sont les bases pyrimidines
Cytosine, thymine et uracile
31
Quelle est la différence fondamentale entre l'ADN et l'ARN
Ribose vs déoxyribose
32
Quelle est la différence entre un nucléoside et un nucléotide
Le phosphate (1, 2 ou 3 phosphates)
33
Vrai ou faux ? Les purines et les pyrimidines sont des dérivés
d'acides aminés
Vrai
34
Quelle enzyme permet de former les désoxynucléotides à partir des ribonucléotides diphosphate?
Ribonucléotide réductase = Transforme le ribose en déoxyribose
35
Que fournit la voie des pentoses phosphate dans la synthèse des acides nucléiques
Ribose et et NADPH nécessaire à la ribonucléotide réductase
36
Quels sont les substrats des ARN polymérase et ADN polymérase
ATP, GTP, CTP et UTP ; dATP, dGTP, dCTP et dTTP
37
À part servir de substrat aux ARN polymérase, quels sont les fonctions des ribonucléotide?
1. Source d'énergie
2. Source de phosphate
38
Quelle est la structure primaire de l'ADN?
1. Linéaire 2 brins
2. Orientation 5'-3'
3. Antiparallèle
4. Les acides nucléiques sont attachés entre eux via les désoxyriboses
5. La séquence spécifique est déterminée par les bases azotées (ATCG)
6. Des ponts H entre les bases azotées relient les 2 brins
39
Quelles sont les différences entre la structure primaire de l'ADN et de l'ARN
1. Ribose au lieu du déoxyribose
2. Base pyrimidique différente (C-U)
3. 1 seul brin
4. Plus labile/fragile
40
Quelle est la structure secondaire de l'ADN
Forme de torsade (à cause des forces de torsion)
Comprend un petit et un grand sillon
41
Quelle est la structure secondaire de l'ARN
Se replie sur elle-même, la forme dépend de la séquence
42
Quelle est la structure tertiaire de l'ADN
Nucléosomes qui forment la chromatine
43
Quelle est la propriété de dénaturation des acides nucléiques
Dissociation des 2 brins selon la T° ou le pH
44
Quelle est la propriété de renaturation des acides nucléiques
Dénaturation réversible en conditions adaptées
45
Quelle est la propriété d'hybridation moléculaire des acides nucléiques
Technique selon laquelle on dénature de l'ADN et où on le laisse ensuite se renaturer en présence d'une molécule complémentaire (ADN-ADN ou ADN-ARN)
46
Que veux dire réplication selon un mode semi-conservatif
Chacun des 2brins complémentaires de la molécule de départ servira de gabarit pour la synthèse de son nouveau brin complémentaire = Chacune des deux molécules d'ADN finales contiendra un brin de la molécule de départ et un brin nouvellement synthétisé
47
Quelles sont les étapes de la réplication + Enzymes
1. Séparation des brins d'ADN à plusieurs endroits (origine de réplication) par les hélicases
2. Synthèse de l'ADN par le complexe enzymatique de réplication (ADN polymérase + hélicase) des 2 sens de l'origine de réplication jusqu'à la rencontre d'un autre en sens contraire = Ajout de nucléotides
48
Qu'est-ce qu'un réplicon?
Segment d'ADN possédant une même origine de réplication.
49
Quelle est le taux d'erreur de l'ADN polymérase? Avec les mécanismes de réparation
1/10 000 ; 1/1 000 000 000 à 10 000 000 000
50
Quels sont les substrats de l'ADN polymérase
1 brin d'ADN et des dATP, dCTP, dGTP et dTTP
51
Quelles sont les étapes du mécanisme excision/réparation
1. Reconnaissance de l'erreur par une ADN-GLYCOSYLASE + coupe le lien entre la base et le sucre
2. Hydrolyse du lien phosphodiester par une ENDONUCLÉASE
3. Élimination de plusieurs nucléotides en 3' par une EXONUCLÉASE
4. Synthèse d'un nouveau fragment d'ADN par une ADN-POLYMÉRASE
5. Liaison du nouveau fragment d'ADN par une ADN-LIGASE + ATP
52
Quelle est une autre façon de synthétiser l'ADN à part les ADN polymérase
Transcriptase inverse : Donne de l'ADNc à partir d'un ARN
53
Qu'est-ce qu'un gène
Ensemble des séquences d'acide nucléique contenant l'information nécessaire à la production régulée d'un ARN particulier (transcription) ou d'une chaîne polypeptidique particulière (transcription+ traduction)
54
Quelles sont les 3 classes de gènes
Classe I : ARNr transcrit par l'ARN pol I
Classe II : ARNm qui seront traduits par l'ARN pol II
Classe III : ARNt transcrit par l'ARN pol III
55
Comment on peut traduire de l'ADN composé de 4 bases par des protéines composées de 22 aa?
Code génétique : Chaque acide aminé est codé par une séquence de 3 nucléotides = Codon
56
Quelles sont les étapes de production d'une protéine à partir d'un gène
1. Trouver le gène
2. Transcription du gène en ARNm
3. Maturation du gène/épissage
export vers le cytoplasme
4. Traduction de l'ARNm
5. Modifications post-trad
6. Transport de la protéine à sa localisation finale
57
Qu'est-ce qu'un gène domestique
Gènes dont toutes les cellules ont besoin pour leur fonctionnement de base (métabolisme basal, réplication et réparation de l'ADN, protéines de structure)
58
Quelles sont les 3 types de séquences des gènes
1. Séquences non transcrites
2. Séquences transcrites, mais non traduites
3. Séquences transcrites et traduites
59
À quoi sert la région régulatrice d'un gène?
Permet le contrôle de la transcription du gène (car pas tous les gènes transcrits tout le temps et dans tous les types cellulaires)
60
Est-ce que la région régulatrice d'un gène est transcrite
Non
61
À quoi sert la région promotrice d'un gène?
Fixation de l'ARN polymérase
Contient des séquences qui signalent à l'enzyme où commencer sa catalyse
62
Vrai ou faux? Une partie du premier exon n'est pas transcrite
Vrai : Fonction régulatrice de la traduction (permet la liaison des protéines de la traduction) = Région 5' non traduite de l'ARNm
63
Quel est le codon d'initiation de la traduction
AUG
64
Vrai ou faux? Une partie du dernier exon n'est pas traduite.
Vrai : Correspond à la séquence de queue polyA de l'ARNm
65
Quels sont les codons de terminaison?
UAA
UAG
UGA
66
Quelles sont les 3 catégories d'éléments susceptibles d'influencer le taux de transcription d'un gène
1. Séquences cis-régulatrices = Régions régulatrices en 5'
2. Séquences simulatrices enhancers : Localisées n'importe où dans le gène en dehors des séquences codantes (donc en 5' UTR, 3' UTR ou dans les introns)
3. Protéines se fixant à l'ADN (trans, car gènes codant situés très loin du gène contrôlé) au niveau des séquences régulatrices ou promotrices
67
À quoi sert la maturation de l'ADN
Cap : Sert à la traduction ultérieure de l'ARNm
Queue polyA : Sert à la stabilisation de l'ARNm et à l'initiation de la traduction
68
Quel est le but de l'épissage?
Retirer du pré-ARNm toutes les séquences introniques pour obtenir un ARNm mûr ne contenant que les exons bout-à-bout et donc prêt à être traduit en protéine
69
Quels sont les 2 principaux acteurs de la traduction
Les ARNt et les ribosomes
70
Quels sont les 2 sites les plus importants d'une molécule d'ARNt
Anticodon et le site de fixation de l'AA
71
Quelle est le nom de l'enzyme responsable de fixer les aa sur les ARNt et pourquoi est-elle doublement spécifique?
Aminoacyl-ARNt synthétases ; car elles reconnaissent à la fois un AA ainsi que l'ARNt qui lui correspond
72
Quelle est l'utilisé d'utiliser l'ARNm comme véhicule de la synthèse protéique
Modulable :
1. Modulation de la synthèse d'ARN (production et quantité)
2. Modulation/variation de la maturation de l'ARN (vitesse, qualité et épissage alternatif)
3. Stockage/stabilité/dégradation d'ARNm : Des séquences dans l'ARNm affecte leur stabilité. Possibilité de stocker des ARNm (comme dans les ovocytes)
73
Vrai ou faux? Chaque acide aminé est fixé à un ARNt par une aminoacylARNt-synthase spécifique
Vrai
74
À quoi correspond l'initiation de la traduction et quelles molécules sont impliquées
L'ARNm mature est reconnu par les différentes molécules du complexe de traduction et qui amorcent la "lecture" de l'ARNm pour procéder à la synthèse
Implique SU 40S, SU 60S, ARNt initiateur, ATP
75
Quelles sont les étapes de l'initiation de la traduction
1. Liaison ARNt initiateur à un protéine
2. Liaison SU 40S
3. Liaison sur l'ARNm sur le codon AUG
4. Liaison SU 60S
76
Que se passe-t-il lors de l'élongation
1. Liaison de l'ARNt correspondant au codon suivant
2. Liaison peptidique entre les aa par la peptidyl-transférase
3. Dissociation de l'ARNt précédent, déplacement du ribosome et liaison de l'ARNt suivant
77
Que se passe-t-il lors de la terminaison
Les 3 codons de terminaison (UAG, UAA et UGA) ne correspondent à aucun ARNt = la traduction s'arrête et le complexe de traduction est désassemblé : Relargage du polypeptide et séparation de l'ARNm du ribosome
78
Donner des exemples de modifications post-traductionnelles structurales et chimiques
Structural : Clivage des liens peptidiques (pour enlever la Met ou pour activer des précurseurs), liens disulfure inter-protéines (structure quaternaire)
Chimique : Phosphorylation pour réguler l'activité de certaines enzymes
79
Qu'est-ce qu'une mutation
Tout événement causant un changement dans la séquence nucléotidique d'une molécule d'ADN
80
Quelles sont les 2 causes de la variation génétique
1. Mutations germinales
2. Recombinaison méiotique
81
Quelles sont les différentes classes des gènes selon le type de cellule dans lequel la mutation se produit
1. Mutation somatique = Cellules somatiques
2. Mutation germinale = Dans les gamètes
3. Mutation constitutive = Dans les cellules somatiques et les cellules germinale
82
Quelles sont les 3 catégories de mutations
1. Changement de séquence
2. Délétion
3. Insertion
83
Qu'est-ce qu'une mutation non sens?
Mutation ponctuelle qui crée un codon stop
84
Qu'est-ce qu'une mutation muette
Mutation ponctuelle qui ne change pas l'aa codé = Pas de changement de séquence
85
Qu'est-ce qu'une mutation faux sens
Mutation ponctuelle qui change l'aa codé = Changement de la séquence
86
Qu'est-ce qu'une expansion de trinucléotides
Insertion de plusieurs copies d'une répétition de 3 nt
87
Qu'est-ce qu'un variant du nombre de copies
Les délétions et les duplications
88
Quelles sont les conséquences possibles d'une mutation ponctuelle dans la région promotrices
1. Silencieuse
2. Diminution ou augmentation de la quantité d'ARNm produit et donc de protéines
89
Quelles sont les conséquences possibles d'une mutation ponctuelle dans une région transcrite mais non traduite
1. Silencieuse
2. Peut affecter la capacité à traduire l'ARNm (peut affecter la capacité du ribosome à se lier, car initiation de la traduction nécessite les séquences avoisinantes), mais n'abolit pas la traduction. Affecte la demi-vie (diminution possible de l'efficacité du capping en 5')
90
Quelle est la conséquence d'une mutation dans le site d'initiation de la traduction
Pas de traduction
91
Quelles sont les conséquences d'une mutation aux jonction exons/intron
1. Silencieuse
2. Élimination d'un site d'excision = Intron conservé et traduit
3. Création d'un site d'excision alternatif = Une partie de l'intron est conservée et traduite
= Insertions, arrêt de traduction si codon stop, mauvais cadre de lecture
92
Quelles sont les conséquences d'une mutation dans un exon
1. Silencieuse
2. Arrêt de la traduction (non sens)
3. Changement de aa (faux sens)
4. Création d'un site alternatif d'excision : L'exon est écourté et possiblement épissé
93
Quelles sont les conséquences d'une mutation dans le codon de terminaison
1. Silencieuse
2. Pas d'arrêt de la traduction = Synthèse d'une protéine plus longue
94
Qu'est-ce qu'un marqueur génétique
Toute variation de séquence de l'ADN (polymorphisme ou mutation) créant des allèles différents à un même locus.
95
Qu'est-ce que la recombinaison méiotique
Échange de matériel génétique entre les paires de chromosomes homologues dans les cellules germinales
96
Vrai ou faux? Plus les gènes sont près l'un de l'autre, plus il y a de chances qu'ils soient recombinés ensemble/restent ensemble malgré la recombinaison
Vrai
97
Quelles sont les conséquences de la variation génétique?
1. Polymorphisme génétique : Différences de séquence sans effets néfastes
2. Pathologies héréditaires
98
Qu'est-ce que le diagnostic génotypique
'Étude du bagage génétique (génotype) d'un individu à un locus donné dans le but de déterminer s'il est porteur d'une altération pouvant expliquer une maladie héréditaire ou une maladie acquise.
99
Dans quelles circonstances le diagnostic moléculaire est indiqué
1. Confirmation d'un dx
2. Dx de porteur chez une personne saine (chances de transmission ou prédisposition)
3. Dx prénatal
100
Que nécessite un Dx génotypique indirect
Cas index : Quelqu'un dans la famille qui a la maladie héréditaire à l'étude, car la combinaison d'allèles associée au gène ne sera pas la même d'une famille à l'autre = Il faut savoir les allèles de marqueur associés au gène muté
101
Pourquoi les résultats du Dx génotypique indirect implique une incertitude
Car les marqueurs sont à une certaine distance du gène = Il y a un risque de recombinaison de chaque côté (%/distance connue)
102
Dans le Dx génotypique indirect, comment calcule-t-on le risque que la personne ait les 2 marqueurs associés au gène normal, mais qu'elle ait le gène muté (double recombinaison)
Produit des % de recombinaison entre les 2 marqueurs et le gène = % de chance d'erreur du Dx
103
Pourquoi le Dx génotypique indirect est parfois impossible?
Si on ne trouve pas de bons marqueurs permettant de distinguer les chromosomes mutés des non mutés
104
Vrai ou faux? Aucun test n'a 100% de sensibilité
Vrai
105
Dans le Dx génotypique indirect, comment calcule-t-on le risque qu'il y ait un événement de recombinaison entre les marqueurs et le gène?
Somme des % de recombinaison entre les 2 marqueurs et le gène = % de chance que le Dx indirect soit impossible (car on ne peut pas savoir si le gène affecté a "suivi" le marqueur #1 ou le marqueur #2.
106
Dans quelles circonstances le diagnostic moléculaire indirect est utilisé
Lorsqu'on qu'on ne connait pas le gène/locus exact, mais qu'on connait la région approximative
107
Dans quelles circonstances le diagnostic moléculaire semi-direct est utilisé
Lorsqu'on connait le gène/locus et l'endroit dans le gène où il y a une mutation
108
Vrai ou faux? Dans un Dx semi-direct, le cas index n'est pas obligatoire
Faux
109
Vrai ou faux? Dans un Dx direct, le cas index n'est pas obligatoire
Vrai
110
Dans quelles circonstances le diagnostic moléculaire direct est utilisé
Lorsqu'on connait le gène et la mutation et qu'on peut séquencer le gène
111
Dans quelles circonstances aurait-ton besoin d'un cas index pour un Dx direct
S'il y a plus d'une mutations possibles (fréquent, à moins que le lien causal entre une mutation et une maladie ait déjà été bien définie, mais sinon peut varier d'une famille à l'autre)
112
Pourquoi il n'y a pas de risque de double recombinaison/d'erreur dans le Dx direct?
Car on teste directement la mutation associée à la maladie et non des marqueurs associés
113
Quelles sont les limites du Dx génotypique
1. Néomutations (mutations germinales)
2. Hétérogénéité génétique (Plusieurs mutations peuvent causer une même maladie = Couteux de toute les chercher)
3. Cas complexes fréquents nécessitant un généticien
4. Mosaïque somatique : Présence de cellules normales et de cellules atteintes (provient de néomutations somatiques) ou mosaïque germinale (provient de néomutations germinales
5. Pénétrance : Porteur ne veut pas dire que la personne va développer la maladie
6. Phénocopie : Si les Sx ne sont pas bien définis ou unique, problème si on utilise un cas index = Fausses conclusions
114
Quelle enzyme est responsable de la création des liens entre les AA durant l'élongation
Peptidyl transférase
