Génétique moléculaire

Question 1

génome humain

Answer 1

mitochondrial: 16,6 kb —> 37 gènes

nucléaire: 3,2 B pb —> 25000-35000 gènes
50% = ADN repet
< 3% ADN code pour prot
proportion importante génome nucléaire transcrit en ARN non codant: 95% (microARN)

Question 2

type séquence ADN

Answer 2

44% ADN répétitif w/ éléments transposables et seq apparentées

15% ADN répétitif non apparenté aux éléments transposables

15% ADN non-codant unique

24% introns + régions régulatrices

1,5% seq codant prot, ARNt, ARNr

Question 3

régions riches G/C

Answer 3

régions riches en gènes
stables
bande G

Question 4

régions riches en A/T

Answer 4

régions pauvres en gènes

bandes R

Question 5

chr 1

Answer 5

le + grand nombre de gènes

~ 3000

Question 6

chr Y

Answer 6

le moins de gènes

231 gènes

Question 7

zones fortements répétitives

Answer 7

10-15% du génome non codé en prot

centromère, telomères, mégasatéllites, mini, micro

Question 8

zones moyennements répétitives

Answer 8

20-40% génome non codé en prot

transposons, SINE, LINE

Question 9

séquences uniques

Answer 9

~ 50% génome
contient la plupart des gènes codant pour les prot
ARNm

Question 10

minisatéllites (seq répétitives)

Answer 10

VNTR = variable numbers of tandem repeats chez eucaryotes = polymorphisme

répétées en tandem (1 motif = 9-60 nucléotides)
chez toutes espèces
surtout télomériques et centromériques
dresser profils génétiques

Question 11

microsatellites (zones répétitives)

Answer 11

STR = short tandem repeat
répétition continue (1 motif = 1-5 nucléotides)

répartition homogène sur tout le génome tous les 25-100 kb
facilement amplifié par PCR
utilisation diagnostic moléculaire + empreinte génétiques
répétitions télomérases : certain K

Question 12

SBMA = atrophie musculaire spinal et bulbaire

Answer 12

CAG X 40-62

ORF

Question 13

HD: Maladie de Huntington

Answer 13

CAG X 36-121

ORF

Question 14

DRPLA: Atrophie dentatorubrale et pallidoluysienne

Answer 14

CAG X 49-88

ORF

Question 15

catalogues des gènes

Answer 15

GenAtlas
OMIM
Genome Browser

Question 16

bases de données

Answer 16

SNP
OMIM
Ensembl

Question 17

Drépanocytose

Answer 17

altération hb ß (transport O2)
remplacement 6ème aa: T —> A
glutamine —> valine

Question 18

maladie monogénique

Answer 18

mucoviscidose

Question 19

maladie multigénique

Answer 19

MCV, K

Question 20

génétique moléculaire: microlésions

Answer 20

échelle des gènes
mutations ponctuelles
insertions/ délétions: qqs nucléotides, qqs 10 ou 100 de nucléotides

Question 21

techniques utilisées génétiques moléculaire

Answer 21

hybridation moléculaire
séquençage
PCR
PCR-RFLP

Question 22

cytogénétique moléculaire: macrolésions

Answer 22

à l’échelle du chromosome:
insertions
délétions 
duplications
amplifications
translocations 
inversions

Question 23

techniques utilisées cytogénétique moléculaire

Answer 23

caryotype
CGH
FISH
puces à ADN/ARN

Question 24

ADN

Answer 24

chrX:
linéaire
155 Mb

23 paires chromosomes: 3,1.10⁹ pb

che bacterien: circulaire qqs miliers pb

Question 25

ARN

Answer 25

taille très variable: 20 pb à qqs dizaines kb

Question 26

ADN foetal

Answer 26

au bout de 4S dans sang maternel 10% ADN total circulant ADN fragmenté + petite taille <200 pb

Question 27

southern blot

Answer 27

déterminer expression gènes | utilisation enzymes restriction

Question 28

northern blot

Answer 28

analyse expression ARN | recherche variants d’épissage

Question 29

enzymes restriction

Answer 29

clive ADNdb niveau sites reconnus spé, seq courtes: 4-10pb enzymes from bactéries

Question 30

ADN polymérases

Answer 30

taq polymérase: from bactérie thermus aquaticus résiste température 94°C incorporation 1000 nucléotides/ min à 72°C

Question 31

choix amorces PCR

Answer 31

17-30 bases seq exactement complémentaire 1 seule cible dans génome

Question 32

PCR standard

Answer 32

à partir 500 ng d’ADN | 25-30 cycles de PCR

Question 33

PCR: traces d’ADN

Answer 33

à partir 5ng d’ADN: 35-40 cycles de PCR

Question 34

PCR unicellulaire

Answer 34

1 seule molécule ADN ou d’ARN | < 0,3 ng (- 50 copies) : 40-45 cycles de PCR

Question 35

PCR taille du fragment à amplifier

Answer 35

difficulté à amplifier grands fragments d’ADN PCR longues permettent d’amplifier au max 20-40 kb PCR permettent amplifier classiquement des fragments de 50-qqs centaines de bases

Question 36

dystrophie musculaire de Duchenne (DMD)

Answer 36

``` gène DMD: plus grand gène connu 2,4 Mb 79 exons sur chr X ``` mutation de novo: fréquence 30 % fréquence de la pathologie délétionnelle: 60-65% changement cadre de lecture produisant prot non fonctionnelle: délétion exon 50

Question 37

achondroplasie

Answer 37

mutation gène FGFR3 98% mutation G --> A glycine --> arginine codon 380 création site reconnu par l'enzyme de restriction Sfcl mise en évidence substitution par PCR-RFLP/ séquençage mutation de novo dans 90% des cas