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(77 cards)

1
Q

Pourquoi étudier la biologie moléculaire des virus?

A

pour pouvoir inhiber selectivmenet la réplication virale avec des médaicament antiviraux et vaccins

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Q

Transfert horizontal

A

intégrer matière génétique sans être le descendant

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3
Q

3 Carastéristiques des virus

A

Grande diversité génétique
mutation rapide
petite taille (<300nm)

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4
Q

Premier virus animal identifié

A

le virus de la fièvre aphteuse

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5
Q

le plus gros virus

A

mimivirus (mimicking microbe virus)

virus géant

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6
Q

virus à virus (virophage)

A

Spoutnik

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7
Q

5 critères pour être un virus

A
  1. posséder 1 seul type d’acide nucléique (ADN ou ARN)
  2. Se reproduire à partir de cette a. nucléique
  3. Ne possède pas d’information génétique pour les enzyme du métabolisme intermédiaire de production d’énergie
  4. Sa multiplication nécessite les structure de la cellule hôte et de ses ribosomes
  5. incapable de croître et de subir une fision binaire
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8
Q

les 2 formes de virus

A

intracellulaire : Variable

Extracellulaire: Virion - particule complète, mature, infectieuse - c’est l’unité structurale du virus

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9
Q

Structure virion

A

Génome viral : contient ensemble info nécessaire à la réplication
Capside : role de protection, intervient dans attachement lorsque nu et porte des structures antigénique
(2 ensemble virus nu - ce sont les deux éléments constants)
Enveloppe : role de protection
(3 ensemble virus enveloppé

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10
Q

Qu’est ce qui détermine le tropisme et l’infectiosité

A

la structure la plus externe

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11
Q

composition de l’enveloppe viral

A

protéine, lipique, glucide
spicule (péplomère) : anti-récepteur viraux
dérivé de la membrane des cellules (plasmique, nucléaire, organites)

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12
Q

Caractéristique et Ex de virus nu

A

Pas de prédominance sur les saisons
Résistant à l’extérieur (pH, enzyme, dessication)

adénovirus
Virus poliomyélite

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13
Q

Caractéristique et ex de virus enveloppé

A

prédominance sur les saison froide
rapidement inactivé dans l’environnement

VIH, variole, grippe, influenza

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14
Q

5 formes de base de particule virale et exemple

A

Hélicoidal nu (VMT) ou enveloppé (rage, influenza, ebola)
icosaédrique nu (poliovius, adénovirus, parvovirus) ou enveloppé (herpès, fièvre jaune, rubéole)
Complexe (poxvirus, phages T-pair)

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15
Q

ex virus hélicoidal

A

Grippe
mosaique du tabac
rage

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16
Q

Caractéristique et ex virus icosaédrique

A

capside composé de capsomères (composé de protomère)
Pentons (5 protomères) : sommet
hexon (6 protomères) : face et arrêtes

adénovirus
polyomavirus

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17
Q

Caractéristique et ex virus complexe

A

symétrie binaire pour T pair (T2,T4,T6..) : tête icosaédrique et queue hélicoidale

Poxvirus
bactériophage

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18
Q

Fonction et caractéristiques Spicule

A
Fixation
Fusion
Activité enzymatique
Glycoprotéine
anti-recepteur viraux
synonyme :Péplomères
même spicule peut faire 2 rôles
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19
Q

qu’est-ce qui détermine la taille d’un virus

A

la taille du génome et la quantité d’information génétique

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20
Q

Type de génome viraux

A

ARN ou ADN
Sb ou Db
+ ou - (pour ARN)

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21
Q

carastérique virus ADN

A

Stable biochimiquement et génétiquement
taux de mutation faible
long segment
Pas besoin d’enzyme spécifique pour la réplication
Sert directement de matrice (ADN–> ARNm–> prot)

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22
Q

carastérique virus ARN

A

instable biochimiquement et génétiquement
taux de mutation élevé
court segment fragmenté
Besoin d’enzyme de réplication viral spécifique
Double rôle de matrice (ARN et ARNm)

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23
Q

Majorité des prot virales sont..

A

multifonctionnelle

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24
Q

classification des virus (5 façon)

A

en fct du mode de transmission (arbovirus : arthrpode borne virus)
en fct de l’organisme parasité (bactériophage : bacétrie; phytovirus : végétaux)
en fct tropisme cellulaire ou tissulaire ( dermotrope, neurotrope..)
Système universelle de calssification
Classification de Baltimore

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25
Systme universele de classification, 4 critères
nature a. nucléique symétrie nucléocapside enveloppé ou non nb de capsomères (icosaédrique) ou le diamètre du nucléocapside (hélicoidale)
26
2 critères systmème de baltimore
type d'a. nucléique | grande étape de réplication et expression viral
27
Viroide
ARNsb ciruclaire | pas de capside
28
prions
glucoprotéines mal replié | ex: encéphalopathie spongiforme bovine
29
virusoide
ne code pas pour ces propres protéines de fixation
30
étape de la réplication viral
Étape précoce - fixation (présence de recepteur viraux détermine tropisme ) - pénétration (endocytose, injection, fusion) - décapsidation Étape de synthèse et réplication viral Étape tardive - assemblage (dans noyau pour virus à ADN, cytop ARN) -libération (par lyse ou bourgeonnement)
31
combien de particule viral par cellule infecté
100 à 1000 (pas toute infectieuse)
32
type d'nteraction virus/cellule
aboritive: pas de replication persistante: replication sans lyse cellulaire productive: interaction lytique cytopathogène: altération morphologique de la cellule - Transformation en cellule maligne : pouvoir oncogène chez certains virus
33
Concept iceberg
proportion des cas d'une maladie qui demeure cliniquement muet
34
facteurs qui détermine groupe de risque
``` gamme d'hôtes pathogénicité dose infectieuse mode de transmission disponibilité des mesures préventives efficaces disponibilit de traitement ```
35
groupe agents pathogènes
2,3 et 4
36
différent type celulaires par virus
résistante: ne possède pas de recepteur susceptible : possède recepteur mais ne peut pas forcément se réplique sensible: possède recepteur et permet la réplication
37
porte d'entrée
``` tractus digestif, urigéntial système respiratoire vaisseux sanguins blessure peau et conjonctive piqûre d'insecte ```
38
particularité transmision voie respiratoire
humidité, température, intensité de production et infectiosité du virus
39
Conséquence de la transmission verticale
avortement, malformation ou immunotolérence à ce virus
40
mode de transmission horizontal
direct: physique, sexuel indirect: eau, aliments, vecteur, maladie iatrogène
41
mode excrétion viral
``` voies respiratoire tractus gastro-intestinal et urogéntial sang peu/muqueuse s. nerveux ```
42
infx localisé particularité
reste au site d'entré
43
infx généralisé particularité
entré virus propagation au g. lymphatique de la région virémie primaire -->propagation à organes sensibles virémie secondaire plus intense -->dissémination à d'autres organe (comme peau) longue incubation
44
virémie secondaire
developpement de sirus dans un site secondaires
45
site de réplication primaire
site ou se developpe l'infection au début
46
type d'infection viral
aboritive: échec/élimination aigue: rapide et autolimitante (ou mort) Persistante -chronite: réplication continue -chronite lente: réplication progressive -latente: pas grand production virus, peu ou pas de réponse immunitaire, peut se réactiver plus tard
47
méthode défense
barrière physique: peau, muqueuse, acidité, larme, microflore défense intrisèque: absence recepteur, autophagie, apoptose immunité inné: cytokin, mastocyte, macrophage, NK, complément, fievre, inflammation... immunité adaptative, PRR: TLR (m. cytoplasmique) NLR et RLR (dans cytoplasme)
48
symptome
subjectif (douleur, appétit)
49
signe
objectif (fièvre, erruption cutané...)
50
syndrome
ensemble des signes et symptomes liés à une maladie
51
période d'incubation
entrée du virus jusqu'à apparition signe et symptome
52
virus pathogène
capable d'induire des signes et symptome (maladie)
53
Pathogénicité
capacité à causé une maladie (qualitatif)
54
Virulence
interaction avec hôte (quantitatif- étendu) -capaciter rentre, croitre dans la cellule de l'hote et combattre les mécanismes de l'ote - capacité a produire des domamges temporaire ou permanent à l'hote c'est un trait relatif
55
transmissibilité
efficacité que c'est transmis à un hôte naif
56
reservoir
soure qui fourni des conditions favorable à la survie et propagation du pathogène
57
Pathogènese
le mécanisme par lequel le virus endommage des population cellulaire menant à des signes et symptômes de la maladie
58
Stratégie pour éviter une réponse immunitaire
- inhiber la reconnaissance immunitaire - infx latente - mutation - lyse des cellules immunitaires - virokines - virorecepteur - inhiber le complément
59
mécanisme d'action des anticoprs neutralisant
- inhiber attachement des virus au recepteur cellulaire - inhiber l'interaction avec cellule donc bloc l'internalisation du virus - empêche la décapsidation - favorise l'aggrégation
60
ADE de la denge
Antibody-dependent enhancement -Les anticorps qui se lient lors d'une seconde infection a la denge facilité la synthèse viral de cette dernière parce qu'elles peuvent s'échapper de la vacuole (lien anticorps et virus moins fort) et se répliquer dans le macrophage
61
facteurs qui affecte la pathogénèse
``` Voie d'entrée le type cellulaire le stade de réplication de la cellule la réponse immunitaire facteurs de restriction de l'hote ``` ``` la virulence du virus la vitesse de réplication et de propagation du virus stabilité infx bactérienne secondaire Dosage ```
62
3 mécanismes des oncovirus
Déregulation du cycle cellulaire et apoptose en inactivant les supresseurs de tumeur (ex:p53) Pertubation de la division cellulaire par des protéines virales Mutagénèse insertionnelle: insertion du génome viral dans le génome cellualire
63
effet que peut avoir virus sur hote
``` aucune inflammation fievre, malaise anorexie mucus diarrhée perte de fonction dévelpement anormal avortement retard de coirssance lésion infx secondaire ```
64
Facteurs hote affectant la pathogénèse viral
``` manque de récepteur age état métabolique -nutrtion -déficience vit A -grossesse réponse immunitaire diminué L'immunité (innée et adaptative) ```
65
Facteurs viraux affectant la pathogénèse viral
manque de récepteur antigéniques dérive antigénique cassure antigénique capacité à entraver la réponse immunitiaire
66
deux type de variations antigénique
saut angtigénique: réarangement important --> nouveau sous-types dérive antigénique : modification légère
67
méthode diagnostic
direct: mettre en évidence présence du virus ex: microscopie électronique, ELISA sandwich, qPCR, PCR indirect: mettre en évidence antirops sythétisé ex: ELISA, qPCR, PCR, detection ECP, test hémaglutination, quantification du titre infectieux par plages de lyse
68
concentration critique pour voir des virus en microscopie électronique
10^6 particule/mL
69
DICC
dose infection en culture de cellule
70
DL50
la dose qui cause la mort de 50% des cellules
71
la concentration en particule viral
charge viral
72
beaucoup de nouvelle opportunité environnemental pour les virus
migration et déplacaement humain échange internatiaux invasion de nouvelle endroit production animal intensive avec mauvaise pratique sanitaire mauvaises surveillance dans certains pays
73
Avantage et incovénient PCR
relativment rapide peu couteux sensible et précis contamination : faux positif
74
avantage test agglutination
rapide précis donne quantité relative (ne quantifie pas les particules infectieuse précisément)
75
isolement et culture viral
sur animaux oeuf embryonné de pouls culture cellulaire primaire, diploide ou ligne continue, explants (culture d'organe)
76
Effet cytopathogène et ex
dépende de la nautre de la cellule et du virus | formation de syncytia (fusion de cellule)
77
principe du test de neutralisation
détecte des anticops capanle de neutralisé spécifiquement un virus dans l'échantillon (pas de destruction cellulaire dans le test = test positif)