Humanes Genom: Von Der Mutation Zum Phänotyp Flashcards

1
Q

DNA-Topologie: welche Formen gibt es?

A
  • B-Form: rechtsdrehend, stabiler
  • Z-Form: linksdrehend
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2
Q

Eigenschaften der Z-DNA

A
  • Mehtylierung von Cytosinen
  • linksgewunden, zickzackförmig
  • begünstigt durch alternierende CGCGCG-Folgen
  • Transkriptionsinaktiv
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3
Q

Welche eukaryotischen RNA-Polymerasen gibt es und was transkribieren sie?

A
  • RNA-Pol I: 18S rRNA, 5,8S rRNA, 28S rRNA
  • RNA-Pol II: mRNA, snRNA
  • RNA Pol III: tRNA, 5S rRNA, snRNA, 7 SL RNA
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4
Q

Was ist das Treacher Collins Syndrom?

A
  • Mutation in einer Untereinheit der RNA Polymerase I
  • autosomal dominant
  • Punktmutationen/ Deletionen
  • Ribosomopathie
  • Gene TCOF1, PolR1D, PolR1C
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5
Q

Klinik beim Treacher Collins Syndrom

A
  • Fehlen/Missbildung der Ohren
  • Schallleitungsschwehörigkeit
  • Mittelgesichthypoplasie
  • hoher Gaumen und Gaumenspalte
  • Zahnfehlstellungen
  • angeborene Herzfehler
  • normale Intelligenz
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6
Q

Nenne Promotorelemente und bindende Transkriptionsfaktoren

A
  • TATA-Box: TFIID
  • CAAT-Box: CTF, NF1, …
  • GC-Box: SP1
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7
Q

Was sind CpG-Inseln?

A
  • lange GC-reiche Abschnitte
  • Abstand zum Transkriptionsstart 1-2 Kb
  • Häufung von GC-reichen Sequenzen auffällig, weil sie im Genom unterrepräsentiert sind
  • werden oft methyliert —> Abschaltung
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8
Q

Was ist die Spinocerebelläre Ataxie (SCA) 17?

A
  • Mutation auf Gen 6q27
  • autosomal dominant
  • TATA-Box-bindendes Protein = TBP betroffen
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9
Q

Klinik der Spinocerebellären Ataxie 17

A
  • Trias: Ataxie, Dysarthrie, Nystagmus
  • Demenz, psychiatrische Symptome
  • Chorea
  • Parkinson
  • cerebelläre Atrophie im MRT/CT
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10
Q

Was ist die Funktion des polyA-Schwanzes?

A
  • stabilisiert RNA
  • erleichtert Transport ins Zytoplasma
  • erleichtert Translation
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11
Q

Wodurch wird die okulo-pharyngeale Muskeldystrophie verursacht?

A
  • Mutation des polyA-Bindeproteins: verlängerter GCG-Repeat
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12
Q

Was ist die Funktion von snRNPs?

A
  • werden für Spleißprozess von unreifer mRNA benötigt
  • small nuclear ribonucleotid particle, bestehend aus Proteinkomplex und kurzer RNA
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13
Q

Eigenschaften spinale Muskelatrophie

A
  • autosomal rezessiv
  • Genort: 5q12.2-q13.3
  • Gen: SMN1 (Erkrankung des 2. Motoneurons)
  • Häufigkeit: 1:7000
  • Spliceosom-Proteinkomplex kann sich nur bilden, wenn 2 große Multi-Proteinkomplexe aktiv sind (ein Komplex beinhaltet das SMN-Protein)
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14
Q

Klinik der spinalen Muskelatrophie Typ 1-3

A
  • generalisierte Muskelhypotonie
  • Muskelatrophie

Typ 1:
- Muskeleigenreflexe nicht auslösbar
- Kind kann nicht alleine sitzen
- Lebenserwartung max. 2 Jahre

Typ 2: kein freies Gehen

Typ 3: freies Gehen ohne Hilfe möglich

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15
Q

Therapie spinale Muskelatrophie

A

Nusinersen (Spinraza) Antisense-Oligo

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16
Q

Inwiefern unterschieden sich die Mutationen bei spinaler Muskelatrophie Typ 1-3?

A
  • Typ 1: SMN1-deletion (hat nur SMN2 einmal)
  • Typ 2 und 3: Gen-Konversion mit erhöhter SMN2-Kopienzahl (hat SMN2 mehrfach)

Normal: jeweils ein SMN1 und SMN2

17
Q

Inwiefern unterscheidet sich das mitochondriale Genom vom Kerngenom?

A
  • viel kleiner (16,6 Kb vs 3000 Mb)
  • zirkuläres Molekül vs 23 XX / XY
  • 10^3 DNA-Moleküle pro Zelle
  • keine Proteine wie Histone
  • beinhaltet ca 37 Gene vs ca 33 000
  • wenig repetitive DNA
  • Transkription am Stück
  • keine Introns
  • keine Rekombination vs Meiose
  • maternale Vererbung
18
Q

Eigenschaften der cystischen Fibrose

A
  • Defekt des Chloridionenkanals (CFTR)
  • autosomal rezessiv
  • Häufigkeit 1 : 2500, häufigste letale monogene Krankheit im Kindesalter
  • Genort 7q31.2
  • mehr als 1900 unterschiedliche Punktmutationen
19
Q

Klinik der cystischen Fibrose

A
  • chronische Bronchitis
  • Malabsorptionssymptome
  • Pankreasinsuffizienz
  • Azoospermie
20
Q

Eigenschaften der Neurofibromatose

A

= Morbus von Recklinghausen
- autosomal dominant
- Gen: NF1
- 17q11.2
- Genprodukt: Neurofibromin 1
- Punktmutationen, Deletionen, Duplikationen
- zu 50 % Neumutationen
- paternales Alter (je älter die Männer bei der Zeugung, desto höher die Wahrscheinlichkeit)

21
Q

Klinik der Neurofibromatose Typ 1

A
  • Neurofibrome unterschiedlicher Größe
  • > 5 Cafe-au-lait-Flecken
  • Lisch-Flecken auf der Iris
  • axilläre Sprenkelung
  • Skelettdeformitäten
  • Optikusgliom
22
Q

Nenne verschiedene repetitive DNA-Abschnitte bei Eukaryonten

A

Tandemwiederholungen:
- Satelliten am Centromer
- Mini-Satelliten am Telomer
- Mikro-Satelliten (auch in Genen)

Verteilt vorkommend:
- SINE = short interspersed elements
- LINE = long interspersed elements

23
Q

Bedeutung von Mirkosatelliten

A
  • meist keine funktionelle Bedeutung
  • werden wegen hoher Variabilität (in der Länge) und leichter Analysierbarkeit für genetische Analysen verwendet
  • können pathologisch sein —> Trinukleptidrepeatkrankheiten